Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
651,654 |
A→G |
9.0% |
intergenic (‑230/‑359) |
dcuC ← / → pagP |
anaerobic C4‑dicarboxylate transport/phospholipid:lipid A palmitoyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 651,654 | 0 | A | G | 9.0%
| 972.0
/ 64.3
| 310 | intergenic (‑230/‑359) | dcuC/pagP | anaerobic C4‑dicarboxylate transport/phospholipid:lipid A palmitoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (119/163); new base G (20/8); total (139/171) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
ATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAA > CP009273/651507‑651803
|
tGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAAtt < 1:964459/150‑1 (MQ=255)
tGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAAtt < 1:3390539/150‑1 (MQ=255)
tGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCaa > 2:2093577/1‑150 (MQ=255)
cTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATg < 2:96036/150‑1 (MQ=255)
cTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATg < 1:3675188/150‑1 (MQ=255)
cTGATTAAAATCAAGAAAAACTGACATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATg < 2:2814812/150‑1 (MQ=255)
tGATTAAAATCAATAAAAACTTCCATTAAGACATTGAAGTTTCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATgg < 2:1039979/150‑1 (MQ=255)
gATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGgt > 2:1842746/1‑150 (MQ=255)
aTTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGgtg > 2:2264049/1‑150 (MQ=255)
aTTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGgtg < 1:4129545/150‑1 (MQ=255)
ttAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGgtgt < 1:776145/150‑1 (MQ=255)
aaaaaCTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCt > 2:2171962/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCtgt < 2:1350997/150‑1 (MQ=255)
aaCTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCtgtg < 1:1085436/150‑1 (MQ=255)
cATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCa < 1:3109053/150‑1 (MQ=255)
aTTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCAAATTAAGAGTTTGGCAATTATCACATAATAATGTTTGCAAATTGATTGTGGATTGATGAAAATTTTTTAATTGCAATGGAGTTATATGCGGCTGTGCTCTCaa > 2:3128961/1‑150 (MQ=255)
aaGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCaaaaa > 2:560025/1‑150 (MQ=255)
aaGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCaaaaa < 1:1431105/150‑1 (MQ=255)
aaGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCaaaaa > 2:767013/1‑150 (MQ=255)
aaGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATAGCAATGGTGTTATCTGCGGCTGTGCTCTCaaaaa > 2:2955049/1‑150 (MQ=255)
gACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAaat > 1:3611557/1‑150 (MQ=255)
cATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAaataa > 1:4373295/1‑150 (MQ=255)
aTTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAaataat > 1:212558/1‑150 (MQ=255)
tGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCt > 1:4228079/1‑150 (MQ=255)
tGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCt > 1:1010530/1‑150 (MQ=255)
gAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTa < 2:1868033/150‑1 (MQ=255)
gAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTa < 2:3846917/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAata > 2:4522355/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAatat < 1:710270/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAatat < 1:710210/150‑1 (MQ=255)
gCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGa < 2:1919448/150‑1 (MQ=255)
cTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAg < 2:709945/150‑1 (MQ=255)
cTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAg < 1:1102164/150‑1 (MQ=255)
tGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGc < 1:1607550/150‑1 (MQ=255)
gTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCa > 1:4242706/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCa > 1:1250708/1‑150 (MQ=255)
tttttATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCAt > 2:1145350/1‑150 (MQ=255)
ttATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAgg < 1:2457387/150‑1 (MQ=255)
taCATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTg > 1:2305092/1‑150 (MQ=255)
taCATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTg < 2:4078334/150‑1 (MQ=255)
tAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGa > 2:3911929/1‑150 (MQ=255)
gATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGata < 1:2828811/150‑1 (MQ=255)
gATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGata > 2:140947/1‑150 (MQ=255)
aTAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGatat < 1:2899639/150‑1 (MQ=255)
aaCAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGatatat < 2:130199/150‑1 (MQ=255)
aaCAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGatatat > 2:4234506/1‑150 (MQ=255)
aaCAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGatatat < 2:2193153/150‑1 (MQ=255)
aCAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGatatata > 2:121837/1‑150 (MQ=255)
aaaaCGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATAtatatt < 1:3527667/150‑1 (MQ=255)
aaCGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATAtatattat > 1:3489451/1‑150 (MQ=255)
gCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATtatata < 1:2712560/150‑1 (MQ=255)
atatTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACt < 2:3328029/150‑1 (MQ=255)
ttAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGt < 1:3868558/150‑1 (MQ=255)
tAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGtt > 1:711386/1‑150 (MQ=255)
gTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAgat < 1:525716/150‑1 (MQ=255)
ttGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAgatg < 1:1321108/150‑1 (MQ=255)
tGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAgatga > 1:1495220/1‑150 (MQ=255)
tGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAgatga > 1:3760158/1‑150 (MQ=255)
gCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGAtt < 1:1529844/150‑1 (MQ=255)
cAATTATCTCATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGAttg < 2:4144695/150‑1 (MQ=255)
cAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGAttg < 2:763004/150‑1 (MQ=255)
aaTTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGAttgt > 1:3060685/1‑150 (MQ=255)
tATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATtgttgt > 2:3597879/1‑150 (MQ=255)
cacaTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtc < 2:2326894/150‑1 (MQ=255)
acaTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtct < 2:864505/150‑1 (MQ=255)
acaTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtct < 2:865036/150‑1 (MQ=255)
acaTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtct < 2:1203654/150‑1 (MQ=255)
caTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTTACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtctc < 1:2416690/150‑1 (MQ=255)
caTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtctc < 2:486668/150‑1 (MQ=255)
caTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtctc < 1:3296559/150‑1 (MQ=255)
caTAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtctc < 2:3092309/150‑1 (MQ=255)
ataatGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTa < 1:1972662/150‑1 (MQ=255)
taatGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTaa < 2:399097/150‑1 (MQ=255)
atGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTaaaa > 1:2256319/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTaaaaa < 2:595294/150‑1 (MQ=255)
gtgCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAaaaata < 1:3009827/150‑1 (MQ=255)
gCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAaaaataaa > 1:3090113/1‑150 (MQ=255)
gCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAaaaataaa > 2:3726396/1‑150 (MQ=255)
aaTTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAaaataaaata < 2:4362112/150‑1 (MQ=255)
aaTTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAaaataaaata < 1:2545566/150‑1 (MQ=255)
aaTTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAaaataaaata < 1:2581898/150‑1 (MQ=255)
aTTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAaataaaataa > 1:922121/1‑150 (MQ=255)
tGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTGATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAAtt > 2:3236114/1‑150 (MQ=255)
gtggATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTcc < 1:2295023/150‑1 (MQ=255)
tggATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACTATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCt < 2:3451455/150‑1 (MQ=255)
gATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTg < 1:2199276/150‑1 (MQ=255)
gATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTg < 1:3998087/150‑1 (MQ=255)
aTGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGc > 2:3516728/1‑150 (MQ=255)
aTGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGc < 2:1478044/150‑1 (MQ=255)
aTGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGc < 2:1478050/150‑1 (MQ=255)
cgCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCa > 1:2510852/2‑150 (MQ=255)
gCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCAt < 2:1637392/150‑1 (MQ=255)
gCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGAGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGTTTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCAt < 2:2070086/150‑1 (MQ=255)
aaaTTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCAttt < 2:2458568/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCAtttt > 1:652467/1‑150 (MQ=255)
tGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGtca > 1:4529391/1‑150 (MQ=255)
ttAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATATTCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGtcatc > 1:4462521/1‑150 (MQ=255)
tAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGtcatca < 1:766563/150‑1 (MQ=255)
tAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGtcatca < 1:1152128/150‑1 (MQ=255)
aaTTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCaa > 1:4324748/1‑150 (MQ=255)
|
ATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAA > CP009273/651507‑651803
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
