Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
280,968 |
G→T |
94.6% |
intergenic (+89/‑138) |
yagF → / → yagG |
CP4‑6 prophage; dehydratase family protein/CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 280,968 | 0 | G | T | 94.6%
| 529.6
/ 20.8
| 187 | intergenic (+89/‑138) | yagF/yagG | CP4‑6 prophage; dehydratase family protein/CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/3); new base T (85/92); total (92/95) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.08e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACATAAGGGTGTAATTCTGATGACGC > CP009273/280823‑281112
|
gACACCTATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATCTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGatat < 2:1684446/148‑1 (MQ=255)
gACACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGatat < 2:2020992/148‑1 (MQ=255)
ccGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGatatatat > 1:2667086/1‑148 (MQ=255)
ccGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGatatatat > 1:1749685/1‑148 (MQ=255)
cGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATc > 2:2831673/1‑148 (MQ=255)
gATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCg > 1:391224/1‑148 (MQ=255)
tAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGtt > 2:22616/1‑148 (MQ=255)
tAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGAAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGtt > 2:230565/1‑148 (MQ=255)
aaaaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTCAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTg > 2:1908809/1‑148 (MQ=255)
aaaaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTg < 2:1367892/148‑1 (MQ=255)
aaaaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTg > 2:3252408/1‑148 (MQ=255)
aaaaTTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTg < 2:462691/148‑1 (MQ=255)
ttATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGt > 2:1507813/1‑148 (MQ=255)
aGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACaaa < 2:1417407/148‑1 (MQ=255)
ttAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCaaa < 1:2237730/148‑1 (MQ=255)
ttAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCaaa < 1:1759064/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATa < 1:2233429/148‑1 (MQ=255)
ccGGTAAAAAAGCGCGCGGAATTTAATTATTAGAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATCTCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACg < 1:3483576/148‑1 (MQ=255)
tAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAAt > 1:3319643/1‑148 (MQ=255)
tAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAAt > 1:362084/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAAtt < 1:151160/148‑1 (MQ=255)
aaaaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTc > 2:2557121/1‑148 (MQ=255)
aaaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCg > 2:3210466/1‑148 (MQ=255)
aaaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCg > 2:2317267/1‑148 (MQ=255)
aaaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCgg < 1:2926703/148‑1 (MQ=255)
aaGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGa > 2:439139/1‑148 (MQ=255)
aGCGCTCGGAATGTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGaa < 2:1916075/148‑1 (MQ=255)
cgcTCTGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAAt < 1:347535/148‑1 (MQ=255)
cgcTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTTCTGAATTTTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCTCAAAAGCAAAATAACGTAATTTGGAAAt < 2:2719646/148‑1 (MQ=255)
cgcTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAAt < 1:1109612/148‑1 (MQ=255)
cTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCTTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTACTTCGGAAATaa > 2:2071257/1‑148 (MQ=255)
tCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAg > 1:1330646/1‑148 (MQ=255)
cGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGa > 1:3313387/1‑148 (MQ=255)
tttAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGa < 2:645473/148‑1 (MQ=255)
tttAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGa < 1:3406289/148‑1 (MQ=255)
tttAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGa > 1:644512/1‑148 (MQ=255)
tttAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTAGGAAATAAGATATGa > 1:2407488/1‑148 (MQ=255)
ttAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGAc > 2:3443172/1‑148 (MQ=255)
tattTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTg > 2:2768821/1‑148 (MQ=255)
tattTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTg < 2:2944651/148‑1 (MQ=255)
tttAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTg < 2:2429132/148‑1 (MQ=255)
tttAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTg > 2:2432957/1‑148 (MQ=255)
ttAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTgg < 1:2543164/148‑1 (MQ=255)
tAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGt > 1:2981630/1‑148 (MQ=255)
agagATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTa < 1:3454592/148‑1 (MQ=255)
agagATAAAACCGTCTGCGGAATATGTCCCGCAGACGGCATTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTa < 1:2171297/148‑1 (MQ=255)
aaaaCCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGaa < 1:464337/148‑1 (MQ=255)
aaCCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATa > 2:1568490/1‑148 (MQ=255)
aaCCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATa > 1:1954243/1‑148 (MQ=255)
ccGTCTGCGGAATATTTCCCGCATACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGc > 2:663148/1‑148 (MQ=255)
ccGTCAGCGGACTATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAAATTATAAATGTAAACAATTGGGTGATATATCTCGTTGGCGTCACAACAGCAAAATAACGTCATTCGGAAAAAACATATGACCATTGCTGGGTAATGGAATAGc > 2:2424972/1‑148 (MQ=255)
cGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCt > 1:2895052/1‑148 (MQ=255)
gTCTGCGGACTATGTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTc < 1:1852646/148‑1 (MQ=255)
gTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTc < 2:96642/148‑1 (MQ=255)
tCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATAGATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCa < 2:1192779/148‑1 (MQ=255)
aaTATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACt < 2:2129642/148‑1 (MQ=255)
tatTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTACTTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTcc > 2:1733354/1‑148 (MQ=255)
tttCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCAt < 2:3311346/148‑1 (MQ=255)
tCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTa < 1:1111118/148‑1 (MQ=255)
ccGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAac < 1:874431/148‑1 (MQ=255)
cGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAaca > 1:1573601/1‑148 (MQ=255)
gACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGAt > 2:810965/1‑148 (MQ=255)
aCGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGAtg > 1:1673505/1‑148 (MQ=255)
aCGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGAtg < 2:60686/148‑1 (MQ=255)
ggCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGATCATTACACTCCATTAACACGAtgtt > 2:3298325/1‑148 (MQ=255)
ggCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGATCATTACACTCCATTAACACGAtgtt > 2:2277302/1‑148 (MQ=255)
cTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGAtgttgt < 1:2735454/148‑1 (MQ=255)
cTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGAtgttgt > 2:1273083/1‑148 (MQ=255)
tttGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTa < 2:2714101/148‑1 (MQ=255)
tttGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTa > 2:1792447/1‑148 (MQ=255)
tttGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACAATCCATTAACACGATGTTGTa < 1:3303503/148‑1 (MQ=255)
ttgttgTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTaa < 1:3197854/148‑1 (MQ=255)
ttgttgTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTaa > 2:2594726/1‑148 (MQ=255)
ttgttgTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTaa > 1:975846/1‑148 (MQ=255)
gttgttTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAAtt < 2:1909154/148‑1 (MQ=255)
gttgttTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAAtt > 1:2399301/1‑148 (MQ=255)
ttgttTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTc < 2:2370742/148‑1 (MQ=255)
ttttGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAATCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGca < 2:918050/148‑1 (MQ=255)
ttttGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGca < 2:917561/148‑1 (MQ=255)
tttGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGcac < 2:1212979/148‑1 (MQ=255)
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ttattaATTTAAAAAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACATa < 1:2456884/148‑1 (MQ=255)
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GCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTA > SRR19973065.343411/1‑150 (MQ=60)
GCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTA > SRR19973065.2762759/1‑150 (MQ=60)
CTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAA > SRR19973065.982330/1‑150 (MQ=60)
CTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAA < SRR19973065.2752467/150‑1 (MQ=60)
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TTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATT < SRR19973065.3217119/150‑1 (MQ=60)
TTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATT > SRR19973065.2414386/1‑150 (MQ=60)
GTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCA > SRR19973065.2230444/1‑150 (MQ=60)
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AATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACAT < SRR19973065.374637/150‑1 (MQ=60)
AATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACAT < SRR19973065.2922683/150‑1 (MQ=60)
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GATATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACATAAGGGTGTAATTCTGATGACGCAAT < SRR19973065.3464168/150‑1 (MQ=60)
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CACCGATAAAATTATCGAGGTAATTAACGCCGGTAAAAAAGCGCTCGGAATTTAATTATTTTAAGAGATAAAACCGTCTGCGGAATATTTCCCGCAGACGGCTTTGTTGTTTTTGAAATTTATTAATTTAAACAATTAGTTGAGATATATCGTTGGCGTCACAAAAGCAAAATAACGTAATTCGGAAATAAGATATGACCATTGCTGGTTAATTGAATAGCTCATTACACTCCATTAACACGATGTTGTAATTCGGCACACTACATAAGGGTGTAATTCTGATGACGCAAT > CP009273/280825‑281115
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
