Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
672,142 |
T→A |
88.3% |
intergenic (‑139/‑25) |
ybeQ ← / → ybeR |
Sel1 family TPR‑like repeat protein/uncharacterized protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 672,142 | 0 | T | A | 88.3%
| 754.1
/ 76.3
| 257 | intergenic (‑139/‑25) | ybeQ/ybeR | Sel1 family TPR‑like repeat protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/18); new base A (121/106); total (133/124) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
AATCATTATCATTTCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGAC > CP009273/671998‑672286
|
aaTCATTATCATTTCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAAt > 2:1529778/1‑148 (MQ=255)
atcattatcattTCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATg < 2:3116998/148‑1 (MQ=255)
cattatcattTCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGaa < 2:3200684/148‑1 (MQ=255)
attTCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTaa > 1:2951551/1‑148 (MQ=255)
tttCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAg > 1:2400670/1‑148 (MQ=255)
tttCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAg > 1:1753837/1‑148 (MQ=255)
tCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGa < 1:3114710/148‑1 (MQ=255)
ccTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGAt > 1:1551903/1‑148 (MQ=255)
cTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATa < 1:1242285/148‑1 (MQ=255)
tATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATaaa > 2:3031607/1‑148 (MQ=255)
tATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATaaa > 2:2197851/1‑148 (MQ=255)
tGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAAtt < 1:343580/148‑1 (MQ=255)
tGCATATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCACAAAACTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTatat < 2:362160/148‑1 (MQ=255)
tGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTatat > 1:1876474/1‑148 (MQ=255)
tGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTatat < 2:2703536/148‑1 (MQ=255)
tGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTatat < 2:1052565/148‑1 (MQ=255)
aaaCATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATgg < 2:3035091/148‑1 (MQ=255)
aCATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAg > 2:392941/1‑148 (MQ=255)
cATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGt > 2:3256389/1‑148 (MQ=255)
cATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGt < 1:2534201/148‑1 (MQ=255)
atattatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTc > 2:1470554/1‑148 (MQ=255)
tattatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCg > 1:1197666/1‑148 (MQ=255)
attatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGc > 2:2737778/1‑148 (MQ=255)
attatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGc > 2:166032/1‑148 (MQ=255)
attatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGc > 1:2152655/1‑148 (MQ=255)
attatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGc > 1:1078954/1‑148 (MQ=255)
tatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCaa > 1:801498/1‑148 (MQ=255)
tatattTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCaa > 1:3219204/1‑148 (MQ=255)
tttttATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCaaaaaa > 1:2781021/1‑148 (MQ=255)
ttttATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAat > 1:761691/1‑148 (MQ=255)
aTGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTg > 1:1400643/1‑148 (MQ=255)
gtgtTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGtt < 2:1014253/148‑1 (MQ=255)
gtgtTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGtt > 2:489623/1‑148 (MQ=255)
tgtTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGttt < 1:1470554/148‑1 (MQ=255)
tgtTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGttt < 2:2103570/148‑1 (MQ=255)
gtTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTg < 1:508162/148‑1 (MQ=255)
ttCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGc > 1:1629080/1‑148 (MQ=255)
tCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCa > 1:3087863/1‑148 (MQ=255)
tCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCa < 1:2510199/148‑1 (MQ=255)
tCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATGATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCa > 1:907122/1‑148 (MQ=255)
ttttGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTc < 2:2024629/148‑1 (MQ=255)
tttGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTcc < 1:2026403/148‑1 (MQ=255)
tttGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTcc < 1:1368720/148‑1 (MQ=255)
tAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCg > 1:443433/1‑148 (MQ=255)
aaGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGa < 2:797521/148‑1 (MQ=255)
aGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGAt > 1:546796/1‑148 (MQ=255)
ttATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGaa < 2:1272050/148‑1 (MQ=255)
tATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGaaa > 1:1030217/1‑148 (MQ=255)
aTGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCa < 2:2647847/148‑1 (MQ=255)
gTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCaatga < 2:1197666/148‑1 (MQ=255)
attatGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCaatgaat > 2:1779785/1‑148 (MQ=255)
tatGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGc > 2:652455/1‑148 (MQ=255)
tatGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGACAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCAGATGGAAATACGCAATGAATGc < 2:2513195/148‑1 (MQ=255)
atGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCt > 1:2362814/1‑148 (MQ=255)
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gTCGCGTCAGAAAATTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGt < 2:1131277/148‑1 (MQ=255)
gTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGt > 2:2529119/1‑148 (MQ=255)
tCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGtt < 1:3155621/148‑1 (MQ=255)
tCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACTCAATGAATGCTGtt > 2:2801776/1‑148 (MQ=255)
gcgTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTa > 1:2132869/1‑148 (MQ=255)
gTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTAcc < 2:1617779/148‑1 (MQ=255)
tCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCt < 1:2936597/148‑1 (MQ=255)
cAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCtt > 1:2179886/1‑148 (MQ=255)
aaaaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGc > 2:692429/1‑148 (MQ=255)
aaaaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGc > 2:2491723/1‑148 (MQ=255)
aaaaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGc > 2:241264/1‑148 (MQ=255)
aaaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCa > 2:1951693/1‑148 (MQ=255)
aaaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCa < 1:1336725/148‑1 (MQ=255)
aaaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCa < 1:3029417/148‑1 (MQ=255)
aaaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCa > 2:1088312/1‑148 (MQ=255)
aaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCAt < 1:489206/148‑1 (MQ=255)
aaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCAt < 1:1693340/148‑1 (MQ=255)
aaGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCAt < 1:1556044/148‑1 (MQ=255)
aGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCAtt < 1:3054660/148‑1 (MQ=255)
taaataaaCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGACATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATtcatc > 1:1973220/1‑148 (MQ=255)
ataaaCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCAcc > 1:3205921/1‑148 (MQ=255)
ataaaCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCAcc > 2:445352/1‑148 (MQ=255)
taaaCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCAccc > 2:2818681/1‑148 (MQ=255)
taaaCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCAccc < 2:2764251/148‑1 (MQ=255)
aaaCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCa > 2:22526/1‑148 (MQ=255)
aCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCaaa < 2:860014/148‑1 (MQ=255)
aCGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCaaa < 1:1172879/148‑1 (MQ=255)
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aGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATg > 2:1003015/1‑148 (MQ=255)
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CTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAA > SRR19973070.1572547/1‑150 (MQ=60)
CTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAA > SRR19973070.3217259/1‑150 (MQ=60)
CTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAA > SRR19973070.1037509/1‑150 (MQ=60)
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TTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCT > SRR19973070.2378787/1‑150 (MQ=60)
TTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCT > SRR19973070.2378448/1‑150 (MQ=60)
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TCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTA < SRR19973070.554219/150‑1 (MQ=60)
TCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTA > SRR19973070.2147121/1‑150 (MQ=60)
GTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTT > SRR19973070.2194314/1‑150 (MQ=60)
TCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTC < SRR19973070.2955527/150‑1 (MQ=60)
CAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCG > SRR19973070.488819/1‑150 (MQ=60)
GAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCA < SRR19973070.1678560/150‑1 (MQ=60)
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TATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGACATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATC > SRR19973070.1986559/1‑150 (MQ=60)
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ATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCA > SRR19973070.1514962/1‑150 (MQ=60)
ATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCA < SRR19973070.1557955/150‑1 (MQ=60)
AAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACC > SRR19973070.3226658/1‑150 (MQ=60)
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CGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATG > SRR19973070.2487033/1‑150 (MQ=60)
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GAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGT > SRR19973070.3128152/1‑150 (MQ=60)
CCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTAAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATT > SRR19973070.3239789/1‑150 (MQ=60)
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TGAAAATCATTATCATTTCCTTATGGTTGCAGATAAAACATATTATATTTTTATGTGTTCCATTTTTGCGTAAGCCTTATTTTATGCGTATTATGTCGCGTCAGAAAAGTATAAATAAACGAGCCTCGCAATGCGGCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTT > CP009273/671994‑672290
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |