Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
745,893 |
G→A |
S578L (TCG→TTG) |
ybgQ ← |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 745,893 | 0 | G | A | 100.0%
| 784.5
/ NA
| 234 | S578L (TCG→TTG) | ybgQ | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (107/127); total (107/127) |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAATGACGTCGAAATC > CP009273/745746‑746039
|
cATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGc > 1:2976741/1‑150 (MQ=255)
aTAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCg > 2:1251377/1‑150 (MQ=255)
aTAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCg > 1:701344/1‑150 (MQ=255)
aTAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCg > 2:2583726/1‑150 (MQ=255)
tAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCgg > 2:3503165/1‑150 (MQ=255)
gttACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGgtg < 2:2155354/148‑1 (MQ=255)
tACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTa > 2:3537297/1‑150 (MQ=255)
cAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATgg < 2:2798711/150‑1 (MQ=255)
aaaTATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGc < 1:3227016/150‑1 (MQ=255)
atCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCtgtg < 1:1045410/150‑1 (MQ=255)
tCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTgg > 1:2574273/1‑150 (MQ=255)
cACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTa > 2:2639203/1‑150 (MQ=255)
cACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTa < 1:2702615/150‑1 (MQ=255)
cTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACt < 2:3233129/150‑1 (MQ=255)
cTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACt > 2:2752251/1‑150 (MQ=255)
tCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTg > 2:1471584/1‑150 (MQ=255)
cACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGt > 2:2091841/1‑150 (MQ=255)
aCCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCATCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGtt > 2:1490797/1‑150 (MQ=255)
ccGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGtttt < 1:1814813/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGtttt < 1:3568442/150‑1 (MQ=255)
cGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTg > 2:2395838/1‑150 (MQ=255)
cTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCTGCGTTTCGTTCCACATCTTGCGGTGTTTGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCa < 2:2836074/150‑1 (MQ=255)
aaCTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGt < 1:2661515/150‑1 (MQ=255)
aaCTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGt > 1:3491457/1‑150 (MQ=255)
aCTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTc < 1:2090447/150‑1 (MQ=255)
cTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCa < 1:2413826/150‑1 (MQ=255)
tCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCAt < 1:148399/150‑1 (MQ=255)
aGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAg > 2:2262459/1‑150 (MQ=255)
tGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCa < 1:2071587/150‑1 (MQ=255)
tGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAcc < 1:1425107/150‑1 (MQ=255)
gATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAccc > 2:1692945/1‑150 (MQ=255)
gATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAccc < 2:722866/150‑1 (MQ=255)
gATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAccc < 2:796263/150‑1 (MQ=255)
agaGTGACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGCTCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCg < 2:3423395/148‑1 (MQ=255)
aTAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCg < 2:1525864/150‑1 (MQ=255)
gTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGacc > 2:812638/1‑150 (MQ=255)
gTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGacc < 2:2058300/150‑1 (MQ=255)
ttACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGacca > 2:462946/1‑150 (MQ=255)
ttACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGacca < 1:854039/150‑1 (MQ=255)
tACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGaccac < 2:1048603/150‑1 (MQ=255)
aCCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGaccacc > 2:1982355/1‑150 (MQ=255)
aCCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGaccacc > 2:2104350/1‑150 (MQ=255)
cTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTa > 2:2388061/1‑150 (MQ=255)
cTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTa < 1:1305618/150‑1 (MQ=255)
aCCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCg < 1:1826706/150‑1 (MQ=255)
ccTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCNa < 1:12309/150‑1 (MQ=255)
tGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAg < 1:3805193/150‑1 (MQ=255)
ggCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAggg < 2:1124750/150‑1 (MQ=255)
gCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAgggg < 2:2703362/150‑1 (MQ=255)
gCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAgggg < 2:3070385/150‑1 (MQ=255)
cTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGa < 2:2726433/150‑1 (MQ=255)
cTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGa < 2:2068569/150‑1 (MQ=255)
cTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGa > 1:2549667/1‑150 (MQ=255)
tCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAg < 2:310355/150‑1 (MQ=255)
tCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATc < 2:1386988/150‑1 (MQ=255)
tCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATc < 1:2014930/150‑1 (MQ=255)
ccGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCg < 1:2295542/150‑1 (MQ=255)
gATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGAt > 1:2935223/1‑150 (MQ=255)
gATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGAt < 1:1870114/150‑1 (MQ=255)
gATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATc > 1:1789607/1‑150 (MQ=255)
ttGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTAGTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTg < 2:3357280/150‑1 (MQ=255)
tGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTgg < 2:1547152/150‑1 (MQ=255)
aGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTg < 2:2574273/150‑1 (MQ=255)
aGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTg < 2:667309/150‑1 (MQ=255)
gTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGt < 1:2755204/150‑1 (MQ=255)
gCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGa < 2:96671/150‑1 (MQ=255)
cAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGAt > 1:611532/1‑150 (MQ=255)
aCATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCtt < 2:682496/150‑1 (MQ=255)
aCATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCtt < 2:528863/150‑1 (MQ=255)
aCATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCtt > 2:2529250/1‑150 (MQ=255)
aCATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCtt < 1:1161657/150‑1 (MQ=255)
cATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCttt > 1:440245/1‑150 (MQ=255)
aTGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTa > 1:931021/1‑150 (MQ=255)
tGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTAt < 1:3537297/150‑1 (MQ=255)
tGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTAt < 1:1640682/150‑1 (MQ=255)
ccAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTc < 1:2882195/150‑1 (MQ=255)
ccAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTc < 2:1652103/150‑1 (MQ=255)
cAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCg < 1:3098991/150‑1 (MQ=255)
aGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGt > 1:538927/1‑150 (MQ=255)
gCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTa > 1:559626/1‑150 (MQ=255)
gCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTa < 1:333274/150‑1 (MQ=255)
tACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTggg < 1:766428/150‑1 (MQ=255)
tACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTggg > 1:1542904/1‑150 (MQ=255)
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GTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAAT < SRR19973061.526913/150‑1 (MQ=60)
TCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATC < SRR19973061.2019978/150‑1 (MQ=60)
TCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATC < SRR19973061.2019991/150‑1 (MQ=60)
CCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCG < SRR19973061.2301348/150‑1 (MQ=60)
CGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGA > SRR19973061.1854447/1‑150 (MQ=60)
GATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGAT > SRR19973061.2942774/1‑150 (MQ=60)
GATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGAT < SRR19973061.3045296/150‑1 (MQ=60)
GATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGAT < SRR19973061.1874771/150‑1 (MQ=60)
GATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATC > SRR19973061.1794087/1‑150 (MQ=60)
ATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCT < SRR19973061.2962614/150‑1 (MQ=60)
GCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGT < SRR19973061.2394150/150‑1 (MQ=60)
CAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTT < SRR19973061.2082687/150‑1 (MQ=60)
GTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGT < SRR19973061.2762299/150‑1 (MQ=60)
TCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTC < SRR19973061.1839787/150‑1 (MQ=60)
GGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCG > SRR19973061.2654027/1‑150 (MQ=60)
GGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCG > SRR19973061.1627386/1‑150 (MQ=60)
GCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGA < SRR19973061.1802627/150‑1 (MQ=60)
GCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGA > SRR19973061.1700682/1‑150 (MQ=60)
CAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGAT > SRR19973061.613104/1‑150 (MQ=60)
ACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTT < SRR19973061.1164603/150‑1 (MQ=60)
CATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTT > SRR19973061.441441/1‑150 (MQ=60)
ATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTA > SRR19973061.933395/1‑150 (MQ=60)
TGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTAT < SRR19973061.89753/150‑1 (MQ=60)
TGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTAT < SRR19973061.1644795/150‑1 (MQ=60)
TGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTAT < SRR19973061.3546357/150‑1 (MQ=60)
CCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCT > SRR19973061.94310/1‑150 (MQ=60)
CCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCT < SRR19973061.425400/150‑1 (MQ=60)
CCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTC < SRR19973061.2889584/150‑1 (MQ=60)
CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCG < SRR19973061.3106974/150‑1 (MQ=60)
AGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGT > SRR19973061.540368/1‑150 (MQ=60)
AGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGT > SRR19973061.540348/1‑150 (MQ=60)
GCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTA < SRR19973061.334151/150‑1 (MQ=60)
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GCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTA < SRR19973061.1275110/150‑1 (MQ=60)
ATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTG > SRR19973061.3461574/1‑150 (MQ=60)
TACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGG > SRR19973061.2382969/1‑150 (MQ=60)
TACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGG < SRR19973061.768439/150‑1 (MQ=60)
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ACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGT < SRR19973061.2960667/150‑1 (MQ=60)
TTCATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGT < SRR19973061.2915113/150‑1 (MQ=60)
ATCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATT > SRR19973061.2819542/1‑150 (MQ=60)
TCCAGCGTATCGTTCCACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTG < SRR19973061.3402284/150‑1 (MQ=60)
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CACAACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAATGACGTCGAAATC < SRR19973061.3605206/150‑1 (MQ=60)
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AACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAATGACGTCGAAATCGAG < SRR19973061.721508/150‑1 (MQ=60)
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TGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAATGACGTCGAAATCGAG > CP009273/745744‑746042
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
