Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,181,504 |
G→T |
100% |
D69Y (GAT→TAT) |
pepT → |
peptidase T |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,181,504 | 0 | G | T | 98.6%
| 684.8
/ 0.5
| 213 | D69Y (GAT→TAT) | pepT | peptidase T |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (86/124); total (88/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.71e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
GTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATG > CP009273/1181363‑1181647
|
gTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATcc < 1:2083240/148‑1 (MQ=255)
gagaCAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATACCg > 2:1368361/1‑148 (MQ=255)
aCAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCg < 1:768623/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGa < 1:2257515/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGa < 2:3280517/148‑1 (MQ=255)
ggTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAtt > 2:3546723/1‑148 (MQ=255)
gTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTg < 1:268474/148‑1 (MQ=255)
ttCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTgg < 1:2601810/148‑1 (MQ=255)
cAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCttt > 1:1400615/1‑148 (MQ=255)
aGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTa < 1:2498440/148‑1 (MQ=255)
cACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAtt < 1:759213/148‑1 (MQ=255)
aCGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAttt < 2:2712072/148‑1 (MQ=255)
cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc < 1:518547/148‑1 (MQ=255)
cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc < 1:2084816/148‑1 (MQ=255)
gAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtctc < 1:3307874/148‑1 (MQ=255)
aaGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCa > 2:3245022/1‑148 (MQ=255)
aaGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCGTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCGTTATTTCTCa > 2:2312728/1‑148 (MQ=255)
gCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCAtgt > 2:460778/1‑148 (MQ=255)
gCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCAtgt < 2:1212740/148‑1 (MQ=255)
aaTGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGa < 1:2722785/148‑1 (MQ=255)
aTGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGAt > 1:2182259/1‑148 (MQ=255)
tGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTCTATCCCGGCGATTGGCTTTAGTTGTCGTGTgggtg > 1:3098241/1‑145 (MQ=255)
ggAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATAc < 2:1060051/148‑1 (MQ=255)
gAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATAcc > 1:911100/1‑148 (MQ=255)
aaGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCt > 1:967892/1‑148 (MQ=255)
ttATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAc < 2:3351437/148‑1 (MQ=255)
ttATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAc < 2:1589712/148‑1 (MQ=255)
ttATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAc < 2:851213/148‑1 (MQ=255)
ttATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATCGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAc > 2:2587195/1‑148 (MQ=255)
tATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAcc > 2:1195500/1‑148 (MQ=255)
tGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGa > 1:755828/1‑148 (MQ=255)
tGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATAACTCACCGGa > 2:2652197/1‑148 (MQ=255)
tGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAGTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGa > 1:1136829/1‑148 (MQ=255)
gCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGAt < 2:766870/148‑1 (MQ=255)
gCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGAt < 2:1468687/148‑1 (MQ=255)
gCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGAt < 2:2232916/148‑1 (MQ=255)
ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAt > 2:1505314/1‑119 (MQ=255)
ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAt < 1:1505314/119‑1 (MQ=255)
ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAGCGGATTGCa > 2:1151681/1‑148 (MQ=255)
ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCa > 1:80811/1‑148 (MQ=255)
ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCa < 1:689540/148‑1 (MQ=255)
tgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAg < 1:1622023/148‑1 (MQ=255)
tgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAg < 2:527639/148‑1 (MQ=255)
tgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAg < 1:50684/148‑1 (MQ=255)
tgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAg < 1:3110611/148‑1 (MQ=255)
aaGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaa > 1:2127718/1‑148 (MQ=255)
cagcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAAtg > 1:2609224/1‑148 (MQ=255)
cTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCCAAAATGTGa > 1:1310894/1‑148 (MQ=255)
tCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGaa < 1:1458584/148‑1 (MQ=255)
cGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAAt > 2:2201601/1‑148 (MQ=255)
gAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATc < 2:903985/148‑1 (MQ=255)
gAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATc < 2:161354/148‑1 (MQ=255)
aaGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGGTTTATTTCTCCTGTGGATACCTCACCCGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATcc > 1:1270516/1‑148 (MQ=255)
aaGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATcc > 1:2942084/1‑148 (MQ=255)
aaGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATcc > 1:1881696/1‑148 (MQ=255)
agagATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCg < 2:1605393/148‑1 (MQ=255)
gaTGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCaa < 2:3437924/148‑1 (MQ=255)
gaTGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCaa < 2:1678910/148‑1 (MQ=255)
ggggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAACGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAtt > 1:415018/1‑148 (MQ=255)
gggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAATTCTCATGTGGATACCACACCGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCaaaaag > 1:1907500/1‑145 (MQ=255)
ggCTTCTCAATGGGAGCGTAAGTGAGCTGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTCACGTACCTTGCTATATCCCTGCTATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCACAttgt < 2:2027982/148‑1 (MQ=255)
cTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttgttg < 2:3127480/148‑1 (MQ=255)
aTCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGaaa > 2:30126/1‑148 (MQ=255)
aTCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGaaa > 1:3551430/1‑148 (MQ=255)
aTCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGaaa < 1:3057644/148‑1 (MQ=255)
aaTGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACt < 1:3245022/148‑1 (MQ=255)
tgtgACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAt < 2:2392624/148‑1 (MQ=255)
tgACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATcg < 2:1875824/148‑1 (MQ=255)
aCCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGTAAACTATcgcg > 1:1341841/1‑148 (MQ=255)
aCCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATcgcg > 2:393317/1‑148 (MQ=255)
aCCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATcgcg > 2:1943510/1‑148 (MQ=255)
ccTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCgg > 2:1071898/1‑148 (MQ=255)
ccTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCgg > 2:103551/1‑148 (MQ=255)
ttAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTg < 1:3054777/148‑1 (MQ=255)
tAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTgg > 2:663676/1‑148 (MQ=255)
aGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATACCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCg < 1:1368361/148‑1 (MQ=255)
gTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGa < 1:444708/148‑1 (MQ=255)
gTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGa < 1:2354405/148‑1 (MQ=255)
tGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGat < 1:2613143/148‑1 (MQ=255)
agaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGatat < 1:48000/148‑1 (MQ=255)
gaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATAtt > 2:3469400/1‑148 (MQ=255)
gggCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTgcg < 1:1750785/148‑1 (MQ=255)
ggCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTgcgc > 2:2708196/1‑148 (MQ=255)
cACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTGTCATGTGGATACCTCACCCGATTTCAGCGGCAAAAATCTGAATACGCAAAATGTTGAAAACAATCGCGGTGGCGCTATTGCGCTg > 1:3404809/1‑148 (MQ=255)
aCTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAACACTGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTgg < 1:2167950/148‑1 (MQ=255)
tttGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGt < 1:2345539/148‑1 (MQ=255)
tGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTAt > 1:697234/1‑148 (MQ=255)
tGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTAt < 1:2404057/148‑1 (MQ=255)
aTGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCAAATGGAAAACTCACCCGAATGCAGCGGCAAAAATGTTAAACCGCAAATTGTTTAAAACTATAGCGGTTGCGATATTGCGCTGGGTATCg > 1:3029943/1‑148 (MQ=255)
gCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCg < 2:2829132/148‑1 (MQ=255)
gCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCg < 1:1711808/148‑1 (MQ=255)
gTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGaa < 2:428322/148‑1 (MQ=255)
tACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGt < 2:94482/148‑1 (MQ=255)
aCCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGtt < 2:1593474/148‑1 (MQ=255)
gCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAGTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATACGCAAATTGTTGAAAACTATAGCGGTGGCGCGATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTAt > 1:2125550/1‑148 (MQ=255)
tAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCa < 1:461124/148‑1 (MQ=255)
aCGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCAcc > 2:765363/1‑148 (MQ=255)
gTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCgg < 1:2252949/148‑1 (MQ=255)
cTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTAt < 1:2001662/148‑1 (MQ=255)
tGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATg < 1:3449943/148‑1 (MQ=255)
|
GTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATG > CP009273/1181363‑1181647
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCG > CP009273/1181362‑1181653
|
GGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCC > SRR19973067.1700135/1‑150 (MQ=60)
GTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCG > SRR19973067.2408194/1‑150 (MQ=60)
GTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCG < SRR19973067.2016558/150‑1 (MQ=60)
GTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCG < SRR19973067.2097040/150‑1 (MQ=60)
AGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCG > SRR19973067.1190735/1‑150 (MQ=60)
GACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGA < SRR19973067.2961098/150‑1 (MQ=60)
GACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGA < SRR19973067.3251608/150‑1 (MQ=60)
ACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAT < SRR19973067.1301382/150‑1 (MQ=60)
ACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAT < SRR19973067.773953/150‑1 (MQ=60)
CAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATT < SRR19973067.2272495/150‑1 (MQ=60)
CAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATT < SRR19973067.2272488/150‑1 (MQ=60)
CAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATT < SRR19973067.473095/150‑1 (MQ=60)
GTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGC < SRR19973067.270280/150‑1 (MQ=60)
TTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCT < SRR19973067.2618729/150‑1 (MQ=60)
TTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCT < SRR19973067.2618874/150‑1 (MQ=60)
TCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTT < SRR19973067.425711/150‑1 (MQ=60)
CCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTT > SRR19973067.1410117/1‑150 (MQ=60)
CAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAT < SRR19973067.259604/150‑1 (MQ=60)
AGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATT < SRR19973067.2514843/150‑1 (MQ=60)
gagttcagacgtgtgctcttccgatctATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTT < SRR19973067.1515252/123‑1 (MQ=60)
CACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTC < SRR19973067.764484/150‑1 (MQ=60)
CACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTC < SRR19973067.764487/150‑1 (MQ=60)
CACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTC < SRR19973067.764504/150‑1 (MQ=60)
CGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTC < SRR19973067.2098003/150‑1 (MQ=60)
CGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTC < SRR19973067.522056/150‑1 (MQ=60)
CGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTC < SRR19973067.2098620/150‑1 (MQ=60)
GAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCAT < SRR19973067.3328747/150‑1 (MQ=60)
AAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGTCTTTATTTCTCATG > SRR19973067.2365882/1‑150 (MQ=60)
AAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATG < SRR19973067.2140348/150‑1 (MQ=60)
CAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGAT > SRR19973067.407111/1‑150 (MQ=60)
CAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGAT > SRR19973067.1400334/1‑150 (MQ=60)
CAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGAT > SRR19973067.2196850/1‑150 (MQ=60)
CAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGAT > SRR19973067.2195739/1‑150 (MQ=60)
AATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTCTATCCCGGCGATTGGCTTTAgttgtcgtgtgggtg > SRR19973067.3117952/1‑135 (MQ=60)
AATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATA < SRR19973067.2740352/150‑1 (MQ=60)
AATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATA < SRR19973067.2263041/150‑1 (MQ=60)
TGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACC > SRR19973067.917155/1‑150 (MQ=60)
GGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCT > SRR19973067.974525/1‑150 (MQ=60)
GGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTATCATGTGGATACCT > SRR19973067.972529/1‑150 (MQ=60)
ATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGA > SRR19973067.761084/1‑150 (MQ=60)
ATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAGTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGA > SRR19973067.1144483/1‑150 (MQ=60)
GCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTG < SRR19973067.2373989/150‑1 (MQ=60)
ATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCA > SRR19973067.81706/1‑150 (MQ=60)
CTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGC < SRR19973067.694380/150‑1 (MQ=60)
CTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGC < SRR19973067.694290/150‑1 (MQ=60)
TGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCG < SRR19973067.51343/150‑1 (MQ=60)
TGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCG < SRR19973067.1633155/150‑1 (MQ=60)
TGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCG < SRR19973067.3130393/150‑1 (MQ=60)
TGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCG < SRR19973067.51339/150‑1 (MQ=60)
TGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCG < SRR19973067.51385/150‑1 (MQ=60)
TGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTATCATGTGGATACCTCACCCGATTGCAGCG > SRR19973067.1564816/1‑150 (MQ=60)
GCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGG < SRR19973067.270279/150‑1 (MQ=60)
CTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGC > SRR19973067.2321306/1‑150 (MQ=60)
CTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGC > SRR19973067.3272363/1‑150 (MQ=60)
CTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGC > SRR19973067.689307/1‑150 (MQ=60)
CTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGC < SRR19973067.2422782/150‑1 (MQ=60)
GAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAA > SRR19973067.2141922/1‑150 (MQ=60)
AAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAA < SRR19973067.1502150/150‑1 (MQ=60)
AGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATG > SRR19973067.2626171/1‑150 (MQ=60)
AGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATG > SRR19973067.2626922/1‑150 (MQ=60)
GCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGT < SRR19973067.3444117/150‑1 (MQ=60)
CAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTG < SRR19973067.51803/150‑1 (MQ=60)
AGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCCAAAATGTGA > SRR19973067.1319844/1‑150 (MQ=60)
TCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATC < SRR19973067.1467992/150‑1 (MQ=60)
TCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATC < SRR19973067.1468342/150‑1 (MQ=60)
CGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGGTTTATTTCTCCTGTGGATACCTCACCCGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCC > SRR19973067.1279156/1‑150 (MQ=60)
CGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCC > SRR19973067.1894539/1‑150 (MQ=60)
CGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCC > SRR19973067.2960730/1‑150 (MQ=60)
ATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATGTCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATT > SRR19973067.2109092/1‑150 (MQ=60)
ATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTTGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATT > SRR19973067.308424/1‑150 (MQ=60)
ATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAACGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATT > SRR19973067.417900/1‑150 (MQ=60)
TGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGGAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTG < SRR19973067.2706904/150‑1 (MQ=60)
TGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAATTCTCATGTGGATACCACACCGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAaag > SRR19973067.1920507/1‑147 (MQ=60)
GGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTT > SRR19973067.1746822/1‑150 (MQ=60)
CTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAA > SRR19973067.1914102/1‑150 (MQ=60)
TTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAA > SRR19973067.3573827/1‑150 (MQ=60)
TTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAA > SRR19973067.155822/1‑150 (MQ=60)
ATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAAC < SRR19973067.3077116/150‑1 (MQ=60)
ATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAAC < SRR19973067.3077106/150‑1 (MQ=60)
TCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCTCTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACT < SRR19973067.1361073/150‑1 (MQ=60)
TCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACT < SRR19973067.824148/150‑1 (MQ=60)
CAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTA > SRR19973067.794188/1‑150 (MQ=60)
AATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAT < SRR19973067.3265348/150‑1 (MQ=60)
ATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATC < SRR19973067.2100968/150‑1 (MQ=60)
GTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGC > SRR19973067.872202/1‑150 (MQ=60)
TGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGTAAACTATCGCG > SRR19973067.1351017/1‑150 (MQ=60)
ACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGT > SRR19973067.2855546/1‑150 (MQ=60)
TTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGC < SRR19973067.3074238/150‑1 (MQ=60)
TTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGC < SRR19973067.3074218/150‑1 (MQ=60)
AGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATACCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGAT < SRR19973067.1377706/150‑1 (MQ=60)
GTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATA > SRR19973067.1974476/1‑150 (MQ=60)
GTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATA < SRR19973067.2369766/150‑1 (MQ=60)
GTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATA < SRR19973067.447796/150‑1 (MQ=60)
TGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATAT < SRR19973067.2630103/150‑1 (MQ=60)
AGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTG > SRR19973067.2951252/1‑150 (MQ=60)
AGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTG < SRR19973067.48639/150‑1 (MQ=60)
AGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTG < SRR19973067.3329100/150‑1 (MQ=60)
GGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCT < SRR19973067.1762718/150‑1 (MQ=60)
GGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTGTCATGTGGATACCTCACCCGATTTCAGCGGCAAAAATCTGAATACGCAAAATGTTGAAAACAATCGCGGTGGCGCTATTGCGCTG > SRR19973067.3426482/1‑150 (MQ=60)
GGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATAGTGCGCTG > SRR19973067.3426010/1‑150 (MQ=60)
ACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAACACTGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGT < SRR19973067.2182446/150‑1 (MQ=60)
ACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGT < SRR19973067.2182131/150‑1 (MQ=60)
TTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTAT < SRR19973067.2360870/150‑1 (MQ=60)
TTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTAT > SRR19973067.702050/1‑150 (MQ=60)
TGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCG < SRR19973067.2419758/150‑1 (MQ=60)
TGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCAAATGGAAAACTCACCCGAATGCAGCGGCAAAAATGTTAAACCGCAAATTGTTTAAAACTATAGCGGTTGCGATATTGCGCTGGGTATCG > SRR19973067.3049234/1‑150 (MQ=60)
GCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGAT < SRR19973067.1723551/150‑1 (MQ=60)
GCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGAT < SRR19973067.1350082/150‑1 (MQ=60)
GCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGAT < SRR19973067.3128239/150‑1 (MQ=60)
TACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTT < SRR19973067.3543642/150‑1 (MQ=60)
CCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTA < SRR19973067.733998/150‑1 (MQ=60)
CGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAGTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATACGCAAATTGTTGAAAACTATAGCGGTGGCGCGATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTAT > SRR19973067.2139736/1‑150 (MQ=60)
TAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACC < SRR19973067.464316/150‑1 (MQ=60)
TAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACC < SRR19973067.463966/150‑1 (MQ=60)
GTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTT < SRR19973067.2267906/150‑1 (MQ=60)
GTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTT < SRR19973067.1802844/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGT < SRR19973067.2015161/150‑1 (MQ=60)
TGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTT < SRR19973067.3471887/150‑1 (MQ=60)
TGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATAACCGGTTATGTT > SRR19973067.1472240/1‑150 (MQ=60)
GCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAAATATAGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATAACCGGTTATGTTAC > SRR19973067.57257/1‑150 (MQ=60)
CTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCC < SRR19973067.1603823/150‑1 (MQ=60)
TATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCG < SRR19973067.3508888/150‑1 (MQ=60)
TATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCG < SRR19973067.1593967/150‑1 (MQ=60)
|
GGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCG > CP009273/1181362‑1181653
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |