Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
1,508,681 |
C→A |
100% |
F198L (TTC→TTA) |
ydcU → |
putative spermidine/putrescine transporter subunit |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 1,508,681 | 0 | C | A | 96.1%
| 613.9
/ 13.2
| 204 | F198L (TTC→TTA) | ydcU | putative spermidine/putrescine transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/6); new base A (91/104); total (93/111) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.93e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
ATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATC > CP009273/1508536‑1508825
|
aTGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAAt > 2:685399/1‑148 (MQ=255)
gCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGAt < 2:2542679/148‑1 (MQ=255)
gCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGAt < 2:2355721/148‑1 (MQ=255)
gCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGAt < 2:1342894/148‑1 (MQ=255)
gCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGAt < 2:3079223/148‑1 (MQ=255)
gTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATcc < 1:471735/148‑1 (MQ=255)
gTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATcc < 1:1958933/148‑1 (MQ=255)
tGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTTCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCt > 2:3148388/1‑148 (MQ=255)
tGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCt > 2:1375873/1‑148 (MQ=255)
ggCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTg < 2:42665/148‑1 (MQ=255)
ggCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTg > 1:3078983/1‑148 (MQ=255)
gCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGc < 1:822290/148‑1 (MQ=255)
cTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGcc < 1:2499953/148‑1 (MQ=255)
tGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTc < 1:103137/148‑1 (MQ=255)
tGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTc < 1:2192812/148‑1 (MQ=255)
tGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTc < 2:1797764/148‑1 (MQ=255)
tGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTc > 2:2233390/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTc > 1:1763976/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTc > 2:2525564/1‑148 (MQ=255)
tttttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATGACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAgg < 2:786894/148‑1 (MQ=255)
ttttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAggc > 2:249917/1‑148 (MQ=255)
caacaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGgcgc < 1:1243255/148‑1 (MQ=255)
caacaTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGgcgc < 1:2988733/148‑1 (MQ=255)
tCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAg > 1:2352488/1‑148 (MQ=255)
tGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGt < 2:2097829/148‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGt < 2:2341309/148‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGt < 2:252614/148‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGt < 1:2920393/148‑1 (MQ=255)
ggCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGttt < 1:142354/148‑1 (MQ=255)
cTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTgc < 2:2613627/148‑1 (MQ=255)
gAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTgccgc > 2:3509557/1‑148 (MQ=255)
aaCCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTgccgcc > 2:2364493/1‑148 (MQ=255)
ccACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGt > 2:1285378/1‑148 (MQ=255)
ccACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGt < 1:1668613/148‑1 (MQ=255)
cACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTc > 1:763901/1‑148 (MQ=255)
ctgctgACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAt < 2:1852709/148‑1 (MQ=255)
tgctgACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAtt < 1:2314685/148‑1 (MQ=255)
ctgACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAttgt > 1:278968/1‑148 (MQ=255)
tgACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAttgtt < 2:2051369/148‑1 (MQ=255)
gACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAttgttg > 2:2886774/1‑148 (MQ=255)
aCTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGc < 1:2962381/148‑1 (MQ=255)
aCTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGc < 1:2552405/148‑1 (MQ=255)
cTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCa < 1:3507618/148‑1 (MQ=255)
gCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAgg > 1:1749529/1‑148 (MQ=255)
cGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGc > 2:1047668/1‑148 (MQ=255)
ttCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGt > 1:1586170/1‑148 (MQ=255)
cTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCgg < 2:2836297/148‑1 (MQ=255)
ttACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGc < 2:932907/148‑1 (MQ=255)
ttACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGc > 1:2365618/1‑148 (MQ=255)
cATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGa > 1:3243776/1‑148 (MQ=255)
cATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGGTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGa > 1:3056754/1‑148 (MQ=255)
cATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCGTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGa > 1:2797848/1‑148 (MQ=255)
aTTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGAt < 2:537131/148‑1 (MQ=255)
gCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGgcg > 2:1685683/1‑148 (MQ=255)
gCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTcc > 2:821015/1‑148 (MQ=255)
cGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGGTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCa > 1:3171082/1‑148 (MQ=255)
aTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa > 2:3259773/1‑148 (MQ=255)
tGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCtt < 2:3316131/148‑1 (MQ=255)
gTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCttt < 2:1763976/148‑1 (MQ=255)
gTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCttt < 1:220777/148‑1 (MQ=255)
gTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCttt < 2:1585561/148‑1 (MQ=255)
cTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTa > 2:2607699/1‑148 (MQ=255)
tCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTAtg > 1:2875343/1‑148 (MQ=255)
gCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTAGgtggtg > 2:2033309/1‑148 (MQ=255)
ggggCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgctg < 2:2715977/148‑1 (MQ=255)
ggggCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgctg < 2:1311206/148‑1 (MQ=255)
gcgcTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCg < 2:1675715/148‑1 (MQ=255)
gcgcTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCg < 1:1325782/148‑1 (MQ=255)
gcgcTGTCTGGTGTTTCTCTAGATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCg < 2:1888055/148‑1 (MQ=255)
cgcTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGc < 1:2886774/148‑1 (MQ=255)
tttCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTgg > 1:3467011/1‑148 (MQ=255)
ttCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGc > 2:2368086/1‑148 (MQ=255)
tCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCa < 1:821015/148‑1 (MQ=255)
tGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAAt < 2:522380/148‑1 (MQ=255)
gtgtTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATcc > 1:38199/1‑148 (MQ=255)
tgtTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATccc < 2:1583954/148‑1 (MQ=255)
tttCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCgg > 2:497101/1‑148 (MQ=255)
ttCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCggg > 2:471182/1‑148 (MQ=255)
ttCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCggg > 2:471130/1‑148 (MQ=255)
ttCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCggg > 2:470987/1‑148 (MQ=255)
atttCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGGTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGc < 1:2090033/145‑1 (MQ=255)
atatCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGc > 2:2621128/1‑148 (MQ=255)
atCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg < 1:1110421/148‑1 (MQ=255)
atCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg < 1:1110788/148‑1 (MQ=255)
atCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg > 1:1066875/1‑148 (MQ=255)
atCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg < 2:2989631/148‑1 (MQ=255)
atCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg < 2:2776893/148‑1 (MQ=255)
atCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg < 2:1217734/148‑1 (MQ=255)
cTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCt > 2:586590/1‑148 (MQ=255)
ggTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTgg < 2:3527799/148‑1 (MQ=255)
ggTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTgg > 1:2113739/1‑148 (MQ=255)
ggTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTgg < 2:225871/148‑1 (MQ=255)
gTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGc > 1:1779557/1‑148 (MQ=255)
gTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGc > 1:2552843/1‑148 (MQ=255)
ttGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGct < 1:435802/148‑1 (MQ=255)
ccGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTa < 2:38199/148‑1 (MQ=255)
ccGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTa > 1:2616464/1‑148 (MQ=255)
cGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTAt < 1:220827/148‑1 (MQ=255)
cGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTAt > 1:3417501/1‑148 (MQ=255)
gTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATc < 2:3467011/148‑1 (MQ=255)
|
ATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATC > CP009273/1508536‑1508825
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTAC > CP009273/1508532‑1508830
|
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTA > SRR19973067.282531/1‑150 (MQ=60)
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTA < SRR19973067.1404295/150‑1 (MQ=60)
AAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTTGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTATGGGTGTTCTCTATATATGGTTGCCGTTAA > SRR19973067.1854530/1‑150 (MQ=60)
AAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAA > SRR19973067.2836895/1‑150 (MQ=60)
AGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAAT > SRR19973067.3176135/1‑150 (MQ=60)
AGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAAT < SRR19973067.2531644/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTG > SRR19973067.3098577/1‑150 (MQ=60)
GTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTG < SRR19973067.2855371/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTG < SRR19973067.474995/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTG < SRR19973067.474462/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTG < SRR19973067.1972249/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTG > SRR19973067.1320159/1‑150 (MQ=60)
GTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTG < SRR19973067.1972250/150‑1 (MQ=60)
GGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCC < SRR19973067.1494031/150‑1 (MQ=60)
GCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCC < SRR19973067.827914/150‑1 (MQ=60)
CTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCG < SRR19973067.2516368/150‑1 (MQ=60)
AGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTC > SRR19973067.264457/1‑150 (MQ=60)
AGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTC > SRR19973067.1775977/1‑150 (MQ=60)
AGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTC > SRR19973067.1775975/1‑150 (MQ=60)
AGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTC > SRR19973067.1775802/1‑150 (MQ=60)
TGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAG < SRR19973067.2207442/150‑1 (MQ=60)
TGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAG < SRR19973067.104170/150‑1 (MQ=60)
TTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGG > SRR19973067.227506/1‑150 (MQ=60)
CAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTT < SRR19973067.1251626/150‑1 (MQ=60)
CAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTT < SRR19973067.3007645/150‑1 (MQ=60)
ACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGA > SRR19973067.1152573/1‑150 (MQ=60)
CATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAG > SRR19973067.2367842/1‑150 (MQ=60)
CATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAG > SRR19973067.2354976/1‑150 (MQ=60)
TGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTT < SRR19973067.2938966/150‑1 (MQ=60)
GGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTG < SRR19973067.2563816/150‑1 (MQ=60)
GGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGC < SRR19973067.143609/150‑1 (MQ=60)
GAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCGGGTGTTTCTGTATAGGTGGTTGCCGTTAATTAAACTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGGCGCCG > SRR19973067.1618464/1‑150 (MQ=60)
ACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTC > SRR19973067.769207/1‑150 (MQ=60)
CCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCA < SRR19973067.1680126/150‑1 (MQ=60)
TGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGT > SRR19973067.280810/1‑150 (MQ=60)
TGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGT > SRR19973067.281044/1‑150 (MQ=60)
TGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGT < SRR19973067.2329918/150‑1 (MQ=60)
TGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGACGCCGTCATTGTTGC > SRR19973067.2918056/1‑150 (MQ=60)
ACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTTCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAG < SRR19973067.2981013/150‑1 (MQ=60)
ACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAG < SRR19973067.2981093/150‑1 (MQ=60)
ACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAG < SRR19973067.2569098/150‑1 (MQ=60)
ACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAG < SRR19973067.299783/150‑1 (MQ=60)
CTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGG > SRR19973067.1761457/1‑150 (MQ=60)
CTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGG < SRR19973067.3529832/150‑1 (MQ=60)
CGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGGCATTGTTGCAGGCGT > SRR19973067.1597034/1‑150 (MQ=60)
CCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGC > SRR19973067.2381024/1‑150 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA > SRR19973067.3264099/1‑150 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGGTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA > SRR19973067.3076221/1‑150 (MQ=60)
TACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCGTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGA > SRR19973067.2815895/1‑150 (MQ=60)
CCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCGTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGTGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGC > SRR19973067.2450583/1‑150 (MQ=60)
GGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGGTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCA > SRR19973067.3191160/1‑150 (MQ=60)
ACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACC < SRR19973067.2205996/150‑1 (MQ=60)
TGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATCTCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTC < SRR19973067.1111778/150‑1 (MQ=60)
GTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCG < SRR19973067.2212028/150‑1 (MQ=60)
GTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCG < SRR19973067.222392/150‑1 (MQ=60)
CAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCT < SRR19973067.3531782/150‑1 (MQ=60)
AACTTCCGGGCTGGGGCGCGTTGTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATTATACTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGGCGCCGGCATTTTTTCAGGCGTCGGCTGATATCGGCGCACGGCCACCACAAAACATTCGCTA > SRR19973067.309564/1‑150 (MQ=60)
CTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATG > SRR19973067.2893739/1‑150 (MQ=60)
TTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGT < SRR19973067.187026/150‑1 (MQ=60)
TTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGT < SRR19973067.2374629/150‑1 (MQ=60)
CGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTTCCGTTAATGATACTGCCCGGTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGGCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAAACATTCGCTAAGTGGT > SRR19973067.1041127/1‑150 (MQ=60)
CGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTATCTAAATCTGGTTTCCGTTAATTATACTGACCGTTCACGCGGCGCTTGAGCGTTTTACGCCGTCAATGTTTCAGGCGTCGGCTGAAATCGGCGCACctccaagaaaaaccaatagctaattggt > SRR19973067.2178397/1‑122 (MQ=48)
GCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCT < SRR19973067.824584/150‑1 (MQ=60)
GGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATACTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTTCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCATTCGCTATGTGGTGCTGCCG > SRR19973067.3027661/1‑150 (MQ=60)
GCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCT < SRR19973067.3519569/150‑1 (MQ=60)
GCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCT < SRR19973067.1334832/150‑1 (MQ=60)
CGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTG < SRR19973067.2905230/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGG > SRR19973067.3489045/1‑150 (MQ=60)
TTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAA > SRR19973067.3453559/1‑150 (MQ=60)
TCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAAT < SRR19973067.827471/150‑1 (MQ=60)
TCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAAT < SRR19973067.826633/150‑1 (MQ=60)
TGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCC > SRR19973067.38758/1‑150 (MQ=60)
TGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCC > SRR19973067.38743/1‑150 (MQ=60)
GTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCG < SRR19973067.2896327/150‑1 (MQ=60)
CTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCACTCCCGGGTATTGC > SRR19973067.1387652/1‑150 (MQ=60)
ATTTCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGGTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCG < SRR19973067.2103861/150‑1 (MQ=60)
ATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCG < SRR19973067.2103876/150‑1 (MQ=60)
ATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCG > SRR19973067.1074191/1‑150 (MQ=60)
ATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCT < SRR19973067.1118320/150‑1 (MQ=60)
ATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCT < SRR19973067.1118202/150‑1 (MQ=60)
ATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCT < SRR19973067.1117950/150‑1 (MQ=60)
ATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCT > SRR19973067.3236319/1‑150 (MQ=60)
ATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCT > SRR19973067.612836/1‑150 (MQ=60)
TCTGGTTGCCGTTTATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCAGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCTCGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTG < SRR19973067.334026/150‑1 (MQ=60)
CTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGG > SRR19973067.2127815/1‑150 (MQ=60)
TGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCCATCCCGGGTATTGCCGCTGGC > SRR19973067.2569437/1‑150 (MQ=60)
TGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGC > SRR19973067.1791596/1‑150 (MQ=60)
TGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGC > SRR19973067.2569537/1‑150 (MQ=60)
GTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTC < SRR19973067.2655712/150‑1 (MQ=60)
TTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCT < SRR19973067.438832/150‑1 (MQ=60)
TGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTA > SRR19973067.2630924/1‑150 (MQ=60)
TGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTA > SRR19973067.2633437/1‑150 (MQ=60)
TGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAAACCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTA > SRR19973067.1691166/1‑150 (MQ=60)
GCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTAT > SRR19973067.3439252/1‑150 (MQ=60)
CGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCT > SRR19973067.1164330/1‑150 (MQ=60)
CGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCT < SRR19973067.222442/150‑1 (MQ=60)
CGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCT < SRR19973067.222439/150‑1 (MQ=60)
GTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCACTCCCGGGTCTTGCCGCTGGCTCTctcgg > SRR19973067.503437/1‑145 (MQ=60)
GTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTT > SRR19973067.2313804/1‑150 (MQ=60)
AATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTAC < SRR19973067.12726/150‑1 (MQ=60)
AATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGGCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCGGGCTCTATCTTTAC > SRR19973067.3480633/1‑150 (MQ=60)
|
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTAC > CP009273/1508532‑1508830
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |