Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
729,456 |
G→A |
100% |
R75R (AGG→AGA) |
ybfB → |
putative membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 729,456 | 0 | G | A | 95.3%
| 817.7
/ 23.6
| 256 | R75R (AGG→AGA) | ybfB | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/5); new base A (88/155); total (95/161) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATT > CP009273/729313‑729600
|
cACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGa < 1:927248/148‑1 (MQ=255)
aCTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGAt < 2:2051565/148‑1 (MQ=255)
aCTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGAt < 2:3424979/148‑1 (MQ=255)
cTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATa > 1:667729/1‑148 (MQ=255)
aTTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATagt > 1:2032223/1‑148 (MQ=255)
ttAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATagta > 1:1719325/1‑148 (MQ=255)
tAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATagtaa < 2:1994378/148‑1 (MQ=255)
aCTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATagtaagta < 2:2292427/148‑1 (MQ=255)
cTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGtat < 1:682841/148‑1 (MQ=255)
ccACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTatat > 1:2237635/1‑148 (MQ=255)
cTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTAtattat < 2:1575051/148‑1 (MQ=255)
tCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATg < 2:749391/148‑1 (MQ=255)
tCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATg < 2:2337999/148‑1 (MQ=255)
tCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATg < 2:2189293/148‑1 (MQ=255)
tGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCg > 2:2685685/1‑148 (MQ=255)
aTGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGat > 1:565067/1‑148 (MQ=255)
tgAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGataat < 2:896328/148‑1 (MQ=255)
gCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGataataat > 2:518709/1‑148 (MQ=255)
gCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGataataat < 2:522034/148‑1 (MQ=255)
gAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAatat < 1:1887939/148‑1 (MQ=255)
ttAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGc > 1:3435430/1‑148 (MQ=255)
tAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCt > 2:188334/1‑148 (MQ=255)
tAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCt > 2:1666668/1‑148 (MQ=255)
aTTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCttt < 1:2877452/148‑1 (MQ=255)
aTTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCttt > 2:952883/1‑148 (MQ=255)
tAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTAt < 1:3279806/148‑1 (MQ=255)
ttATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCagga < 1:621233/148‑1 (MQ=255)
tATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCaggag < 2:2612087/148‑1 (MQ=255)
ggAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGt > 2:3209801/1‑148 (MQ=255)
tgatgGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTatat > 2:1875057/1‑148 (MQ=255)
gatgTTAATATTTTTTCCAACAGGAATATTATTATTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATAtt < 1:1107594/148‑1 (MQ=255)
atgGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTc > 1:2704001/1‑148 (MQ=255)
ggTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCaa > 1:2162053/1‑148 (MQ=255)
atatGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGt < 2:1651468/148‑1 (MQ=255)
ttttCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTa > 2:3382632/1‑148 (MQ=255)
tttCCAACTGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTTAGTATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTAt < 1:2956187/148‑1 (MQ=255)
tttCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGt > 2:1481243/1‑142 (MQ=255)
cAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATtaag < 1:1535763/148‑1 (MQ=255)
cAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATtaagtaa < 2:893648/148‑1 (MQ=255)
cATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAgcgc < 1:1929532/148‑1 (MQ=255)
aTAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCa > 1:3194282/1‑148 (MQ=255)
aTAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCa < 1:90097/148‑1 (MQ=255)
aTAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCATAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCa < 1:1456866/148‑1 (MQ=255)
aGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCAtt > 2:3155605/1‑148 (MQ=255)
gTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATta > 2:730392/1‑148 (MQ=255)
gTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATta < 2:1294994/148‑1 (MQ=255)
aTTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATtata > 2:3075203/1‑148 (MQ=255)
aTTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATtata < 1:886663/148‑1 (MQ=255)
ttatttATTGCTCTAATATTTATAGGGACTTTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATaa < 1:1328245/145‑1 (MQ=255)
ttCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATaa < 1:1281700/148‑1 (MQ=255)
ttCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATaa > 1:913300/1‑148 (MQ=255)
ttCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATaa > 2:1121052/1‑148 (MQ=255)
tCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATaaa > 1:2824492/1‑148 (MQ=255)
tCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATaaa < 1:2771450/148‑1 (MQ=255)
cTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAAc < 2:1129232/148‑1 (MQ=255)
cTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAAc > 2:1005598/1‑148 (MQ=255)
aTTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACaaat > 2:3467866/1‑148 (MQ=255)
aTTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACaaat < 1:2193636/148‑1 (MQ=255)
tctctAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACaaataaa < 1:3278196/147‑1 (MQ=255)
tctAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAAtt < 2:1591060/148‑1 (MQ=255)
tctAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAAtt > 1:1624494/1‑148 (MQ=255)
tctAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAAtt < 2:3083809/148‑1 (MQ=255)
tAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTaa < 1:2453560/148‑1 (MQ=255)
tAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTaa < 2:3514447/148‑1 (MQ=255)
aaTATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAg > 1:1612879/1‑148 (MQ=255)
atatTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGt < 1:1320296/148‑1 (MQ=255)
tatTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGtt < 2:1073827/148‑1 (MQ=255)
tttATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGttca < 2:1954374/148‑3 (MQ=255)
tttATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTaa < 1:83219/148‑1 (MQ=255)
tttATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTaa < 2:1484134/148‑1 (MQ=255)
tttATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTaa < 2:656756/148‑1 (MQ=255)
ttATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAAt > 2:3008377/1‑148 (MQ=255)
ttATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAAt < 1:109824/148‑1 (MQ=255)
taGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGc > 1:364452/1‑148 (MQ=255)
taGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGc < 2:2071080/148‑1 (MQ=255)
gggACTGTATCAGACATGATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGctc < 1:1012115/148‑1 (MQ=255)
gACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCtt < 1:2919005/148‑1 (MQ=255)
gTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCNGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCCTTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCttatta < 1:1801382/148‑1 (MQ=255)
gTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCttatta < 2:698398/148‑1 (MQ=255)
tATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCttattat < 2:2952841/148‑1 (MQ=255)
aTCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCttattatt < 1:1409054/148‑1 (MQ=255)
aTCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCttattatt < 2:3435430/148‑1 (MQ=255)
tCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCttattatta < 1:1666557/148‑1 (MQ=255)
cAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTtattattat < 2:2905015/148‑1 (MQ=255)
cAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTtattattat < 1:2149478/148‑1 (MQ=255)
aCATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATg > 2:3547148/1‑148 (MQ=255)
cATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGTGTATAATCAATGGATTGTATTAAGTAATCGCATTATAAACAAATAAATTAATTTAATTGCTCTTATTATTATATGt > 1:3333974/1‑148 (MQ=255)
attattGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTa < 2:1773813/148‑1 (MQ=255)
tattGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAAc < 1:2149273/148‑1 (MQ=255)
tattGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAAc > 2:3097309/1‑148 (MQ=255)
tattGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAAc > 2:1324751/1‑148 (MQ=255)
ttGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCt > 2:3450325/1‑148 (MQ=255)
ttGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCt < 2:565067/148‑1 (MQ=255)
tGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTg < 2:2619001/148‑1 (MQ=255)
tGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTg > 2:1255289/1‑148 (MQ=255)
tGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTg < 1:2685543/148‑1 (MQ=255)
tGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCAGTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTg < 2:2237635/148‑1 (MQ=255)
gCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTggg > 2:2022860/1‑148 (MQ=255)
gCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTggg > 1:1622085/1‑148 (MQ=255)
aaGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCAtt < 1:3186897/148‑1 (MQ=255)
|
TCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATT > CP009273/729313‑729600
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGACTTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATAT > CP009273/729307‑729605
|
AGACTTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGA < SRR19973067.262756/150‑1 (MQ=60)
ACTTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAAT < SRR19973067.1491546/150‑1 (MQ=60)
CTTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATT < SRR19973067.3514389/150‑1 (MQ=60)
CTTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATT < SRR19973067.1417694/150‑1 (MQ=60)
CTTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCCAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATT < SRR19973067.1744748/150‑1 (MQ=60)
TTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTG > SRR19973067.14840/1‑150 (MQ=60)
TCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGAT < SRR19973067.2769105/150‑1 (MQ=60)
CACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATA > SRR19973067.672297/1‑150 (MQ=60)
CACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATA < SRR19973067.933509/150‑1 (MQ=60)
CTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGT > SRR19973067.2045844/1‑150 (MQ=60)
TATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTA > SRR19973067.1731103/1‑150 (MQ=60)
GACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTAT < SRR19973067.1714730/150‑1 (MQ=60)
CTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATAT < SRR19973067.687626/150‑1 (MQ=60)
CTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATAT < SRR19973067.687531/150‑1 (MQ=60)
CTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATAT < SRR19973067.2245321/150‑1 (MQ=60)
CTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATAT > SRR19973067.2252518/1‑150 (MQ=60)
CACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTAT < SRR19973067.3216576/150‑1 (MQ=60)
CTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGG < SRR19973067.174990/150‑1 (MQ=60)
CGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCG < SRR19973067.294375/150‑1 (MQ=60)
GTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGA > SRR19973067.282756/1‑150 (MQ=60)
TGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGAT > SRR19973067.568747/1‑150 (MQ=60)
GAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTACTATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAAGATGG > SRR19973067.2191160/1‑150 (MQ=60)
GAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGG < SRR19973067.1900829/150‑1 (MQ=60)
GAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGG > SRR19973067.388927/1‑150 (MQ=60)
GAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGG < SRR19973067.93097/150‑1 (MQ=60)
AGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGC > SRR19973067.3457303/1‑150 (MQ=60)
TAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTT < SRR19973067.321873/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTAT < SRR19973067.2895967/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTAT < SRR19973067.2895861/150‑1 (MQ=60)
ATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTAT > SRR19973067.1326339/1‑150 (MQ=60)
TAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTT < SRR19973067.3300367/150‑1 (MQ=60)
TAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTT < SRR19973067.3300215/150‑1 (MQ=60)
GTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTC > SRR19973067.2334323/1‑150 (MQ=60)
GTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTC < SRR19973067.1436741/150‑1 (MQ=60)
CTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTG < SRR19973067.918775/150‑1 (MQ=60)
TCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGT < SRR19973067.3035154/150‑1 (MQ=60)
TCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGT < SRR19973067.3339550/150‑1 (MQ=60)
CTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAG < SRR19973067.2226621/150‑1 (MQ=60)
TTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGG < SRR19973067.624772/150‑1 (MQ=60)
TTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGG < SRR19973067.625332/150‑1 (MQ=60)
TTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGG < SRR19973067.625719/150‑1 (MQ=60)
GAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATA < SRR19973067.2884499/150‑1 (MQ=60)
AATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATAT < SRR19973067.2714368/150‑1 (MQ=60)
TGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTC > SRR19973067.2721413/1‑150 (MQ=60)
GATGTTAATATTTTTTCCAACAGGAATATTATTATTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCA < SRR19973067.1115118/150‑1 (MQ=60)
GATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCA < SRR19973067.1115058/150‑1 (MQ=60)
GATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCA < SRR19973067.1115055/150‑1 (MQ=60)
ATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAA > SRR19973067.1930441/1‑150 (MQ=60)
ATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAA > SRR19973067.2176507/1‑150 (MQ=60)
ATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAA > SRR19973067.2176334/1‑150 (MQ=60)
GTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGG > SRR19973067.1379238/1‑150 (MQ=60)
GTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGG > SRR19973067.1379570/1‑150 (MQ=60)
ATCTGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTT < SRR19973067.1491075/150‑1 (MQ=60)
TTTCCAACTGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTTAGTATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTA < SRR19973067.2974878/150‑1 (MQ=60)
CAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTA < SRR19973067.1546748/150‑1 (MQ=60)
CAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTA < SRR19973067.1546162/150‑1 (MQ=60)
AACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAA > SRR19973067.1133239/1‑150 (MQ=60)
AACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAA > SRR19973067.703224/1‑150 (MQ=60)
ACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACTTTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAG < SRR19973067.1331175/150‑1 (MQ=60)
ACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAG < SRR19973067.95361/150‑1 (MQ=60)
GGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGC > SRR19973067.1896608/1‑150 (MQ=60)
GGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGC > SRR19973067.84542/1‑150 (MQ=60)
GCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCA > SRR19973067.3214259/1‑150 (MQ=60)
GCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCA > SRR19973067.3214445/1‑150 (MQ=60)
CATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCAT < SRR19973067.1942700/150‑1 (MQ=60)
ATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATT < SRR19973067.975184/150‑1 (MQ=60)
ATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATT < SRR19973067.91254/150‑1 (MQ=60)
ATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATT < SRR19973067.91062/150‑1 (MQ=60)
ATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCATAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATT < SRR19973067.1466618/150‑1 (MQ=60)
TATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAA > SRR19973067.919382/1‑150 (MQ=60)
ATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAA < SRR19973067.892670/150‑1 (MQ=60)
ATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAA > SRR19973067.2842664/1‑150 (MQ=60)
ATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAA < SRR19973067.892548/150‑1 (MQ=60)
TTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAAC < SRR19973067.1290609/150‑1 (MQ=60)
TTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAAC < SRR19973067.1290431/150‑1 (MQ=60)
TTATTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTTTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAAC < SRR19973067.1337305/150‑1 (MQ=60)
TCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACA < SRR19973067.2789351/150‑1 (MQ=60)
ATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAA < SRR19973067.2208272/150‑1 (MQ=60)
ATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAA > SRR19973067.1585852/1‑150 (MQ=60)
ATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAA > SRR19973067.1946186/1‑150 (MQ=60)
ATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAA < SRR19973067.407019/150‑1 (MQ=60)
TCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATT < SRR19973067.3298725/150‑1 (MQ=60)
GCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATT < SRR19973067.840501/150‑1 (MQ=60)
GCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATT < SRR19973067.3298726/150‑1 (MQ=60)
GCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATT > SRR19973067.1635639/1‑150 (MQ=60)
GCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATT > SRR19973067.1635632/1‑150 (MQ=60)
CTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAG > SRR19973067.3395913/1‑150 (MQ=60)
CTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAG > SRR19973067.1623978/1‑150 (MQ=60)
CTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAG > SRR19973067.1623950/1‑150 (MQ=60)
TAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGT < SRR19973067.675567/150‑1 (MQ=60)
TAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGT > SRR19973067.2164472/1‑150 (MQ=60)
TAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGT < SRR19973067.2469689/150‑1 (MQ=60)
ATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTA < SRR19973067.1329309/150‑1 (MQ=60)
ATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAAT > SRR19973067.2671313/1‑150 (MQ=60)
ATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAAT < SRR19973067.2507656/150‑1 (MQ=60)
TTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATT < SRR19973067.84127/150‑1 (MQ=60)
TTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTG < SRR19973067.110888/150‑1 (MQ=60)
TATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGC > SRR19973067.366881/1‑150 (MQ=60)
TATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGC > SRR19973067.366985/1‑150 (MQ=60)
ATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTAATTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCT < SRR19973067.2834693/150‑1 (MQ=60)
GGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTT < SRR19973067.649795/150‑1 (MQ=60)
GGGACTGTATCAGACATGATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTT < SRR19973067.1019065/150‑1 (MQ=60)
GACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTAT < SRR19973067.2007601/150‑1 (MQ=60)
GACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTAT > SRR19973067.2163045/1‑150 (MQ=60)
GACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTAT < SRR19973067.2937572/150‑1 (MQ=60)
ACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATT < SRR19973067.2905655/150‑1 (MQ=60)
CTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTA < SRR19973067.1034861/150‑1 (MQ=60)
GTATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCNGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCCTTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATT < SRR19973067.1813494/150‑1 (MQ=60)
ATCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTAT < SRR19973067.1418598/150‑1 (MQ=60)
TCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATA < SRR19973067.1677881/150‑1 (MQ=60)
TCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATA < SRR19973067.1678050/150‑1 (MQ=60)
TCAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATA < SRR19973067.1678163/150‑1 (MQ=60)
CAGACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATAT < SRR19973067.2163847/150‑1 (MQ=60)
GACATTATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGTGTATAATCAATGGATTGTATTAAGTAATCGCATTATAAACAAATAAATTAATTTAATTGCTCTTATTATTATATGT > SRR19973067.3355074/1‑150 (MQ=60)
ATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAAC < SRR19973067.2163041/150‑1 (MQ=60)
TATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCT < SRR19973067.2163698/150‑1 (MQ=60)
TATTGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCT < SRR19973067.2163640/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGG < SRR19973067.2702914/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGG < SRR19973067.2702769/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGG > SRR19973067.1633238/1‑150 (MQ=60)
TGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGG > SRR19973067.1633218/1‑150 (MQ=60)
TGGCGTAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGG < SRR19973067.1838118/150‑1 (MQ=60)
TAAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTG < SRR19973067.3438191/150‑1 (MQ=60)
AAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGA < SRR19973067.3206989/150‑1 (MQ=60)
AAGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGA < SRR19973067.3207044/150‑1 (MQ=60)
AGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGAT < SRR19973067.2843333/150‑1 (MQ=60)
AGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGAT < SRR19973067.1647365/150‑1 (MQ=60)
AGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGAT < SRR19973067.3489905/150‑1 (MQ=60)
AGAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGAT < SRR19973067.1647371/150‑1 (MQ=60)
GAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATA < SRR19973067.1012504/150‑1 (MQ=60)
GAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATA > SRR19973067.895647/1‑150 (MQ=60)
GAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATA < SRR19973067.1751879/150‑1 (MQ=60)
GAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATA > SRR19973067.2660594/1‑150 (MQ=60)
GAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATA < SRR19973067.3108810/150‑1 (MQ=60)
GAATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATA < SRR19973067.3559720/150‑1 (MQ=60)
AATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATAT < SRR19973067.3299304/150‑1 (MQ=60)
AATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATAT < SRR19973067.3299311/150‑1 (MQ=60)
|
AGACTTTCACTATTAGACTCCACTCGTGATGTGAGCGAGTTAATTAGTCTCATGTCTTATGGAATGATGGTAATATGTTTTCCAACAGGCATAGTATTCTTTATTGCTCTAATATTTATAGGGACTGTATCAGACATTATTGGCGTAAGGATTGATAGTAAGTATATTATGGCGATAATAATATGGCTTTATTTTCTGTCAGGAGGGTATATTCAATGGTTTGTATTAAGTAAGCGCATTATAAACAAATAAATTAAGTTAATTGCTCTTATTATTATATGTAACCTGGGCATTGATAT > CP009273/729307‑729605
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
