Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
2,318,825 |
G→T |
100% |
V197V (GTG→GTT) |
atoE → |
short chain fatty acid transporter |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 2,318,825 | 0 | G | T | 97.9%
| 603.1
/ 3.4
| 189 | V197V (GTG→GTT) | atoE | short chain fatty acid transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base T (84/101); total (86/103) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
CCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTGATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCAT > CP009273/2318680‑2318968
|
ccTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTAt > 1:2497800/1‑148 (MQ=255)
ccTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTAt > 2:355304/1‑148 (MQ=255)
tGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGc < 2:1805962/148‑1 (MQ=255)
tGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGc > 2:3293828/1‑148 (MQ=255)
tGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGAATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGc > 2:554681/1‑148 (MQ=255)
ggggTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGcc > 2:1376412/1‑148 (MQ=255)
ggTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAt > 2:381603/1‑148 (MQ=255)
gTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAtt < 2:1844531/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAttt < 1:669538/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAttt < 2:1841502/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAttt < 2:1660453/148‑1 (MQ=255)
tGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAttt < 1:3204645/148‑1 (MQ=255)
cggcTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATc < 1:352368/148‑1 (MQ=255)
ggcTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCa < 1:1037552/148‑1 (MQ=255)
ggcTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCa < 1:1222031/148‑1 (MQ=255)
ctctGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGc < 2:3094531/148‑1 (MQ=255)
ctGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCat > 1:2181102/1‑148 (MQ=255)
tGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatg < 1:2320002/148‑1 (MQ=255)
tGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatg > 1:1752450/1‑148 (MQ=255)
aaTGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCACCCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatgatg > 1:855838/1‑148 (MQ=255)
aaTGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatgatg < 1:514497/148‑1 (MQ=255)
aTGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGc < 1:321723/148‑1 (MQ=255)
gCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCa > 1:801574/1‑148 (MQ=255)
tctGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCaaaa > 1:403042/1‑148 (MQ=255)
tGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAAcc < 1:3022305/148‑1 (MQ=255)
ttGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGt < 2:2640213/148‑1 (MQ=255)
ttGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGt < 1:3281455/148‑1 (MQ=255)
ttGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGt > 1:1922053/1‑148 (MQ=255)
ttGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGt < 1:564536/148‑1 (MQ=255)
ttGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGt > 1:2840201/1‑148 (MQ=255)
ttGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGGTGATTGTGGTTATGCGATTTATCACCCGCATGATGATGCCCAAACCGt > 1:1088281/1‑148 (MQ=255)
tGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTc < 1:2256328/148‑1 (MQ=255)
ggCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCt < 1:1233508/148‑1 (MQ=255)
gCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTg < 2:2157520/148‑1 (MQ=255)
gCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACg < 1:1406130/148‑1 (MQ=255)
gCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACg < 2:687839/148‑1 (MQ=255)
cAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgt > 2:2818998/1‑148 (MQ=255)
cAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgt > 2:2818614/1‑148 (MQ=255)
aaCACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtg < 2:3288371/148‑1 (MQ=255)
acCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtggtg < 1:3480212/148‑1 (MQ=255)
acCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtggtg < 1:1724398/148‑1 (MQ=255)
acCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtggtg < 2:3063888/148‑1 (MQ=255)
acCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtggtg > 2:3386771/1‑148 (MQ=255)
ggCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTa < 1:2973638/148‑1 (MQ=255)
gCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTAt > 2:2195300/1‑148 (MQ=255)
gCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTAt < 1:714165/148‑1 (MQ=255)
aCCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGa > 2:1545090/1‑148 (MQ=255)
cccGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGAt > 2:1278629/1‑148 (MQ=255)
cccGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGAt < 1:215497/148‑1 (MQ=255)
ttGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCaaa < 1:1457763/148‑1 (MQ=255)
ttGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCaaa < 1:2805759/148‑1 (MQ=255)
tGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCaaaa > 2:1244219/1‑148 (MQ=255)
tGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCaaaa < 1:462561/148‑1 (MQ=255)
aGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAact < 1:2900949/148‑1 (MQ=255)
atatCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAactact < 1:2642647/148‑1 (MQ=255)
tCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCAt > 2:1328846/1‑148 (MQ=255)
cGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATg < 2:1262772/148‑1 (MQ=255)
gCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATgg < 2:855838/148‑1 (MQ=255)
gCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATgg < 2:2452659/148‑1 (MQ=255)
ccGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGa < 2:625477/148‑1 (MQ=255)
ggCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAaga > 2:3023258/1‑148 (MQ=255)
gCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGTCGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAcgag > 1:1073501/1‑148 (MQ=255)
gCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAagag > 1:3315496/1‑148 (MQ=255)
gATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCt < 1:2188488/148‑1 (MQ=255)
gATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCt > 1:1616101/1‑148 (MQ=255)
cccGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACTTTTTCATCAATGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAt < 1:3408029/148‑1 (MQ=255)
ccGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAtt < 1:2205041/148‑1 (MQ=255)
cGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAttt < 2:1777735/148‑1 (MQ=255)
gggCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCaa < 2:1298369/148‑1 (MQ=255)
aTACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagca > 2:1711675/1‑148 (MQ=255)
tACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagcag > 2:1510379/1‑148 (MQ=255)
tACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagcag > 2:307630/1‑148 (MQ=255)
tACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagcag < 1:1278629/148‑1 (MQ=255)
tACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagcag > 2:1509770/1‑148 (MQ=255)
aCTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagcagc < 1:2818698/148‑1 (MQ=255)
ctctGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCt > 1:661843/1‑148 (MQ=255)
tctGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCCGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTa > 1:298952/1‑148 (MQ=255)
ctGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTAc > 1:3369672/1‑148 (MQ=255)
ctGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTAc > 1:90130/1‑148 (MQ=255)
gTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTGTGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCg > 2:799815/1‑148 (MQ=255)
tCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGaa < 2:2316740/148‑1 (MQ=255)
aGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTGATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAg > 2:1737285/1‑148 (MQ=255)
gTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGa < 1:775965/148‑1 (MQ=255)
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CTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCT > SRR19973065.1626945/1‑150 (MQ=60)
TGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTG < SRR19973065.384271/150‑1 (MQ=60)
GATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGA < SRR19973065.2202462/150‑1 (MQ=60)
GATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGA < SRR19973065.2202523/150‑1 (MQ=60)
CCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACTTTTTCATCAATGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTT < SRR19973065.3428850/150‑1 (MQ=60)
CCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTT < SRR19973065.3428854/150‑1 (MQ=60)
CCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTT < SRR19973065.2219149/150‑1 (MQ=60)
ATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGC > SRR19973065.1352057/1‑150 (MQ=60)
TACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCT < SRR19973065.1287070/150‑1 (MQ=60)
TACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCT > SRR19973065.666225/1‑150 (MQ=60)
ACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTA < SRR19973065.2836112/150‑1 (MQ=60)
ACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTA < SRR19973065.2836414/150‑1 (MQ=60)
ACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTA < SRR19973065.2836027/150‑1 (MQ=60)
ACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCCGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTA > SRR19973065.300885/1‑150 (MQ=60)
ACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATATATCACCCGCATGATGATGCC‑AAACCGTCGGTCGTGGTGAGTATCGATGCAAAAATACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCATATGCAGCTAC > SRR19973065.300832/1‑150 (MQ=60)
CTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTAC > SRR19973065.90990/1‑150 (MQ=60)
CTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTAC > SRR19973065.3390282/1‑150 (MQ=60)
CTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTAC > SRR19973065.3391495/1‑150 (MQ=60)
CTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTAC > SRR19973065.3390258/1‑150 (MQ=60)
AGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGAT < SRR19973065.2209368/150‑1 (MQ=60)
GTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATG < SRR19973065.2088931/150‑1 (MQ=60)
GTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATG < SRR19973065.781124/150‑1 (MQ=60)
GTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATG < SRR19973065.3037249/150‑1 (MQ=60)
GTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATG < SRR19973065.2750407/150‑1 (MQ=60)
TGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGTGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGC > SRR19973065.3346652/1‑150 (MQ=60)
TGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGC > SRR19973065.3346645/1‑150 (MQ=60)
TGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGC > SRR19973065.2949406/1‑150 (MQ=60)
TGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGC > SRR19973065.653293/1‑150 (MQ=60)
TGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGC > SRR19973065.653316/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCC > SRR19973065.3334317/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCC > SRR19973065.3333789/1‑150 (MQ=60)
TAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACC < SRR19973065.427799/150‑1 (MQ=60)
TAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACC > SRR19973065.2580909/1‑150 (MQ=60)
TAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACC > SRR19973065.3268356/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCC > SRR19973065.1280128/1‑150 (MQ=60)
TTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCG > SRR19973065.2572714/1‑150 (MQ=60)
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TTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCG > SRR19973065.2572700/1‑150 (MQ=60)
CACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACT < SRR19973065.520360/150‑1 (MQ=60)
CACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACT < SRR19973065.516622/150‑1 (MQ=60)
CTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGG > SRR19973065.2097270/1‑150 (MQ=60)
TGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCC < SRR19973065.3079975/150‑1 (MQ=60)
TGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTC < SRR19973065.1924675/150‑1 (MQ=60)
TGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCGGACGTGGTGAGTATCGATCAAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCTTCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTC < SRR19973065.3065112/150‑1 (MQ=60)
GTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTG > SRR19973065.1418077/1‑150 (MQ=60)
TTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGGGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAACGCCGCCTTCTGA > SRR19973065.619540/1‑150 (MQ=60)
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CACCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTGATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGA > CP009273/2318678‑2318973
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |