Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F142 I0 R1
|
859 |
274.6 |
8723680 |
96.4% |
8409627 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,566,392 |
A→T |
24.6% |
intergenic (‑90/+272) |
gadB ← / ← pqqL |
glutamate decarboxylase B, PLP‑dependent/putative periplasmic M16 family zinc metalloendopeptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,566,392 | 0 | A | T | 24.6%
| 290.4
/ 107.0
| 138 | intergenic (‑90/+272) | gadB/pqqL | glutamate decarboxylase B, PLP‑dependent/putative periplasmic M16 family zinc metalloendopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (53/51); new base T (15/19); total (68/70) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.56e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
CGCACCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCTGTGTCTCCTGAATTATCACGTAAAAA > CP009273/1566243‑1566541
|
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aaaCGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCt < 1:1793667/150‑1 (MQ=255)
aaCGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTa < 2:271273/150‑1 (MQ=255)
aaCGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTa > 1:1735699/1‑150 (MQ=255)
cGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAAt > 2:251465/1‑150 (MQ=255)
cGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAAt > 2:251348/1‑150 (MQ=255)
cGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAAt > 2:3849458/1‑150 (MQ=255)
cGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAAt > 1:1594392/1‑150 (MQ=255)
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gAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGtt < 1:1639922/150‑1 (MQ=255)
gAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGtt < 2:1774636/150‑1 (MQ=255)
gAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGtt > 1:270088/1‑150 (MQ=255)
tagAGTAGTTCCTACCTTAAATCCGTTACTTGATTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGttatt < 2:1863390/148‑1 (MQ=255)
tCGTGTAGTTCCGTCCTTAAATCCGTTTCGTGGGTCTTATCCATTTTAAACTCCTTTAAATTTTTTGTTCGGATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGttatt < 2:3184734/150‑1 (MQ=255)
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cgtgtattTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGttattt < 1:2745101/147‑1 (MQ=255)
gAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGttattta < 1:1096461/150‑1 (MQ=255)
agtagtTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGttatttat > 1:116368/1‑150 (MQ=255)
tCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTgag < 2:2719497/150‑1 (MQ=255)
gACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAATGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGata > 2:4289465/1‑150 (MQ=255)
gACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGata > 1:4159328/1‑150 (MQ=255)
gACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATGGTgtgtta > 2:4290373/1‑145 (MQ=255)
aaTCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTAcgcg < 2:802830/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTAcgcg < 1:3921105/150‑1 (MQ=255)
ctCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAACGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGa < 2:296893/149‑1 (MQ=255)
aTCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGa < 2:296508/150‑1 (MQ=255)
tCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGaa < 1:1013496/150‑1 (MQ=255)
ccGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGaat < 2:3798843/150‑1 (MQ=255)
cGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGaata > 2:1088264/1‑150 (MQ=255)
gTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGaataa < 1:4245125/150‑1 (MQ=255)
ttACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGaataat < 2:1962964/150‑1 (MQ=255)
ttACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGaataat < 1:1560232/150‑1 (MQ=255)
ttACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGaataat < 1:1560223/150‑1 (MQ=255)
tACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAataata < 1:2733878/150‑1 (MQ=255)
tACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAataata < 1:1864483/150‑1 (MQ=255)
cTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATAtt > 1:345572/1‑150 (MQ=255)
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ttGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATAttt < 1:663042/150‑1 (MQ=255)
tGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATAtttt > 1:814358/1‑150 (MQ=255)
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gCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATAttttt < 2:366227/150‑1 (MQ=255)
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ttATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCAtt > 2:911284/1‑150 (MQ=255)
aTCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGa > 1:3654807/1‑150 (MQ=255)
aTCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGa > 1:1283001/1‑150 (MQ=255)
aTCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGa > 1:4198162/1‑150 (MQ=255)
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aaCTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAacaatac > 1:2461590/1‑150 (MQ=255)
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aaTGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAAt > 2:3078861/1‑150 (MQ=255)
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tGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTc > 1:256575/1‑150 (MQ=255)
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ggATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATCTGAAATTCTTggg > 2:4012137/1‑150 (MQ=255)
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ggATCGAATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTggg < 2:635366/150‑1 (MQ=255)
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gCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGggtggtg < 2:3267592/150‑1 (MQ=255)
cATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGggtggtgg < 2:3773028/150‑1 (MQ=255)
cATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGggtggtgg < 2:2854877/150‑1 (MQ=255)
cATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGggtggtgg < 2:1105627/150‑1 (MQ=255)
cATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGggtggtgg > 1:699442/1‑150 (MQ=255)
aaaaaaGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAg > 1:2577912/1‑150 (MQ=255)
aaaaGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGgt < 2:2003721/150‑1 (MQ=255)
aaaaGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGgt < 1:2059111/150‑1 (MQ=255)
aaGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGgtgt > 1:633935/1‑150 (MQ=255)
aaGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGgtgt < 1:3183093/150‑1 (MQ=255)
tAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGtttt > 2:2221946/1‑150 (MQ=255)
tAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGtttt > 2:2221957/1‑150 (MQ=255)
tttATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCt < 1:3269017/150‑1 (MQ=255)
tATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGt > 2:3100292/1‑150 (MQ=255)
tATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGt > 2:3100295/1‑150 (MQ=255)
tATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGt > 2:374218/1‑150 (MQ=255)
tATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGt < 2:4178481/150‑1 (MQ=255)
tATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAAATTAATTTATCGTGAGATATAACGCGAATAAAAATTTTTCATAGAAAAAAAATACAAAATGAAATACTTGGTTGGTGGTAATTTCTTTTATGCttt > 1:2535250/1‑148 (MQ=255)
aTCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGtt < 2:3264280/150‑1 (MQ=255)
cGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAGATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTAt > 1:3604110/1‑150 (MQ=255)
cGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTAt > 1:1328831/1‑150 (MQ=255)
aTAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTAttt > 2:1305503/1‑150 (MQ=255)
aaGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTa > 2:468305/1‑150 (MQ=255)
tAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATgc > 1:2160230/1‑150 (MQ=255)
cAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCAt < 1:493856/150‑1 (MQ=255)
aGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACTAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTc > 1:1976995/1‑150 (MQ=255)
gCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCtgt > 1:2194229/1‑150 (MQ=255)
cAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCtgtg > 2:1114749/1‑150 (MQ=255)
aaGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCTGTGtc > 1:2985293/1‑150 (MQ=255)
ggACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCTGTGtctc > 2:4210718/1‑150 (MQ=255)
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aaTAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCTGTGTCTCCTGAATTATCACg < 1:537604/150‑1 (MQ=255)
aaCAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCTGTGTCTCCTGAATTATCACGTaa > 1:908403/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCTGTGTCTCCTGAATTATCACGTaaaaa > 1:3334896/1‑150 (MQ=255)
|
CGCACCAAAACGTGAATCGAGTAGTTCCGACCTTAAATCCGTTACTTGCTTCTTATCCATTTTAAACTCCTTAAAATGATTGGATCGCATTAAAAAAGTAGGATTTATCGATAAAGTAAGCAAGTGCAAAGGACTCGTGTTTAAATAACAAAATCCTAATGTTATTTATCGTGAGATATTACGCGAATAATATTTTTTCATTGAAAAACAATACAATATGAAATTCTTGGGTGGTGGTAAGGTGTTTTATGCTGTTATTTTTATGCGCATTCTGTGTCTCCTGAATTATCACGTAAAAA > CP009273/1566243‑1566541
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
