Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
699,167 |
(T)6→7 |
intergenic (‑100/‑233) |
nagB ← / → nagE |
glucosamine‑6‑phosphate deaminase/fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 699,161 | 1 | . | T | 99.5%
| 707.1
/ ‑3.2
| 214 | intergenic (‑94/‑239) | nagB/nagE | glucosamine‑6‑phosphate deaminase/fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base T (94/119); total (95/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
TGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTA > CP009273/699012‑699305
|
tGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGa < 2:2090604/150‑1 (MQ=255)
tGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGa < 1:1383691/150‑1 (MQ=255)
ggCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t < 1:2822090/150‑1 (MQ=255)
gCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑t < 1:602225/150‑1 (MQ=255)
gCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑t < 1:2916353/150‑1 (MQ=255)
gCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑t < 1:1274699/150‑1 (MQ=255)
cGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑tt < 1:1111876/150‑1 (MQ=255)
cGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑tt > 2:1916854/1‑150 (MQ=255)
gAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑ttt > 1:44185/1‑150 (MQ=255)
gAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑ttt < 1:3572629/150‑1 (MQ=255)
gcagcCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑ttttt < 1:2920897/150‑1 (MQ=255)
cagcCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑tttttt > 1:2348083/1‑149 (MQ=255)
cagcCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑tttttt < 1:3400759/150‑2 (MQ=255)
agcCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑ttttttg < 1:1558797/150‑3 (MQ=255)
gcCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑t‑ttttttga < 2:160907/150‑4 (MQ=255)
ttGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATa < 1:1605288/150‑1 (MQ=255)
ttGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGANa < 1:2024906/150‑1 (MQ=255)
tGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATaa < 1:1921228/150‑1 (MQ=255)
cGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAAt > 1:1745797/1‑150 (MQ=255)
aCCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATaa > 1:2986751/1‑150 (MQ=255)
tGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGtt < 2:759412/150‑1 (MQ=255)
ttCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGtttt < 1:2669234/150‑1 (MQ=255)
cAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCt < 1:1340627/150‑1 (MQ=255)
cAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCt < 2:1060067/150‑1 (MQ=255)
cAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCt < 1:2537645/150‑1 (MQ=255)
aGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTg < 2:2923217/150‑1 (MQ=255)
cGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGt < 1:2052854/150‑1 (MQ=255)
ggTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGtt < 1:1830382/150‑1 (MQ=255)
ggTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGtt > 2:1191649/1‑150 (MQ=255)
ggTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGtt < 2:3132804/150‑1 (MQ=255)
gTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCTGATTAGTCATCTTTAATCGTAACCTGTATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCTACCTGA‑TATTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTATTGttt > 1:2607704/1‑150 (MQ=255)
gTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGttt < 2:353983/150‑1 (MQ=255)
aGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAg > 1:2884751/1‑150 (MQ=255)
aGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAg < 1:3662900/150‑1 (MQ=255)
gTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGc < 1:2105411/150‑1 (MQ=255)
tCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGcc < 1:614579/150‑1 (MQ=255)
ggggATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTa > 1:942210/1‑150 (MQ=255)
ggATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTaaa > 1:3358126/1‑150 (MQ=255)
gATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTaaaa < 1:503670/150‑1 (MQ=255)
aTCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAg > 2:2573762/1‑150 (MQ=255)
cAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAggg > 1:510603/1‑150 (MQ=255)
aGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGa > 1:3581582/1‑150 (MQ=255)
ctcATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTg < 1:585280/150‑1 (MQ=255)
ctcATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTg < 1:763648/150‑1 (MQ=255)
ctcATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTg < 2:3269510/150‑1 (MQ=255)
ctcATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTg < 1:1100172/150‑1 (MQ=255)
tcATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGa > 2:670461/1‑150 (MQ=255)
tcATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGa > 2:832485/1‑150 (MQ=255)
tattCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGataat > 2:1709048/1‑150 (MQ=255)
atacACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCTTTGGAGGATTAGGCATCTTTAATCTTAACCTGGATTTGCTCAGACAGGATTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATAATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGACAGTAAAAGGGAGTGataata > 1:2150016/4‑150 (MQ=255)
ttCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGAtaataa > 1:1740173/1‑150 (MQ=255)
cAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATAtt > 2:670742/1‑150 (MQ=255)
cAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATAtt < 1:703716/150‑1 (MQ=255)
aaGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGt < 2:423627/150‑1 (MQ=255)
aaGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGt < 2:1265744/150‑1 (MQ=255)
aaGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGt < 2:673966/150‑1 (MQ=255)
tAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGAc > 1:325572/1‑150 (MQ=255)
tAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGAc > 2:1031679/1‑150 (MQ=255)
tGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAAc > 1:2623408/1‑150 (MQ=255)
tGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAAc < 1:3242130/150‑1 (MQ=255)
gTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACt < 1:3046489/150‑1 (MQ=255)
gTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACt < 1:1145617/150‑1 (MQ=255)
cGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGacac > 2:1241889/1‑150 (MQ=255)
ggATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACAcg > 1:3803416/1‑150 (MQ=255)
ggATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACAcg > 2:1461787/1‑150 (MQ=255)
aTTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACAcgcg > 2:742264/1‑150 (MQ=255)
aTTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACAcgcg < 1:2417383/150‑1 (MQ=255)
aGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGttt < 2:594089/150‑1 (MQ=255)
aGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGttt < 1:1766315/150‑1 (MQ=255)
aGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGttt < 2:2959414/150‑1 (MQ=255)
ggCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTa < 1:115020/150‑1 (MQ=255)
ggCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTa < 2:466584/150‑1 (MQ=255)
ggCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTa < 1:1330253/150‑1 (MQ=255)
atatttAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCTTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAAtt < 2:3391338/147‑1 (MQ=255)
aTCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAAtt > 2:2049736/1‑150 (MQ=255)
cTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTg > 2:3641526/1‑150 (MQ=255)
ttAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCg > 1:2495405/1‑150 (MQ=255)
cGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAATCTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACg > 2:2221672/1‑150 (MQ=255)
ccTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTa > 2:2709457/1‑150 (MQ=255)
ccTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTa < 1:3579132/150‑1 (MQ=255)
tGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATATTATAAGTTTTCTGGTTTATCAAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGAGATAAGAATTaaa > 1:3755561/1‑150 (MQ=255)
gATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAAtt > 1:2786190/1‑150 (MQ=255)
ttGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTc < 2:2728314/150‑1 (MQ=255)
ttGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTc < 1:1661348/150‑1 (MQ=255)
gcAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTcacac < 1:1901344/150‑1 (MQ=255)
cAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTcacaca < 1:104502/150‑1 (MQ=255)
cAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTcacaca < 1:2013741/150‑1 (MQ=255)
gACTGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTTATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACAct < 2:499855/150‑1 (MQ=255)
cGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAg < 2:1745797/150‑1 (MQ=255)
gTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCAAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATAATTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTAGCGATACGAATTAAATTTTCACACACACTGTAGc > 1:2433104/1‑150 (MQ=255)
aaTCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAga > 1:1510717/1‑150 (MQ=255)
aaTCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAga < 2:1071381/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAga > 1:3704541/1‑150 (MQ=255)
aTCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAgat > 1:181953/1‑150 (MQ=255)
gNCCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATc > 1:883184/1‑150 (MQ=255)
gACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATc > 2:2457842/1‑150 (MQ=255)
aCCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCt < 2:2767760/150‑1 (MQ=255)
aCCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCt > 2:2291491/1‑150 (MQ=255)
aCCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCt > 2:1768558/1‑150 (MQ=255)
ccTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTATCAGATGATCTa > 1:3296108/1‑150 (MQ=255)
|
TGGCGAGCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTA > CP009273/699012‑699305
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACAATCTG > CP009273/699018‑699313
|
GCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTT < SRR19973061.2928400/150‑1 (MQ=60)
CAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTTT < SRR19973061.3409493/150‑1 (MQ=60)
CAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTTT > SRR19973061.2354047/1‑150 (MQ=60)
AGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTTtg < SRR19973061.1562672/150‑3 (MQ=60)
CCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAA < SRR19973061.1191819/150‑1 (MQ=60)
TTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATA < SRR19973061.1609282/150‑1 (MQ=60)
TTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATA < SRR19973061.1609283/150‑1 (MQ=60)
TTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGANA < SRR19973061.2029992/150‑1 (MQ=60)
TGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAA < SRR19973061.1926038/150‑1 (MQ=60)
TGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAA < SRR19973061.1925995/150‑1 (MQ=60)
CCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAA > SRR19973061.2705745/1‑150 (MQ=60)
CCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAA > SRR19973061.751237/1‑150 (MQ=60)
CGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAAT > SRR19973061.1750183/1‑150 (MQ=60)
ACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAA > SRR19973061.2994456/1‑150 (MQ=60)
CTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGT < SRR19973061.1768176/150‑1 (MQ=60)
TGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTT > SRR19973061.1741221/1‑150 (MQ=60)
GTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTT > SRR19973061.1644404/1‑150 (MQ=60)
TTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTT < SRR19973061.2676102/150‑1 (MQ=60)
TTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTT < SRR19973061.505302/150‑1 (MQ=60)
TCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTC < SRR19973061.3377869/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCT < SRR19973061.3767408/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCT < SRR19973061.2544105/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCT < SRR19973061.1343997/150‑1 (MQ=60)
CAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCT < SRR19973061.1343945/150‑1 (MQ=60)
CGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGT < SRR19973061.2058016/150‑1 (MQ=60)
GGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTT < SRR19973061.1834963/150‑1 (MQ=60)
GGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTT < SRR19973061.1834969/150‑1 (MQ=60)
GTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCTGATTAGTCATCTTTAATCGTAACCTGTATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCTACCTGA‑TATTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTATTGTTT > SRR19973061.2614407/1‑150 (MQ=60)
GTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTT < SRR19973061.2234878/150‑1 (MQ=60)
TAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTA < SRR19973061.3737870/150‑1 (MQ=60)
AGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAG < SRR19973061.3672263/150‑1 (MQ=60)
AGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAG < SRR19973061.3672260/150‑1 (MQ=60)
AGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAG < SRR19973061.3672005/150‑1 (MQ=60)
AGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAG > SRR19973061.2892148/1‑150 (MQ=60)
GTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGC < SRR19973061.2110695/150‑1 (MQ=60)
GTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGC < SRR19973061.2110686/150‑1 (MQ=60)
TCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCC < SRR19973061.616515/150‑1 (MQ=60)
TCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCC < SRR19973061.616159/150‑1 (MQ=60)
GGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTA > SRR19973061.944601/1‑150 (MQ=60)
GGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCCGTAAA > SRR19973061.2967051/1‑150 (MQ=60)
GGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAA > SRR19973061.3366763/1‑150 (MQ=60)
GATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAA < SRR19973061.505001/150‑1 (MQ=60)
GATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAA < SRR19973061.474781/150‑1 (MQ=60)
TCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGG > SRR19973061.3114922/1‑150 (MQ=60)
CAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGG > SRR19973061.511951/1‑150 (MQ=60)
CAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGG > SRR19973061.511982/1‑150 (MQ=60)
AGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGA > SRR19973061.3590703/1‑150 (MQ=60)
AGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGA > SRR19973061.2926811/1‑150 (MQ=60)
AGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGA > SRR19973061.3590763/1‑150 (MQ=60)
GTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAG < SRR19973061.2428172/150‑1 (MQ=60)
TCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGT < SRR19973061.1739067/150‑1 (MQ=60)
TCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGT < SRR19973061.680843/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG < SRR19973061.586650/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG < SRR19973061.1102987/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG < SRR19973061.894985/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG < SRR19973061.586805/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG < SRR19973061.2065435/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG < SRR19973061.2803823/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG > SRR19973061.2774882/1‑150 (MQ=60)
CTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTG < SRR19973061.765652/150‑1 (MQ=60)
TCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGA > SRR19973061.595637/1‑150 (MQ=60)
TATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAAT > SRR19973061.3426666/1‑150 (MQ=60)
ATACACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCTTTGGAGGATTAGGCATCTTTAATCTTAACCTGGATTTGCTCAGACAGGATTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATAATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGACAGTAAAAGGGAGTGATAATA > SRR19973061.2155416/1‑150 (MQ=60)
TTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAA > SRR19973061.1744546/1‑150 (MQ=60)
TTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAA > SRR19973061.1744551/1‑150 (MQ=60)
CACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACG > SRR19973061.467850/1‑150 (MQ=60)
TCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATAT > SRR19973061.2472544/1‑150 (MQ=60)
CAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATT < SRR19973061.705549/150‑1 (MQ=60)
CAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATT < SRR19973061.2975698/150‑1 (MQ=60)
CAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATT < SRR19973061.2617327/150‑1 (MQ=60)
AATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTT > SRR19973061.797439/1‑150 (MQ=60)
ATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTG < SRR19973061.1423825/150‑1 (MQ=60)
TAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGAC > SRR19973061.326434/1‑150 (MQ=60)
TAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGAC > SRR19973061.326422/1‑150 (MQ=60)
TGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAAC > SRR19973061.2630148/1‑150 (MQ=60)
TGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAAC < SRR19973061.3250472/150‑1 (MQ=60)
GTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACT < SRR19973061.1205116/150‑1 (MQ=60)
GTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACT < SRR19973061.1148530/150‑1 (MQ=60)
GTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACT < SRR19973061.3054362/150‑1 (MQ=60)
AGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCAC > SRR19973061.3751991/1‑150 (MQ=60)
CCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAA > SRR19973061.2915803/1‑150 (MQ=60)
CGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAA < SRR19973061.2839461/150‑1 (MQ=60)
CGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAA < SRR19973061.2839468/150‑1 (MQ=60)
GTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAA < SRR19973061.2580352/150‑1 (MQ=60)
GGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACG > SRR19973061.3813108/1‑150 (MQ=60)
GATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGC < SRR19973061.3316525/150‑1 (MQ=60)
ATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCG < SRR19973061.2423554/150‑1 (MQ=60)
ATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCG > SRR19973061.2523220/1‑150 (MQ=60)
ATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCG > SRR19973061.3454793/1‑150 (MQ=60)
TAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTT < SRR19973061.2357656/150‑1 (MQ=60)
TAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTT > SRR19973061.1949652/1‑150 (MQ=60)
AGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTT < SRR19973061.3213438/150‑1 (MQ=60)
AGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTT < SRR19973061.1770740/150‑1 (MQ=60)
GGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTA < SRR19973061.115360/150‑1 (MQ=60)
GGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTA < SRR19973061.115402/150‑1 (MQ=60)
GGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTA < SRR19973061.1333597/150‑1 (MQ=60)
GCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAA < SRR19973061.1921602/150‑1 (MQ=60)
CTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTG > SRR19973061.1095654/1‑150 (MQ=60)
TTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCG > SRR19973061.2501760/1‑150 (MQ=60)
TTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCG > SRR19973061.1380519/1‑150 (MQ=60)
TTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCG > SRR19973061.1380497/1‑150 (MQ=60)
CCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTA < SRR19973061.3588206/150‑1 (MQ=60)
CCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTA < SRR19973061.3588308/150‑1 (MQ=60)
TGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATATTATAAGTTTTCTGGTTTATCAAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGAGATAAGAATTAAA > SRR19973061.3765170/1‑150 (MQ=60)
GATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATT > SRR19973061.2793355/1‑150 (MQ=60)
ATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTT < SRR19973061.2632133/150‑1 (MQ=60)
TTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTC < SRR19973061.1665520/150‑1 (MQ=60)
TGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCA < SRR19973061.2127983/150‑1 (MQ=60)
GCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCAC < SRR19973061.2321251/150‑1 (MQ=60)
GCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACAC < SRR19973061.1905714/150‑1 (MQ=60)
GCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACAC < SRR19973061.1905719/150‑1 (MQ=60)
GCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACAC < SRR19973061.1906054/150‑1 (MQ=60)
CAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACA < SRR19973061.3258700/150‑1 (MQ=60)
CAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACA < SRR19973061.104850/150‑1 (MQ=60)
CAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACA < SRR19973061.3335759/150‑1 (MQ=60)
CAGACAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACA < SRR19973061.2018799/150‑1 (MQ=60)
CAGGCGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCT < SRR19973061.614813/150‑1 (MQ=60)
CGTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATCAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAG > SRR19973061.256872/1‑150 (MQ=60)
GTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGC > SRR19973061.2439701/1‑150 (MQ=60)
GTCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCAAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATAATTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTAGCGATACGAATTAAATTTTCACACACACTGTAGC > SRR19973061.2439312/1‑150 (MQ=60)
TCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCA > SRR19973061.1122145/1‑150 (MQ=60)
TCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCA > SRR19973061.429148/1‑150 (MQ=60)
TCAATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCA > SRR19973061.1122027/1‑150 (MQ=60)
AATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGA > SRR19973061.1514498/1‑150 (MQ=60)
AATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGA > SRR19973061.1515039/1‑150 (MQ=60)
AATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGA > SRR19973061.2022919/1‑150 (MQ=60)
AATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGA > SRR19973061.1814713/1‑150 (MQ=60)
AATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGA > SRR19973061.3714009/1‑150 (MQ=60)
ATCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGAT > SRR19973061.182511/1‑150 (MQ=60)
TCCGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTATCAGATG > SRR19973061.3687569/1‑150 (MQ=60)
CGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGAT > SRR19973061.1554752/1‑150 (MQ=60)
CGACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAAATCACAAAAGACACGCGTTTAATTTACGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGAT > SRR19973061.78561/1‑150 (MQ=60)
GNCCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATC > SRR19973061.885473/1‑150 (MQ=60)
GACCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATC > SRR19973061.3000037/1‑150 (MQ=60)
CCTGATT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAATACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTATCAGATGATCTA > SRR19973061.3304593/1‑150 (MQ=60)
gatT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACA > SRR19973061.3774501/4‑150 (MQ=60)
atT‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACAC > SRR19973061.3323091/3‑150 (MQ=60)
TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACAATCT < SRR19973061.1396016/150‑1 (MQ=60)
TTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACAATCTG < SRR19973061.573304/150‑1 (MQ=60)
|
GCAGCCCATTTGCCGACCTGTTCAGCGGTAGTCAGGGGGATCAGTCTCATTATTCACCTCAATAAGTAAAATGTAAGCCGTTGGCGGATTAGGCATCTTTAAGCGTAACCTGGATTTGCGCAGACAGGCGTCAATCCGACCTGA‑T‑TTTTTGAATGATAAAATAAGTTTTCTGGTTTAGCCAGTAAAAGGGAGTGATAATAACGATATTTGGTGACAAAACTCACAAAAGACACGCGTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACAATCTG > CP009273/699018‑699313
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |