Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
325,740 |
G→T |
57.8% |
P189P (CCG→CCT) |
betT → |
choline transporter of high affinity |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 325,740 | 0 | G | T | 57.8%
| 38.1
/ inf
| 325 | P189P (CCG→CCT) | betT | choline transporter of high affinity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/69); new base T (87/101); total (155/170) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.75e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
GTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC > CP009273/325591‑325889
|
gTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCg > 2:5049373/1‑150 (MQ=255)
ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAg < 2:1570670/150‑1 (MQ=255)
ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAg < 2:2812419/150‑1 (MQ=255)
gACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAAAGGGCCTATAgg > 2:1811938/1‑150 (MQ=255)
gCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCa < 2:1923948/150‑1 (MQ=255)
gCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCa < 1:1074588/150‑1 (MQ=255)
gCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCa < 2:3430415/150‑1 (MQ=255)
tGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACt < 1:2281139/150‑1 (MQ=255)
tttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCa < 2:3515286/150‑1 (MQ=255)
tttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCa < 1:2640511/150‑1 (MQ=255)
cACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTATCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACTGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTg > 2:4057422/1‑150 (MQ=255)
cACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTATCGGGCCTATAGGTCACTCAGTg < 2:560314/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGatat < 1:3060210/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATAGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGatat < 1:4280500/150‑1 (MQ=255)
ggCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATAtt < 1:4434557/150‑1 (MQ=255)
tAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAg < 1:1969447/150‑1 (MQ=255)
tAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATGTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAg < 1:284739/150‑1 (MQ=255)
aaCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGc < 1:626623/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTg < 1:198786/150‑1 (MQ=255)
cTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGAt > 2:320477/1‑150 (MQ=255)
cTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGAt < 2:584551/150‑1 (MQ=255)
tGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATc < 2:137585/150‑1 (MQ=255)
ggTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCg < 2:2338067/150‑1 (MQ=255)
gTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCgg < 2:4763002/150‑1 (MQ=255)
gTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCgg < 1:715986/150‑1 (MQ=255)
cGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCa > 1:1862313/1‑150 (MQ=255)
gATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATCTTGCAGCGGTGATCGGCAc > 1:1104733/1‑150 (MQ=255)
aTGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACt > 1:4870175/1‑150 (MQ=255)
gTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTAt < 1:949114/150‑1 (MQ=255)
tATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATc < 2:4898486/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTc < 2:2681517/150‑1 (MQ=255)
cggATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGt < 2:2952803/148‑1 (MQ=255)
gATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTAt > 1:3430153/1‑150 (MQ=255)
aTGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTAtt < 2:2715023/150‑1 (MQ=255)
ggCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGcc < 1:4024413/150‑1 (MQ=255)
aTGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACt < 1:3162908/150‑1 (MQ=255)
cgcTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGc > 2:4336971/1‑150 (MQ=255)
gcTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCt < 1:483764/150‑1 (MQ=255)
gcTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCt > 2:166681/1‑150 (MQ=255)
cTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTc < 2:3355857/150‑1 (MQ=255)
cTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTc < 1:4953156/150‑1 (MQ=255)
cTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTc < 1:4484755/150‑1 (MQ=255)
gATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTa > 1:5074772/1‑150 (MQ=255)
tACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATc < 2:1067849/150‑1 (MQ=255)
cTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCgg > 1:861817/1‑150 (MQ=255)
aGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGtgtg > 1:1284359/1‑150 (MQ=255)
aGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGtgtg < 1:1337172/150‑1 (MQ=255)
aTCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTCTTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGc > 2:685015/1‑150 (MQ=255)
gTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGc > 1:2223265/1‑150 (MQ=255)
taATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCTCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTaa < 2:3282328/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAAc < 2:4279529/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAAc < 1:2804914/150‑1 (MQ=255)
tttGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTa > 1:5119408/1‑150 (MQ=255)
tccGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTTTGGTGCAGCTTAACTATgg < 2:3881427/149‑1 (MQ=255)
cTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTg < 1:4754973/150‑1 (MQ=255)
cTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTg < 2:2207841/150‑1 (MQ=255)
tCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGa > 2:1717446/1‑150 (MQ=255)
tCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGa > 1:790205/1‑150 (MQ=255)
tCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGa > 2:58024/1‑150 (MQ=255)
cACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAg < 2:953247/150‑1 (MQ=255)
aCCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGc > 1:613627/1‑150 (MQ=255)
ccATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCAGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCg > 1:3261372/1‑150 (MQ=255)
ccATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCg > 1:344276/1‑150 (MQ=255)
cATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGt > 2:3778195/1‑150 (MQ=255)
ccGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACt < 1:3477252/150‑1 (MQ=255)
ccGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACt < 1:4340034/150‑1 (MQ=255)
ccGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACt < 1:762706/150‑1 (MQ=255)
cGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTg < 2:4580725/150‑1 (MQ=255)
cGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTg < 2:4468012/150‑1 (MQ=255)
ggCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGa < 1:1664615/150‑1 (MQ=255)
cgcTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGata < 2:4691259/150‑1 (MQ=255)
cTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATAtt < 1:1159367/150‑1 (MQ=255)
cTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATAtt < 1:2403252/150‑1 (MQ=255)
aCCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCg > 2:1451828/1‑150 (MQ=255)
gATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTc < 2:1999442/150‑1 (MQ=255)
aTCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCg < 1:2769253/150‑1 (MQ=255)
aTCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCg < 2:2419558/150‑1 (MQ=255)
cTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGAt < 2:3604203/150‑1 (MQ=255)
cTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGAt < 1:1480709/150‑1 (MQ=255)
ttCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATg > 2:5120393/1‑150 (MQ=255)
tCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTg > 1:1195382/1‑132 (MQ=255)
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ggTAAACGGATTAACGTGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCTGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGAAGCTTAACTATGGCTAGAGCGTAATTTTTGATATTACCGATTCGAtttcg > 1:1266466/1‑146 (MQ=255)
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CGTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATGCGAT > SRR19973062.2270203/1‑150 (MQ=60)
TTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATG < SRR19973062.3175081/150‑1 (MQ=60)
GTCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATG > SRR19973062.5167692/1‑150 (MQ=60)
TCGGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGAgatcggaagagcacacg > SRR19973062.1200961/1‑133 (MQ=60)
TCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGG < SRR19973062.3199748/150‑1 (MQ=60)
TCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGG < SRR19973062.1898459/150‑1 (MQ=60)
GGTAAACGGATTAACGTGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCTGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGAAGCTTAACTATGGCTAGAGCGTAATTTTTGATATTACCGATTCGATttcg > SRR19973062.1272307/1‑146 (MQ=60)
GGTAAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCG < SRR19973062.1601539/150‑1 (MQ=60)
GGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCG > SRR19973062.1272526/1‑150 (MQ=60)
AAACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCG < SRR19973062.4962560/150‑1 (MQ=60)
AAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCG > SRR19973062.3160380/1‑150 (MQ=60)
AAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCG > SRR19973062.3160373/1‑150 (MQ=60)
AACGGATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGA > SRR19973062.4195439/1‑150 (MQ=60)
CGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAA < SRR19973062.5076141/150‑1 (MQ=60)
GGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAG > SRR19973062.1650140/1‑150 (MQ=60)
GATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGC > SRR19973062.559119/1‑150 (MQ=60)
GATTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGC > SRR19973062.2413442/1‑150 (MQ=60)
GATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGC > SRR19973062.3311193/1‑150 (MQ=60)
GATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGC > SRR19973062.1259962/1‑150 (MQ=60)
GATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGC > SRR19973062.3941135/1‑150 (MQ=60)
ATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCG > SRR19973062.1915372/1‑150 (MQ=60)
TTAACGGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGG > SRR19973062.1574488/1‑150 (MQ=60)
GGGCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTG > SRR19973062.2825491/1‑150 (MQ=60)
GGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTG < SRR19973062.191605/150‑1 (MQ=60)
GGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTG < SRR19973062.3773269/150‑1 (MQ=60)
GCCTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGAT > SRR19973062.5231033/1‑150 (MQ=60)
CTATAGGTCACTCAGTGGGTATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCG > SRR19973062.1418288/1‑150 (MQ=60)
CTATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCG > SRR19973062.5060600/1‑150 (MQ=60)
CGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCG > SRR19973062.4378683/1‑150 (MQ=60)
TATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC < SRR19973062.5105788/150‑1 (MQ=60)
GATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC > SRR19973062.438440/1‑150 (MQ=60)
GATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC > SRR19973062.438441/1‑150 (MQ=60)
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GTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACTCAGTGGATATTGCAGCGGTGATCGGCACTATCTTCGGTATTGCCACTACGCTCGGTATCGGTGTGGTGCAGCTTAACTATGGCTTGAGCGTACTGTTTGATATTCCCGATTCGATGGCGGCGAAAGCGGCACTGATCGC > CP009273/325591‑325889
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |