Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,523,802 |
T→G |
60.0% |
pseudogene (1644/2037 nt) |
rhsE → |
pseudogene, Rhs family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,523,802 | 0 | T | G | 60.0%
| 300.5
/ 254.7
| 252 | pseudogene (1644/2037 nt) | rhsE | pseudogene, Rhs family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/48); new base G (79/72); total (132/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGAT > CP009273/1523655‑1523947
|
tatCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCt < 2:46336/148‑1 (MQ=255)
tatCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCt > 1:326553/1‑148 (MQ=255)
atCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTg > 2:2153876/1‑148 (MQ=255)
atCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTg > 1:1376770/1‑148 (MQ=255)
tCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTgg > 2:1169007/1‑148 (MQ=255)
cACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGga > 1:2959395/1‑148 (MQ=255)
ccccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgatt > 1:2018566/1‑148 (MQ=255)
cccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattg > 1:1513025/1‑148 (MQ=255)
ccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGgattga < 2:335372/148‑1 (MQ=255)
cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGgattgat > 1:2258837/1‑148 (MQ=255)
cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattgat > 2:66507/1‑148 (MQ=255)
cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattgat > 2:1868622/1‑148 (MQ=255)
cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGgattgat > 2:66536/1‑148 (MQ=255)
aCCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATtgc > 1:2704070/1‑148 (MQ=255)
cGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATtgctgc > 1:2366275/1‑148 (MQ=255)
cGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATtgctgc > 1:19345/1‑148 (MQ=255)
ttGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCa > 1:1779192/1‑148 (MQ=255)
atagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTa > 2:1678872/3‑148 (MQ=255)
agagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTa > 2:2547178/1‑148 (MQ=255)
gagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGTGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc > 2:1813609/1‑148 (MQ=255)
gagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc > 1:3018452/1‑148 (MQ=255)
gatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAg < 2:2156325/148‑1 (MQ=255)
gatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAg < 1:2050257/148‑1 (MQ=255)
atggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGt > 2:1557211/1‑148 (MQ=255)
tggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTg < 1:472803/148‑1 (MQ=255)
ggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc < 2:1299458/139‑1 (MQ=255)
ggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAc > 1:1299723/1‑139 (MQ=255)
ggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGc < 2:2289604/148‑1 (MQ=255)
tGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCa > 2:282762/1‑148 (MQ=255)
tATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGt < 1:1557221/148‑1 (MQ=255)
aTCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATCGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTACTTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATAGATTGCTGCAAACAGCATTACTATCAGTGCTTACCAGtt > 1:333408/1‑148 (MQ=255)
aTCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGtt < 1:925160/148‑1 (MQ=255)
tCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTc > 1:2392789/1‑148 (MQ=255)
gTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGt > 2:65545/1‑148 (MQ=255)
gTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGt > 1:1124867/1‑148 (MQ=255)
tATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGtt > 1:3427018/1‑148 (MQ=255)
tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTAt < 1:628729/148‑1 (MQ=255)
gTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGat > 1:3516396/1‑148 (MQ=255)
gTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGat < 1:2422770/148‑1 (MQ=255)
ttGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGata > 1:2909678/1‑148 (MQ=255)
ttGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAGGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGata > 2:1830935/1‑148 (MQ=255)
tGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 2:2329824/148‑1 (MQ=255)
tGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 2:1453624/148‑1 (MQ=255)
tCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGAt > 2:2784786/1‑148 (MQ=255)
tCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGAt > 2:1579162/1‑148 (MQ=255)
cccATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATg < 1:3228726/148‑1 (MQ=255)
ccATACAAGTGATTGACCCAATGGGGTGAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTTTCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACTGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGc < 1:2188166/148‑1 (MQ=255)
aCAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAtt > 1:2954772/1‑148 (MQ=255)
aCAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAtt > 2:342102/1‑148 (MQ=255)
aaGTGATAGACCCAATGGTGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAttgt < 2:2663933/148‑1 (MQ=255)
aaGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAttgt < 2:1740855/148‑1 (MQ=255)
tGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTgg > 1:124959/1‑148 (MQ=255)
aTAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 2:3208553/1‑148 (MQ=255)
tAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCgg < 2:1277974/148‑1 (MQ=255)
aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGa > 1:2313731/1‑148 (MQ=255)
aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGa > 1:3038791/1‑148 (MQ=255)
gACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAg < 1:997536/148‑1 (MQ=255)
aCCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGc < 1:2113858/148‑1 (MQ=255)
aCCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGc < 2:53390/148‑1 (MQ=255)
ccAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTc > 1:516256/1‑148 (MQ=255)
cAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCa < 1:307230/148‑1 (MQ=255)
cAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCa > 2:2254147/1‑148 (MQ=255)
aaTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCAt > 1:1003352/1‑148 (MQ=255)
aTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATa < 2:2449700/148‑1 (MQ=255)
aTGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATa < 2:3062686/148‑1 (MQ=255)
tGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATaa < 1:1813609/148‑1 (MQ=255)
ggTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATgg < 2:3195168/148‑1 (MQ=255)
gTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATggg > 2:1512026/1‑148 (MQ=255)
tAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgc < 2:2872691/148‑1 (MQ=255)
tGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgccgcc > 2:1310907/1‑148 (MQ=255)
cGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGa < 2:1868512/148‑1 (MQ=255)
cGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGa < 2:391523/148‑1 (MQ=255)
tGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCa > 1:2847758/1‑148 (MQ=255)
tGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCa < 2:1565292/148‑1 (MQ=255)
gaATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATg < 2:196125/148‑1 (MQ=255)
gaATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATg < 2:196078/148‑1 (MQ=255)
gaATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATg > 1:1096827/1‑148 (MQ=255)
aaTATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATga > 1:834285/1‑148 (MQ=255)
atatGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgag < 2:335402/148‑1 (MQ=255)
tatGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga > 2:2027610/1‑148 (MQ=255)
aTCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGCTTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGt < 2:2880408/148‑1 (MQ=255)
cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTa > 2:2931013/1‑148 (MQ=255)
cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTa < 1:1416901/148‑1 (MQ=255)
gTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACtt > 1:2533521/1‑148 (MQ=255)
ggACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGa < 1:419142/148‑1 (MQ=255)
ggACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGa < 1:2562673/148‑1 (MQ=255)
ggACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGa < 2:1085447/148‑1 (MQ=255)
cTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAtgt < 2:1376770/148‑1 (MQ=255)
tATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGaa < 1:222168/148‑1 (MQ=255)
aTGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAAt < 1:604995/148‑1 (MQ=255)
tGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATg < 1:3360933/148‑1 (MQ=255)
gCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGa < 2:3431487/148‑1 (MQ=255)
gTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTa < 2:3256392/148‑1 (MQ=255)
gTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTa < 1:1850448/148‑1 (MQ=255)
tCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGa > 2:738837/1‑148 (MQ=255)
tGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACa < 2:3516396/148‑1 (MQ=255)
gtgtACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACAtt < 2:3188704/148‑1 (MQ=255)
tgtACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACAttt < 1:1169007/148‑1 (MQ=255)
ccTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCTATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTAGGAt < 2:3018452/148‑1 (MQ=255)
ccTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGAt > 2:2232403/1‑148 (MQ=255)
|
TATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGAT > CP009273/1523655‑1523947
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TATATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGATC > CP009273/1523653‑1523948
|
TATATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCT > SRR19973066.329234/1‑150 (MQ=60)
TATATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCT > SRR19973066.329035/1‑150 (MQ=60)
TATATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCT < SRR19973066.296617/150‑1 (MQ=60)
ATATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTG > SRR19973066.1386731/1‑150 (MQ=60)
ATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGA > SRR19973066.2979001/1‑150 (MQ=60)
ATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGA > SRR19973066.2978221/1‑150 (MQ=60)
CACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATT > SRR19973066.2032695/1‑150 (MQ=60)
CACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATT > SRR19973066.2034836/1‑150 (MQ=60)
ACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTG > SRR19973066.1523640/1‑150 (MQ=60)
CCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGAT > SRR19973066.2274397/1‑150 (MQ=60)
CCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGAT > SRR19973066.3093125/1‑150 (MQ=60)
CCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACATGGATTGAT > SRR19973066.2681771/1‑150 (MQ=60)
GGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGC > SRR19973066.2722189/1‑150 (MQ=60)
CCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGC > SRR19973066.2382295/1‑150 (MQ=60)
CCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGC > SRR19973066.19637/1‑150 (MQ=60)
TGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAG < SRR19973066.775963/150‑1 (MQ=60)
GGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCA > SRR19973066.1791906/1‑150 (MQ=60)
GTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCAT > SRR19973066.1826513/1‑150 (MQ=60)
TGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTA > SRR19973066.3277821/1‑150 (MQ=60)
GAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTAC > SRR19973066.3038584/1‑150 (MQ=60)
AGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACT < SRR19973066.233209/150‑1 (MQ=60)
AGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACT < SRR19973066.233221/150‑1 (MQ=60)
GAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTA > SRR19973066.400214/1‑150 (MQ=60)
GGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAAC < SRR19973066.1060657/150‑1 (MQ=60)
GTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACA > SRR19973066.3311507/1‑150 (MQ=60)
TGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAG < SRR19973066.3586200/150‑1 (MQ=60)
GATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTG < SRR19973066.2064507/150‑1 (MQ=60)
ATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAAgatcgg > SRR19973066.1308874/1‑144 (MQ=60)
ATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAAgatcgg > SRR19973066.1309141/1‑144 (MQ=60)
TGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCT < SRR19973066.476386/150‑1 (MQ=60)
TGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCT > SRR19973066.1382620/1‑150 (MQ=60)
GGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTT > SRR19973066.1314951/1‑150 (MQ=60)
GAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTA > SRR19973066.6460/1‑150 (MQ=60)
ATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAG > SRR19973066.313611/1‑150 (MQ=60)
TGTATCAGTCTCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGT < SRR19973066.217343/150‑1 (MQ=60)
TGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGT < SRR19973066.1641929/150‑1 (MQ=60)
GTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATCGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTACTTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATAGATTGCTGCAAACAGCATTACTATCAGTGCTTACCAGTT > SRR19973066.335955/1‑150 (MQ=60)
GTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTT > SRR19973066.335994/1‑150 (MQ=60)
TATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTC > SRR19973066.2408898/1‑150 (MQ=60)
TATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTC < SRR19973066.1568410/150‑1 (MQ=60)
TATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTC < SRR19973066.1568420/150‑1 (MQ=60)
ATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCG < SRR19973066.984501/150‑1 (MQ=60)
ATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCG < SRR19973066.931850/150‑1 (MQ=60)
CAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGT > SRR19973066.1132962/1‑150 (MQ=60)
CAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGT > SRR19973066.1132938/1‑150 (MQ=60)
CAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGT > SRR19973066.1132943/1‑150 (MQ=60)
AGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTT > SRR19973066.3449938/1‑150 (MQ=60)
TCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGA < SRR19973066.633240/150‑1 (MQ=60)
CCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGAT > SRR19973066.3539817/1‑150 (MQ=60)
CGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATA > SRR19973066.2929292/1‑150 (MQ=60)
CGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATA > SRR19973066.2929100/1‑150 (MQ=60)
GTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATAT < SRR19973066.2439217/150‑1 (MQ=60)
TTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATG < SRR19973066.993880/150‑1 (MQ=60)
TTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATG < SRR19973066.539828/150‑1 (MQ=60)
ATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTTGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATG < SRR19973066.2390177/150‑1 (MQ=60)
ATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATG < SRR19973066.2390130/150‑1 (MQ=60)
CCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCT < SRR19973066.3250062/150‑1 (MQ=60)
CCATACAAGTGATTGACCCAATGGGGTGAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTTTCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACTGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTA < SRR19973066.2203348/150‑1 (MQ=60)
ATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATT > SRR19973066.2451796/1‑150 (MQ=60)
ATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATT > SRR19973066.1184576/1‑150 (MQ=60)
ATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATT > SRR19973066.2974363/1‑150 (MQ=60)
TACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTG > SRR19973066.257182/1‑150 (MQ=60)
ACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGT > SRR19973066.2876429/1‑150 (MQ=60)
AGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGG > SRR19973066.1869167/1‑150 (MQ=60)
AGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGG > SRR19973066.51993/1‑150 (MQ=60)
AGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGG > SRR19973066.126203/1‑150 (MQ=60)
GTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGC > SRR19973066.901553/1‑150 (MQ=60)
GTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGC < SRR19973066.2779217/150‑1 (MQ=60)
ATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGA > SRR19973066.2329563/1‑150 (MQ=60)
ATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGA > SRR19973066.3059098/1‑150 (MQ=60)
AGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTAACGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATTCTATTTTTGGCGGAGC > SRR19973066.2116304/1‑150 (MQ=60)
GACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCT < SRR19973066.1004884/150‑1 (MQ=60)
GACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCT < SRR19973066.426210/150‑1 (MQ=60)
GACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCT < SRR19973066.571228/150‑1 (MQ=60)
ACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTC > SRR19973066.520062/1‑150 (MQ=60)
ACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTC > SRR19973066.2323342/1‑150 (MQ=60)
ACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTC < SRR19973066.2128473/150‑1 (MQ=60)
CCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCA > SRR19973066.1551941/1‑150 (MQ=60)
CCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCAT > SRR19973066.1010743/1‑150 (MQ=60)
CCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCAT < SRR19973066.3510292/150‑1 (MQ=60)
CAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATA < SRR19973066.309405/150‑1 (MQ=60)
CAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATA < SRR19973066.309453/150‑1 (MQ=60)
AATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAA < SRR19973066.1170334/150‑1 (MQ=60)
TGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATG < SRR19973066.1826519/150‑1 (MQ=60)
TGGGGTTAGATGAGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATG < SRR19973066.1825717/150‑1 (MQ=60)
GGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGG < SRR19973066.2230000/150‑1 (MQ=60)
GTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGC > SRR19973066.629931/1‑150 (MQ=60)
GATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGNC < SRR19973066.2494654/150‑1 (MQ=60)
GCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGAT > SRR19973066.205737/1‑150 (MQ=60)
GATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGC > SRR19973066.2957735/1‑150 (MQ=60)
GATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGC < SRR19973066.2787700/150‑1 (MQ=60)
ATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCA > SRR19973066.2866891/1‑150 (MQ=60)
ATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAAAAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGATCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCA > SRR19973066.1504344/1‑150 (MQ=60)
GAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATG > SRR19973066.1104800/1‑150 (MQ=60)
GAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATG > SRR19973066.1435263/1‑150 (MQ=60)
AGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGA > SRR19973066.840368/1‑150 (MQ=60)
ATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGAC > SRR19973066.50643/1‑150 (MQ=60)
ATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGAC > SRR19973066.3086250/1‑150 (MQ=60)
TGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGCTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATT > SRR19973066.2246390/1‑150 (MQ=60)
CAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACT > SRR19973066.2016902/1‑150 (MQ=60)
CAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACT < SRR19973066.1426587/150‑1 (MQ=60)
CAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACT < SRR19973066.1932413/150‑1 (MQ=60)
CAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACT < SRR19973066.1427051/150‑1 (MQ=60)
AGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTT > SRR19973066.2550744/1‑150 (MQ=60)
AGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTT < SRR19973066.2192601/150‑1 (MQ=60)
GGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATG < SRR19973066.422409/150‑1 (MQ=60)
GGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATG < SRR19973066.2580068/150‑1 (MQ=60)
GACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGT < SRR19973066.1835880/150‑1 (MQ=60)
ACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTG < SRR19973066.3047791/150‑1 (MQ=60)
TAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTTGCGGAGCTCAGAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTC > SRR19973066.2422025/1‑150 (MQ=60)
AATTTATGCCGTATCTGGTGTCCCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCG > SRR19973066.1194250/1‑150 (MQ=60)
TATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATG > SRR19973066.2999135/1‑150 (MQ=60)
TATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATG > SRR19973066.2999170/1‑150 (MQ=60)
TATGCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATG < SRR19973066.223974/150‑1 (MQ=60)
ATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGA < SRR19973066.609181/150‑1 (MQ=60)
TGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGAC < SRR19973066.3383341/150‑1 (MQ=60)
GCCGTATCTGGTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACT < SRR19973066.3409435/150‑1 (MQ=60)
GTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAG < SRR19973066.1863691/150‑1 (MQ=60)
GTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTG < SRR19973066.2564483/150‑1 (MQ=60)
GTGTACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTG < SRR19973066.3436580/150‑1 (MQ=60)
TGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGG < SRR19973066.1177270/150‑1 (MQ=60)
ACCGGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGATC < SRR19973066.2233772/150‑1 (MQ=60)
|
TATATCACCCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACTAAGACATTTGGATC > CP009273/1523653‑1523948
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
