Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,570,826 |
C→A |
D351Y (GAC→TAC) |
yddB ← |
putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,570,826 | 0 | C | A | 100.0%
| 705.0
/ NA
| 211 | D351Y (GAC→TAC) | yddB | putative TonB‑dependent outer membrane receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (115/96); total (115/96) |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CATTACCCACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTCATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCTGGTAT > CP009273/1570682‑1570972
|
cATTACCCACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGAt < 1:2554377/150‑1 (MQ=255)
aTTACCCACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATc < 1:683977/150‑1 (MQ=255)
aTTACCCACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATc < 1:2266463/150‑1 (MQ=255)
tACCCACGGCGAATTTGTGCCAGTCCAGGCGTGTTGTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGt > 2:591396/1‑150 (MQ=255)
ccACGGCGATTTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGAc < 1:1318316/150‑1 (MQ=255)
ccACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGTTCGTGAc < 1:1026467/150‑1 (MQ=255)
cACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACg < 1:924944/150‑1 (MQ=255)
cACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACg < 2:63391/150‑1 (MQ=255)
cGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGtat < 2:3433839/150‑1 (MQ=255)
aaTTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATaa > 2:3191692/1‑150 (MQ=255)
aaTTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATaa > 2:2969942/1‑150 (MQ=255)
aTTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAAt < 2:3082344/150‑1 (MQ=255)
aTTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAAt > 1:383585/1‑150 (MQ=255)
ttttGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCa < 2:2515721/150‑1 (MQ=255)
tttGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCAc > 2:3643251/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTa < 1:567553/150‑1 (MQ=255)
ccAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAat < 1:1939651/150‑1 (MQ=255)
ccAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAat < 2:3402336/150‑1 (MQ=255)
ccAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAat < 2:617789/150‑1 (MQ=255)
aGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAatat < 2:2746103/150‑1 (MQ=255)
tCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGa > 2:1749243/1‑150 (MQ=255)
ccAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGAt > 1:849573/1‑150 (MQ=255)
ccAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGAt < 1:895291/150‑1 (MQ=255)
ccAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGAt < 1:3392173/150‑1 (MQ=255)
cAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATc < 2:1047946/150‑1 (MQ=255)
aGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCCACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATcc < 2:129380/150‑1 (MQ=255)
gCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCcca < 2:845621/150‑1 (MQ=255)
cGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTTCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCccaa > 1:2913364/1‑150 (MQ=255)
cGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCccaa < 2:2676832/150‑1 (MQ=255)
gtTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCccaacca > 1:1432669/1‑150 (MQ=255)
gtTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCccaacca > 1:978955/1‑150 (MQ=255)
gtTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCccaacca > 1:3329028/1‑150 (MQ=255)
tttGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCcaaccaac < 2:3713599/150‑1 (MQ=255)
ttGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACg < 1:2430591/150‑1 (MQ=255)
ttGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACg < 1:476381/150‑1 (MQ=255)
tGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACgg > 1:2209490/1‑150 (MQ=255)
tGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACgg > 1:1485828/1‑150 (MQ=255)
aGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACggtgg > 1:1256272/1‑150 (MQ=255)
ggTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACggtggt > 2:1313452/1‑150 (MQ=255)
ggTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACggtggt < 2:55772/150‑1 (MQ=255)
ggTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACggtggt < 1:2873741/150‑1 (MQ=255)
gtAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACg > 2:709317/1‑150 (MQ=255)
aaTTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCa > 2:3621890/1‑150 (MQ=255)
aaTTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCa > 2:2586576/1‑150 (MQ=255)
aaTTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCa > 1:2756091/1‑150 (MQ=255)
aaTTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCa < 1:3709906/150‑1 (MQ=255)
aTTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAg < 2:830111/150‑1 (MQ=255)
aTTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAg > 1:3617186/1‑150 (MQ=255)
tATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGtt > 1:313545/1‑150 (MQ=255)
aTCTACTGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCACCGCCCTGTAATATCACCATAGGTACATGAAAGTTCGGTGTCCCGGGTGTAATGAGCGTGACGGGTATACTCACTCATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGttt > 2:1474448/1‑150 (MQ=255)
cTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTgg > 2:219690/1‑150 (MQ=255)
tACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGc > 2:2317366/1‑150 (MQ=255)
ccTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATg > 1:61754/1‑150 (MQ=255)
cTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGc > 1:1164205/1‑150 (MQ=255)
cTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGc > 1:217026/1‑150 (MQ=255)
tGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCg > 1:1909491/1‑150 (MQ=255)
tGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCg > 1:244345/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCt < 1:416094/150‑1 (MQ=255)
aTGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGc > 1:353592/1‑150 (MQ=255)
aTGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGc > 2:3787837/1‑150 (MQ=255)
tgtgTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCg > 2:3457322/1‑150 (MQ=255)
gtCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTAt > 2:1136410/1‑150 (MQ=255)
tCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATc > 2:196555/1‑150 (MQ=255)
ccTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATcc > 1:3015828/1‑150 (MQ=255)
aaTCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCata < 1:3297481/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCata > 2:907947/1‑150 (MQ=255)
ccGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATcc < 1:2764201/150‑1 (MQ=255)
cGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATccc < 2:1792691/150‑1 (MQ=255)
ccACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCAt < 1:1749243/150‑1 (MQ=255)
ccACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCAt < 1:3518586/150‑1 (MQ=255)
aCGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGc > 2:2016721/1‑150 (MQ=255)
aCGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGc > 2:1914884/1‑150 (MQ=255)
tGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGAc > 2:3288650/1‑150 (MQ=255)
gCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGAcc < 1:3406282/150‑1 (MQ=255)
cAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCa > 2:2331144/1‑150 (MQ=255)
cAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCa > 2:3784865/1‑150 (MQ=255)
ccTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGAt > 1:793698/1‑150 (MQ=255)
tGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGAttt > 1:1076870/1‑150 (MQ=255)
tGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGAttt > 1:1076913/1‑150 (MQ=255)
atatCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATttatta < 2:3143353/150‑1 (MQ=255)
aCCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCAt > 1:1564946/1‑150 (MQ=255)
aCCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCAt < 2:15511/150‑1 (MQ=255)
ccATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCAtt > 2:1601174/1‑150 (MQ=255)
cATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCAttt < 2:1256272/150‑1 (MQ=255)
atatGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTc < 2:2472758/150‑1 (MQ=255)
tatGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTcg < 2:2913364/150‑1 (MQ=255)
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ATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATAT > SRR19973061.1988282/1‑150 (MQ=60)
CCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCC < SRR19973061.2771317/150‑1 (MQ=60)
CCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCAT < SRR19973061.3527600/150‑1 (MQ=60)
CCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCAT < SRR19973061.1753636/150‑1 (MQ=60)
GTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGA > SRR19973061.362005/1‑150 (MQ=60)
GCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACC < SRR19973061.3415031/150‑1 (MQ=60)
GCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGG < SRR19973061.2766855/150‑1 (MQ=60)
CCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGA > SRR19973061.771312/1‑150 (MQ=60)
CCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGAT > SRR19973061.795782/1‑150 (MQ=60)
TGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTT > SRR19973061.1079633/1‑150 (MQ=60)
TGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTT < SRR19973061.1167505/150‑1 (MQ=60)
TGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTT > SRR19973061.1079669/1‑150 (MQ=60)
TGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTT > SRR19973061.1079676/1‑150 (MQ=60)
TGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTT < SRR19973061.1482205/150‑1 (MQ=60)
TAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTAT < SRR19973061.2442803/150‑1 (MQ=60)
TCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCC < SRR19973061.1139665/150‑1 (MQ=60)
TCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCC > SRR19973061.1060387/1‑150 (MQ=60)
CACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCA < SRR19973061.67166/150‑1 (MQ=60)
ACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCAT > SRR19973061.1568834/1‑150 (MQ=60)
ATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTC > SRR19973061.1261331/1‑150 (MQ=60)
TATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCG < SRR19973061.3300151/150‑1 (MQ=60)
TATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCG < SRR19973061.3503455/150‑1 (MQ=60)
CATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCA > SRR19973061.874913/1‑150 (MQ=60)
CATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCA < SRR19973061.3063428/150‑1 (MQ=60)
CATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCA > SRR19973061.1467471/1‑150 (MQ=60)
CATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCA > SRR19973061.1466583/1‑150 (MQ=60)
ATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAG > SRR19973061.1305531/1‑150 (MQ=60)
GAAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGAC > SRR19973061.3447115/1‑150 (MQ=60)
AAAGTTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACT > SRR19973061.1924971/1‑150 (MQ=60)
TTCGGTGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGG > SRR19973061.388567/1‑150 (MQ=60)
TGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGG < SRR19973061.3651767/150‑1 (MQ=60)
TGTACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGG < SRR19973061.3652562/150‑1 (MQ=60)
TACCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTG > SRR19973061.559127/1‑150 (MQ=60)
CCAGATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCT < SRR19973061.1298681/150‑1 (MQ=60)
GATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCTGGT < SRR19973061.2466908/150‑1 (MQ=60)
ATGTAATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCTGGTA < SRR19973061.1605156/150‑1 (MQ=60)
ATGTAATGATCGTGAAGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCATCGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCTGGTA < SRR19973061.1605131/150‑1 (MQ=60)
AATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCTGGTATTAT > SRR19973061.1293194/1‑150 (MQ=60)
AATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCTGGTATTAT > SRR19973061.23773/1‑150 (MQ=60)
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CATTACCCACGGCGAATTTTTGCCAGTCCAGGCGTGTTTTGAAGGTGTAATTATCTACAGCCTGGGAAATGTGTCCTAATCCGCCACGGGTGCAACGCCCTGTAATATCACCATATGTACATGAAAGTTCGGTGTACCAGATGTCATGATCGTGACGGGTATAATCACTAATATGATCCCAACCAACGGTGGTACGCAGTTTGGCCCATGCGAGCTGCGTATCCATATCCCATGCCAGACCATAGGATTTATTACCCATTTCGCGATCAGACTGCGGGAAGGTGCTGGTATTAT > CP009273/1570682‑1570975
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |