Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,508,681 |
C→A |
F198L (TTC→TTA) |
ydcU → |
putative spermidine/putrescine transporter subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,508,681 | 0 | C | A | 100.0%
| 758.1
/ NA
| 226 | F198L (TTC→TTA) | ydcU | putative spermidine/putrescine transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (124/102); total (124/102) |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
AGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTT > CP009273/1508534‑1508827
|
aGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAAt > 1:916964/1‑150 (MQ=255)
ggCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATc > 2:2417221/1‑150 (MQ=255)
cGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCt < 2:1234646/150‑1 (MQ=255)
cGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCt < 2:1822940/150‑1 (MQ=255)
tGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGc > 2:2672050/1‑150 (MQ=255)
gCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGccc < 1:1285286/150‑1 (MQ=255)
aGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTc < 2:63074/150‑1 (MQ=255)
gTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCa > 2:3280278/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAg > 2:2994257/1‑150 (MQ=255)
tttttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAggcg < 2:1689628/150‑1 (MQ=255)
tttttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAggcg < 2:570792/150‑1 (MQ=255)
tttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAggcggc > 1:2251468/1‑150 (MQ=255)
tttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAggcggc > 2:2694479/1‑150 (MQ=255)
ttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGgcggcg > 1:1973540/1‑150 (MQ=255)
tACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGgcgc > 1:570937/1‑150 (MQ=255)
acaacaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCt < 2:2879758/150‑1 (MQ=255)
acaacaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCt < 1:1991643/150‑1 (MQ=255)
caacaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCtt > 2:182386/1‑150 (MQ=255)
caacaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCtt > 1:2104035/1‑150 (MQ=255)
aacaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTg > 1:1934208/1‑150 (MQ=255)
acaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGa > 2:1910211/1‑150 (MQ=255)
aTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGc > 2:910539/1‑150 (MQ=255)
aTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGc > 2:910470/1‑150 (MQ=255)
tCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCg < 1:3721643/150‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGttt > 2:1532531/1‑150 (MQ=255)
cTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTgccg < 1:709108/150‑1 (MQ=255)
aCCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTc > 1:620089/1‑150 (MQ=255)
gctgACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAttgtt < 1:1199782/150‑1 (MQ=255)
tgACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGc > 1:1620689/1‑150 (MQ=255)
gACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCa < 2:589954/150‑1 (MQ=255)
aCTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAg < 1:3316835/150‑1 (MQ=255)
tGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGc > 1:3588001/1‑150 (MQ=255)
gTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCCTTGTTGCAGGCGTc > 2:517173/1‑150 (MQ=255)
gTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTc < 1:73400/150‑1 (MQ=255)
gTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTc < 1:3301456/150‑1 (MQ=255)
gTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTc > 2:3373357/1‑150 (MQ=255)
ttCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCg < 1:3378089/150‑1 (MQ=255)
ttACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTg < 2:1647131/150‑1 (MQ=255)
ttACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTg > 2:274405/1‑150 (MQ=255)
tACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGa < 1:1027637/150‑1 (MQ=255)
tACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGa < 1:1027717/150‑1 (MQ=255)
tACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGa > 1:1348481/1‑150 (MQ=255)
cATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGAtc > 1:2979498/1‑150 (MQ=255)
aTTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGAtct > 2:3349616/1‑150 (MQ=255)
ttACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGAtctc < 2:2620251/150‑1 (MQ=255)
cTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGgcg > 1:2436/1‑150 (MQ=255)
cTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGgcg > 1:1399681/1‑150 (MQ=255)
gggCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTcc > 2:3422225/1‑150 (MQ=255)
ggCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCa < 1:1028036/150‑1 (MQ=255)
cGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACg > 2:2811594/1‑150 (MQ=255)
cGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACg > 2:1988925/1‑150 (MQ=255)
gAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGAc > 1:2853265/1‑150 (MQ=255)
aaaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa < 1:1579133/150‑1 (MQ=255)
aaaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa > 2:2529818/1‑150 (MQ=255)
aaaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa < 1:1455296/150‑1 (MQ=255)
aaaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa > 1:3197878/1‑150 (MQ=255)
tACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAAc < 2:221696/150‑1 (MQ=255)
aCGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAAcc < 2:2304147/150‑1 (MQ=255)
cTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGTTCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCttt < 2:1273505/150‑1 (MQ=255)
cAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCt > 1:1786300/1‑150 (MQ=255)
cAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCt < 1:2132613/150‑1 (MQ=255)
aaCTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTa > 2:1916080/1‑150 (MQ=255)
cGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATgtggt < 1:2994257/150‑1 (MQ=255)
cGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATgtggt < 1:2019398/150‑1 (MQ=255)
cGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATgtggt < 2:1137866/150‑1 (MQ=255)
gggCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATgtggtg < 1:2672050/150‑1 (MQ=255)
gggCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATgtggtg < 1:1441/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgc > 1:2134062/1‑150 (MQ=255)
ggCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgc < 1:1824864/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgct > 1:569433/1‑150 (MQ=255)
cTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgctg < 1:2614401/150‑1 (MQ=255)
tGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgctgc > 2:1901437/1‑150 (MQ=255)
ggggCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGcc > 2:353539/1‑150 (MQ=255)
ggggCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGcc > 2:1122005/1‑150 (MQ=255)
gggCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCg < 2:2095994/150‑1 (MQ=255)
gggCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCg < 1:1939875/150‑1 (MQ=255)
gcgcTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCt < 1:2693246/150‑1 (MQ=255)
cTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGc > 2:3703578/1‑150 (MQ=255)
tttCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCa > 1:3763478/1‑150 (MQ=255)
tttCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCa > 1:1323415/1‑150 (MQ=255)
tCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAAt < 1:1024453/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATccc > 1:1867192/1‑150 (MQ=255)
ggTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATccc < 2:1629092/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATccc < 2:3180203/150‑1 (MQ=255)
tgtTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCgg > 1:3370181/1‑150 (MQ=255)
gtTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCACTCCCggg > 1:2299040/1‑150 (MQ=255)
gtTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCggg > 1:2485743/1‑150 (MQ=255)
ttCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTa < 1:3548133/150‑1 (MQ=255)
tctcTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTAt > 2:3067949/1‑150 (MQ=255)
tctcTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTAt < 2:1394054/150‑1 (MQ=255)
tctATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTg < 1:600829/150‑1 (MQ=255)
ctATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGc > 1:836485/1‑150 (MQ=255)
atCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTTAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCTCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCt < 2:1272967/150‑1 (MQ=255)
tCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTg < 2:706100/150‑1 (MQ=255)
tGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGc > 2:2948196/1‑150 (MQ=255)
ggTTGCCGTTAATGATCCGGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGct < 2:2260758/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGctc < 2:930089/150‑1 (MQ=255)
ttGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCACTCCCGGGTATTGCCGCTGGctct > 2:2255644/1‑150 (MQ=255)
gCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTAt < 2:1965690/150‑1 (MQ=255)
gTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCtt > 2:1041351/1‑150 (MQ=255)
|
AGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTT > CP009273/1508534‑1508827
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTT > CP009273/1508532‑1508828
|
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTA > SRR19973061.932461/1‑150 (MQ=60)
AGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAAT < SRR19973061.2748427/150‑1 (MQ=60)
AGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAAT > SRR19973061.919314/1‑150 (MQ=60)
TGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGAT < SRR19973061.713394/150‑1 (MQ=60)
TGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGAT > SRR19973061.866318/1‑150 (MQ=60)
TGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGAT > SRR19973061.866320/1‑150 (MQ=60)
GCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCC < SRR19973061.1288470/150‑1 (MQ=60)
CTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCG > SRR19973061.2609473/1‑150 (MQ=60)
AGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTC > SRR19973061.1370518/1‑150 (MQ=60)
AGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTC > SRR19973061.1315125/1‑150 (MQ=60)
TTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGC > SRR19973061.2257131/1‑150 (MQ=60)
TTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCG > SRR19973061.1978479/1‑150 (MQ=60)
TACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGC > SRR19973061.572427/1‑150 (MQ=60)
ACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCT < SRR19973061.1996629/150‑1 (MQ=60)
ACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCT < SRR19973061.1998229/150‑1 (MQ=60)
ACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCT < SRR19973061.1996633/150‑1 (MQ=60)
CAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTT > SRR19973061.2109319/1‑150 (MQ=60)
CAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTT < SRR19973061.1885105/150‑1 (MQ=60)
AACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTG > SRR19973061.1939016/1‑150 (MQ=60)
AACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTG > SRR19973061.1939052/1‑150 (MQ=60)
ACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGA > SRR19973061.1432796/1‑150 (MQ=60)
ATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTATCTCTATATCTGGTTGCCGATAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGC > SRR19973061.1970605/1‑150 (MQ=60)
TCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCG < SRR19973061.3731154/150‑1 (MQ=60)
CTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGT > SRR19973061.2218130/1‑150 (MQ=60)
CTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCG < SRR19973061.710957/150‑1 (MQ=60)
TGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGC > SRR19973061.3387291/1‑150 (MQ=60)
TGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGC > SRR19973061.3799731/1‑150 (MQ=60)
TGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGC > SRR19973061.2055992/1‑150 (MQ=60)
GGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCC < SRR19973061.2908831/150‑1 (MQ=60)
GGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCC < SRR19973061.2166631/150‑1 (MQ=60)
ACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTC > SRR19973061.621673/1‑150 (MQ=60)
ACCACTGCTGAATGCGTTCCTTATATTACCTGCGGTGGGCTGTAATACGCTGTTAAATTCCGGGATGGGTCGCTTTATGGTGTTTCTCTTTATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTC < SRR19973061.606278/150‑1 (MQ=60)
CACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGAGTCGCTTTCTGGAGTTTCTCTATATCAGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGAGTTTGCCGCCGTCAT > SRR19973061.3594908/1‑150 (MQ=60)
TGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGT > SRR19973061.1824419/1‑150 (MQ=60)
GCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTT < SRR19973061.1377814/150‑1 (MQ=60)
GCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTT < SRR19973061.1202799/150‑1 (MQ=60)
TGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGC > SRR19973061.1624730/1‑150 (MQ=60)
ACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAG < SRR19973061.3325389/150‑1 (MQ=60)
TGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGC > SRR19973061.3597200/1‑150 (MQ=60)
TGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGC > SRR19973061.676177/1‑150 (MQ=60)
TGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGC > SRR19973061.676225/1‑150 (MQ=60)
TGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGC > SRR19973061.1128493/1‑150 (MQ=60)
GTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTC < SRR19973061.3309954/150‑1 (MQ=60)
GTTCCTTACATGACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTC < SRR19973061.73669/150‑1 (MQ=60)
TTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCG < SRR19973061.3386771/150‑1 (MQ=60)
CTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCT < SRR19973061.1831160/150‑1 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA < SRR19973061.1030234/150‑1 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA < SRR19973061.1030269/150‑1 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA < SRR19973061.1030341/150‑1 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA < SRR19973061.1030350/150‑1 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA < SRR19973061.1030375/150‑1 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA > SRR19973061.1351873/1‑150 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA < SRR19973061.3023973/150‑1 (MQ=60)
CATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATC > SRR19973061.2987186/1‑150 (MQ=60)
ATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCT > SRR19973061.94595/1‑150 (MQ=60)
TTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTC > SRR19973061.2314462/1‑150 (MQ=60)
TACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCG < SRR19973061.3357201/150‑1 (MQ=60)
TACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCG > SRR19973061.2987538/1‑150 (MQ=60)
CTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCG > SRR19973061.1451061/1‑150 (MQ=60)
CTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCG > SRR19973061.2441/1‑150 (MQ=60)
CTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCG > SRR19973061.1403214/1‑150 (MQ=60)
GGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCA < SRR19973061.1030670/150‑1 (MQ=60)
GGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGA > SRR19973061.2124088/1‑150 (MQ=60)
GAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGAC > SRR19973061.2860569/1‑150 (MQ=60)
AAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACA < SRR19973061.1583054/150‑1 (MQ=60)
AAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACA < SRR19973061.1458969/150‑1 (MQ=60)
AAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACA < SRR19973061.3288728/150‑1 (MQ=60)
AAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACA > SRR19973061.3206083/1‑150 (MQ=60)
AAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACA < SRR19973061.1583348/150‑1 (MQ=60)
AAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACA < SRR19973061.1591002/150‑1 (MQ=60)
ACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACC > SRR19973061.2443011/1‑150 (MQ=60)
CAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCT < SRR19973061.2137972/150‑1 (MQ=60)
CAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCT < SRR19973061.2137971/150‑1 (MQ=60)
CAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCT > SRR19973061.1790774/1‑150 (MQ=60)
TCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTG < SRR19973061.370374/150‑1 (MQ=60)
CGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGT < SRR19973061.3001985/150‑1 (MQ=60)
CGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGT < SRR19973061.2024472/150‑1 (MQ=60)
GGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTG < SRR19973061.2678924/150‑1 (MQ=60)
GGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTG < SRR19973061.1917975/150‑1 (MQ=60)
GGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTG < SRR19973061.1443/150‑1 (MQ=60)
GGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGC < SRR19973061.1829436/150‑1 (MQ=60)
GGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGC > SRR19973061.2139421/1‑150 (MQ=60)
GCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCT > SRR19973061.570921/1‑150 (MQ=60)
GCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCT > SRR19973061.570920/1‑150 (MQ=60)
CTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTG < SRR19973061.2621819/150‑1 (MQ=60)
CTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTG < SRR19973061.2621113/150‑1 (MQ=60)
TGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGC > SRR19973061.1678090/1‑150 (MQ=60)
GGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCC < SRR19973061.1536352/150‑1 (MQ=60)
GGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCG < SRR19973061.1944704/150‑1 (MQ=60)
GCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCT < SRR19973061.2700168/150‑1 (MQ=60)
GCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCT < SRR19973061.2698448/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGG > SRR19973061.528242/1‑150 (MQ=60)
CTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGC > SRR19973061.2452364/1‑150 (MQ=60)
TTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCA > SRR19973061.1326742/1‑150 (MQ=60)
TTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCA > SRR19973061.3760229/1‑150 (MQ=60)
TTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCA > SRR19973061.3773097/1‑150 (MQ=60)
TCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAAT < SRR19973061.1027072/150‑1 (MQ=60)
TGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCC > SRR19973061.1988255/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCC > SRR19973061.1871847/1‑150 (MQ=60)
TGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGG > SRR19973061.3378845/1‑150 (MQ=60)
TGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGG > SRR19973061.3379375/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCACTCCCGGG > SRR19973061.2304858/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGG > SRR19973061.582529/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGG > SRR19973061.2492073/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGG > SRR19973061.1114487/1‑150 (MQ=60)
TTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTA < SRR19973061.3557220/150‑1 (MQ=60)
TCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTG > SRR19973061.3239398/1‑150 (MQ=60)
TCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTG < SRR19973061.602388/150‑1 (MQ=60)
CTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGC > SRR19973061.838597/1‑150 (MQ=60)
CTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGC > SRR19973061.838661/1‑150 (MQ=60)
TATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCC > SRR19973061.2280863/1‑150 (MQ=60)
TATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCC < SRR19973061.1268459/150‑1 (MQ=60)
ATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCT > SRR19973061.1345768/1‑150 (MQ=60)
TGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTA > SRR19973061.3310272/1‑150 (MQ=60)
TGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTA < SRR19973061.275155/150‑1 (MQ=60)
TGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTA < SRR19973061.3515907/150‑1 (MQ=60)
TTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTT < SRR19973061.797772/150‑1 (MQ=60)
|
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTT > CP009273/1508532‑1508828
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
