Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,318,825 |
G→T |
100% |
V197V (GTG→GTT) |
atoE → |
short chain fatty acid transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,318,825 | 0 | G | T | 98.4%
| 825.6
/ 3.1
| 263 | V197V (GTG→GTT) | atoE | short chain fatty acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base T (116/142); total (119/144) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CACCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTGATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCT > CP009273/2318678‑2318971
|
cACCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTAt > 1:2938608/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGTGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATg > 2:3119678/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATg > 1:3461864/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATg > 1:1623182/1‑150 (MQ=255)
ccTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGc < 1:5097080/150‑1 (MQ=255)
ggggTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAt > 1:2561127/1‑150 (MQ=255)
ggggTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAt > 1:1991945/1‑150 (MQ=255)
ggTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAttt < 1:1040443/150‑1 (MQ=255)
ggTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCAttt < 1:4779630/150‑1 (MQ=255)
gTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTa < 2:3282420/150‑1 (MQ=255)
gTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTa < 1:3977397/150‑1 (MQ=255)
tGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAATCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTAt < 2:1605241/150‑1 (MQ=255)
ggcggcTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATc > 1:2841182/1‑150 (MQ=255)
gcggcTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCAGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCa < 2:4403552/150‑1 (MQ=255)
ggcTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCAcc < 1:631690/150‑1 (MQ=255)
cTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCg > 1:2264364/1‑150 (MQ=255)
ctctGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTGATGCCATTTATCACCCGCat < 1:2374577/150‑1 (MQ=255)
ggATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatg > 1:1318838/1‑150 (MQ=255)
ggATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatg < 2:756187/150‑1 (MQ=255)
ggATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatg > 2:4708539/1‑150 (MQ=255)
ggATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatg > 2:3952942/1‑150 (MQ=255)
ggATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGGTATGCCATTTATCACCCGCatgatg > 1:2183214/1‑150 (MQ=255)
aTCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatgat > 1:3508610/1‑150 (MQ=255)
tCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCatgatgatg < 1:2023673/150‑1 (MQ=255)
tGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCaa < 2:4044032/150‑1 (MQ=255)
ctGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCg > 1:1931351/1‑150 (MQ=255)
ttGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCt < 1:5074767/150‑1 (MQ=255)
tGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgt < 2:142472/150‑1 (MQ=255)
aaCACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtggt < 1:2665937/150‑1 (MQ=255)
aaCACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtggt < 2:194891/150‑1 (MQ=255)
aaCACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTGATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACgtggt > 2:733791/1‑150 (MQ=255)
acCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGGGGGCGAGACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAg < 2:3828567/150‑1 (MQ=255)
cGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTa < 2:2444230/150‑1 (MQ=255)
gggCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTAt < 2:3986829/150‑1 (MQ=255)
gggCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTAt < 2:4849041/150‑1 (MQ=255)
ggCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATc > 1:2380503/1‑150 (MQ=255)
ggCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATc > 1:5221575/1‑150 (MQ=255)
ggCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATc < 1:1782005/150‑1 (MQ=255)
aaCCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGAt > 2:4284607/1‑150 (MQ=255)
aaCCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGAt < 2:4606237/150‑1 (MQ=255)
ggTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCaaa > 2:3295242/1‑150 (MQ=255)
gTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCaaaa < 2:751028/150‑1 (MQ=255)
ttGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAac < 1:3769619/150‑1 (MQ=255)
tGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAact > 1:1071555/1‑150 (MQ=255)
atatCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCa > 1:4669722/1‑150 (MQ=255)
tatCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCAt > 1:2728849/1‑150 (MQ=255)
gCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGGTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGaa > 1:4503539/1‑150 (MQ=255)
ccGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAag < 2:3146280/150‑1 (MQ=255)
cGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAaga < 2:3340324/150‑1 (MQ=255)
cGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAaga > 2:1617572/1‑150 (MQ=255)
gggCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAagag > 1:4780738/1‑150 (MQ=255)
gggCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAagag < 1:3197174/150‑1 (MQ=255)
gggCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAagag < 1:3409130/150‑1 (MQ=255)
cTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCt > 2:2955454/1‑150 (MQ=255)
tGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTg < 1:975401/150‑1 (MQ=255)
aTCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAt < 2:3423820/150‑1 (MQ=255)
tCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAtt < 1:2130919/150‑1 (MQ=255)
cccGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGTTGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACGACTCATGGAAGAGGCTGAttt < 1:4631664/150‑1 (MQ=255)
cccGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAttt < 1:393611/150‑1 (MQ=255)
cccGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAttt < 1:715921/150‑1 (MQ=255)
gTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCaa < 2:943536/150‑1 (MQ=255)
gTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCaa < 1:1183789/150‑1 (MQ=255)
gCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagc > 1:1775228/1‑150 (MQ=255)
cGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagca < 2:558799/150‑1 (MQ=255)
cGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagca < 2:3236045/150‑1 (MQ=255)
gATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAagcag > 1:2334060/1‑150 (MQ=255)
tACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCt < 2:2264364/150‑1 (MQ=255)
aCTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTa > 1:3306338/1‑150 (MQ=255)
ctctGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTAc < 1:1822940/150‑1 (MQ=255)
ctctGTTAAGTGGTTTTAACATTTTAATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATTCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTAATCAAGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTaa > 2:1362574/1‑149 (MQ=255)
tCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCATTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTCTCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAg > 2:3607857/1‑150 (MQ=255)
gTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATg < 2:3491194/150‑1 (MQ=255)
gTGCTTTGAACATTTTCCTCACTGTGGCGTTGATTGTGCTTATGCCAGTTCTCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACGCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATg < 2:3354471/150‑1 (MQ=255)
tGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGc < 1:4896071/150‑1 (MQ=255)
ttttAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGcccc < 2:1835762/150‑1 (MQ=255)
tttAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTGTCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCcca > 2:261287/1‑150 (MQ=255)
aCATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCAt < 2:1991945/150‑1 (MQ=255)
aCATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGAAGCTACCGAAAGATGCAccaccaa > 2:3894368/1‑149 (MQ=255)
cATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATc < 1:2527989/150‑1 (MQ=255)
cATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATc < 1:3787813/150‑1 (MQ=255)
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catcaCTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCg > 1:5014313/1‑150 (MQ=255)
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CGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACGTTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTA < SRR19973062.5008654/150‑1 (MQ=60)
CGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTA < SRR19973062.5008683/150‑1 (MQ=60)
GGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTAT > SRR19973062.2486536/1‑150 (MQ=60)
GGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATC > SRR19973062.5249106/1‑150 (MQ=60)
GGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATC > SRR19973062.2393260/1‑150 (MQ=60)
GGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATC < SRR19973062.1790635/150‑1 (MQ=60)
CAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGA < SRR19973062.5045023/150‑1 (MQ=60)
CAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGA > SRR19973062.217096/1‑150 (MQ=60)
ACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATC < SRR19973062.5220726/150‑1 (MQ=60)
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TGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACT < SRR19973062.1800234/150‑1 (MQ=60)
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ATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATG > SRR19973062.1971581/1‑150 (MQ=60)
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TGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTG < SRR19973062.979911/150‑1 (MQ=60)
ATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAAAATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTTAGTATCTATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAT < SRR19973062.2317370/150‑1 (MQ=60)
TCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATT < SRR19973062.2141752/150‑1 (MQ=60)
TCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATT < SRR19973062.427992/150‑1 (MQ=60)
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CCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTT < SRR19973062.395356/150‑1 (MQ=60)
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GTGGCGTTGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAA > SRR19973062.3605333/1‑150 (MQ=60)
GTGGCGTTGATGGTGTTTATGCATTTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGTTTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAA < SRR19973062.1395553/150‑1 (MQ=60)
TGATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGTTGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCC < SRR19973062.2512520/150‑1 (MQ=60)
TGATTGTGGTTATACCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCC < SRR19973062.3027627/150‑1 (MQ=60)
ATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGC > SRR19973062.4206848/1‑150 (MQ=60)
ATTGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGC > SRR19973062.2319863/1‑150 (MQ=60)
TGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCAT < SRR19973062.2929019/150‑1 (MQ=60)
TGTGGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCAT < SRR19973062.2928996/150‑1 (MQ=60)
GGTTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCT < SRR19973062.4373483/150‑1 (MQ=60)
TTATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGA > SRR19973062.2876658/1‑150 (MQ=60)
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TCACCTGGGGTGGCGGCTTCTCTGGATCAATGCCTCTGTTGGCTGCAACACCGGGCAACCCGGTTGAGCATATCGCCGGGCTGATCCCGGTGGGCGATACTCTGTTCAGTGGTTTTAACATTTTCATCACTGTGGCGTTGATTGTGGTGATGCCATTTATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGA > CP009273/2318677‑2318973
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
