Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,389,852 |
G→T |
R110S (CGC→AGC) |
ynaI ← |
mechanosensitive channel protein, very small conductance |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,389,852 | 0 | G | T | 100.0%
| 823.8
/ NA
| 251 | R110S (CGC→AGC) | ynaI | mechanosensitive channel protein, very small conductance |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (127/124); total (127/124) |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
CCATACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCGACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAA > CP009273/1389705‑1389998
|
ccATACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTAc < 1:2233589/150‑1 (MQ=255)
cATACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTAcc > 1:1137755/1‑150 (MQ=255)
aTACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCt < 1:2049867/150‑1 (MQ=255)
aTACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCt < 2:3680450/150‑1 (MQ=255)
aCCGACAGCCAGACCGCCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCttt < 2:1159778/150‑1 (MQ=255)
aCCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCttt < 2:649730/150‑1 (MQ=255)
ccGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCtttt < 1:1034527/150‑1 (MQ=255)
ccGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCtttt < 1:2936619/150‑1 (MQ=255)
cGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCttttt > 2:1648426/1‑150 (MQ=255)
gACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCtttttt < 2:1473021/150‑1 (MQ=255)
cAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCATCAAGCCAGAAAGGCTCATGACGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATCTCGCTACCTTTTTTaa > 2:2064112/1‑150 (MQ=255)
cAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTaa < 2:1435250/150‑1 (MQ=255)
ccAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATct > 2:2307102/1‑150 (MQ=255)
ccAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATct < 1:2031140/150‑1 (MQ=255)
aGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATctgc < 2:3205348/150‑1 (MQ=255)
gACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATctgct > 1:3667525/1‑150 (MQ=255)
gACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATctgct > 1:379405/1‑150 (MQ=255)
gACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATctgct > 2:601283/1‑150 (MQ=255)
accaccAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATctgctg > 2:3201167/1‑150 (MQ=255)
aaTACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTc < 1:3445637/150‑1 (MQ=255)
aTACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGATATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCa < 1:660267/150‑1 (MQ=255)
caccaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACt > 2:3040621/1‑150 (MQ=255)
accaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTg > 1:1985613/1‑150 (MQ=255)
accaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTg < 2:3796393/150‑1 (MQ=255)
accaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTg > 1:2685164/1‑150 (MQ=255)
caAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGAt < 2:2741673/150‑1 (MQ=255)
caAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGAt < 1:117294/150‑1 (MQ=255)
ggTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAAt > 2:1799968/1‑150 (MQ=255)
gTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATc < 2:1668709/150‑1 (MQ=255)
aGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATcagc > 1:1227474/1‑150 (MQ=255)
gCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATcagca < 2:3598801/150‑1 (MQ=255)
ccAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAAt < 1:1506139/150‑1 (MQ=255)
ccAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAAt > 2:2505221/1‑150 (MQ=255)
cAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATa > 2:3323507/1‑150 (MQ=255)
aGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAg < 2:738402/150‑1 (MQ=255)
aaGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCtt < 2:2337565/150‑1 (MQ=255)
aaGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCtt < 2:1416205/150‑1 (MQ=255)
aGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTa > 1:1308277/1‑150 (MQ=255)
gCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAAt < 2:406885/150‑1 (MQ=255)
cTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATc < 2:2891846/150‑1 (MQ=255)
tCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCg < 1:2713909/150‑1 (MQ=255)
aTGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTc < 2:3352590/150‑1 (MQ=255)
ccGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGa > 2:1055699/1‑150 (MQ=255)
cGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGaa > 2:784786/1‑150 (MQ=255)
cGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGaa > 2:784890/1‑150 (MQ=255)
gAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAAt > 1:2251953/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATa > 1:872239/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATa < 1:335678/150‑1 (MQ=255)
aaTGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATaa > 2:2121151/1‑150 (MQ=255)
tCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCa < 1:3486216/150‑1 (MQ=255)
tCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCa < 1:3264548/150‑1 (MQ=255)
gCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAAt < 2:2772989/150‑1 (MQ=255)
ccATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATc > 1:2155253/1‑150 (MQ=255)
tAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAgg > 1:1466714/1‑150 (MQ=255)
aaaGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAggg > 1:3205179/1‑150 (MQ=255)
aaGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGa < 1:3368661/150‑1 (MQ=255)
aaGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGa > 1:1282547/1‑150 (MQ=255)
aGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGAc > 2:3089475/1‑150 (MQ=255)
cAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGt > 2:3772157/1‑150 (MQ=255)
aGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTa < 1:381787/150‑1 (MQ=255)
gAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTAc > 2:1372061/1‑150 (MQ=255)
gAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTAc > 2:2539222/1‑150 (MQ=255)
aaCAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACa < 2:62982/150‑1 (MQ=255)
cAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGa < 2:370724/150‑1 (MQ=255)
aaGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAt < 2:1006055/150‑1 (MQ=255)
aaGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAt > 1:331875/1‑150 (MQ=255)
aGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCTCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATa > 1:3625864/1‑150 (MQ=255)
caccacAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATaaa < 1:2154921/150‑1 (MQ=255)
accacAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATaaaa > 1:1837072/1‑150 (MQ=255)
accacAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATaaaa > 1:3005548/1‑150 (MQ=255)
ccacAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAAt < 2:2234110/150‑1 (MQ=255)
cacaATACTGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATc < 2:2180811/150‑1 (MQ=255)
cacaATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATc < 1:2887909/150‑1 (MQ=255)
aataatGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGAt < 2:1754405/150‑1 (MQ=255)
aatGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAAc > 1:2323550/1‑150 (MQ=255)
atGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGTACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACg > 2:3586523/1‑150 (MQ=255)
ggTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGcc > 1:1191084/1‑150 (MQ=255)
tGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTg < 2:2649179/150‑1 (MQ=255)
tgatgaTACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGa < 2:356038/150‑1 (MQ=255)
tgatgaTACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGa < 2:355587/150‑1 (MQ=255)
gatgatACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGAt < 2:1308265/150‑1 (MQ=255)
atgatACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATa < 2:1137755/150‑1 (MQ=255)
gatACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACATTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATaaa < 1:1914673/150‑1 (MQ=255)
aCGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAAttt < 2:2402656/150‑1 (MQ=255)
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cgACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAg > 1:3227911/1‑150 (MQ=255)
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AGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTA > SRR19973061.3227099/1‑150 (MQ=60)
AGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTA > SRR19973061.2347156/1‑150 (MQ=60)
AACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACA < SRR19973061.2984320/150‑1 (MQ=60)
AACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACA < SRR19973061.1090502/150‑1 (MQ=60)
AACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACA < SRR19973061.1079454/150‑1 (MQ=60)
AACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACA < SRR19973061.2199130/150‑1 (MQ=60)
AAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAT > SRR19973061.332748/1‑150 (MQ=60)
AAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAT > SRR19973061.3537637/1‑150 (MQ=60)
AAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAT > SRR19973061.3171471/1‑150 (MQ=60)
AGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCTCACTGGTGATATCTCTACCTTTTTTAATCTGATGTTTTTCAAACTAATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGACATAATAACCGCAATCAGAAACGTACAGATA > SRR19973061.3321426/1‑150 (MQ=60)
AGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCTCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATA > SRR19973061.3635137/1‑150 (MQ=60)
AGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATA > SRR19973061.806331/1‑150 (MQ=60)
AGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATA > SRR19973061.2716745/1‑150 (MQ=60)
CACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAA < SRR19973061.2160337/150‑1 (MQ=60)
ACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAA > SRR19973061.3013307/1‑150 (MQ=60)
ACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAA > SRR19973061.1841673/1‑150 (MQ=60)
CACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATC < SRR19973061.2895315/150‑1 (MQ=60)
ACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCG > SRR19973061.1417811/1‑150 (MQ=60)
AATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGAT < SRR19973061.1997515/150‑1 (MQ=60)
TAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAA < SRR19973061.1781339/150‑1 (MQ=60)
TAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAA < SRR19973061.3679747/150‑1 (MQ=60)
TAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAA > SRR19973061.95507/1‑150 (MQ=60)
AATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAAC > SRR19973061.3262874/1‑150 (MQ=60)
AATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAAC > SRR19973061.2329446/1‑150 (MQ=60)
GGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCC > SRR19973061.1194083/1‑150 (MQ=60)
GTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCT > SRR19973061.3742160/1‑150 (MQ=60)
TGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTG < SRR19973061.325403/150‑1 (MQ=60)
TGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTG > SRR19973061.2882679/1‑150 (MQ=60)
TGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTG > SRR19973061.1971664/1‑150 (MQ=60)
TTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGT < SRR19973061.1287623/150‑1 (MQ=60)
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ACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTT < SRR19973061.3332075/150‑1 (MQ=60)
CGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAG > SRR19973061.3236213/1‑150 (MQ=60)
CGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAG > SRR19973061.2092982/1‑150 (MQ=60)
ATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTA > SRR19973061.644369/1‑150 (MQ=60)
ATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTA > SRR19973061.1282394/1‑150 (MQ=60)
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AATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATA < SRR19973061.602842/150‑1 (MQ=60)
ATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAG > SRR19973061.742507/1‑150 (MQ=60)
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GNTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAAC > SRR19973061.1417288/1‑150 (MQ=60)
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TATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAAT > SRR19973061.2364350/1‑150 (MQ=60)
ATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATT < SRR19973061.1654066/150‑1 (MQ=60)
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GGCCATACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCGACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATA > CP009273/1389703‑1390000
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |