Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,373,441 |
A→C |
70.9% |
intergenic (‑85/‑109) |
yhcM ← / → yhcB |
putative AFG1‑like family P‑loop ATPase/DUF1043 family inner membrane‑anchored protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,373,441 | 0 | A | C | 70.9%
| 455.6
/ 162.1
| 230 | intergenic (‑85/‑109) | yhcM/yhcB | putative AFG1‑like family P‑loop ATPase/DUF1043 family inner membrane‑anchored protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/30); new base C (85/78); total (122/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.71e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TGATGGCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTC > CP009273/3373298‑3373585
|
tGATGGCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCg > 1:1681595/1‑148 (MQ=255)
aTGGCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCggg > 1:3377333/1‑148 (MQ=255)
tGGCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGa > 2:569143/1‑148 (MQ=255)
ggCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGAt < 1:3116121/148‑1 (MQ=255)
gCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGAtt > 1:951776/1‑148 (MQ=255)
gCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGAtt > 1:1467667/1‑148 (MQ=255)
cTGCCATCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTc < 2:3419774/148‑1 (MQ=255)
ccTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCAc < 2:951349/148‑1 (MQ=255)
ttCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACtt < 2:125787/148‑1 (MQ=255)
ttCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACtt > 1:3206524/1‑148 (MQ=255)
aTTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtg > 2:582894/1‑148 (MQ=255)
ttAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtgt < 2:846159/148‑1 (MQ=255)
ttAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtgt > 1:1218662/1‑148 (MQ=255)
ttAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtgt > 1:3200582/1‑148 (MQ=255)
ttAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTAtgt < 2:3111504/148‑1 (MQ=255)
tAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTAtgtg > 1:1116644/1‑148 (MQ=255)
aGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTAGTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGa < 1:2962301/148‑1 (MQ=255)
aGCGCCGTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGa < 2:3231281/148‑1 (MQ=255)
gcgcCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGaa > 2:1709517/1‑148 (MQ=255)
gcgcCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTAACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGaa > 2:200974/1‑148 (MQ=255)
cgcCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAAt > 2:2135228/1‑148 (MQ=255)
ccTTCAGGTATTGCGATGTTGGTGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTAAGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTa > 1:55427/1‑148 (MQ=255)
tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCTCGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACg < 1:2316487/148‑1 (MQ=255)
tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACg < 1:2525068/148‑1 (MQ=255)
tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACg < 1:2135228/148‑1 (MQ=255)
tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACg > 1:2802567/1‑148 (MQ=255)
tCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACg > 1:2802057/1‑148 (MQ=255)
aGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGt < 1:258092/148‑1 (MQ=255)
ggTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGtt > 2:2594166/1‑148 (MQ=255)
tGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGt > 1:2089204/1‑148 (MQ=255)
gTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATa < 1:2505772/148‑1 (MQ=255)
tgggggTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTTCGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATaa < 1:2809349/146‑1 (MQ=255)
tGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAAt < 2:3077092/148‑1 (MQ=255)
ggggTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATc < 2:161654/148‑1 (MQ=255)
gggTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCa < 1:2033046/148‑1 (MQ=255)
gggTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCa > 2:2447342/1‑148 (MQ=255)
gggTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCa > 2:2475976/1‑148 (MQ=255)
ggTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTAGTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAg < 2:1689417/148‑1 (MQ=255)
tAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGcc > 1:2254526/1‑148 (MQ=255)
aCGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGc > 2:2046557/1‑148 (MQ=255)
aCGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGc > 1:3064253/1‑148 (MQ=255)
aCGCTTTGCATGATCGTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGc < 2:2356487/148‑1 (MQ=255)
cGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCa < 1:978773/148‑1 (MQ=255)
cATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATgg > 2:669563/1‑148 (MQ=255)
tGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAg < 2:592203/148‑1 (MQ=255)
tCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCt > 2:242483/1‑148 (MQ=255)
tATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGaa > 1:564011/1‑148 (MQ=255)
ttGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGc > 1:318208/1‑148 (MQ=255)
ttGTTATTCCGTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGAGTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGc < 2:3200227/148‑1 (MQ=255)
ttGTTAGTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGc < 2:395754/148‑1 (MQ=255)
tGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGcc > 1:1739652/1‑148 (MQ=255)
tGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGcc > 1:223715/1‑148 (MQ=255)
ttATTCCTTGAATAATCGGTGCTCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGTCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCaa > 2:3501816/1‑148 (MQ=255)
ttATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAGTCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCaa > 2:736104/1‑148 (MQ=255)
tATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAac < 2:2817537/148‑1 (MQ=255)
tATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAac < 1:1361864/148‑1 (MQ=255)
ttCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCcaccac > 2:287698/1‑148 (MQ=255)
ccTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACAccc > 1:947073/1‑148 (MQ=255)
ttGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTa < 2:3029780/148‑1 (MQ=255)
aataatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACgg > 1:652640/1‑148 (MQ=255)
taatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGaa > 2:1636245/1‑148 (MQ=255)
taatCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGaa < 2:223435/148‑1 (MQ=255)
tCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACa > 1:958416/1‑148 (MQ=255)
cGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACaa < 1:572733/148‑1 (MQ=255)
ggTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACaaa > 1:2895409/1‑148 (MQ=255)
tGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAg > 1:514438/1‑148 (MQ=255)
gcgcCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGa < 1:160245/148‑1 (MQ=255)
cgcCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGAc > 1:2703579/1‑148 (MQ=255)
cgcCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGAc < 1:1085388/148‑1 (MQ=255)
cgcCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACGTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGAc > 1:949046/1‑148 (MQ=255)
ttCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGgag < 2:528260/148‑1 (MQ=255)
ttGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGACACAAAAGACAACGGGAGAGGTTCa > 2:2806059/1‑148 (MQ=255)
tGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCAt > 2:136380/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTg > 1:737302/1‑148 (MQ=255)
aaaaaGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTgg > 2:1731261/1‑148 (MQ=255)
aGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAat < 1:1954385/148‑1 (MQ=255)
aGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAat < 1:2594163/148‑1 (MQ=255)
aGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAat < 2:937033/148‑1 (MQ=255)
aGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTAGGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAat < 2:2685322/148‑1 (MQ=255)
ggCCGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCAGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAata < 1:2447527/148‑1 (MQ=255)
ggCAGTTCTACACTACGCGATATGCCGTCGGGATTCCACTTATGTGGAATTAACTGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAata < 2:74211/148‑1 (MQ=255)
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GTTGATGGCTGCCTTCATTAAGCGCCTTCAGGTATTGCGATGTTGGGGTAACGCTTTGCATGATCTTATTGTTATTCCTTGAATAATCGGTGCGCCGTTGTTCACGGTTGACGAAAAAAAGGCCGTTCTACACTACGCGATATGCAGTCGGGATTCCACTTCTGTGGAATTAACGGTTATAGTGGCATAATCAGCCGCAGGCATGGAGCCTGAAGCCAACACCCTACGGAAACAAAAGACAACGGGAGATGTTCATGACCTGGGAATATGCGCTAATTGGGTTAGTCGTCGGCA > CP009273/3373296‑3373589
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
