Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
364,561 |
G→T |
84.5% |
D18Y (GAC→TAC) |
mhpB → |
2,3‑dihydroxyphenylpropionate 1,2‑dioxygenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 364,561 | 0 | G | T | 84.5%
| 626.2
/ 134.5
| 287 | D18Y (GAC→TAC) | mhpB | 2,3‑dihydroxyphenylpropionate 1,2‑dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/16); new base T (120/122); total (149/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.51e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.80e-01 |
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
TCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTT > CP009273/364415‑364709
|
cAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCgg > 2:3634935/1‑149 (MQ=255)
gggCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAagag < 2:1789665/149‑1 (MQ=255)
ggCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAgg < 1:434990/149‑1 (MQ=255)
gCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGt > 1:2660577/1‑149 (MQ=255)
aaGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGc > 2:2240854/1‑149 (MQ=255)
aaGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGc > 1:3097016/1‑149 (MQ=255)
aGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCt < 2:4632479/149‑1 (MQ=255)
cccTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGAGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGa > 1:179512/1‑149 (MQ=255)
ccTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGAt > 2:72068/1‑149 (MQ=255)
tGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGa > 2:2730319/1‑149 (MQ=255)
aaTAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAgg > 1:4108558/1‑149 (MQ=255)
aaTAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAgg > 1:945552/1‑149 (MQ=255)
aTAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGt < 2:1453690/149‑1 (MQ=255)
tAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTc < 1:2908654/149‑1 (MQ=255)
aaCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCaa < 2:919156/149‑1 (MQ=255)
aaCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCaa > 1:30583/1‑149 (MQ=255)
cTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATg < 1:3754073/149‑1 (MQ=255)
gCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCg > 1:1185815/1‑149 (MQ=255)
tCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGa < 1:1095287/149‑1 (MQ=255)
cGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGAt < 2:3804966/149‑1 (MQ=255)
gTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTg > 1:3446415/1‑149 (MQ=255)
gatgaCGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGcc < 2:2038821/149‑1 (MQ=255)
atgaCGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCa < 1:1633809/149‑1 (MQ=255)
tgaCGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAg > 1:319169/1‑149 (MQ=255)
gaCGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAgc > 2:1847194/1‑149 (MQ=255)
cGCTGACCCGCCCTGATGCCGTCGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAgcgc < 2:3413603/149‑1 (MQ=255)
gCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGcc < 2:76754/149‑1 (MQ=255)
tGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCcg > 2:3852463/1‑149 (MQ=255)
aCCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCcgcg > 2:532258/1‑149 (MQ=255)
aTGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGc < 1:1864442/149‑1 (MQ=255)
gACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAt < 1:990252/149‑1 (MQ=255)
gACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAt < 2:3288355/149‑1 (MQ=255)
aCGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAtt < 1:2808816/149‑1 (MQ=255)
aCGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAtt < 1:2067241/149‑1 (MQ=255)
cGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATtc > 2:4171909/1‑149 (MQ=255)
gTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATtct < 1:4624044/149‑1 (MQ=255)
ttCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTcc < 2:2811264/149‑1 (MQ=255)
cTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTcccc > 1:3794097/1‑149 (MQ=255)
cTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTcccc < 2:1285213/149‑1 (MQ=255)
aaaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACt > 1:3654026/1‑149 (MQ=255)
aaaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACt > 2:2972576/1‑149 (MQ=255)
aaaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACt > 2:2897267/1‑149 (MQ=255)
aaaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACt > 2:2621533/1‑149 (MQ=255)
aaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtgg < 1:3515099/149‑1 (MQ=255)
gCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGc < 2:513923/149‑1 (MQ=255)
gCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGc < 2:138818/149‑1 (MQ=255)
cTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTg > 2:165857/1‑149 (MQ=255)
tGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGt > 1:1891551/1‑149 (MQ=255)
gATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGtt > 1:2886335/1‑149 (MQ=255)
gATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGtt > 2:4463663/1‑149 (MQ=255)
atatGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGttt < 1:4417003/149‑1 (MQ=255)
atatGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGttt < 1:43584/149‑1 (MQ=255)
tatGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTg < 1:2240854/149‑1 (MQ=255)
tcACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTgcgc < 1:2235951/148‑1 (MQ=255)
gCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTgcgc > 2:4034538/1‑149 (MQ=255)
cGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAg > 1:715340/1‑149 (MQ=255)
ttATCTTAACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTAACCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATTGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATc > 1:2566782/1‑149 (MQ=255)
tATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCa > 1:969475/1‑149 (MQ=255)
aTCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCAc > 2:3349699/1‑149 (MQ=255)
tCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACt < 2:3486503/149‑1 (MQ=255)
ttCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTAc > 2:640529/1‑149 (MQ=255)
ttCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTAc > 2:4651099/1‑149 (MQ=255)
ttCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTAc > 2:436026/1‑149 (MQ=255)
cACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACaa < 2:1714688/149‑1 (MQ=255)
cACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACaa < 2:97927/149‑1 (MQ=255)
cTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTCTGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACg > 2:1573432/1‑149 (MQ=255)
gTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGc > 1:2401019/1‑149 (MQ=255)
cTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCtt < 1:840780/149‑1 (MQ=255)
cTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCtt < 1:3184837/149‑1 (MQ=255)
cTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCtt < 1:4737443/149‑1 (MQ=255)
tttCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttt > 2:1320274/1‑149 (MQ=255)
tttCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttt > 1:4166111/1‑149 (MQ=255)
tttCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttt > 1:4541532/1‑149 (MQ=255)
ttCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCtttt > 1:2997208/1‑149 (MQ=255)
tCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttttt < 2:1904921/149‑1 (MQ=255)
tCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttttt > 1:3310384/1‑149 (MQ=255)
tCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttttt < 2:3097016/149‑1 (MQ=255)
cccACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTc < 2:2671438/149‑1 (MQ=255)
cccACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTc < 2:2394201/149‑1 (MQ=255)
cccACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTc > 2:4274913/1‑149 (MQ=255)
ccACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCt < 2:2132658/149‑1 (MQ=255)
cACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTa > 2:1732633/1‑149 (MQ=255)
cACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTa < 1:2111657/149‑1 (MQ=255)
cTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATg > 2:4434649/1‑149 (MQ=255)
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CGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAAC < SRR19973071.3221768/150‑1 (MQ=60)
GAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACT > SRR19973071.3666887/1‑150 (MQ=60)
GAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACT > SRR19973071.1349142/1‑150 (MQ=60)
AAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGT < SRR19973071.3527428/150‑1 (MQ=60)
AGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTG > SRR19973071.4510432/1‑150 (MQ=60)
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GTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGT > SRR19973071.3933512/1‑150 (MQ=60)
CTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTT > SRR19973071.3595270/1‑150 (MQ=60)
CGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTT > SRR19973071.1357744/1‑150 (MQ=60)
CGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTT > SRR19973071.3755595/1‑150 (MQ=60)
GACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTTA < SRR19973071.4262183/150‑1 (MQ=60)
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CATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTTA > CP009273/364412‑364710
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
