Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
255,899 |
G→A |
intergenic (‑88/‑200) |
phoE ← / → proB |
outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamate kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 255,899 | 0 | G | A | 99.5%
| 715.5
/ ‑3.2
| 214 | intergenic (‑88/‑200) | phoE/proB | outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (107/106); minor base . (0/1); total (107/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CTGTACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAGATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACCGACGACAGTCC > CP009273/255752‑256045
|
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tACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatata < 1:857330/150‑1 (MQ=255)
tACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatata < 1:896710/150‑1 (MQ=255)
aCAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatatat < 1:1447627/150‑1 (MQ=255)
aCAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatatat < 1:1447139/150‑1 (MQ=255)
agatgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTa > 2:3722431/1‑150 (MQ=255)
atgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACa > 1:3660958/1‑150 (MQ=255)
atgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACa < 1:1714141/150‑1 (MQ=255)
tgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAg < 2:1503395/150‑1 (MQ=255)
tgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAg < 1:2695060/150‑1 (MQ=255)
cagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTCATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGAt > 2:2106398/1‑150 (MQ=255)
cagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGAt < 1:544548/150‑1 (MQ=255)
cacaATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAAAAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTaataat > 1:2843162/1‑150 (MQ=255)
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aaTGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATAtt > 2:1986015/1‑150 (MQ=255)
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gCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCtt < 1:494457/150‑1 (MQ=255)
cccATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTa > 2:31640/1‑150 (MQ=255)
ccATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaa > 2:2586195/1‑150 (MQ=255)
ccATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaa > 2:1858688/1‑150 (MQ=255)
aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 2:3637628/1‑150 (MQ=255)
aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 2:1527734/1‑150 (MQ=255)
aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 1:1177686/1‑150 (MQ=255)
aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 2:3476984/1‑150 (MQ=255)
tCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAt > 2:1045500/1‑150 (MQ=255)
caccacTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAtg > 1:3577762/1‑150 (MQ=255)
accacTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAtgt < 2:1444688/150‑1 (MQ=255)
ccacTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAtgtg > 1:3026846/1‑150 (MQ=255)
acTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGt > 1:163508/1‑150 (MQ=255)
cTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTa < 1:3726858/150‑1 (MQ=255)
aTGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAAtt > 1:364682/1‑150 (MQ=255)
cAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACATATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATttatt > 1:2248804/1‑150 (MQ=255)
agagTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATttatta < 1:2383084/150‑1 (MQ=255)
gagTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTaa < 1:2644366/150‑1 (MQ=255)
agTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTaaa > 2:3190775/1‑150 (MQ=255)
tGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATc < 2:3510786/150‑1 (MQ=255)
tctTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGt > 2:3616070/1‑150 (MQ=255)
cattttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATaaaa > 2:2009892/1‑150 (MQ=255)
cattttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATaaaa > 1:3760016/1‑150 (MQ=255)
cattttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATaaaa > 1:1864199/1‑150 (MQ=255)
ttttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGc < 2:2120444/150‑1 (MQ=255)
ttttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGc > 2:2315638/1‑150 (MQ=255)
tttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCg > 2:1683817/1‑150 (MQ=255)
tttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCg < 2:2110563/150‑1 (MQ=255)
tttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCg < 2:2980691/150‑1 (MQ=255)
ttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGt > 1:1030913/1‑150 (MQ=255)
tcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGACCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTa > 2:1824241/1‑150 (MQ=255)
cattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaa < 1:3384674/150‑1 (MQ=255)
cattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaa > 1:3651185/1‑150 (MQ=255)
attCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaaa > 1:3295641/1‑150 (MQ=255)
attCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaaa > 1:1265137/1‑150 (MQ=255)
ccTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAaacaa < 2:496479/150‑1 (MQ=255)
cTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAaacaac < 1:1833596/150‑1 (MQ=255)
cTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAaacaac > 1:1556329/1‑150 (MQ=255)
tGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACt < 1:2525430/150‑1 (MQ=255)
gATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTg > 1:784690/1‑150 (MQ=255)
ttttAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGcc < 2:1348776/150‑1 (MQ=255)
taattaaCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCt > 2:3132319/1‑150 (MQ=255)
aattaaCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTa > 1:3066024/1‑150 (MQ=255)
aaCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCTCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCt > 1:750834/1‑150 (MQ=255)
aCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCtt < 1:3352803/150‑1 (MQ=255)
cgcgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTg > 2:1167371/1‑150 (MQ=255)
cgcgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTg < 2:2715559/150‑1 (MQ=255)
cgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAGTATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCt < 2:2089966/150‑1 (MQ=255)
cgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCt < 2:3805438/150‑1 (MQ=255)
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gcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTg < 1:1207762/150‑1 (MQ=255)
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cgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGa < 1:814240/150‑1 (MQ=255)
gAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGAt < 2:236744/150‑1 (MQ=255)
aaTATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATc > 2:3084095/1‑150 (MQ=255)
atatTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATcc > 2:889593/1‑150 (MQ=255)
tatTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATccc < 1:2505632/150‑1 (MQ=255)
tatTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATccc < 1:1027790/150‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCcgcg < 1:34307/150‑1 (MQ=255)
tCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCcgcg < 1:3012199/150‑1 (MQ=255)
gagTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAAc > 1:598189/1‑150 (MQ=255)
gagTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAAc < 2:1089838/150‑1 (MQ=255)
gTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGc > 1:2162397/1‑150 (MQ=255)
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TACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAGATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACCGACGACAGTCCTGC > CP009273/255755‑256048
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
