Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
307,479 |
G→A |
86.8% |
intergenic (‑432/‑344) |
ecpR ← / → ykgL |
putative transcriptional regulator for the ecp operon/uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 307,479 | 0 | G | A | 86.8%
| 758.9
/ 93.6
| 269 | intergenic (‑432/‑344) | ecpR/ykgL | putative transcriptional regulator for the ecp operon/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (17/18); new base A (131/102); total (149/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TACTTGCATTTTATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGTAAGCCCCCAAGAGCCAGATTAAGTGAAGTTAAACGAA > CP009273/307333‑307627
|
cTTGCATTTTATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCaa < 1:2460052/149‑1 (MQ=255)
ttGCATTTTATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAAt < 2:1851016/149‑1 (MQ=255)
ttGCATTTTATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGATGTCATTGAAGATGATTTTCCAAt > 2:4013521/1‑149 (MQ=255)
aTTTTATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGt < 2:2378350/149‑1 (MQ=255)
ttttATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTa < 1:4372875/149‑1 (MQ=255)
ttttATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTa < 1:2352913/149‑1 (MQ=255)
ttttATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTa > 2:1205154/1‑149 (MQ=255)
ttttATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACAAATCAGTa > 1:2572374/1‑149 (MQ=255)
tttATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTaa > 2:126517/1‑149 (MQ=255)
tttATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTaa > 1:382021/1‑149 (MQ=255)
tatTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCTCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGata < 1:4569679/149‑1 (MQ=255)
atTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGatat > 2:397562/1‑149 (MQ=255)
tgTCATGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGTACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATAtttt < 2:551722/148‑1 (MQ=255)
gTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTa > 1:3450147/1‑149 (MQ=255)
gTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTa > 1:1459733/1‑149 (MQ=255)
tCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTaa < 1:2037722/149‑1 (MQ=255)
cAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGTTGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAAt < 2:254213/149‑1 (MQ=255)
cAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAAt > 1:1510823/1‑149 (MQ=255)
cAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAAt < 1:3283032/149‑1 (MQ=255)
ggAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATgg < 2:2166649/149‑1 (MQ=255)
gAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGa < 1:1792423/149‑1 (MQ=255)
gAACTGTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGa < 2:809448/149‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAGGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTa > 2:3542769/1‑149 (MQ=255)
cTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAGGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTa > 2:103512/1‑149 (MQ=255)
cTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTa > 2:2654952/1‑149 (MQ=255)
tttGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTaa > 1:3482415/1‑149 (MQ=255)
tttGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTaa < 1:1064269/149‑1 (MQ=255)
ccTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAGGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGc < 2:1432863/149‑1 (MQ=255)
gAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATTGATTAACATGCCGc > 1:1392787/1‑149 (MQ=255)
aaGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGca < 2:3575372/149‑1 (MQ=255)
gtgtTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGcaca > 1:2643891/1‑149 (MQ=255)
ttAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACaaaa > 1:1602923/1‑149 (MQ=255)
aGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATg > 1:3078369/1‑149 (MQ=255)
ggAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATgg > 2:3349426/1‑149 (MQ=255)
gAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACACAATGGt > 2:4687057/1‑149 (MQ=255)
aaTAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGtt > 2:2956643/1‑149 (MQ=255)
tAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTAc < 2:1392270/149‑1 (MQ=255)
gTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAg < 1:4591829/149‑1 (MQ=255)
catAATGCGCTTTGTGATGTAATAGTAAAAAAAAAAGTTTTAAGGGTAAGGGATATAATATAAAACTATGATTAGCTGTAATTGAAGATGATTTACAAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgt < 2:4294537/147‑1 (MQ=255)
tAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgtgt < 2:2664775/149‑1 (MQ=255)
tAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGgtgt < 1:1232222/149‑1 (MQ=255)
aaTGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGtt > 2:2133320/1‑149 (MQ=255)
aaTGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGtt > 1:3509434/1‑149 (MQ=255)
aTGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTc < 2:1792980/149‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTc < 2:3891680/149‑1 (MQ=255)
gtgtgATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCaa < 1:927080/149‑1 (MQ=255)
tgtgATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAAt > 2:4505513/1‑149 (MQ=255)
tgtgATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAAt > 1:3871205/1‑149 (MQ=255)
tgtgATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAAt > 1:3871214/1‑149 (MQ=255)
tgATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATaa > 2:3727007/1‑149 (MQ=255)
gATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAg < 2:2876903/149‑1 (MQ=255)
aTGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGt < 2:3311630/149‑1 (MQ=255)
tGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTa < 1:339479/149‑1 (MQ=255)
gACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAAt > 1:4771587/1‑149 (MQ=255)
tAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGa < 1:2408464/149‑1 (MQ=255)
tAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGa > 2:2791641/1‑149 (MQ=255)
aaaaaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAAtt < 1:635762/149‑1 (MQ=255)
aaaaaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAAtt < 1:3625456/149‑1 (MQ=255)
aaaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGaa < 2:944217/149‑1 (MQ=255)
aaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAAc > 1:4274135/1‑149 (MQ=255)
aaCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAAc < 2:2270033/149‑1 (MQ=255)
aCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACg > 2:1434782/1‑149 (MQ=255)
aCAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACg > 2:476873/1‑149 (MQ=255)
cAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACgg > 1:1643109/1‑149 (MQ=255)
ttttAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGt < 1:1178488/149‑1 (MQ=255)
tttAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTa < 1:515920/149‑1 (MQ=255)
taagggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATg < 1:1476526/149‑1 (MQ=255)
aagggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGt < 2:1158064/149‑1 (MQ=255)
aagggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGt > 2:1880090/1‑149 (MQ=255)
gggtaagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTAc > 1:307282/1‑149 (MQ=255)
taagggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTc > 1:1005598/1‑149 (MQ=255)
aagggATAGAATATAAAACTATGAAGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCa > 1:1851319/1‑149 (MQ=255)
gggATATAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATTTACGTCATc < 2:4582042/149‑1 (MQ=255)
gggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATc < 1:2230787/149‑1 (MQ=255)
ggATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCt > 1:4143048/1‑149 (MQ=255)
gATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTg < 2:1557912/149‑1 (MQ=255)
tAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGtt < 1:840952/149‑1 (MQ=255)
atatAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGt < 1:3031538/149‑1 (MQ=255)
atatAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGt < 2:836762/149‑1 (MQ=255)
tataAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGTa > 2:2776450/1‑149 (MQ=255)
tataAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGTa > 2:4087662/1‑149 (MQ=255)
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aaaCTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGTAAGcc > 1:391469/1‑149 (MQ=255)
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ACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGTAAGCCCCCAAGAGCCAGATTAAGTGAAGTTAAACGAAG < SRR19973071.3708314/150‑1 (MQ=60)
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TCTTACTTGCATTTTATATTGGTCAGGAACTTTGCCCTGAAGTGTTAGGAATAGTCTTAATGCGCTGTGTGATGGACTAGTAAAAAAACAAGTTTTAAGGGTAAGGGATAGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCGGTAAGCCCCCAAGAGCCAGATTAAGTGAAGTTAAACGAAG > CP009273/307330‑307628
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
