Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,899,504 |
T→C |
V149V (GTT→GTC) |
yobD → |
UPF0266 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,899,504 | 0 | T | C | 100.0%
| 834.3
/ NA
| 211 | V149V (GTT→GTC) | yobD | UPF0266 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (102/109); total (102/109) |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CTTCGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGAAAATCGTTAT > CP009273/1899357‑1899650
|
cttcGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGtctc > 2:598444/1‑150 (MQ=255)
cttcGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGtctc > 2:2676486/1‑150 (MQ=255)
ttcGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCa > 1:3067203/1‑150 (MQ=255)
ttcGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCa > 2:2069787/1‑150 (MQ=255)
cGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAAc < 1:1973986/150‑1 (MQ=255)
gCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACt < 2:1199977/150‑1 (MQ=255)
cAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCa < 2:1905702/150‑1 (MQ=255)
aaTGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTctcaactcaa > 1:313988/1‑150 (MQ=255)
tGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATa > 2:2453021/1‑150 (MQ=255)
gTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATaa > 2:2059921/1‑150 (MQ=255)
gATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTAt > 2:3680691/1‑150 (MQ=255)
aTTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATg > 2:1585501/1‑150 (MQ=255)
aTTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATg > 1:3299522/1‑150 (MQ=255)
aTTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATg > 2:433423/1‑150 (MQ=255)
tGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGaa < 2:1280906/150‑1 (MQ=255)
aaTATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAAtt > 1:1961213/1‑150 (MQ=255)
ataGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAg > 1:366231/1‑150 (MQ=255)
ataGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAg < 2:1015970/150‑1 (MQ=255)
taGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGc > 1:1503614/1‑150 (MQ=255)
taGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAAGAAGTTATGAATTTAGc < 2:1476778/150‑1 (MQ=255)
aGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGcc < 2:2994867/150‑1 (MQ=255)
aGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGcc > 2:2729281/1‑150 (MQ=255)
aaTCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGc < 1:3793631/150‑1 (MQ=255)
aaTCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGc < 1:452652/150‑1 (MQ=255)
tCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTa < 2:1790778/150‑1 (MQ=255)
aaGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGt > 2:1665381/1‑150 (MQ=255)
aGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGtt < 1:2657005/150‑1 (MQ=255)
gCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGttt < 2:534054/150‑1 (MQ=255)
cGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTa > 2:3663505/1‑150 (MQ=255)
gAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAgtgt > 1:2115244/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCNAAGCTATGTTTAGTGTa > 1:2935899/1‑150 (MQ=255)
ttGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTAttt < 1:2311238/150‑1 (MQ=255)
gAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaata > 1:2344136/1‑150 (MQ=255)
gAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaata > 1:3525672/1‑150 (MQ=255)
aaGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTtaataa > 1:3426812/1‑150 (MQ=255)
gATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATc < 2:2606992/150‑1 (MQ=255)
cGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACa > 1:3497484/1‑150 (MQ=255)
gtgtTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACAt > 1:338217/1‑150 (MQ=255)
tgtTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATa < 2:1228855/150‑1 (MQ=255)
gtTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAg < 1:2249142/150‑1 (MQ=255)
gtTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAg < 1:2444888/150‑1 (MQ=255)
gtTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAg < 1:1623087/150‑1 (MQ=255)
tGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCt > 2:970336/1‑150 (MQ=255)
tGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCt < 1:1166972/150‑1 (MQ=255)
gTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTa > 1:453840/1‑150 (MQ=255)
gATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAgg > 2:3315482/1‑150 (MQ=255)
tGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCt > 2:934501/1‑150 (MQ=255)
cAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCtat > 2:939486/1‑150 (MQ=255)
tAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTa < 1:516620/150‑1 (MQ=255)
tAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTa < 1:1031274/150‑1 (MQ=255)
aaCAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACct > 2:378142/1‑150 (MQ=255)
aaCAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACct > 2:377726/1‑150 (MQ=255)
aCAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACctc > 2:1428507/1‑150 (MQ=255)
cAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACctct < 2:1090364/150‑1 (MQ=255)
aGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCtt > 1:816247/1‑150 (MQ=255)
cGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTcc < 2:862553/150‑1 (MQ=255)
gTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTccc > 1:2435316/1‑150 (MQ=255)
ggCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTa > 2:2193362/1‑150 (MQ=255)
tGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTAttt > 1:754891/1‑150 (MQ=255)
tGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTAttt < 1:1710822/150‑1 (MQ=255)
tAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGtt < 1:1111371/150‑1 (MQ=255)
tAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGtt < 2:3330519/150‑1 (MQ=255)
aaTCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGtta < 1:1407354/150‑1 (MQ=255)
aTCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGttat < 2:1651484/150‑1 (MQ=255)
ccGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGttattt < 2:1171928/150‑1 (MQ=255)
cgcgTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGttattta > 1:596979/1‑150 (MQ=255)
cgTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTtatttatt > 2:966494/1‑150 (MQ=255)
cgTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTtatttatt < 1:1665381/150‑1 (MQ=255)
gTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTatttattt < 2:1294666/150‑1 (MQ=255)
gTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTatttattt < 2:819209/150‑1 (MQ=255)
ttCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTAtttt > 2:904291/1‑150 (MQ=255)
tCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTa < 1:2079316/150‑1 (MQ=255)
cGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTaa > 1:526541/1‑150 (MQ=255)
gAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAAc < 2:3259056/150‑1 (MQ=255)
gAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAAc < 2:2938830/150‑1 (MQ=255)
aaaTATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACg < 2:3525672/150‑1 (MQ=255)
aaaTATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACg < 1:2453021/150‑1 (MQ=255)
aaTATCGACGATCTGTAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTAAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATTTTTAGTGTATTTTTATTAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTTTTTATTTTAACGt < 2:1111399/150‑1 (MQ=255)
atatCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTTTTATTTATTTTAACGtt > 1:2196773/1‑150 (MQ=255)
atatCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGtt < 1:2818494/150‑1 (MQ=255)
atCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGGTTc < 1:1321171/150‑1 (MQ=255)
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gacgaTCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCAtt < 1:2492336/150‑1 (MQ=255)
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TGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTT > SRR19973061.756876/1‑150 (MQ=60)
TGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTT < SRR19973061.1715119/150‑1 (MQ=60)
TAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTT < SRR19973061.1114215/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTA < SRR19973061.1303447/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTA < SRR19973061.1410749/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTA < SRR19973061.1410903/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTA < SRR19973061.1411062/150‑1 (MQ=60)
CCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTT < SRR19973061.2653979/150‑1 (MQ=60)
CCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTT < SRR19973061.1261029/150‑1 (MQ=60)
CGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTA > SRR19973061.598533/1‑150 (MQ=60)
CGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATT < SRR19973061.1669562/150‑1 (MQ=60)
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TCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTA < SRR19973061.2084828/150‑1 (MQ=60)
TCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTA < SRR19973061.2084532/150‑1 (MQ=60)
CGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAA > SRR19973061.3065079/1‑150 (MQ=60)
CGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAA > SRR19973061.527933/1‑150 (MQ=60)
GAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAAC > SRR19973061.352228/1‑150 (MQ=60)
AAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACG < SRR19973061.2459272/150‑1 (MQ=60)
ATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTTTTATTTATTTTAACGTT > SRR19973061.2202294/1‑150 (MQ=60)
ATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTT < SRR19973061.2825723/150‑1 (MQ=60)
TATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTT < SRR19973061.294744/150‑1 (MQ=60)
ATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGGTTC < SRR19973061.1324491/150‑1 (MQ=60)
CGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCAT > SRR19973061.57121/1‑150 (MQ=60)
CGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCAT < SRR19973061.3375531/150‑1 (MQ=60)
CGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCAT < SRR19973061.3375537/150‑1 (MQ=60)
GACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATT < SRR19973061.2498684/150‑1 (MQ=60)
ACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTG < SRR19973061.2996200/150‑1 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATA < SRR19973061.1805867/150‑1 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATA < SRR19973061.3703836/150‑1 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATA > SRR19973061.2077809/1‑150 (MQ=60)
CTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATA > SRR19973061.2078811/1‑150 (MQ=60)
TGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATAT < SRR19973061.2891157/150‑1 (MQ=60)
TGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATAT > SRR19973061.3402113/1‑150 (MQ=60)
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GGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATA > SRR19973061.286147/1‑150 (MQ=60)
GAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAA < SRR19973061.3264345/150‑1 (MQ=60)
AAAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAAT > SRR19973061.2444801/1‑150 (MQ=60)
AAAATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATC < SRR19973061.2647593/150‑1 (MQ=60)
AATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCA > SRR19973061.1806471/1‑150 (MQ=60)
AATTTATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCA < SRR19973061.3672870/150‑1 (MQ=60)
TATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATG > SRR19973061.2155820/1‑150 (MQ=60)
ATAAGCTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGA < SRR19973061.543493/150‑1 (MQ=60)
CTTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGAAAATC < SRR19973061.2074988/150‑1 (MQ=60)
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TTCTCGTCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGAAAATCG > SRR19973061.2001440/1‑150 (MQ=60)
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TCTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTCAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGAAAATCGTTATCA < SRR19973061.1153924/150‑1 (MQ=60)
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TCTTCGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTTCAACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGAAAATCGTTATCA > CP009273/1899356‑1899652
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |