Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
176,864 |
C→T |
7.7% |
L381L (CTA→TTA) |
dgt → |
deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 176,864 | 0 | C | T | 7.7%
| 910.5
/ 46.2
| 272 | L381L (CTA→TTA) | dgt | deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/139); new base T (12/9); total (124/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.62e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
AGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAG > CP009273/176715‑177011
|
aGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGc < 2:2806608/150‑1 (MQ=255)
gTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCt > 2:1280306/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCt < 1:3570571/150‑1 (MQ=255)
gTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCt > 1:1415066/1‑150 (MQ=255)
ttttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCta > 1:2790279/1‑150 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat > 1:2892029/1‑150 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat < 2:1524472/150‑1 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat < 2:3459645/150‑1 (MQ=255)
tATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATaa < 1:677995/150‑1 (MQ=255)
tATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAt > 2:4270873/1‑150 (MQ=255)
tATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAt > 2:2236481/1‑150 (MQ=255)
tATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAt > 2:2235960/1‑150 (MQ=255)
tttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGt < 2:3179542/150‑1 (MQ=255)
tttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGt < 1:3274272/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 1:3728204/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 2:4051931/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 2:1798743/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 1:91138/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATGTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc > 1:3723009/1‑150 (MQ=255)
tACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCg < 2:1742818/150‑1 (MQ=255)
cGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCt < 1:2167144/150‑1 (MQ=255)
ggTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGt > 2:4080128/1‑150 (MQ=255)
ggTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGt > 1:1110686/1‑150 (MQ=255)
ggTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGt > 1:4261032/1‑150 (MQ=255)
gTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTa > 2:3396579/1‑150 (MQ=255)
tAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTaa < 1:328772/150‑1 (MQ=255)
tAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTaa > 2:195775/1‑150 (MQ=255)
acacCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGACTGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAAc > 2:3072514/1‑150 (MQ=255)
cTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACAtgtg < 2:1708716/150‑1 (MQ=255)
aaataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGtt > 1:2229200/1‑150 (MQ=255)
aaataaaCTGGTACCCTACGCGGCAAAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGtt > 1:4434596/1‑150 (MQ=255)
ataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTa < 2:1071640/150‑1 (MQ=255)
aaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGcc > 1:3581432/1‑150 (MQ=255)
gTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCa < 2:844912/150‑1 (MQ=255)
tACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTGTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAg > 2:225656/1‑150 (MQ=255)
tACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAg < 1:445214/150‑1 (MQ=255)
ccTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATg > 1:409837/1‑150 (MQ=255)
cTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGt < 1:3495890/150‑1 (MQ=255)
aCGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCg < 1:2709269/150‑1 (MQ=255)
gcgGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAg < 2:3276325/150‑1 (MQ=255)
ggCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCg > 1:1405886/1‑150 (MQ=255)
ggCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCg > 2:160914/1‑150 (MQ=255)
caACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCtt < 1:2026966/150‑1 (MQ=255)
aaCGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTg < 2:372449/150‑1 (MQ=255)
aCGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGa < 2:2606656/150‑1 (MQ=255)
cGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGaa < 1:191987/150‑1 (MQ=255)
gATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAAt > 2:2043196/1‑150 (MQ=255)
gATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAAt < 2:4435367/150‑1 (MQ=255)
tttatttaTAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTg < 2:2790268/150‑1 (MQ=255)
tttatttaTAATCTGCCTGCGATTTTCGACGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCTGATGTCGTGCGGCTTGAATTg > 2:1452074/1‑150 (MQ=255)
aTTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTATTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAg > 1:4030691/1‑150 (MQ=255)
tttaTAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAAATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAgg > 1:1126295/4‑150 (MQ=255)
aTCTGCGTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATc > 2:3664275/1‑150 (MQ=255)
tgcctgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTATTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCggg < 2:214053/150‑1 (MQ=255)
cctgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTc > 2:1005318/1‑150 (MQ=255)
ctgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCa < 2:2511870/150‑1 (MQ=255)
tgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCAt < 2:673828/150‑1 (MQ=255)
gATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAg < 1:1748678/150‑1 (MQ=255)
aTTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGc < 1:3506836/150‑1 (MQ=255)
aTTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGc < 2:4366563/150‑1 (MQ=255)
ttttCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCg < 2:732977/150‑1 (MQ=255)
gCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGatta < 2:2313155/150‑1 (MQ=255)
ccGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGattat < 2:1189629/150‑1 (MQ=255)
ggAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGAttatta < 2:3627606/150‑1 (MQ=255)
ggAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGAttatta > 2:2990390/1‑150 (MQ=255)
tttAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGAtt < 2:2444263/150‑1 (MQ=255)
tttAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGAtt < 2:2904432/150‑1 (MQ=255)
aaTCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTAt < 1:2656627/150‑1 (MQ=255)
aTCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATc < 1:97723/150‑1 (MQ=255)
aTCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATc < 1:1511911/150‑1 (MQ=255)
aTCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATc < 1:577755/150‑1 (MQ=255)
cATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGt < 2:3792642/150‑1 (MQ=255)
gCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCt < 1:3660841/150‑1 (MQ=255)
gCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCt < 1:2989631/150‑1 (MQ=255)
cATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCtt < 1:1253655/150‑1 (MQ=255)
ttattGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTtta < 1:2370589/150‑1 (MQ=255)
ttGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTttatta > 1:1452993/1‑150 (MQ=255)
ttGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTttatta > 1:546298/1‑150 (MQ=255)
ggAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAg > 2:1713100/1‑150 (MQ=255)
ggAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAg < 1:2501225/150‑1 (MQ=255)
aaGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGcc < 2:2949796/150‑1 (MQ=255)
gCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCg > 2:1741060/1‑150 (MQ=255)
cAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGtt < 2:4182205/150‑1 (MQ=255)
cAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGtt < 2:1710134/150‑1 (MQ=255)
aGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTa > 2:804952/1‑150 (MQ=255)
aGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTa > 2:460805/1‑150 (MQ=255)
cGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTCTCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATc > 2:975476/1‑150 (MQ=255)
aTGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGa < 2:2899701/150‑1 (MQ=255)
cGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTAc > 1:3587620/1‑150 (MQ=255)
gATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACt < 1:4270480/150‑1 (MQ=255)
aTCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTg > 2:3448525/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTg < 2:2815402/150‑1 (MQ=255)
aTCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTg < 2:2424076/150‑1 (MQ=255)
tcttctTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGa > 1:1370504/1‑150 (MQ=255)
tcttAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACt < 1:765305/150‑1 (MQ=255)
cttAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTg > 2:603275/1‑150 (MQ=255)
aaGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGCTTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTa > 2:4260988/1‑150 (MQ=255)
aaGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTa > 1:3587453/1‑150 (MQ=255)
aGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAg > 2:3999609/1‑150 (MQ=255)
aGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAg > 1:3405304/1‑150 (MQ=255)
|
AGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAG > CP009273/176715‑177011
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
