Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
364,561 |
G→T |
D18Y (GAC→TAC) |
mhpB → |
2,3‑dihydroxyphenylpropionate 1,2‑dioxygenase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 364,561 | 0 | G | T | 99.5%
| 596.1
/ NA
| 192 | D18Y (GAC→TAC) | mhpB | 2,3‑dihydroxyphenylpropionate 1,2‑dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (91/100); minor base A (1/0); total (92/100) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
CGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGT > CP009273/364417‑364707
|
cGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCg < 2:1554754/150‑1 (MQ=255)
gCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCgg > 1:3777070/1‑150 (MQ=255)
aaaCCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGgcg > 2:2370535/1‑150 (MQ=255)
aaCCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGgcgc > 2:1774440/1‑150 (MQ=255)
aaCCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGgcgc < 2:325896/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAaga < 1:3586513/150‑1 (MQ=255)
tGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAagag < 2:2116720/150‑1 (MQ=255)
tGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAagag < 1:3509408/150‑1 (MQ=255)
gggCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAgg > 2:3176096/1‑150 (MQ=255)
ggCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGt < 2:1363927/150‑1 (MQ=255)
gCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTg < 2:3145181/150‑1 (MQ=255)
cAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGc > 1:1648028/1‑150 (MQ=255)
aaGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCt > 2:3412937/1‑150 (MQ=255)
aaGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCt < 1:445399/150‑1 (MQ=255)
aaGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCt > 2:1655776/1‑150 (MQ=255)
aGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTc < 1:740047/150‑1 (MQ=255)
gACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCg < 1:3192140/150‑1 (MQ=255)
gACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCg < 1:888318/150‑1 (MQ=255)
gACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCg > 2:1889353/1‑150 (MQ=255)
gACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCg < 1:2073794/150‑1 (MQ=255)
aCCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTGTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGa < 2:2496292/150‑1 (MQ=255)
cccTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGAt > 1:1394588/1‑150 (MQ=255)
ccTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATg < 1:2140292/150‑1 (MQ=255)
cTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGa > 2:1821606/1‑150 (MQ=255)
tGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAg < 2:2093558/150‑1 (MQ=255)
gAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAgg < 2:2014057/150‑1 (MQ=255)
aTAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTc < 2:1543875/150‑1 (MQ=255)
aaaCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCaa < 1:47865/150‑1 (MQ=255)
aCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATg > 2:987044/1‑150 (MQ=255)
aCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATg > 2:553271/1‑150 (MQ=255)
ggCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCg > 1:1781272/1‑150 (MQ=255)
gTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCACGAAGAGGTCAATGGCGTGa > 1:862327/1‑150 (MQ=255)
tCGTTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGACGACGTTTCTGTCGAAAAGTTAGACTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGTTGGGTTATGTATACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAACGGCGTGAt < 2:2943174/150‑1 (MQ=255)
tCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGAt > 2:2352077/1‑150 (MQ=255)
cGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGAtt > 1:1742712/1‑150 (MQ=255)
gatgaCGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCa > 1:3016408/1‑150 (MQ=255)
cGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGcc > 1:3532013/1‑150 (MQ=255)
cTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCcg > 2:643965/1‑150 (MQ=255)
gACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCcgcg < 1:1555468/150‑1 (MQ=255)
cGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCCAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCg < 2:3581222/150‑1 (MQ=255)
cGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCg > 2:544152/1‑150 (MQ=255)
cGCCCTGATGCAGAAGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCg < 1:322247/150‑1 (MQ=255)
ccTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTAt > 2:852030/1‑150 (MQ=255)
ccTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTAt < 1:760939/150‑1 (MQ=255)
cTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTAtt > 2:3600311/1‑150 (MQ=255)
tGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTg > 2:1987082/1‑150 (MQ=255)
gATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGc > 1:396465/1‑150 (MQ=255)
aTGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCg > 1:795641/1‑150 (MQ=255)
ccGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCa < 2:747217/150‑1 (MQ=255)
aCGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATtc > 2:545026/1‑150 (MQ=255)
ttCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTccc < 2:734173/150‑1 (MQ=255)
ttCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTccc > 2:3357513/1‑150 (MQ=255)
ttCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTccc > 1:3347183/1‑150 (MQ=255)
gAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACt < 2:401803/150‑1 (MQ=255)
aaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtgg > 2:211993/1‑150 (MQ=255)
aaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtgg < 1:2555571/150‑1 (MQ=255)
aaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtgg > 2:63707/1‑150 (MQ=255)
ggTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtggtgg < 1:1025384/150‑1 (MQ=255)
ggTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtggtgg < 2:891315/150‑1 (MQ=255)
ggTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtggtgg < 1:1025324/150‑1 (MQ=255)
ggTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTACCCTGAACtggtgg < 1:2433590/150‑1 (MQ=255)
ggTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTACCCTGAACtggtgg < 1:39057/150‑1 (MQ=255)
aGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGc > 2:3045160/1‑150 (MQ=255)
aGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGc > 2:1912524/1‑150 (MQ=255)
aGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGc > 2:797182/1‑150 (MQ=255)
gCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCt < 2:3767341/150‑1 (MQ=255)
ccTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTg > 1:1678243/1‑150 (MQ=255)
tGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGtt > 1:1878542/1‑150 (MQ=255)
gATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGttt < 2:1457631/150‑1 (MQ=255)
tatGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTgc > 2:1674626/1‑150 (MQ=255)
atGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTgcg < 1:3357621/150‑1 (MQ=255)
atGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTgcg > 1:2834331/1‑150 (MQ=255)
aCGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAg > 1:2109892/1‑150 (MQ=255)
gCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGAt > 1:3352212/1‑150 (MQ=255)
gCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGAt < 2:775684/150‑1 (MQ=255)
gCTTATCTTCACTGTCTGTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGAt < 2:2680915/150‑1 (MQ=255)
cTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATc > 2:1634893/1‑150 (MQ=255)
tATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCAc > 1:1516491/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACt > 1:2201311/1‑150 (MQ=255)
cTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTAc < 2:1632889/150‑1 (MQ=255)
cTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTAc < 1:2667832/150‑1 (MQ=255)
tCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACaa < 2:1649280/150‑1 (MQ=255)
aCTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACg < 1:1818644/150‑1 (MQ=255)
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cTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACgg > 1:996962/1‑150 (MQ=255)
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ACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACG < SRR19973061.1823199/150‑1 (MQ=60)
CTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGG < SRR19973061.1812671/150‑1 (MQ=60)
CTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGG > SRR19973061.999506/1‑150 (MQ=60)
CTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGAGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGG > SRR19973061.1752586/1‑150 (MQ=60)
CTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGAGTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGG < SRR19973061.3434901/150‑1 (MQ=60)
CCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCT < SRR19973061.3723635/150‑1 (MQ=60)
CCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCT < SRR19973061.1826168/150‑1 (MQ=60)
TCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGAC > SRR19973061.2566908/1‑150 (MQ=60)
GCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGT > SRR19973061.2883364/1‑150 (MQ=60)
GCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGT > SRR19973061.402945/1‑150 (MQ=60)
CCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTG < SRR19973061.1465661/150‑1 (MQ=60)
TGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGTGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCAC < SRR19973061.440011/150‑1 (MQ=60)
TGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCAC < SRR19973061.440132/150‑1 (MQ=60)
GGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCG > SRR19973061.2785598/1‑150 (MQ=60)
ATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCT < SRR19973061.2277943/150‑1 (MQ=60)
ATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCT > SRR19973061.510124/1‑150 (MQ=60)
ATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCT < SRR19973061.2276832/150‑1 (MQ=60)
TGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTG < SRR19973061.546464/150‑1 (MQ=60)
TGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTG < SRR19973061.546317/150‑1 (MQ=60)
TGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTG > SRR19973061.3205227/1‑150 (MQ=60)
GTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGT < SRR19973061.2470745/150‑1 (MQ=60)
TACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTTA < SRR19973061.545584/150‑1 (MQ=60)
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ATTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGTTTA > CP009273/364413‑364710
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |