Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,751,360 |
C→T |
intergenic (‑173/+17) |
yiaY ← / ← selB |
putative Fe‑containing alcohol dehydrogenase, Pfam00465 family/selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,751,360 | 0 | C | T | 98.9%
| 601.8
/ ‑4.7
| 184 | intergenic (‑173/+17) | yiaY/selB | putative Fe‑containing alcohol dehydrogenase, Pfam00465 family/selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (97/85); minor base A (2/0); total (99/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGC > CP009273/3751213‑3751504
|
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gggcgggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAAttt > 1:1194264/1‑150 (MQ=255)
gggcgggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAAttt < 1:1218616/150‑1 (MQ=255)
gggcTGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATttaatt < 2:3776937/150‑1 (MQ=255)
ggcAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATttaatta > 2:951996/1‑150 (MQ=255)
cAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTtaattaat > 2:1706809/1‑150 (MQ=255)
cAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTtaattaat < 2:3221750/150‑1 (MQ=255)
gAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCtt < 2:2026709/150‑1 (MQ=255)
aGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTa < 2:3693407/150‑1 (MQ=255)
aGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTa < 2:1302246/150‑1 (MQ=255)
ggATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTAt < 1:1078828/150‑1 (MQ=255)
ttttCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTAtttt < 2:3743032/150‑1 (MQ=255)
ttCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTc > 1:2439648/1‑150 (MQ=255)
tCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTcc > 2:1013674/1‑150 (MQ=255)
cATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTATAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCg > 2:2703155/1‑150 (MQ=255)
aTTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCgg < 1:1869725/150‑1 (MQ=255)
ttCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGa < 1:3780506/150‑1 (MQ=255)
ttCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGa > 2:1294688/1‑150 (MQ=255)
tCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGaa < 2:1504737/150‑1 (MQ=255)
cGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGaaa < 2:3638947/150‑1 (MQ=255)
gAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAACTTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAaat < 2:2954893/150‑1 (MQ=255)
gAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAaat < 2:3091422/150‑1 (MQ=255)
gAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAaat > 2:3470530/1‑150 (MQ=255)
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tCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGt < 1:3187938/150‑1 (MQ=255)
cAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTc < 2:1851836/150‑1 (MQ=255)
aGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTcg > 1:2830635/1‑150 (MQ=255)
gTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTcgc < 1:520464/150‑1 (MQ=255)
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tGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATaa < 1:3734199/150‑1 (MQ=255)
cAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCa > 1:2861815/1‑150 (MQ=255)
cAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCa > 2:736122/1‑150 (MQ=255)
cAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCa < 1:2165617/150‑1 (MQ=255)
aaaaTTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCAt > 2:1134674/1‑150 (MQ=255)
aaaaTTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCAt < 2:2872105/150‑1 (MQ=255)
aaaaTTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCAt > 1:592565/1‑150 (MQ=255)
ttAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTcc < 1:2988529/150‑1 (MQ=255)
tAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATGAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAAATTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCa > 2:592192/1‑150 (MQ=255)
tAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCa > 2:592364/1‑150 (MQ=255)
aaTCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCac > 1:3118430/1‑150 (MQ=255)
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aaTCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCac > 1:1336787/1‑150 (MQ=255)
atataataaAAATCACATTGTATTTATTAAACAATGTTTTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacg < 1:74536/147‑1 (MQ=255)
aTCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacg > 2:3419553/1‑150 (MQ=255)
aataaAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacga < 1:2881229/150‑1 (MQ=255)
aataaAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacga > 2:2814142/1‑150 (MQ=255)
ataaAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacgac > 2:654101/1‑150 (MQ=255)
taaAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCacgacgacg > 1:492786/1‑150 (MQ=255)
aaaaGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGAcgcg > 1:405195/1‑150 (MQ=255)
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aGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTaa > 2:1201277/1‑150 (MQ=255)
cacaTTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAg > 2:1367414/1‑150 (MQ=255)
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gTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATg < 2:2868252/150‑1 (MQ=255)
tATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGc < 1:1013674/150‑1 (MQ=255)
tATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGc < 2:2166786/150‑1 (MQ=255)
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cATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTc > 1:2247781/1‑150 (MQ=255)
cATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTc < 1:1205353/150‑1 (MQ=255)
ttAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCaa > 2:1455293/1‑150 (MQ=255)
aaCAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAat > 1:484145/1‑150 (MQ=255)
aaCAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAat > 2:2335625/1‑150 (MQ=255)
aaCAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAat > 1:2706130/1‑150 (MQ=255)
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aaTGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATAtt > 2:1902600/1‑150 (MQ=255)
aaTGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATAtt < 2:223779/150‑1 (MQ=255)
aTGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTc > 1:3422539/1‑150 (MQ=255)
tgtgCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTcc < 2:105578/150‑1 (MQ=255)
gCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGa < 1:2352607/150‑1 (MQ=255)
ttttAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTg < 2:489321/150‑1 (MQ=255)
ttttAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTg < 1:2912797/150‑1 (MQ=255)
ttttAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTg < 2:1804645/150‑1 (MQ=255)
ttAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGaa < 2:2439648/150‑1 (MQ=255)
ttAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGaa < 2:2311615/150‑1 (MQ=255)
tAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAAt < 2:2365444/150‑1 (MQ=255)
aaaTTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAAtt > 2:1689506/1‑150 (MQ=255)
aaTTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTg < 1:1294694/150‑1 (MQ=255)
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ATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTC > SRR19973061.3431321/1‑150 (MQ=60)
GCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGA < SRR19973061.2358587/150‑1 (MQ=60)
GCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGA < SRR19973061.2134123/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAA < SRR19973061.1800392/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAA > SRR19973061.807190/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTG < SRR19973061.2920271/150‑1 (MQ=60)
TTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAA > SRR19973061.2333485/1‑150 (MQ=60)
AATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTG < SRR19973061.1297904/150‑1 (MQ=60)
AATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTG < SRR19973061.1297910/150‑1 (MQ=60)
TTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCC > SRR19973061.2622466/1‑150 (MQ=60)
TTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCC > SRR19973061.66583/1‑150 (MQ=60)
ATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGC > SRR19973061.2792989/1‑150 (MQ=60)
AAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTT > SRR19973061.430669/1‑150 (MQ=60)
GAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTC < SRR19973061.689261/150‑1 (MQ=60)
AATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCG < SRR19973061.2415339/150‑1 (MQ=60)
ATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGG > SRR19973061.2913380/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGG < SRR19973061.2848001/150‑1 (MQ=60)
ATTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGG < SRR19973061.1881279/150‑1 (MQ=60)
TTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGC > SRR19973061.401939/1‑150 (MQ=60)
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TTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGC > SRR19973061.1355600/1‑150 (MQ=60)
TTTTGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTACCAGCTTTCGGC > SRR19973061.402565/1‑150 (MQ=60)
TGTATTAATTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTA > SRR19973061.1648853/1‑150 (MQ=60)
TTTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAG < SRR19973061.1393906/150‑1 (MQ=60)
TTATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGC > SRR19973061.3159890/1‑150 (MQ=60)
TATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCG < SRR19973061.1240900/150‑1 (MQ=60)
ATTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCTCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGA > SRR19973061.379095/1‑150 (MQ=60)
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TTTTAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGAT > SRR19973061.1712904/1‑150 (MQ=60)
TAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGC > SRR19973061.2965415/1‑150 (MQ=60)
TAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGC > SRR19973061.1155584/1‑150 (MQ=60)
TAAAATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGC > SRR19973061.3061852/1‑150 (MQ=60)
AATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGA > SRR19973061.57897/1‑150 (MQ=60)
AATTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGA > SRR19973061.57782/1‑150 (MQ=60)
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AAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGATCAGTATTATTGATTATCAAAATTAATCTAATAAAAAGCACATTGTATTCATTAAACAATGTGCTTTTTTTAAATTCATAAGAATTTTGTATTAATTTATTTTAAAACTTAATTAATCATTTCCTTATTTTTCCGGAAATAATAATGCGTCGCGCAATAAATGATCATTTCCACGACGACGCGTAAAGCCAATGCGGTCAAAATATTCCAGAATCTGAATTGCCAGCTTTCGGCCTACGCCTAAGCGATCGCGGA > CP009273/3751211‑3751507
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
