Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,173,179 |
G→T |
100% |
P669P (CCG→CCT) |
rpoB → |
RNA polymerase, beta subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,173,179 | 0 | G | T | 95.5%
| 722.4
/ 22.8
| 243 | P669P (CCG→CCT) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/5); new base T (117/115); total (123/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAG > CP009273/4173036‑4173324
|
aaCTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTcc < 1:3278041/148‑1 (MQ=255)
cTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTg > 1:3163784/1‑148 (MQ=255)
ggATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGaa < 1:3321813/148‑1 (MQ=255)
ggATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGaa < 2:1810397/148‑1 (MQ=255)
ggATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGaa < 2:1810211/148‑1 (MQ=255)
gATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAac < 1:1653209/148‑1 (MQ=255)
tGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAacac > 1:1846153/1‑148 (MQ=255)
gaagaaGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACg > 2:3306516/1‑148 (MQ=255)
agaagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGAt < 1:168204/148‑1 (MQ=255)
aagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGa < 1:1567055/148‑1 (MQ=255)
aagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGa > 2:74168/1‑148 (MQ=255)
aagGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGa > 1:2394631/1‑148 (MQ=255)
agGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGAc > 1:13137/1‑148 (MQ=255)
tAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGc > 2:2603905/1‑148 (MQ=255)
agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 1:1888806/148‑1 (MQ=255)
agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 2:1574260/148‑1 (MQ=255)
agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa > 2:1501183/1‑148 (MQ=255)
agaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGAAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 2:22872/148‑1 (MQ=255)
gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:249073/1‑148 (MQ=255)
gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:248792/1‑148 (MQ=255)
gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:337569/1‑148 (MQ=255)
gaagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:881455/1‑148 (MQ=255)
aagaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCAtt > 1:2424493/1‑148 (MQ=255)
gaCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGa < 1:561768/148‑1 (MQ=255)
aCCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGAt > 2:841470/1‑148 (MQ=255)
ccTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATg < 1:291337/148‑1 (MQ=255)
cTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATgg > 2:3431022/1‑148 (MQ=255)
ggTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGt > 1:251915/1‑148 (MQ=255)
gTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTg < 2:562014/148‑1 (MQ=255)
tAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGc < 1:986227/148‑1 (MQ=255)
aCTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGa < 2:1895413/148‑1 (MQ=255)
aCTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGa < 2:3112425/148‑1 (MQ=255)
ttGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc > 2:480601/1‑148 (MQ=255)
ttGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc < 1:914538/148‑1 (MQ=255)
tGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGACCa > 2:1076020/1‑148 (MQ=255)
gTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCa < 2:581325/148‑1 (MQ=255)
aGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 1:2108832/1‑148 (MQ=255)
gCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACg > 2:3384080/1‑148 (MQ=255)
cAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGt > 1:379166/1‑148 (MQ=255)
aaaGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTc > 2:3035374/1‑148 (MQ=255)
aaaGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTc < 2:1292141/148‑1 (MQ=255)
aaGGAGAATCCATCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCAGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCa < 2:3095756/148‑1 (MQ=255)
aGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAg < 1:2174705/148‑1 (MQ=255)
aGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAg > 1:842105/1‑148 (MQ=255)
ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGTGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAgg > 2:2398202/1‑148 (MQ=255)
ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAgg > 2:757788/1‑148 (MQ=255)
gCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGc > 1:486990/1‑148 (MQ=255)
cAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCg > 1:2153448/1‑148 (MQ=255)
aGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 1:2159809/148‑1 (MQ=255)
cTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGAct < 1:1035628/148‑1 (MQ=255)
gCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 1:2828459/148‑1 (MQ=255)
gCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGGGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 2:469022/148‑1 (MQ=255)
cgcgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTg < 2:2400422/148‑1 (MQ=255)
gcgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGa < 1:2327891/148‑1 (MQ=255)
cgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGAt > 2:667798/1‑148 (MQ=255)
cgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGAt > 2:2450863/1‑148 (MQ=255)
ccAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAg > 2:3492069/1‑148 (MQ=255)
gTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCTTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGc < 2:1004354/148‑1 (MQ=255)
gTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCTTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGc < 2:2780611/148‑1 (MQ=255)
gACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtgg < 2:2903715/148‑1 (MQ=255)
gACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtgg < 2:961573/148‑1 (MQ=255)
aCTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggt > 2:3230604/1‑148 (MQ=255)
aCTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggt < 1:2906319/148‑1 (MQ=255)
cTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt > 2:1593434/1‑148 (MQ=255)
aCATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttgg > 2:2436361/1‑148 (MQ=255)
cATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt < 1:820383/148‑1 (MQ=255)
cATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt < 1:2603905/148‑1 (MQ=255)
aTGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTa > 1:2640023/1‑148 (MQ=255)
ggACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACt > 1:2753010/1‑148 (MQ=255)
gACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTg < 1:1498030/148‑1 (MQ=255)
gTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTa < 2:943263/148‑1 (MQ=255)
aTCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATg < 1:337601/148‑1 (MQ=255)
cccTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACg > 2:1264039/1‑148 (MQ=255)
ctgcagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTg < 2:2640609/146‑1 (MQ=255)
ctgcagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTg > 2:1625807/3‑148 (MQ=255)
gcagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCGGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCt < 1:1959738/148‑1 (MQ=255)
agGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGt < 2:1329142/148‑1 (MQ=255)
ggtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGtt > 2:2343173/1‑148 (MQ=255)
ggtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGtt > 2:257575/1‑148 (MQ=255)
ggtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGtt > 2:3530868/1‑148 (MQ=255)
tggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGc > 2:272000/1‑148 (MQ=255)
gtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCg < 2:40215/148‑1 (MQ=255)
tATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGt < 1:249144/148‑1 (MQ=255)
tATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGt < 1:248792/148‑1 (MQ=255)
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GCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTG < SRR19973067.2846646/150‑1 (MQ=60)
GCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATA < SRR19973067.2343176/150‑1 (MQ=60)
GACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAG > SRR19973067.1272895/1‑150 (MQ=60)
CCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCC > SRR19973067.3310070/1‑150 (MQ=60)
AGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGC > SRR19973067.1404382/1‑150 (MQ=60)
ACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTG < SRR19973067.2924841/150‑1 (MQ=60)
ACTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTG < SRR19973067.2997525/150‑1 (MQ=60)
CTACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGG > SRR19973067.3073533/1‑150 (MQ=60)
TACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGT > SRR19973067.1056834/1‑150 (MQ=60)
TACATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGT > SRR19973067.74716/1‑150 (MQ=60)
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CATGGACGTATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTAC < SRR19973067.825996/150‑1 (MQ=60)
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ATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGA < SRR19973067.339919/150‑1 (MQ=60)
ATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGA < SRR19973067.340263/150‑1 (MQ=60)
ATCCACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCCGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGA > SRR19973067.1116946/1‑150 (MQ=60)
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CACCCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTAGTATGGAACG < SRR19973067.1691964/150‑1 (MQ=60)
CCTGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCTTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGC < SRR19973067.2148961/150‑1 (MQ=60)
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GTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCC < SRR19973067.2513961/150‑1 (MQ=60)
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AACTCCAACTTGGATGAAGAAGGCCACTTCGTAGAAGACCTGGTAACTTGCCGTAGCAAAGGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAG > CP009273/4173030‑4173324
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
