Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F142 I0 R1
|
859 |
274.6 |
8723680 |
96.4% |
8409627 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,999,632 |
G→T |
92.3% |
intergenic (+73/‑5) |
fliT → / → amyA |
putative flagellar synthesis and assembly chaperone/cytoplasmic alpha‑amylase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,999,632 | 0 | G | T | 92.3%
| 873.3
/ 55.8
| 283 | intergenic (+73/‑5) | fliT/amyA | putative flagellar synthesis and assembly chaperone/cytoplasmic alpha‑amylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (16/5); new base T (137/124); total (154/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.13e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GGTGCAAAAATCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATAAAGGCG > CP009273/1999484‑1999778
|
ggTGCAAAAATCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCga < 1:2788548/150‑1 (MQ=255)
gTGCAAAAATCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCtaa > 1:2549597/1‑150 (MQ=255)
aaTCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCg < 2:1036625/150‑1 (MQ=255)
aTCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGt > 2:486585/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGt < 1:3240800/150‑1 (MQ=255)
tCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTa < 1:737667/150‑1 (MQ=255)
cGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTaa > 1:4269063/1‑150 (MQ=255)
cGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTaa > 1:1624863/1‑150 (MQ=255)
ggTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAAt < 1:1870189/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAAt > 1:1154241/1‑150 (MQ=255)
tgtTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATcc < 2:3937915/150‑1 (MQ=255)
gtTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATccc < 1:1282146/150‑1 (MQ=255)
gtTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATccc > 2:1143974/1‑150 (MQ=255)
gtTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATacc > 2:4029488/1‑150 (MQ=255)
ttAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCa > 2:732489/1‑150 (MQ=255)
tAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCAc < 1:3639915/150‑1 (MQ=255)
aaGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACg > 2:1213507/1‑150 (MQ=255)
aaGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACg < 2:1320745/150‑1 (MQ=255)
gTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCt < 1:2666491/150‑1 (MQ=255)
gTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCt > 1:1250826/1‑150 (MQ=255)
ccTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGtt > 2:4133722/1‑150 (MQ=255)
cTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTATTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAAAGCGTAATCCCACGcaggtc > 2:3084084/1‑145 (MQ=255)
tATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTAc > 1:1387207/1‑150 (MQ=255)
ggCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAAt > 2:3377393/1‑150 (MQ=255)
gATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGtt > 2:3988675/1‑150 (MQ=255)
gATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGtt > 1:3166142/1‑150 (MQ=255)
aGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCa < 1:716927/150‑1 (MQ=255)
aGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCGTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCa > 1:3047449/1‑150 (MQ=255)
gggCGTCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTATTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCAc < 1:3099473/150‑1 (MQ=255)
gggCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCAc < 2:2252560/150‑1 (MQ=255)
ggcggcTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACt > 2:1335097/1‑150 (MQ=255)
ggcTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGt > 2:2790416/1‑150 (MQ=255)
gcTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTa > 2:2604409/1‑150 (MQ=255)
cTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTAt < 1:1524940/150‑1 (MQ=255)
cTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTAt < 1:2504137/150‑1 (MQ=255)
cTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTAt < 1:3551724/150‑1 (MQ=255)
cTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTAt > 1:1007165/1‑150 (MQ=255)
tttGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTAtt < 2:1217949/150‑1 (MQ=255)
ttGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTa < 2:2573872/150‑1 (MQ=255)
tgCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTAccc < 2:3065618/150‑1 (MQ=255)
gCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGt > 1:2812797/1‑150 (MQ=255)
aGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTaa < 2:1745442/150‑1 (MQ=255)
gATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATTGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGc < 1:1368893/150‑1 (MQ=255)
aTAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGct > 1:3777672/1‑150 (MQ=255)
aTAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGct < 1:1431419/150‑1 (MQ=255)
aTAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGct > 2:3226514/1‑150 (MQ=255)
tAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctc > 2:1225774/1‑150 (MQ=255)
tAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctc > 2:3568420/1‑150 (MQ=255)
aaCCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctct > 2:3674029/1‑150 (MQ=255)
aaCCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctct < 1:1074108/150‑1 (MQ=255)
aaCCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctct > 1:2316928/1‑150 (MQ=255)
aCCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTg < 1:1163809/150‑1 (MQ=255)
aCCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTg > 1:2202367/1‑150 (MQ=255)
ccTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTCCCCGGAAGGCGGTAAGCTCTgg > 2:1811547/1‑150 (MQ=255)
ctTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCt > 2:1565525/1‑150 (MQ=255)
ctTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCt > 2:272856/1‑150 (MQ=255)
ttttGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTg > 1:1858695/1‑150 (MQ=255)
ttttGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTg > 1:391236/1‑150 (MQ=255)
tttGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGa < 2:4224131/150‑1 (MQ=255)
tttGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGa > 2:2869663/1‑150 (MQ=255)
aTCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTgg > 1:497679/1‑150 (MQ=255)
aTCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTgg > 1:465637/1‑150 (MQ=255)
aTCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTgg < 2:1559425/150‑1 (MQ=255)
cTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGcc < 1:4091205/150‑1 (MQ=255)
tGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTCATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACCATGTTGTCACTGGTATTCCCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGACCGGGCCg > 1:3357708/1‑150 (MQ=255)
aaTGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAg < 1:2627531/150‑1 (MQ=255)
aaTGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAg < 1:959728/150‑1 (MQ=255)
gAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAgcgc > 1:2880991/1‑150 (MQ=255)
cGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCg < 1:1600338/150‑1 (MQ=255)
gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGa < 2:2129454/150‑1 (MQ=255)
aTGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGAc < 2:2321058/150‑1 (MQ=255)
aTGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGAc > 1:2046830/1‑150 (MQ=255)
tGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACg > 1:2300125/1‑150 (MQ=255)
cgcgAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGtttt < 2:68589/150‑1 (MQ=255)
gAATAATCCGATTACGGATACGCTTCTAATGTTCCCCTTTAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAAt < 2:533956/150‑1 (MQ=255)
aataatCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATg > 2:1904858/1‑150 (MQ=255)
ataatCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGa > 1:873435/1‑150 (MQ=255)
taatCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGat > 1:1977018/1‑150 (MQ=255)
aatCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGata > 2:2851949/1‑150 (MQ=255)
cGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTgg < 1:3681482/150‑1 (MQ=255)
cGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTgg < 2:3447710/150‑1 (MQ=255)
gATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGt > 2:382454/1‑150 (MQ=255)
ttACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTAt < 2:2088224/150‑1 (MQ=255)
ttACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTAt < 1:692872/150‑1 (MQ=255)
cTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAatat < 1:3890668/150‑1 (MQ=255)
tACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATg < 2:1177804/150‑1 (MQ=255)
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ATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCT < SRR19973079.1439157/150‑1 (MQ=60)
ATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCT < SRR19973079.1439179/150‑1 (MQ=60)
ATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCT < SRR19973079.1439124/150‑1 (MQ=60)
ATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCT > SRR19973079.3797025/1‑150 (MQ=60)
AACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCT < SRR19973079.1079854/150‑1 (MQ=60)
AACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCT < SRR19973079.1079972/150‑1 (MQ=60)
AACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCT > SRR19973079.2328956/1‑150 (MQ=60)
AACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCT > SRR19973079.3368525/1‑150 (MQ=60)
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ACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTG > SRR19973079.2213720/1‑150 (MQ=60)
ACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTG < SRR19973079.1170515/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCC > SRR19973079.1806227/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCC < SRR19973079.3392558/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCC < SRR19973079.732410/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCT < SRR19973079.177822/150‑1 (MQ=60)
TTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTG > SRR19973079.393478/1‑150 (MQ=60)
TTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTG > SRR19973079.1868543/1‑150 (MQ=60)
TTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTG > SRR19973079.1868589/1‑150 (MQ=60)
TAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACT > SRR19973079.4318334/1‑150 (MQ=60)
GAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACT < SRR19973079.2915466/150‑1 (MQ=60)
GAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACT > SRR19973079.3169869/1‑150 (MQ=60)
AATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTG > SRR19973079.3114018/1‑150 (MQ=60)
ATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGG > SRR19973079.468443/1‑150 (MQ=60)
ATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGG > SRR19973079.1895164/1‑150 (MQ=60)
ATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGG > SRR19973079.468444/1‑150 (MQ=60)
ATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGG > SRR19973079.500708/1‑150 (MQ=60)
CTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCC > SRR19973079.2650774/1‑150 (MQ=60)
CTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCC < SRR19973079.4111938/150‑1 (MQ=60)
TGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTCATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACCATGTTGTCACTGGTATTCCCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGACCGGGCCG > SRR19973079.3374965/1‑150 (MQ=60)
AATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAG < SRR19973079.965128/150‑1 (MQ=60)
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AATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAG < SRR19973079.2641102/150‑1 (MQ=60)
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CGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCG < SRR19973079.1609129/150‑1 (MQ=60)
GATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGA > SRR19973079.943138/1‑150 (MQ=60)
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GAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAAT < SRR19973079.853518/150‑1 (MQ=60)
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TAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGAT > SRR19973079.1987515/1‑150 (MQ=60)
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GATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGT > SRR19973079.3866633/1‑150 (MQ=60)
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TCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGG > SRR19973079.1354063/1‑150 (MQ=60)
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TAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATAAAGGCGCAT > SRR19973079.3709790/1‑150 (MQ=60)
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GGTGCAAAAATCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATAAAGGCGCAT > CP009273/1999484‑1999781
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |