Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,294,862 |
G→T |
I457I (ATC→ATA) |
napA ← |
nitrate reductase, periplasmic, large subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,294,862 | 0 | G | T | 100.0%
| 710.9
/ NA
| 212 | I457I (ATC→ATA) | napA | nitrate reductase, periplasmic, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (83/129); total (83/129) |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
TGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCCC > CP009273/2294717‑2295008
|
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tgatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTAttt < 1:3075207/150‑1 (MQ=255)
tgatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTAttt < 1:1843099/150‑1 (MQ=255)
tgatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTAttt < 2:662559/150‑1 (MQ=255)
tgatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTAttt < 1:188469/150‑1 (MQ=255)
tgatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTAttt < 2:661108/150‑1 (MQ=255)
atgaAGGTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTc < 2:2867876/150‑1 (MQ=255)
tgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCg < 1:2909794/150‑1 (MQ=255)
aGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCg < 2:2606313/150‑1 (MQ=255)
aGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCg > 2:1005789/1‑150 (MQ=255)
aGTTGCGAGGATCGCGACAGCCCGGCATACGCTCTACAGTGATGTACGGCCACGCCTGAATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGAGCAGACCTATTATCGCCg > 2:2909947/1‑150 (MQ=255)
gcgcGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAAt < 1:1263239/150‑1 (MQ=255)
cgcgGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATg < 2:839868/150‑1 (MQ=255)
ggATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTg < 2:1904986/150‑1 (MQ=255)
ggATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTg > 1:581838/1‑150 (MQ=255)
ggATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTg < 2:3798665/150‑1 (MQ=255)
ggATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTg > 2:45684/1‑150 (MQ=255)
ggATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTg > 2:549306/1‑150 (MQ=255)
ggATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTg < 2:1223249/150‑1 (MQ=255)
gATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGACTGGTGc > 2:3187394/1‑150 (MQ=255)
gATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGc > 2:777362/1‑150 (MQ=255)
aTCGCGCCAGCGCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCCCCGCGTGCAGACCTCTTTTCGCCGGAATGGTGcc > 1:824964/1‑150 (MQ=255)
aTCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGcc < 1:3528155/150‑1 (MQ=255)
aTCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGcc < 2:3171404/150‑1 (MQ=255)
tCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCg < 2:1591493/150‑1 (MQ=255)
tCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCg < 2:3488219/150‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGc > 1:2212191/1‑150 (MQ=255)
gcCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCg > 2:270634/1‑150 (MQ=255)
ccAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCgg < 2:3414573/150‑1 (MQ=255)
aGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGa > 2:1165427/1‑150 (MQ=255)
aGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGa > 1:3087919/1‑150 (MQ=255)
gCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTcc < 1:963299/150‑1 (MQ=255)
aTACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCAc < 1:1819946/150‑1 (MQ=255)
aTACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCAc > 2:3449368/1‑150 (MQ=255)
aTACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTGTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCAc > 2:93989/1‑150 (MQ=255)
cGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActtc < 1:3169031/150‑1 (MQ=255)
ctctTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActtctt < 2:2870495/150‑1 (MQ=255)
ctctTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActtctt > 2:3715025/1‑150 (MQ=255)
tCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCg < 1:1571431/150‑1 (MQ=255)
aTGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGata < 1:2696830/150‑1 (MQ=255)
ttCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCa < 1:2893907/150‑1 (MQ=255)
tCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCAc > 2:2818550/1‑150 (MQ=255)
cggcccggccTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACg < 2:8535/150‑1 (MQ=255)
cggcccggccTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACg < 2:8315/150‑1 (MQ=255)
gcccggccTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGgt > 2:299408/1‑150 (MQ=255)
ccggccTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGgtgt < 1:896320/150‑1 (MQ=255)
cTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACAGTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTtctc < 1:3660066/150‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGt > 2:1643761/1‑150 (MQ=255)
cATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGtt < 2:3532491/150‑1 (MQ=255)
aTGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTg < 2:2675291/150‑1 (MQ=255)
tgttgtTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTgg < 1:3150439/150‑1 (MQ=255)
tgttgtTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTgg > 2:2423078/1‑150 (MQ=255)
gttgGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTcac < 2:2675766/150‑1 (MQ=255)
ggTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTcaccac < 2:2199077/150‑1 (MQ=255)
cacaTGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATg < 1:1111208/150‑1 (MQ=255)
cacaTGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATg < 2:2252801/150‑1 (MQ=255)
tGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCg > 2:1326804/1‑150 (MQ=255)
tGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCg > 1:1239738/1‑150 (MQ=255)
tGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCg < 1:1923579/150‑1 (MQ=255)
tGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCg > 1:67027/1‑150 (MQ=255)
gTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCgca > 1:261397/1‑150 (MQ=255)
aGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCgcaggca > 1:133096/1‑150 (MQ=255)
tAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGa > 1:1289902/1‑150 (MQ=255)
tAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGa > 2:2751429/1‑150 (MQ=255)
aaaCATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGAc < 1:327714/150‑1 (MQ=255)
aCATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACgg > 2:3122728/1‑150 (MQ=255)
cAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGc < 1:1194912/150‑1 (MQ=255)
cAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGc < 1:1866105/150‑1 (MQ=255)
tGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAgg < 2:3595401/150‑1 (MQ=255)
gCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGt > 1:3564853/1‑150 (MQ=255)
gCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGt > 1:3411649/1‑150 (MQ=255)
gCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGt < 1:2042495/150‑1 (MQ=255)
gCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGt < 2:581838/150‑1 (MQ=255)
ccGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTg > 1:2232153/1‑150 (MQ=255)
ccGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTg < 2:161192/150‑1 (MQ=255)
ccGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTg < 1:620793/150‑1 (MQ=255)
tCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGccc > 1:515776/1‑150 (MQ=255)
tttCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCAc > 1:375069/1‑150 (MQ=255)
tttCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCAc > 2:2480959/1‑150 (MQ=255)
ttCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACt < 2:3087890/150‑1 (MQ=255)
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tCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACtt > 2:1362059/1‑150 (MQ=255)
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AAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGAC < SRR19973061.328571/150‑1 (MQ=60)
AACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACG < SRR19973061.1884860/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTG > SRR19973061.3280454/1‑150 (MQ=60)
CAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGC < SRR19973061.1870758/150‑1 (MQ=60)
CAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGC < SRR19973061.1197921/150‑1 (MQ=60)
AGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCA > SRR19973061.3793647/1‑150 (MQ=60)
TTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAA > SRR19973061.1639017/1‑150 (MQ=60)
GCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGT < SRR19973061.2047628/150‑1 (MQ=60)
GCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGT < SRR19973061.779405/150‑1 (MQ=60)
GCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGT > SRR19973061.3420325/1‑150 (MQ=60)
GCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGT > SRR19973061.3420410/1‑150 (MQ=60)
GCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGT > SRR19973061.3573785/1‑150 (MQ=60)
GCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGT > SRR19973061.3573985/1‑150 (MQ=60)
CCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTG < SRR19973061.622378/150‑1 (MQ=60)
CCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTG > SRR19973061.2237754/1‑150 (MQ=60)
CCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTG > SRR19973061.2237602/1‑150 (MQ=60)
CCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTG < SRR19973061.2911883/150‑1 (MQ=60)
CGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGC > SRR19973061.1283774/1‑150 (MQ=60)
TCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCC > SRR19973061.517134/1‑150 (MQ=60)
TTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCAC > SRR19973061.376086/1‑150 (MQ=60)
CAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTC < SRR19973061.1859745/150‑1 (MQ=60)
CAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTC < SRR19973061.773683/150‑1 (MQ=60)
CAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTC < SRR19973061.773708/150‑1 (MQ=60)
CAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTC < SRR19973061.1479441/150‑1 (MQ=60)
AGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCA > SRR19973061.2950394/1‑150 (MQ=60)
CGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACG < SRR19973061.465000/150‑1 (MQ=60)
CACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCG > SRR19973061.3393570/1‑150 (MQ=60)
CGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCA > SRR19973061.1717649/1‑150 (MQ=60)
GGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAG > SRR19973061.2414882/1‑150 (MQ=60)
GGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAG < SRR19973061.2711778/150‑1 (MQ=60)
CCACCGCGTGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACG < SRR19973061.3009526/150‑1 (MQ=60)
TGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGT < SRR19973061.43916/150‑1 (MQ=60)
TGCAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGT < SRR19973061.1320813/150‑1 (MQ=60)
CAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTG > SRR19973061.654527/1‑150 (MQ=60)
CAGACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTG < SRR19973061.2140121/150‑1 (MQ=60)
GACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCC < SRR19973061.1911938/150‑1 (MQ=60)
ACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCCC > SRR19973061.355918/1‑150 (MQ=60)
ACCTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACATCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCCC > SRR19973061.356024/1‑150 (MQ=60)
CTATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCCCGG < SRR19973061.3336679/150‑1 (MQ=60)
TATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAGGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCCCGGT > SRR19973061.2020312/1‑150 (MQ=60)
TATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCCCGGT > SRR19973061.2020334/1‑150 (MQ=60)
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CGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCACGGTGTTTCTCGTTGGTCACCACCATGTCCGCAGGCAGACGGTGAGCAAAGGTGCCCACTTCACGCGCAGTACCACACGCAGAAGGTTGCCCGGT > CP009273/2294714‑2295011
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
