Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
767,399 |
A→T |
E162D (GAA→GAT) |
cydA → |
cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 767,399 | 0 | A | T | 99.6%
| 732.7
/ NA
| 220 | E162D (GAA→GAT) | cydA | cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (111/108); total (112/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TTCTTCTTCGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGAAACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTATCAGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCG > CP009273/767253‑767545
|
ttcttcttcGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACt > 1:3134858/1‑150 (MQ=255)
ttcGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGt > 2:1549554/1‑150 (MQ=255)
tcGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGCGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTa > 2:1341577/1‑150 (MQ=255)
cGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTAt > 1:3584966/1‑150 (MQ=255)
ggTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATg < 1:928472/150‑1 (MQ=255)
aTCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTCTGCGTATGGAGATgg > 2:2475669/1‑150 (MQ=255)
aTCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATgg < 2:2725498/150‑1 (MQ=255)
aTCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATgg < 1:1700831/150‑1 (MQ=255)
tCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGt < 2:1479938/150‑1 (MQ=255)
cGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTg < 2:3567767/150‑1 (MQ=255)
cGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTg > 2:162168/1‑150 (MQ=255)
tCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAg < 1:978015/150‑1 (MQ=255)
cTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGc < 1:309576/150‑1 (MQ=255)
tGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCt > 1:2088919/1‑150 (MQ=255)
tGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCt > 2:2811333/1‑150 (MQ=255)
gggTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCtt < 1:296505/150‑1 (MQ=255)
gggTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCtt < 1:296486/150‑1 (MQ=255)
gTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTtct > 2:1982589/1‑150 (MQ=255)
gTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTtct > 1:2720640/1‑150 (MQ=255)
gTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTtct > 1:160135/1‑150 (MQ=255)
gTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTtct > 1:2070587/1‑150 (MQ=255)
aaaGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTcc > 2:3461455/1‑150 (MQ=255)
aaGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCg > 2:1250569/1‑150 (MQ=255)
ttCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGc > 1:639336/1‑150 (MQ=255)
aGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTgg > 2:2364295/1‑150 (MQ=255)
aGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCGGTCCGCACTGTGGATTCTGGGTGCGAACGGCTGGATGCAAACCCCACTCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTgg < 2:3234207/150‑1 (MQ=255)
gCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGt < 2:714077/150‑1 (MQ=255)
cATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTg > 2:1738137/1‑150 (MQ=255)
atatGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCACTCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGc > 2:1960519/1‑150 (MQ=255)
atatGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGc > 2:1393732/1‑150 (MQ=255)
atGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCtt > 2:775653/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTa > 1:2344227/1‑150 (MQ=255)
tgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAAccc > 2:2470294/1‑150 (MQ=255)
cACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGt > 1:2818931/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGtt > 2:46229/1‑150 (MQ=255)
ccTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTg < 1:2686892/150‑1 (MQ=255)
tggctggTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCt > 2:2497611/1‑150 (MQ=255)
tggctggTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCt > 1:1329481/1‑150 (MQ=255)
gtggCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTg < 1:3105590/150‑1 (MQ=255)
gtggCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTg < 1:453201/150‑1 (MQ=255)
cgcTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAAt < 2:3600015/150‑1 (MQ=255)
cgcTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAAt > 2:2273269/1‑150 (MQ=255)
gcTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAAtt < 2:592213/150‑1 (MQ=255)
gcTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAAtt > 1:2919756/1‑150 (MQ=255)
cTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTc < 1:849604/150‑1 (MQ=255)
tCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCg > 2:2245393/1‑150 (MQ=255)
cGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGGGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGt > 1:1461603/1‑150 (MQ=255)
ggTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGtt < 1:2452080/150‑1 (MQ=255)
gTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTc > 1:3346970/1‑150 (MQ=255)
tCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTcac > 1:2263839/1‑150 (MQ=255)
aaaCCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCacac > 1:2552844/1‑150 (MQ=255)
ccTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATTCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGt > 1:1016690/1‑150 (MQ=255)
ccGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGt < 1:2681080/150‑1 (MQ=255)
gCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCt < 1:1250569/150‑1 (MQ=255)
gCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTAGTTCACACTGTAGCGTCt < 1:876070/150‑1 (MQ=255)
cACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTg < 1:238712/150‑1 (MQ=255)
aCTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTgg < 2:30057/150‑1 (MQ=255)
tgtgGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGtt > 1:2409315/1‑150 (MQ=255)
gtgGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTa > 2:104626/1‑150 (MQ=255)
gtgGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTa < 1:2211022/150‑1 (MQ=255)
ggATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTAtg < 1:1129434/150‑1 (MQ=255)
gATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTAtgt > 1:1290648/1‑150 (MQ=255)
aTTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCACTCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTAtgtg < 2:1278022/150‑1 (MQ=255)
aTTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTAtgtg < 2:3675176/150‑1 (MQ=255)
aTTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTAtgtg > 2:3393315/1‑150 (MQ=255)
tCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGAc > 1:2640044/1‑150 (MQ=255)
tGGTTGCGAACGGCTGGATGCTAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTg < 2:1574762/150‑1 (MQ=255)
tGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTg > 2:3689523/1‑150 (MQ=255)
gAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGAt > 2:562660/1‑150 (MQ=255)
aaCGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATg < 1:1982589/150‑1 (MQ=255)
cGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGtt < 2:583319/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTc > 2:1228932/1‑150 (MQ=255)
cTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCAt > 2:3157738/1‑150 (MQ=255)
cTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCAt > 2:2290064/1‑150 (MQ=255)
cTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCAt > 2:2135566/1‑150 (MQ=255)
ggATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATcc > 1:3683137/1‑150 (MQ=255)
gATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCt > 1:2507271/1‑150 (MQ=255)
aTGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTc < 2:3655790/150‑1 (MQ=255)
tGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCg > 2:1152960/1‑150 (MQ=255)
gCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGGTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCgg < 2:3134858/150‑1 (MQ=255)
aaaaCCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTa > 2:2899515/1‑150 (MQ=255)
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CACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTG > SRR19973061.2668805/1‑150 (MQ=60)
CACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTG < SRR19973061.239397/150‑1 (MQ=60)
CACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTG > SRR19973061.3541887/1‑150 (MQ=60)
TGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTT > SRR19973061.2415471/1‑150 (MQ=60)
GTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTA < SRR19973061.2216573/150‑1 (MQ=60)
TGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTAT < SRR19973061.2319384/150‑1 (MQ=60)
TGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTAT < SRR19973061.555024/150‑1 (MQ=60)
GGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATG < SRR19973061.1132316/150‑1 (MQ=60)
GGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATG > SRR19973061.2087724/1‑150 (MQ=60)
GATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGT > SRR19973061.1293849/1‑150 (MQ=60)
ATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTG < SRR19973061.2476586/150‑1 (MQ=60)
TTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGA > SRR19973061.2080793/1‑150 (MQ=60)
TCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGAC > SRR19973061.2646823/1‑150 (MQ=60)
GAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGAT > SRR19973061.2960821/1‑150 (MQ=60)
GAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGAT > SRR19973061.3322654/1‑150 (MQ=60)
AACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATG < SRR19973061.1987549/150‑1 (MQ=60)
AACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATG < SRR19973061.133118/150‑1 (MQ=60)
AACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATG < SRR19973061.1711355/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTT > SRR19973061.2534349/1‑150 (MQ=60)
GGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCC > SRR19973061.3692549/1‑150 (MQ=60)
GATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCT > SRR19973061.2513659/1‑150 (MQ=60)
GATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCT < SRR19973061.162672/150‑1 (MQ=60)
GCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGG > SRR19973061.3190496/1‑150 (MQ=60)
CAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGT < SRR19973061.648319/150‑1 (MQ=60)
CAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGT > SRR19973061.357483/1‑150 (MQ=60)
AAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTA < SRR19973061.1640719/150‑1 (MQ=60)
AAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTAT > SRR19973061.226325/1‑150 (MQ=60)
AAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTAT < SRR19973061.2253120/150‑1 (MQ=60)
AAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTAT > SRR19973061.861463/1‑150 (MQ=60)
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TGATACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTATCAGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCG < SRR19973061.1553408/150‑1 (MQ=60)
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TGTTCTTCTTCGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGAAACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTATCAGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCG > CP009273/767251‑767545
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
