Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,146,949 |
T→A |
48.4% |
intergenic (+89/‑122) |
fabG → / → acpP |
3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase/acyl carrier protein (ACP) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,146,949 | 0 | T | A | 48.4%
| 24.1
/ inf
| 217 | intergenic (+89/‑122) | fabG/acpP | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase/acyl carrier protein (ACP) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/50); new base A (63/42); total (125/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
AAGCAGCTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAA > CP009273/1146802‑1147096
|
aaGCAGCTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGt > 2:1745322/1‑148 (MQ=255)
cagcTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAg > 2:354069/1‑148 (MQ=255)
gcTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGc < 1:1974568/148‑1 (MQ=255)
cTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGTGGGGAAAGGcc > 1:1751810/1‑148 (MQ=255)
ttACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCt < 1:392754/148‑1 (MQ=255)
aCATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCa > 2:1405136/1‑148 (MQ=255)
cATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCaa > 2:2732756/1‑148 (MQ=255)
aTCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCaaa < 1:1673680/148‑1 (MQ=255)
cACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAAt > 2:439913/1‑148 (MQ=255)
aCGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATa < 2:1683823/148‑1 (MQ=255)
ggTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACg < 1:2830340/148‑1 (MQ=255)
ggTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACg < 1:2036409/148‑1 (MQ=255)
ggTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACg < 1:1585682/148‑1 (MQ=255)
aaaCTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTaaa > 2:160615/1‑148 (MQ=255)
aaaCTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTaaa > 1:2177505/1‑148 (MQ=255)
ttGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTCAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGt > 2:781865/1‑148 (MQ=255)
gAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGAc < 1:1256154/148‑1 (MQ=255)
gAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTAGGAGTAATAAGTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGAc < 1:3179352/148‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCt < 2:2176008/148‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCt > 1:2054519/1‑148 (MQ=255)
cggcggGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTg < 2:1917774/148‑1 (MQ=255)
gcggGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGcc > 2:1142236/1‑148 (MQ=255)
gcggGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGcc > 1:1091071/1‑148 (MQ=255)
ggATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCggg > 1:665570/1‑148 (MQ=255)
gATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGa < 1:1952457/148‑1 (MQ=255)
aTGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAt < 2:3258102/148‑1 (MQ=255)
tGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAtt > 1:2227917/1‑148 (MQ=255)
cATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGt < 2:3037802/148‑1 (MQ=255)
cATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGt < 2:3271723/148‑1 (MQ=255)
cATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGt < 1:2455904/148‑1 (MQ=255)
ggTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGc > 1:2049261/1‑148 (MQ=255)
gTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCa > 1:2698507/1‑148 (MQ=255)
cTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCaaa > 1:2381987/1‑148 (MQ=255)
cTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCaaa > 2:2012099/1‑148 (MQ=255)
cTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCaaa > 2:2156722/1‑148 (MQ=255)
tGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAAt < 1:2365074/148‑1 (MQ=255)
aCCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAAttt < 1:559349/148‑1 (MQ=255)
gcgATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTc > 1:1506514/1‑148 (MQ=255)
tttGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACa > 1:881242/1‑148 (MQ=255)
tttGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACa > 1:881347/1‑148 (MQ=255)
tGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAtt < 1:2261305/148‑1 (MQ=255)
acaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTta > 2:1616445/1‑148 (MQ=255)
acaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTta < 1:979280/148‑1 (MQ=255)
taTGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATaca < 1:3386455/147‑1 (MQ=255)
aaTGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATaca > 2:3463629/1‑148 (MQ=255)
aTGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATacac > 2:464427/1‑148 (MQ=255)
aTGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATacac < 1:1789518/148‑1 (MQ=255)
tGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACt < 2:826123/148‑1 (MQ=255)
tGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGGTATTGGGGGGAAAGTCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACt > 2:2398791/1‑148 (MQ=255)
gCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTa > 2:20840/1‑148 (MQ=255)
cTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTAc > 1:759833/1‑148 (MQ=255)
cTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTAc > 1:2542353/1‑148 (MQ=255)
gTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGaaaa > 1:3124008/1‑148 (MQ=255)
gTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGaaaa > 1:875201/1‑148 (MQ=255)
ttGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAAc > 2:2666972/1‑148 (MQ=255)
cgcgcAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCAt > 1:3487002/1‑148 (MQ=255)
cgcAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATcg < 2:2568636/148‑1 (MQ=255)
aGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGa > 2:70061/1‑148 (MQ=255)
tCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGaaa > 1:425760/1‑148 (MQ=255)
tCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGaaa > 1:2521772/1‑148 (MQ=255)
tCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGaaa > 2:1191649/1‑148 (MQ=255)
cTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAg < 2:1710640/148‑1 (MQ=255)
ggTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGtt > 2:838925/1‑148 (MQ=255)
ggTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGtt < 1:3053434/148‑1 (MQ=255)
ttATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGtttt > 1:3046417/1‑148 (MQ=255)
tATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTg > 2:1242664/1‑148 (MQ=255)
tATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTg > 2:1089863/1‑148 (MQ=255)
tATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTg < 1:788347/148‑1 (MQ=255)
gAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATa > 1:473041/1‑148 (MQ=255)
gAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATa > 1:3076976/1‑148 (MQ=255)
aGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACGTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAACGCGAGTTTTGATAg > 1:2991388/1‑148 (MQ=255)
aGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAg > 1:2781157/1‑148 (MQ=255)
taataaTTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGa > 1:258030/1‑148 (MQ=255)
ataatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGaaa < 2:424990/148‑1 (MQ=255)
ataatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGaaa > 1:1598543/1‑148 (MQ=255)
taatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAt > 1:1803598/1‑148 (MQ=255)
taatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAt < 1:941914/148‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTa > 1:2783393/1‑148 (MQ=255)
tAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTaa > 2:989403/1‑148 (MQ=255)
aGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAag > 2:2555314/1‑148 (MQ=255)
aGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAag < 2:1803598/148‑1 (MQ=255)
aGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAag < 1:710134/148‑1 (MQ=255)
gTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAaga > 1:1361989/1‑148 (MQ=255)
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ATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAT > SRR19973067.3112146/1‑150 (MQ=60)
ATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACAT > SRR19973067.3112046/1‑150 (MQ=60)
TGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTT < SRR19973067.2276305/150‑1 (MQ=60)
TGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTT < SRR19973067.2275940/150‑1 (MQ=60)
ACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATA < SRR19973067.986002/150‑1 (MQ=60)
ACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATA < SRR19973067.2914459/150‑1 (MQ=60)
AAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACA > SRR19973067.1801684/1‑150 (MQ=60)
AAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAAAGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACA > SRR19973067.3053622/1‑150 (MQ=60)
TATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACT < SRR19973067.3407977/150‑1 (MQ=60)
AATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACT < SRR19973067.3407819/150‑1 (MQ=60)
ATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTA < SRR19973067.1801580/150‑1 (MQ=60)
TGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTAC > SRR19973067.2558996/1‑150 (MQ=60)
TGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTAC > SRR19973067.765108/1‑150 (MQ=60)
GCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACG > SRR19973067.434066/1‑150 (MQ=60)
ATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAA > SRR19973067.904064/1‑150 (MQ=60)
ATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAA > SRR19973067.3143865/1‑150 (MQ=60)
ATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAA > SRR19973067.881043/1‑150 (MQ=60)
TGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCAT > SRR19973067.3509130/1‑150 (MQ=60)
TGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCAT > SRR19973067.2429975/1‑150 (MQ=60)
AGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAA > SRR19973067.2228910/1‑150 (MQ=60)
AGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAA > SRR19973067.2538304/1‑150 (MQ=60)
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GTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTT > SRR19973067.863904/1‑150 (MQ=60)
GTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTT > SRR19973067.2655085/1‑150 (MQ=60)
GGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTT > SRR19973067.3065824/1‑150 (MQ=60)
GGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTT < SRR19973067.161944/150‑1 (MQ=60)
GGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTT > SRR19973067.1283855/1‑150 (MQ=60)
GGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTT < SRR19973067.3072887/150‑1 (MQ=60)
GGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTT < SRR19973067.3070874/150‑1 (MQ=60)
GTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTG > SRR19973067.2846102/1‑150 (MQ=60)
TATGAGTAATAATTAGTTCATTATGATTTGCGTTATTGGTGGGTAAGGACTCATAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGATAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGAT < SRR19973067.793786/150‑1 (MQ=60)
TATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGAT < SRR19973067.793794/150‑1 (MQ=60)
TATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGAT < SRR19973067.2061117/150‑1 (MQ=60)
TATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGAT < SRR19973067.1549059/150‑1 (MQ=60)
ATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATA > SRR19973067.476306/1‑150 (MQ=60)
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AATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGC > SRR19973067.3331036/1‑150 (MQ=60)
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AATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGC > SRR19973067.808193/1‑150 (MQ=60)
TGATTTGCGTTATTGGGGGGAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCAC < SRR19973067.1012089/150‑1 (MQ=60)
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GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGT < SRR19973067.2264828/150‑1 (MQ=60)
GAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAAG > SRR19973067.2215531/1‑150 (MQ=60)
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GAAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTAAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTCTCGAAGAACGCGTTAAG > SRR19973067.2215840/1‑150 (MQ=60)
TAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAAGA < SRR19973067.116506/150‑1 (MQ=60)
TAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAAGA < SRR19973067.116010/150‑1 (MQ=60)
AAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAAGA > SRR19973067.1731802/1‑150 (MQ=60)
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CGAAGCAGCTTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCACTATCGAAGAACGCGTTAAGA > CP009273/1146800‑1147098
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
