Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,241,153 |
G→T |
pseudogene (265/1323 nt) |
yjbI → |
pseudogene, SopA‑related, pentapeptide repeats‑containing |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,241,153 | 0 | G | T | 100.0%
| 788.0
/ NA
| 233 | pseudogene (265/1323 nt) | yjbI | pseudogene, SopA‑related, pentapeptide repeats‑containing |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (111/122); total (111/122) |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TTTTTATCATCAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCGATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTCACCAGAGCAGAGTTTCTGTCT > CP009273/4241006‑4241299
|
tttttATCATCAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTAt < 1:270989/150‑1 (MQ=255)
tttttATCATCAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTAt > 2:1702050/1‑150 (MQ=255)
tttATCATCAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATGGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTAttt < 2:764620/150‑1 (MQ=255)
tATCATCAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCa < 1:65865/150‑1 (MQ=255)
atcatcAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAg < 1:3470656/150‑1 (MQ=255)
atcatcAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAg < 1:2417511/150‑1 (MQ=255)
tcatcaAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGc < 1:317178/150‑1 (MQ=255)
aTCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAata > 1:2750331/1‑150 (MQ=255)
cTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATAtt > 2:2760041/1‑150 (MQ=255)
cTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATAtt < 1:245199/150‑1 (MQ=255)
acaacaTGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCt < 1:2158953/150‑1 (MQ=255)
caacaTGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCtt > 1:101808/1‑150 (MQ=255)
caacaTGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCtt > 2:1051070/1‑150 (MQ=255)
acaTGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGa > 1:3549563/1‑150 (MQ=255)
tGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATAc > 2:271143/1‑150 (MQ=255)
aaCATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGt < 1:3716610/150‑1 (MQ=255)
tcATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGtt > 2:1814451/2‑150 (MQ=255)
aCATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGtt < 2:223209/150‑1 (MQ=255)
aTTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGa > 2:1720377/1‑150 (MQ=255)
ttCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGAc < 1:3763662/150‑1 (MQ=255)
ttCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGAc > 1:973943/1‑150 (MQ=255)
tCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACt < 1:2789429/150‑1 (MQ=255)
cGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACtt < 2:2360075/150‑1 (MQ=255)
cGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACtt > 2:1369912/1‑150 (MQ=255)
cGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACtt > 1:1572091/1‑150 (MQ=255)
aaTGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTtct > 2:2881407/1‑150 (MQ=255)
aTGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTtctc < 1:619965/150‑1 (MQ=255)
tGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCg > 2:3062963/1‑150 (MQ=255)
tGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCg < 2:3528664/150‑1 (MQ=255)
aaaGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTGTCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCag > 2:3395947/1‑150 (MQ=255)
aaGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCaga > 2:2153073/1‑150 (MQ=255)
gAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGt < 2:2491625/150‑1 (MQ=255)
aaTTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCa > 1:867825/1‑150 (MQ=255)
tGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACt > 1:2599301/1‑150 (MQ=255)
ggggATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACtt > 1:3624298/1‑150 (MQ=255)
ggggATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACtt > 1:3328794/1‑150 (MQ=255)
gggATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTACTCGCAGAGTCAACTTg > 2:200741/1‑150 (MQ=255)
ggATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTgg < 1:1208588/150‑1 (MQ=255)
ggATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTgg < 1:1955492/150‑1 (MQ=255)
gATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGt < 1:3112821/150‑1 (MQ=255)
tGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCAt < 1:549703/150‑1 (MQ=255)
cAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAg > 1:3073352/1‑150 (MQ=255)
aaTTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGt > 2:3684742/1‑150 (MQ=255)
tttACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAAt > 1:2051088/1‑150 (MQ=255)
actactGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAAtttt < 2:1951455/150‑1 (MQ=255)
ctactGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTc > 1:1510002/1‑150 (MQ=255)
tGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGa < 2:3169383/150‑1 (MQ=255)
aaTAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATg < 1:1702050/150‑1 (MQ=255)
aaTAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATg > 2:532108/1‑150 (MQ=255)
aTAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGt < 2:2601744/150‑1 (MQ=255)
aTAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGt > 2:3758918/1‑150 (MQ=255)
aTAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGt < 2:2051353/150‑1 (MQ=255)
tAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTc < 1:1767717/150‑1 (MQ=255)
aGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGAAGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCa < 1:2306151/150‑1 (MQ=255)
aaTGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGa > 2:2633316/1‑150 (MQ=255)
tGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGaaa > 2:2516247/1‑150 (MQ=255)
gTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAAt < 2:391049/150‑1 (MQ=255)
tCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACATTTGACTTCTCGCAGATTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAAtt > 1:2057035/1‑150 (MQ=255)
atatTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCa > 2:2278960/1‑150 (MQ=255)
atatTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCa > 2:1108230/1‑150 (MQ=255)
aGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTc < 1:1624220/150‑1 (MQ=255)
aTGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGa < 1:810027/150‑1 (MQ=255)
gTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATa < 2:182851/150‑1 (MQ=255)
gTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATa > 2:3240425/1‑150 (MQ=255)
cGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAAt < 2:1314498/150‑1 (MQ=255)
gACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAAtt < 2:1510002/150‑1 (MQ=255)
gACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAAtt > 2:3590254/1‑150 (MQ=255)
aCGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTg > 2:2395330/1‑150 (MQ=255)
cGTTTACACAATGTGATTTTTATCTAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGt < 1:928774/150‑1 (MQ=255)
gTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGtt > 1:251158/1‑150 (MQ=255)
ttACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTAt < 1:2804982/150‑1 (MQ=255)
tACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATc < 2:734724/150‑1 (MQ=255)
cacaATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCtt > 1:2628094/1‑150 (MQ=255)
aTGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACg > 1:2873725/1‑150 (MQ=255)
aTGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACg < 2:85582/150‑1 (MQ=255)
tgtgATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGc < 2:3715970/150‑1 (MQ=255)
gtgATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCt > 1:3694184/1‑150 (MQ=255)
tgATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCtt > 2:579672/1‑150 (MQ=255)
gATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTc < 2:1804669/150‑1 (MQ=255)
aaaGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTCAcc > 2:1546907/1‑150 (MQ=255)
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TGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGA > SRR19973061.3134019/1‑150 (MQ=60)
CAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAAT > SRR19973061.3565630/1‑150 (MQ=60)
AATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATG < SRR19973061.1706325/150‑1 (MQ=60)
TAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTC < SRR19973061.1772144/150‑1 (MQ=60)
AGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGAAGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCA < SRR19973061.2311995/150‑1 (MQ=60)
GTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAG > SRR19973061.2207185/1‑150 (MQ=60)
TGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGAT > SRR19973061.3545748/1‑150 (MQ=60)
GATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATT < SRR19973061.807125/150‑1 (MQ=60)
ATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAA < SRR19973061.2773949/150‑1 (MQ=60)
GTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAAT < SRR19973061.222968/150‑1 (MQ=60)
TCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACATTTGACTTCTCGCAGATTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATT > SRR19973061.2062213/1‑150 (MQ=60)
ATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAA > SRR19973061.1555331/1‑150 (MQ=60)
TAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTT < SRR19973061.1534630/150‑1 (MQ=60)
AGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTC > SRR19973061.625364/1‑150 (MQ=60)
AGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTC < SRR19973061.1628267/150‑1 (MQ=60)
AGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTC < SRR19973061.1628272/150‑1 (MQ=60)
AGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTC < SRR19973061.1742751/150‑1 (MQ=60)
GATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATACTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCG > SRR19973061.2017392/1‑150 (MQ=60)
ATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGA < SRR19973061.812146/150‑1 (MQ=60)
CGTTTACACAATGTGATTTTTATCTAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGT < SRR19973061.931143/150‑1 (MQ=60)
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GTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTT > SRR19973061.251860/1‑150 (MQ=60)
TTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTAT < SRR19973061.2812217/150‑1 (MQ=60)
TTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTAT < SRR19973061.2812186/150‑1 (MQ=60)
CACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTT > SRR19973061.2634847/1‑150 (MQ=60)
AATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTAC < SRR19973061.3694161/150‑1 (MQ=60)
ATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACG > SRR19973061.2881093/1‑150 (MQ=60)
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TTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCAC > SRR19973061.1478590/1‑150 (MQ=60)
ATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTC < SRR19973061.736955/150‑1 (MQ=60)
TCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTCA > SRR19973061.3724207/1‑150 (MQ=60)
AAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTCACCA < SRR19973061.956716/150‑1 (MQ=60)
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AAGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTCACCA < SRR19973061.2884559/150‑1 (MQ=60)
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AGCGAGTGGTGAATGTGTCTATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTCACCAG < SRR19973061.3768529/150‑1 (MQ=60)
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CTTTTTTATCATCAAATCTACAACATGTAACATTCGAATGTAAAGAAATTGGGGATTGCAATTTTACTACTGCAATAGTTGATAATGTCATATTTAGATGTCGACGTTTACACAATGTGATTTTTATCAAAGCGAGTGGTGAATGTGTCGATTTCAGCAAAAATATTCTTGATACAGTTGACTTCTCGCAGAGTCAACTTGGTCATAGTAATTTTCGCGAATGTCAGATTAGAAATTCAAACTTCGATAATTGTTATCTTTACGCTTCGCACTTCACCAGAGCAGAGTTTCTGTCTGCC > CP009273/4241004‑4241302
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |