Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F181 I0 R1
|
1262 |
323.1 |
10297870 |
97.5% |
10040423 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
176,864 |
C→T |
15.5% |
L381L (CTA→TTA) |
dgt → |
deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 176,864 | 0 | C | T | 15.5%
| 816.3
/ 125.2
| 284 | L381L (CTA→TTA) | dgt | deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (106/134); new base T (26/18); total (132/152) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.28e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
GTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAGAA > CP009273/176716‑177013
|
ttttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCta > 2:950158/1‑150 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat > 1:1097653/1‑150 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTtatat < 1:1743709/150‑1 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat > 1:3801974/1‑150 (MQ=255)
tATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATaa < 1:2601248/150‑1 (MQ=255)
aTGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATaaa > 2:3406759/1‑150 (MQ=255)
tATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCATCGATCTTCTTAAGCTATCTaagaaa > 2:1929418/1‑149 (MQ=255)
tttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGt > 1:1138070/1‑150 (MQ=255)
tACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCg < 2:2437132/150‑1 (MQ=255)
aCGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGc > 2:2740901/1‑150 (MQ=255)
cGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCt > 2:668326/1‑150 (MQ=255)
cGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCt > 1:2441629/1‑150 (MQ=255)
cGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCt < 1:2821208/150‑1 (MQ=255)
cGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCt < 1:4107077/150‑1 (MQ=255)
aaaCACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTaaa > 1:203292/1‑150 (MQ=255)
aaCACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTaaaa > 1:1944772/1‑150 (MQ=255)
cacCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACa < 1:3171345/150‑1 (MQ=255)
cacCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACa > 2:1805684/1‑150 (MQ=255)
cacCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCAAATCGAATTATTGATAATCTGCCTGAGATATTCGCCGGAACTGTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACa > 2:2403605/1‑150 (MQ=255)
taaataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATgtgt < 1:1261495/150‑1 (MQ=255)
taaataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATgtgt > 1:444352/1‑150 (MQ=255)
aaataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGtt > 1:2173632/1‑150 (MQ=255)
aataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGttt < 1:5044846/150‑1 (MQ=255)
ataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTa < 2:3871779/150‑1 (MQ=255)
taaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAg > 2:1996031/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGc > 2:787374/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTACCCTACGCGACACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCa < 1:4608065/150‑1 (MQ=255)
cTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCAt > 2:1013390/1‑150 (MQ=255)
tGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATc < 1:347802/150‑1 (MQ=255)
ggTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATcc < 2:614742/150‑1 (MQ=255)
ggTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATcc < 2:446432/150‑1 (MQ=255)
ggTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATcc > 2:1181778/1‑150 (MQ=255)
gTACCCTACGCGGCACATCGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGATCGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTTTATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATcta < 2:2348136/150‑3 (MQ=255)
gTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCa < 2:43635/150‑1 (MQ=255)
tACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAg > 1:1515874/1‑150 (MQ=255)
ccTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATg > 2:2709316/1‑150 (MQ=255)
tACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTc > 2:3528935/1‑150 (MQ=255)
gcgGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAg < 2:4307097/150‑1 (MQ=255)
gcgGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAg < 2:2771582/150‑1 (MQ=255)
gCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCgg < 2:1651145/150‑1 (MQ=255)
gCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCgg > 1:2907750/1‑150 (MQ=255)
gCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCgg < 2:1412274/150‑1 (MQ=255)
caACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCtt < 1:2292061/150‑1 (MQ=255)
aCGATTTATTGATCATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGa < 1:3604736/150‑1 (MQ=255)
atttatttATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAAtt > 2:4093882/1‑150 (MQ=255)
tttATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTg > 2:324636/1‑150 (MQ=255)
aTAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCt > 1:3215333/1‑150 (MQ=255)
aTCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATc < 1:2412224/150‑1 (MQ=255)
cctgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTc > 1:1215253/1‑150 (MQ=255)
ctgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCa < 2:882461/150‑1 (MQ=255)
tgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCAt < 2:1234432/150‑1 (MQ=255)
tgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCAt < 1:4958920/150‑1 (MQ=255)
tgcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCAt > 1:4337449/1‑150 (MQ=255)
gcGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCAtt > 1:4830599/1‑150 (MQ=255)
aTTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGc > 2:4493788/1‑150 (MQ=255)
ttCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGTGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGa < 2:2933872/150‑1 (MQ=255)
cGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGatt < 2:2232502/150‑1 (MQ=255)
gCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGatta < 2:282839/150‑1 (MQ=255)
ggAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATTTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGAttatta < 1:778643/150‑1 (MQ=255)
ggAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATACAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGAttatta < 2:1781011/150‑1 (MQ=255)
aCGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTagag < 2:231096/150‑1 (MQ=255)
aCGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTagag < 2:761573/150‑1 (MQ=255)
aCGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTagag > 2:3385670/1‑150 (MQ=255)
aCGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTagag < 2:3061723/150‑1 (MQ=255)
tttAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGAtt < 2:5090277/150‑1 (MQ=255)
tttAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGAtt < 2:5090125/150‑1 (MQ=255)
tttAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGAtt > 1:639340/1‑150 (MQ=255)
aTCATGCATGATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTGAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATc < 2:2778949/150‑1 (MQ=255)
aTGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTc > 1:2640561/1‑150 (MQ=255)
aTGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTc < 2:4778653/150‑1 (MQ=255)
aTGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTc > 2:4546967/1‑150 (MQ=255)
tGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTcc < 2:3701572/150‑1 (MQ=255)
gCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCt > 2:1210464/1‑150 (MQ=255)
attattGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCttt < 1:4742043/150‑1 (MQ=255)
tattGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTttat < 1:2010938/150‑1 (MQ=255)
tattGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTttat > 2:4853054/1‑150 (MQ=255)
tgAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAg < 1:538859/149‑1 (MQ=255)
aGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCt < 1:3277942/150‑1 (MQ=255)
aTGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGt < 1:1472283/150‑1 (MQ=255)
aTGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGt < 2:4931516/150‑1 (MQ=255)
ccAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGt > 2:2491536/1‑150 (MQ=255)
cAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGtt > 2:3506592/1‑150 (MQ=255)
aGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTa > 2:1057871/1‑150 (MQ=255)
cGAATGCAGCGATATTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTATTACTTGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGATTTGCAGGGCTTTCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTTTCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATc < 1:4298148/150‑1 (MQ=255)
aTGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGa > 2:3316494/1‑150 (MQ=255)
aTGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGa < 1:3757720/150‑1 (MQ=255)
aTGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGa < 1:2016955/150‑1 (MQ=255)
gCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACt < 1:4901684/150‑1 (MQ=255)
cGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTAc > 2:3702058/1‑150 (MQ=255)
cGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGACATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTAc > 1:715078/1‑150 (MQ=255)
cGATCTACTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGACTGTCGTTATCAGACTTTAc > 1:4193417/1‑150 (MQ=255)
gATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACt < 1:2103036/150‑1 (MQ=255)
tcttctTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGa > 2:369131/1‑150 (MQ=255)
tcttAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACt > 1:911527/1‑150 (MQ=255)
tAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGt < 1:4697864/150‑1 (MQ=255)
aaGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTa > 1:3165120/1‑150 (MQ=255)
aaGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTa < 2:2134042/150‑1 (MQ=255)
aaGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTa < 1:2055464/150‑1 (MQ=255)
cTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAGaa > 2:1528368/1‑150 (MQ=255)
cTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAGaa < 2:2186741/150‑1 (MQ=255)
|
GTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGCTATCGGGTCATTAGCGGATTATTAGAGATTTATCGTCCTTTATTAAGCCTGTCGTTATCAGACTTTACTGAACTGGTAGAA > CP009273/176716‑177013
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
