Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
201,962 |
A→T |
100% |
D117V (GAT→GTT) |
dnaE → |
DNA polymerase III alpha subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 201,962 | 0 | A | T | 98.7%
| 704.5
/ ‑0.4
| 227 | D117V (GAT→GTT) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/2); new base T (108/115); total (109/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
ATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCG > CP009273/201818‑202106
|
aTTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCatcgttcg > 2:3119980/1‑148 (MQ=255)
ttttAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTcgc > 2:692670/1‑148 (MQ=255)
tAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGAc < 2:1438660/148‑1 (MQ=255)
aCGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTg > 1:3235443/1‑148 (MQ=255)
tCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCt < 1:3009037/148‑1 (MQ=255)
tGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCg > 1:3438490/1‑148 (MQ=255)
ctgctgGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTaa < 1:1148108/148‑1 (MQ=255)
gggTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGaa < 2:1157789/148‑1 (MQ=255)
gggTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGaa > 1:3512485/1‑148 (MQ=255)
gTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAgg < 1:224315/148‑1 (MQ=255)
tgatgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAggg > 1:3126748/1‑148 (MQ=255)
gatgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGt < 1:1518212/148‑1 (MQ=255)
gatgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGt > 2:238934/1‑148 (MQ=255)
tgaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTg < 1:2830374/148‑1 (MQ=255)
gaGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGa > 1:258240/1‑148 (MQ=255)
gTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATc < 2:3159218/148‑1 (MQ=255)
gTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATc < 2:3239623/148‑1 (MQ=255)
tAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCct < 2:1342205/148‑1 (MQ=255)
aaCCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACATGACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTTTAAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCGGATCATCGTTCGCTACTGGCTTATAGATTTAAACGAAGGGTTGATCctt < 1:3106867/148‑1 (MQ=255)
ccACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCcttctt > 1:1034177/1‑148 (MQ=255)
ccACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCcttctt > 1:1932223/1‑148 (MQ=255)
cACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCttt > 1:3248327/1‑148 (MQ=255)
tGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCcgg < 1:1571391/148‑1 (MQ=255)
aCGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCcggcg > 1:976423/1‑148 (MQ=255)
cTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCa < 2:3207681/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACTGTGACGCCGGGCCGATCATCGTTGGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCAt < 1:3023097/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCAt > 2:3393598/1‑148 (MQ=255)
gcggcgAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATgg > 1:12024/1‑148 (MQ=255)
gcggcgAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATgg > 2:430051/1‑148 (MQ=255)
cggcgAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATggg < 2:642/148‑1 (MQ=255)
gcgAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCg < 1:1445017/148‑1 (MQ=255)
aaCAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACg > 2:2720704/1‑148 (MQ=255)
aCAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGt > 1:2874180/1‑148 (MQ=255)
aCAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGt > 1:824692/1‑148 (MQ=255)
aTACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCgg > 1:2901773/1‑148 (MQ=255)
aCCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGAc > 2:2158200/1‑148 (MQ=255)
aCCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGAc > 1:2098439/1‑148 (MQ=255)
ccGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACg > 1:3250074/1‑148 (MQ=255)
cGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGc < 2:2088454/148‑1 (MQ=255)
ggCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCa > 1:1248310/1‑148 (MQ=255)
tATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTc > 1:2250840/1‑148 (MQ=255)
tATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTc > 1:2250994/1‑148 (MQ=255)
tATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTc < 2:2240763/148‑1 (MQ=255)
tCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTAt > 2:3382216/1‑84 (MQ=255)
tCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTAt < 1:649081/84‑1 (MQ=255)
gAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTg > 1:1774000/1‑148 (MQ=255)
gAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTg > 1:2630322/1‑148 (MQ=255)
aTCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCg < 1:2753960/148‑1 (MQ=255)
aTCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCg < 2:2952908/148‑1 (MQ=255)
aTCGGACGTTGCTGATCTCAACAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCg < 1:1641475/148‑1 (MQ=255)
cTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTg < 2:1862190/148‑1 (MQ=255)
tGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTgg < 2:2034902/148‑1 (MQ=255)
tGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTgg > 2:3480652/1‑148 (MQ=255)
tGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTgg < 2:2613503/148‑1 (MQ=255)
tGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGGTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTgg < 2:2509699/148‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTaa < 1:1105014/148‑1 (MQ=255)
gTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAAc > 1:2924773/1‑148 (MQ=255)
cTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAgcg < 2:2257666/148‑1 (MQ=255)
gATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAgcgcg > 2:2931481/1‑148 (MQ=255)
gATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAgcgcg < 1:3280222/148‑1 (MQ=255)
gATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAgcgcg < 1:3280800/148‑1 (MQ=255)
aTCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTCCGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAgcgcgc > 2:186920/1‑148 (MQ=255)
aTCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAgcgcgc > 1:3014128/1‑148 (MQ=255)
ctcAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTg > 2:2899865/1‑148 (MQ=255)
tcAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTgg < 1:2457095/148‑1 (MQ=255)
tcAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTgg < 2:1405469/148‑1 (MQ=255)
tcAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCACGCTgg > 2:1366881/1‑148 (MQ=255)
cAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGt < 1:1271166/148‑1 (MQ=255)
cAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGt < 2:2076206/148‑1 (MQ=255)
aaaGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAg > 1:994596/1‑148 (MQ=255)
aaGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGa < 2:362125/148‑1 (MQ=255)
aaGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGa > 1:2021155/1‑148 (MQ=255)
aaGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGa > 2:671338/1‑148 (MQ=255)
aaGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGa < 1:448083/148‑1 (MQ=255)
aGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGAt < 2:3117594/148‑1 (MQ=255)
tCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAgtgt < 2:3015734/148‑1 (MQ=255)
cgcgGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTcg < 2:2171308/148‑1 (MQ=255)
cgGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTcgcg < 2:1222505/148‑1 (MQ=255)
ggTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGtt < 1:3339525/148‑1 (MQ=255)
gTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGttt > 1:2359/1‑148 (MQ=255)
gTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGttt < 2:152471/148‑1 (MQ=255)
gTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGttt < 1:2793343/148‑1 (MQ=255)
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tACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGtttt < 2:2690752/148‑1 (MQ=255)
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ATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTG < SRR19973065.2771092/150‑1 (MQ=60)
ATCGGACGTTGCTGATCTCAACAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTG < SRR19973065.1652499/150‑1 (MQ=60)
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CGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACA < SRR19973065.1112259/150‑1 (MQ=60)
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TGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGC > SRR19973065.3032585/1‑150 (MQ=60)
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GATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCT < SRR19973065.3300453/150‑1 (MQ=60)
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ATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTG > SRR19973065.1576588/1‑150 (MQ=60)
CTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGT < SRR19973065.639843/150‑1 (MQ=60)
CTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCGGGT < SRR19973065.639940/150‑1 (MQ=60)
TCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTA < SRR19973065.2472580/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGCGTATCAGCGCGGGTGCGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCGGGTAG < SRR19973065.1691645/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAG > SRR19973065.1001209/1‑150 (MQ=60)
CAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAG < SRR19973065.1279550/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAG < SRR19973065.1279665/150‑1 (MQ=60)
AAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGA > SRR19973065.2034160/1‑150 (MQ=60)
AAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGAT > SRR19973065.395477/1‑150 (MQ=60)
AAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTCCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGAT > SRR19973065.2282048/1‑150 (MQ=60)
AAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATG < SRR19973065.3167493/150‑1 (MQ=60)
AAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATG < SRR19973065.451194/150‑1 (MQ=60)
AAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATG < SRR19973065.451162/150‑1 (MQ=60)
GCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAG < SRR19973065.828130/150‑1 (MQ=60)
GTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTG > SRR19973065.1078111/1‑150 (MQ=60)
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AGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCG < SRR19973065.2716854/150‑1 (MQ=60)
AGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCG > SRR19973065.3009856/1‑150 (MQ=60)
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CATCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCG > SRR19973065.1421422/1‑150 (MQ=60)
TCGTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCGCT < SRR19973065.433036/150‑1 (MQ=60)
GTTCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCGCTAT > SRR19973065.748448/1‑150 (MQ=60)
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GCAGATTTTAACGTCCAGTGCGACCTGCTGGGTGATGAGTTAACCCACCTGACGGTACTGGCGGCGAACAATACCGGCTATCAGAATCTGACGTTGCTGATCTCAAAAGCGTATCAGCGCGGGTACGGTGCCGCCGGGCCGATCATCGATCGCGACTGGCTTATCGAATTAAACGAAGGGTTGATCCTTCTTTCCGGCGGACGCATGGGCGACGTCGGACGCAGTCTTTTGCGTGGTAACAGCGCGCTGGTAGATGAGTGTGTCGCGTTTTATGAAGAACACTTCCCGGATCGCTAT > CP009273/201814‑202110
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |