Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
325,740 |
G→T |
94.4% |
P189P (CCG→CCT) |
betT → |
choline transporter of high affinity |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 325,740 | 0 | G | T | 94.4%
| 696.5
/ 33.2
| 249 | P189P (CCG→CCT) | betT | choline transporter of high affinity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/12); new base T (149/86); total (151/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.61e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.06e-01 |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
GGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTG > CP009273/325595‑325884
|
ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTAt < 1:2776370/148‑1 (MQ=255)
ttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTc > 2:1073792/1‑148 (MQ=255)
cACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAg < 1:2999612/148‑1 (MQ=255)
aCTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGt < 2:2300795/148‑1 (MQ=255)
cTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTg > 2:2514704/1‑148 (MQ=255)
tACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTgg > 1:78102/1‑148 (MQ=255)
aCGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGa < 1:1014732/148‑1 (MQ=255)
aCGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGa > 1:2770180/1‑148 (MQ=255)
ggCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGata > 2:2890140/1‑148 (MQ=255)
aaCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCa < 1:1297092/148‑1 (MQ=255)
aCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAg < 2:3253883/148‑1 (MQ=255)
ccGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGc > 1:969008/1‑148 (MQ=255)
ccGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGc > 1:969137/1‑148 (MQ=255)
cGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCg < 1:2425584/148‑1 (MQ=255)
cGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCg < 1:2126094/148‑1 (MQ=255)
cGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCg < 2:2007461/148‑1 (MQ=255)
cTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTg < 1:1830722/148‑1 (MQ=255)
tGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGa < 1:823342/148‑1 (MQ=255)
ggTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGAt > 2:3203303/1‑148 (MQ=255)
tCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCg < 1:1821032/148‑1 (MQ=255)
gATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGc > 2:1170669/1‑148 (MQ=255)
aTGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCa > 1:251370/1‑148 (MQ=255)
tGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATc < 2:3047584/148‑1 (MQ=255)
cgcTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCtt < 1:3197196/148‑1 (MQ=255)
gcTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTc < 1:3212780/148‑1 (MQ=255)
tGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCgg > 1:135289/1‑148 (MQ=255)
tGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCgg > 1:55779/1‑148 (MQ=255)
gATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGt < 1:2248691/148‑1 (MQ=255)
aTGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTa > 1:1999513/1‑148 (MQ=255)
tGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCAc > 1:817262/1‑148 (MQ=255)
cGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTc > 1:2230577/1‑148 (MQ=255)
cGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTc > 2:700000/1‑148 (MQ=255)
gATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCgg > 1:2174720/1‑148 (MQ=255)
atatTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGt > 1:1895350/1‑148 (MQ=255)
atatTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGt > 1:1895729/1‑148 (MQ=255)
aTACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGt > 2:654200/1‑148 (MQ=255)
tACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTa > 1:2694761/1‑148 (MQ=255)
aCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTAt < 2:800544/148‑1 (MQ=255)
aCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTAt > 2:1527961/1‑148 (MQ=255)
ttAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCgg > 1:2905014/1‑148 (MQ=255)
ttAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCgg < 1:3100262/148‑1 (MQ=255)
ttAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCgg > 1:1070757/1‑148 (MQ=255)
ttAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCgg > 1:193299/1‑148 (MQ=255)
gCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGgtgt > 1:1319368/1‑148 (MQ=255)
tATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTgtgg < 1:1183616/148‑1 (MQ=255)
aTCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTgtggt > 1:2328809/1‑148 (MQ=255)
aTCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTgtggt < 2:1899085/148‑1 (MQ=255)
cGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGc > 2:2636359/1‑148 (MQ=255)
cGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGc > 1:1027764/1‑148 (MQ=255)
tataATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGc > 1:3329588/1‑148 (MQ=255)
ataATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCt > 1:656634/1‑148 (MQ=255)
aTTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTaa > 2:2692583/1‑148 (MQ=255)
aTTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTaa > 2:2481440/1‑148 (MQ=255)
tttGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAAc > 1:1518529/1‑148 (MQ=255)
tttGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAAc > 1:1518610/1‑148 (MQ=255)
ttGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACt < 1:2345600/148‑1 (MQ=255)
ttGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACt > 2:2471183/1‑148 (MQ=255)
ttGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACt > 2:2467091/1‑148 (MQ=255)
ccGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATg > 1:2002593/1‑148 (MQ=255)
cTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCt > 1:3284023/1‑148 (MQ=255)
cTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCt < 2:2230577/148‑1 (MQ=255)
cTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCt < 2:1609746/148‑1 (MQ=255)
cACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTg < 1:2810645/148‑1 (MQ=255)
aCCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGa < 1:529026/148‑1 (MQ=255)
tCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGt > 2:857919/1‑148 (MQ=255)
tCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGt > 1:1171868/1‑148 (MQ=255)
tCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGt > 1:194758/1‑148 (MQ=255)
tCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGt > 1:3269821/1‑148 (MQ=255)
ccGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGTCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTa > 2:917431/1‑148 (MQ=255)
ccGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTa > 2:2993837/1‑148 (MQ=255)
tCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGt < 2:2382651/148‑1 (MQ=255)
tCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGt < 2:49876/148‑1 (MQ=255)
tCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGt < 2:1284276/148‑1 (MQ=255)
cGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGtt > 2:633854/1‑148 (MQ=255)
cGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGtt > 2:552550/1‑148 (MQ=255)
ggCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGttt > 1:3356558/1‑148 (MQ=255)
gcgcTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTg < 2:1679725/148‑1 (MQ=255)
cgcTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGa < 1:476481/148‑1 (MQ=255)
cTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGata < 1:2584443/148‑1 (MQ=255)
cTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGata < 2:393912/148‑1 (MQ=255)
gTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATAtt > 2:3403467/1‑148 (MQ=255)
aCCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTcc < 1:1073792/148‑1 (MQ=255)
aCCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTcc > 2:2853582/1‑148 (MQ=255)
ccGATCTTCGGTAAACGGATTTACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTTCGCTCGGTATCGGTGTGGTGCTGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATAttacat < 2:1305972/148‑5 (MQ=255)
gATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCTATACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTTCTGTTTGATATTCCCgtt < 2:1731799/148‑3 (MQ=255)
cTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCg > 2:3326131/1‑148 (MQ=255)
cTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCg > 1:2849071/1‑148 (MQ=255)
ttCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGa < 1:1283864/148‑1 (MQ=255)
cGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATg < 2:1999513/148‑1 (MQ=255)
gTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATggc > 2:1603104/1‑148 (MQ=255)
tacaCGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTCCGCTCGGTNTCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATNTTCCCGATTCGATggcg < 2:2586166/145‑1 (MQ=255)
aCGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGgcggcg > 1:387477/1‑148 (MQ=255)
gATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGaaa < 2:78102/148‑1 (MQ=255)
ttAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGc < 2:1399243/148‑1 (MQ=255)
ttAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGc < 2:1894955/148‑1 (MQ=255)
tAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCg > 2:1538921/1‑148 (MQ=255)
aaCGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCgg < 1:3042248/148‑1 (MQ=255)
aCGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGc > 2:1250844/1‑148 (MQ=255)
gCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTg > 2:523637/1‑148 (MQ=255)
gCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTg > 2:524140/1‑148 (MQ=255)
|
GGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTG > CP009273/325595‑325884
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC > CP009273/325592‑325889
|
TCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTA < SRR19973065.121473/150‑1 (MQ=60)
TGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATA < SRR19973065.811057/150‑1 (MQ=60)
TGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATA < SRR19973065.809742/150‑1 (MQ=60)
GGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAG < SRR19973065.2793560/150‑1 (MQ=60)
GGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAG < SRR19973065.2793604/150‑1 (MQ=60)
GACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGG < SRR19973065.547693/150‑1 (MQ=60)
ACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGT > SRR19973065.3341130/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCA < SRR19973065.2596207/150‑1 (MQ=60)
TTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAG < SRR19973065.2246385/150‑1 (MQ=60)
CACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTG < SRR19973065.3018751/150‑1 (MQ=60)
CACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTG < SRR19973065.3017990/150‑1 (MQ=60)
ACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGG > SRR19973065.1911518/1‑150 (MQ=60)
ACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGG > SRR19973065.1911563/1‑150 (MQ=60)
ACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGG > SRR19973065.78889/1‑150 (MQ=60)
ACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGG > SRR19973065.78903/1‑150 (MQ=60)
CTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGA > SRR19973065.2787387/1‑150 (MQ=60)
CTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGA > SRR19973065.1023154/1‑150 (MQ=60)
ACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATA < SRR19973065.1021455/150‑1 (MQ=60)
AACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGC > SRR19973065.975442/1‑150 (MQ=60)
AACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGC > SRR19973065.975488/1‑150 (MQ=60)
AACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGC > SRR19973065.975571/1‑150 (MQ=60)
AACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGC < SRR19973065.1305637/150‑1 (MQ=60)
AACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGC < SRR19973065.1305640/150‑1 (MQ=60)
ACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCG < SRR19973065.2911974/150‑1 (MQ=60)
ACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCG < SRR19973065.1149604/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGT < SRR19973065.2440888/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGT < SRR19973065.2139777/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGA > SRR19973065.1318473/1‑150 (MQ=60)
CTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGAT > SRR19973065.866283/1‑150 (MQ=60)
CTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGAT < SRR19973065.3536975/150‑1 (MQ=60)
CTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGAT < SRR19973065.1842782/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATC > SRR19973065.3235686/1‑150 (MQ=60)
TGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATC < SRR19973065.828744/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATC > SRR19973065.2118300/1‑150 (MQ=60)
TCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGC > SRR19973065.2826060/1‑150 (MQ=60)
TCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGC > SRR19973065.1062646/1‑150 (MQ=60)
TCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGC < SRR19973065.1833024/150‑1 (MQ=60)
CGATGTATGGGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCA > SRR19973065.504055/1‑150 (MQ=60)
CGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCA > SRR19973065.253127/1‑150 (MQ=60)
CGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCA < SRR19973065.1841385/150‑1 (MQ=60)
GTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTAT < SRR19973065.1084401/150‑1 (MQ=60)
TATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATC < SRR19973065.2767571/150‑1 (MQ=60)
ATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCT > SRR19973065.3101241/1‑150 (MQ=60)
CGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCG < SRR19973065.3216458/150‑1 (MQ=60)
GCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGG > SRR19973065.136449/1‑150 (MQ=60)
GCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGG < SRR19973065.3232107/150‑1 (MQ=60)
GCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGG > SRR19973065.56378/1‑150 (MQ=60)
TGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTA > SRR19973065.2012458/1‑150 (MQ=60)
TGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTA > SRR19973065.2012460/1‑150 (MQ=60)
GATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTAT < SRR19973065.2263254/150‑1 (MQ=60)
GATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTAT < SRR19973065.2262951/150‑1 (MQ=60)
TGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTG > SRR19973065.201225/1‑150 (MQ=60)
CATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCAC > SRR19973065.822635/1‑150 (MQ=60)
CATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCAC > SRR19973065.822826/1‑150 (MQ=60)
GGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTAC < SRR19973065.2863314/150‑1 (MQ=60)
CTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTC > SRR19973065.2244462/1‑150 (MQ=60)
CTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTC > SRR19973065.2244774/1‑150 (MQ=60)
CGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGG > SRR19973065.2188671/1‑150 (MQ=60)
CGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGG > SRR19973065.2188581/1‑150 (MQ=60)
GGATATTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGT > SRR19973065.1908187/1‑150 (MQ=60)
GGATATTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGT > SRR19973065.1907805/1‑150 (MQ=60)
GGATATTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGT > SRR19973065.1908115/1‑150 (MQ=60)
GATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTA > SRR19973065.2712172/1‑150 (MQ=60)
GATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTA > SRR19973065.2711491/1‑150 (MQ=60)
ATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTAT > SRR19973065.2274982/1‑150 (MQ=60)
ATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTAT > SRR19973065.1624966/1‑150 (MQ=60)
ACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCTGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGAAGCGGTGATCGGCACTATATTCGGTATTGCCACTACCCTCGGTAaag > SRR19973065.1733868/1‑147 (MQ=60)
CTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGG > SRR19973065.1077843/1‑150 (MQ=60)
CTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGG > SRR19973065.2389049/1‑150 (MQ=60)
CTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGG > SRR19973065.2922722/1‑150 (MQ=60)
CTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGG > SRR19973065.194805/1‑150 (MQ=60)
TTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTG < SRR19973065.3120551/150‑1 (MQ=60)
TTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTG < SRR19973065.3119188/150‑1 (MQ=60)
TAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGT > SRR19973065.1328096/1‑150 (MQ=60)
TAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGT > SRR19973065.1328135/1‑150 (MQ=60)
CTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGT > SRR19973065.2343405/1‑150 (MQ=60)
CTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGT > SRR19973065.2343377/1‑150 (MQ=60)
CTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGT < SRR19973065.3506676/150‑1 (MQ=60)
TATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTG < SRR19973065.1191110/150‑1 (MQ=60)
TATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTG < SRR19973065.2424553/150‑1 (MQ=60)
ATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGC > SRR19973065.1034565/1‑150 (MQ=60)
ATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGC > SRR19973065.1207410/1‑150 (MQ=60)
GTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGC > SRR19973065.3349907/1‑150 (MQ=60)
TTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCT > SRR19973065.660963/1‑150 (MQ=60)
TTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCT < SRR19973065.1948993/150‑1 (MQ=60)
ATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTA > SRR19973065.1478910/1‑150 (MQ=60)
AATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAAC > SRR19973065.1528463/1‑150 (MQ=60)
AATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAAC > SRR19973065.1528514/1‑150 (MQ=60)
AATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAAC > SRR19973065.1528544/1‑150 (MQ=60)
ATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACT > SRR19973065.561759/1‑150 (MQ=60)
ATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACT < SRR19973065.3149468/150‑1 (MQ=60)
TTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTAT < SRR19973065.2360228/150‑1 (MQ=60)
TGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATG > SRR19973065.2015577/1‑150 (MQ=60)
TGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATG > SRR19973065.1045054/1‑150 (MQ=60)
TGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATG > SRR19973065.2015546/1‑150 (MQ=60)
TGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATG > SRR19973065.2807053/1‑150 (MQ=60)
CGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCT > SRR19973065.3304115/1‑150 (MQ=60)
CGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCT > SRR19973065.3303992/1‑150 (MQ=60)
CGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCT > SRR19973065.3303852/1‑150 (MQ=60)
TCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGA < SRR19973065.509402/150‑1 (MQ=60)
CACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAG < SRR19973065.2828028/150‑1 (MQ=60)
CACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAG < SRR19973065.3000643/150‑1 (MQ=60)
ACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGC < SRR19973065.532492/150‑1 (MQ=60)
CATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGT > SRR19973065.3289653/1‑150 (MQ=60)
CATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGT > SRR19973065.1179337/1‑150 (MQ=60)
CATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGT > SRR19973065.1185126/1‑150 (MQ=60)
CATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGT > SRR19973065.196274/1‑150 (MQ=60)
CTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTT > SRR19973065.3356312/1‑150 (MQ=60)
TCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTT > SRR19973065.3377077/1‑150 (MQ=60)
GCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGAT < SRR19973065.704659/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATA < SRR19973065.3242131/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATA < SRR19973065.479733/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATA < SRR19973065.1520090/150‑1 (MQ=60)
GCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATAT < SRR19973065.1890444/150‑1 (MQ=60)
CTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATT < SRR19973065.2600543/150‑1 (MQ=60)
TGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTCTGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTC > SRR19973065.1846498/1‑150 (MQ=60)
TACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGAGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTAGATATTCCC > SRR19973065.2639094/1‑150 (MQ=60)
ACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCG < SRR19973065.1080882/150‑1 (MQ=60)
ACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCG < SRR19973065.1080894/150‑1 (MQ=60)
CGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATT < SRR19973065.406390/150‑1 (MQ=60)
GATCTTCGGTAAACTGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTC < SRR19973065.2557805/150‑1 (MQ=60)
ATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCG > SRR19973065.3056249/1‑150 (MQ=60)
ATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCG > SRR19973065.2866628/1‑150 (MQ=60)
ATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCG > SRR19973065.2866597/1‑150 (MQ=60)
CTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGAT < SRR19973065.2528225/150‑1 (MQ=60)
CTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGAT < SRR19973065.2011342/150‑1 (MQ=60)
TTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATG > SRR19973065.3225660/1‑150 (MQ=60)
TTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATG < SRR19973065.1297288/150‑1 (MQ=60)
TTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATG < SRR19973065.1292333/150‑1 (MQ=60)
CGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGC > SRR19973065.814787/1‑150 (MQ=60)
CGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGC > SRR19973065.1242726/1‑150 (MQ=60)
GTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGG > SRR19973065.876026/1‑150 (MQ=60)
TAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGC > SRR19973065.603946/1‑150 (MQ=60)
TAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGC < SRR19973065.2210659/150‑1 (MQ=60)
AAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCG > SRR19973065.1766326/1‑150 (MQ=60)
AAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCG > SRR19973065.390177/1‑150 (MQ=60)
AACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCA < SRR19973065.3060868/150‑1 (MQ=60)
CCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATC < SRR19973065.833574/150‑1 (MQ=60)
TATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC > SRR19973065.766639/1‑150 (MQ=60)
|
TCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC > CP009273/325592‑325889
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
