Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,335,922 |
C→T |
H370Y (CAT→TAT) |
yciM → |
envelope integrity maintenance protein; EnvC‑interacting protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,335,922 | 0 | C | T | 100.0%
| 652.9
/ NA
| 194 | H370Y (CAT→TAT) | yciM | envelope integrity maintenance protein; EnvC‑interacting protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (84/110); total (84/110) |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTCCATTGTGCTCCGGCAACGACGGCGCAGAAAAAG > CP009273/1335775‑1336067
|
ttAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTAt > 1:2237334/1‑150 (MQ=255)
aaTGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTg > 2:3738400/1‑150 (MQ=255)
ggATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTcc < 2:168049/150‑1 (MQ=255)
aTTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGt > 2:2456932/1‑150 (MQ=255)
tACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCt < 1:3468021/150‑1 (MQ=255)
cACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGt > 1:785651/1‑150 (MQ=255)
aCTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTc < 2:3590752/150‑1 (MQ=255)
tAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCggg < 2:1330889/150‑1 (MQ=255)
tAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCggg < 1:2834517/150‑1 (MQ=255)
aaTGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGcc > 1:1248258/1‑150 (MQ=255)
aTGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCt < 1:2343929/150‑1 (MQ=255)
tGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTg > 1:112806/1‑150 (MQ=255)
ggAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAAc < 1:647833/150‑1 (MQ=255)
ggAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAAc > 2:410024/1‑150 (MQ=255)
agaagGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCAt < 2:195/150‑1 (MQ=255)
aagGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTa > 1:546005/1‑150 (MQ=255)
gCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAAcc < 1:417449/150‑1 (MQ=255)
cGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCg > 1:1550032/1‑150 (MQ=255)
cGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTATTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCg > 1:2321416/1‑150 (MQ=255)
gCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGAtt < 1:1672267/150‑1 (MQ=255)
ccAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTc > 2:2397226/1‑150 (MQ=255)
ccAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTc < 2:502284/150‑1 (MQ=255)
cAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTcg < 2:1924632/150‑1 (MQ=255)
cAAAGAGAGCCTGATGGAGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTcg < 2:1924991/150‑1 (MQ=255)
aaaGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTcgc > 2:1391996/1‑150 (MQ=255)
aaaGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTcgc < 1:3211046/150‑1 (MQ=255)
aaGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTcgcg > 2:710442/1‑150 (MQ=255)
aaGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTcgcg < 2:1591071/150‑1 (MQ=255)
agagagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCgg < 2:655318/150‑1 (MQ=255)
agagagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCgg > 2:1102573/1‑150 (MQ=255)
gagagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGt > 2:3230271/1‑150 (MQ=255)
gagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCt > 1:2948904/1‑150 (MQ=255)
gagCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCt < 1:1240120/150‑1 (MQ=255)
agCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCtt < 2:1890330/150‑1 (MQ=255)
gCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTg > 1:3065273/1‑150 (MQ=255)
gCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTg > 1:1166142/1‑150 (MQ=255)
gCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTg > 1:1823512/1‑150 (MQ=255)
ccTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGa > 1:1545997/1‑150 (MQ=255)
tGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGcc < 2:203639/150‑1 (MQ=255)
tGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGcc < 1:2509478/150‑1 (MQ=255)
tgctgcGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGt > 2:3528913/1‑150 (MQ=255)
ctgcGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTaa < 1:1898879/150‑1 (MQ=255)
ctgcGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTaa > 2:907479/1‑150 (MQ=255)
ctgcGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTaa < 1:3228988/150‑1 (MQ=255)
ctgcGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTaa < 1:1896682/150‑1 (MQ=255)
gcGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAAtt < 2:2967018/150‑1 (MQ=255)
ggTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑aaaaaa < 1:3627036/150‑1 (MQ=255)
agaAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGAc > 1:27832/1‑150 (MQ=255)
agaAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGAc > 2:1636707/1‑150 (MQ=255)
gaAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACt < 2:2657519/150‑1 (MQ=255)
gaAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACt > 2:534641/1‑150 (MQ=255)
aaGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACtt < 1:3324506/150‑1 (MQ=255)
aGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACttt < 1:751756/150‑1 (MQ=255)
cGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTa < 1:702861/150‑1 (MQ=255)
cGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTa < 1:2201729/150‑1 (MQ=255)
gtagtaAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTac < 2:3145375/150‑1 (MQ=255)
tagtaAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTaca < 2:2313942/150‑1 (MQ=255)
tagtaAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTaca < 2:854635/150‑1 (MQ=255)
agtaAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTacaa < 2:1248134/150‑1 (MQ=255)
gCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCAGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATAc < 2:3547171/150‑1 (MQ=255)
ccTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACt > 1:2683256/1‑150 (MQ=255)
cTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTa > 2:1813037/1‑150 (MQ=255)
gTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAatt < 1:2397226/150‑1 (MQ=255)
ttATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAatta > 2:2989070/1‑150 (MQ=255)
ttATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTATTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAatta < 1:2436894/150‑1 (MQ=255)
tATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCTTATTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAAACGATTAGCGGTCTTGATGGAATGTAATTTTT‑AAAAAAAATAAGACTTTAGTTACAACATAATAattat > 1:2038232/1‑150 (MQ=255)
tATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAattat > 2:897975/1‑150 (MQ=255)
aTCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAattatt > 2:3389132/1‑150 (MQ=255)
aTCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAattatt < 2:3189844/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTaa > 1:1851092/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAAt < 2:1738566/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAAt < 2:1529638/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAAt > 2:1144720/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAAt > 1:2251587/1‑150 (MQ=255)
ttGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTTAAAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAAt < 1:14179/150‑1 (MQ=255)
gCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGtt < 2:3428438/150‑1 (MQ=255)
gCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGtt < 2:1533111/150‑1 (MQ=255)
gCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGtt > 2:2587751/1‑150 (MQ=255)
ccAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTc < 2:3681065/150‑1 (MQ=255)
aGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTGATGTTCCa > 2:991732/1‑150 (MQ=255)
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GTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATT < SRR19973061.2403340/150‑1 (MQ=60)
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AAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTCCATT < SRR19973061.2570539/150‑1 (MQ=60)
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AATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTCCATTG > SRR19973061.1461301/1‑150 (MQ=60)
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ACTGGTATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTCCATTGTGCTCCGGCAACGACGGCGCAGAAAAA > SRR19973061.1938595/1‑150 (MQ=60)
TATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTCCATTGTGCTCCGGCAACGACGGCGCAGAAAAAGCCTG > SRR19973061.2752288/1‑150 (MQ=60)
TATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTCCATTGTGCTCCGGCAACGACGGCGCAGAAAAAGCCTG > SRR19973061.2753068/1‑150 (MQ=60)
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TTAATGGATTACCACTTAAATGAAGCGGAAGAAGGGCGTGCCAAAGAGAGCCTGATGGTGCTGCGTGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTACCGCATACACCCTCTACTGGCATTGTCCGTCTTGTCGGGCCTGGTCAACCATTAAACCGATTCGCGGTCTTGATGGCCTGTAATTTTT‑AAAAAAAATCCGACTTTAGTTACAACATACTAATTATTAATGTTCCATTGTGCTCCGGCAACGACGGCGCAGAAAAAGCCTG > CP009273/1335775‑1336071
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
