Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
816,302 |
G→T |
88.4% |
R18S (AGG→AGT) |
ybhM → |
UPF0005 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 816,302 | 0 | G | T | 88.4%
| 680.7
/ 92.1
| 277 | R18S (AGG→AGT) | ybhM | UPF0005 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (18/14); new base T (150/95); total (168/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.01e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.98e-01 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGTA > CP009273/816156‑816447
|
aTCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTaaa < 1:1488870/149‑1 (MQ=255)
ccATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACg < 1:2508690/149‑1 (MQ=255)
cATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACgg > 2:2496616/1‑149 (MQ=255)
aTAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCTCGAGGCCAGGATATTAAACGGt < 1:2192086/149‑1 (MQ=255)
aTAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTAATAGATGGTTAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATATTCAGCACGATGCCAGTATATTAAACTGt > 2:4474970/1‑149 (MQ=255)
aaTGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGtata < 2:3332736/149‑1 (MQ=255)
tGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGTACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATg > 1:1593676/1‑149 (MQ=255)
gCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATgg > 1:3426536/1‑149 (MQ=255)
gCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATgg > 1:1036910/1‑149 (MQ=255)
gCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATgg > 1:3247702/1‑149 (MQ=255)
cAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGc > 2:2572978/1‑149 (MQ=255)
cAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGc > 2:2713485/1‑149 (MQ=255)
aaaaGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCt > 2:245504/1‑149 (MQ=255)
aaGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCa < 1:1988520/149‑1 (MQ=255)
aGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCAt > 1:4216037/1‑149 (MQ=255)
gTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCAtt < 1:534042/149‑1 (MQ=255)
aTTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTAc < 2:1033952/149‑1 (MQ=255)
ttttGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTAcc > 1:1695471/1‑149 (MQ=255)
tGTATGCGTGTTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCt < 2:4238071/149‑1 (MQ=255)
aTGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTa < 1:2707957/149‑1 (MQ=255)
tGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAg > 2:3734429/1‑149 (MQ=255)
tGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAg < 2:752293/149‑1 (MQ=255)
cGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGt < 1:4474106/149‑1 (MQ=255)
gTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAgggt > 2:4667985/1‑147 (MQ=255)
gTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGtt > 1:3339841/1‑149 (MQ=255)
tGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGttt > 1:4772607/1‑149 (MQ=255)
ttttAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTtggt > 2:3908293/1‑149 (MQ=255)
tttAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTtggtg > 1:1622496/1‑149 (MQ=255)
ttAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTtggtgg > 1:1254618/1‑149 (MQ=255)
tttATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAAAGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAAcc > 1:4072123/1‑149 (MQ=255)
tATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGc > 1:69638/1‑149 (MQ=255)
ttGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAg > 1:4147333/1‑149 (MQ=255)
ttGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAg > 1:4413588/1‑149 (MQ=255)
aTGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGAc > 1:2309103/1‑149 (MQ=255)
ggTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTa > 2:544601/1‑149 (MQ=255)
tGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGc > 1:1058219/1‑149 (MQ=255)
gAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATGCTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGcc < 2:1629250/149‑1 (MQ=255)
aatattaatattTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCt > 1:101034/1‑149 (MQ=255)
tattaatattTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTgg > 1:207748/1‑149 (MQ=255)
ttaatattTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTgggg > 2:2332016/1‑149 (MQ=255)
taatattTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGa < 1:820103/149‑1 (MQ=255)
taatattTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGa < 1:644969/149‑1 (MQ=255)
atattTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGc > 2:1399932/1‑149 (MQ=255)
attTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTa > 1:3940151/1‑149 (MQ=255)
attTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTa > 1:968712/1‑149 (MQ=255)
ttttttCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTaa < 2:4054069/149‑1 (MQ=255)
ttttttCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTaa < 1:3212921/149‑1 (MQ=255)
tCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGtata < 2:2110784/149‑1 (MQ=255)
tCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGtata > 2:3598933/1‑149 (MQ=255)
cTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTatat < 2:1736430/149‑1 (MQ=255)
tAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATc > 1:2606014/1‑149 (MQ=255)
aaGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATCAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCg < 1:2769468/149‑1 (MQ=255)
aGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGa > 2:4459017/1‑149 (MQ=255)
gATAACTAAAAGAATGGAATCATACTAGCAAAACAGCAATAAATTAGAATTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGATCATTACCGCTTAAGGTTTGGTGGCAACCGAAGGACTAGCCTGGGGAGCTCAGTATATCGaaa > 2:4602485/1‑149 (MQ=255)
tAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACgg > 2:707995/1‑149 (MQ=255)
aaaaGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGc > 1:3982806/1‑149 (MQ=255)
aaaaGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGc > 1:3396159/1‑149 (MQ=255)
aaaGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATCTCGAAATTACGGCa > 1:427464/1‑149 (MQ=255)
aGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAAc > 2:368782/1‑149 (MQ=255)
gAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAAcc > 1:4127862/1‑149 (MQ=255)
aaTGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTCAGTATATCGAAATTACGGCAACCa > 2:483608/1‑149 (MQ=255)
aaTGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCa > 1:1569581/1‑149 (MQ=255)
ggAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAat < 2:3580523/149‑1 (MQ=255)
gAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAata > 1:3051591/1‑149 (MQ=255)
aTACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGAtt < 2:1188406/149‑1 (MQ=255)
aTACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGAtt < 2:4435661/149‑1 (MQ=255)
tCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTcacc > 1:2425339/1‑149 (MQ=255)
tCGCAAAAAAGCAATAAATAAGATTTTCAGCACGAGGCAAGTATATTAAACGGTAAATGGCTCATTACATCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGTGGAGCTAAGTAAATCGAAATTACTGCAACCAAATCTGATTcacc > 2:1510438/1‑149 (MQ=255)
aaaaCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCACCCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCAccacca > 2:1680613/1‑149 (MQ=255)
aaaaCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCAccacca > 1:1730167/1‑149 (MQ=255)
aaaCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCTCGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCaa > 1:2678675/1‑149 (MQ=255)
aaaCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCaa > 2:3447147/1‑149 (MQ=255)
aaCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAat > 2:870152/1‑149 (MQ=255)
aaCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAat < 2:1927132/149‑1 (MQ=255)
aCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAatg > 1:4551875/1‑149 (MQ=255)
aCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAatg > 2:2209050/1‑149 (MQ=255)
aCAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAatg > 1:4551802/1‑149 (MQ=255)
aGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAatgta < 1:320336/149‑1 (MQ=255)
aGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAatgta > 2:4386632/1‑149 (MQ=255)
aaTAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAatgtatgt < 1:2866895/149‑1 (MQ=255)
aTAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTc > 1:1347624/1‑149 (MQ=255)
tAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAAGGTATGTCg > 2:1549986/1‑149 (MQ=255)
aaTTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGcc > 1:609079/1‑149 (MQ=255)
tAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATa < 2:2976573/149‑1 (MQ=255)
gATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAgg > 1:1882043/1‑149 (MQ=255)
aTTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAggg < 2:1180485/149‑1 (MQ=255)
ttttCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCCATGTATGTCGCCATAGGGt > 2:2852866/1‑149 (MQ=255)
ttttCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGt < 1:2967405/149‑1 (MQ=255)
ttttCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGt < 2:106256/149‑1 (MQ=255)
ttttCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGt > 2:2632419/1‑149 (MQ=255)
tCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGttat < 2:1985105/149‑1 (MQ=255)
gCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGttattat > 1:2230581/1‑149 (MQ=255)
aCGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGttattatta < 1:3831086/149‑1 (MQ=255)
aCGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTATAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTATCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACTGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATCGGGttattatta > 2:3978055/1‑149 (MQ=255)
gAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACt < 1:2410157/149‑1 (MQ=255)
gAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACt < 2:1222548/149‑1 (MQ=255)
aGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACtt < 1:1009444/149‑1 (MQ=255)
gCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTtg < 2:1148292/149‑1 (MQ=255)
gCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTtg < 1:3796209/149‑1 (MQ=255)
cAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTtgta > 2:3279551/1‑149 (MQ=255)
|
TTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGTA > CP009273/816156‑816447
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGTATGTA > CP009273/816153‑816451
|
GTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGT > SRR19973071.3179768/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGT > SRR19973071.974823/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGT > SRR19973071.974819/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGT > SRR19973071.3179769/1‑150 (MQ=60)
TTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTA > SRR19973071.785963/1‑150 (MQ=60)
TCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATAT < SRR19973071.4401069/150‑1 (MQ=60)
CTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATT < SRR19973071.1042179/150‑1 (MQ=60)
ATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAAC < SRR19973071.1494270/150‑1 (MQ=60)
ATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAAC < SRR19973071.3891731/150‑1 (MQ=60)
CCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGG < SRR19973071.2517823/150‑1 (MQ=60)
ATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCTCGAGGCCAGGATATTAAACGGTA < SRR19973071.2200189/150‑1 (MQ=60)
ATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTA > SRR19973071.2541636/1‑150 (MQ=60)
AAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTTGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATA < SRR19973071.1757951/150‑1 (MQ=60)
AAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATA < SRR19973071.1757965/150‑1 (MQ=60)
AAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATA < SRR19973071.2282998/150‑1 (MQ=60)
AAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATA < SRR19973071.2654464/150‑1 (MQ=60)
ATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGTACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATG > SRR19973071.1599303/1‑150 (MQ=60)
ATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGTACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATG > SRR19973071.1599257/1‑150 (MQ=60)
ATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATG > SRR19973071.4469092/1‑150 (MQ=60)
TGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGACTATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGG > SRR19973071.626136/1‑150 (MQ=60)
TGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGG > SRR19973071.3437843/1‑150 (MQ=60)
TGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGG > SRR19973071.3438658/1‑150 (MQ=60)
TGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGG > SRR19973071.1040650/1‑150 (MQ=60)
TGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGG > SRR19973071.3259156/1‑150 (MQ=60)
AAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCAT > SRR19973071.4231031/1‑150 (MQ=60)
AAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCAT > SRR19973071.2878559/1‑150 (MQ=60)
AAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCAT < SRR19973071.1995700/150‑1 (MQ=60)
GTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTA < SRR19973071.536041/150‑1 (MQ=60)
GTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTA > SRR19973071.194941/1‑150 (MQ=60)
TATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTAC > SRR19973071.480297/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACC > SRR19973071.3980582/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACC > SRR19973071.1701736/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACC > SRR19973071.4156469/1‑150 (MQ=60)
GTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTT < SRR19973071.4092909/150‑1 (MQ=60)
GTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTT < SRR19973071.4092848/150‑1 (MQ=60)
GTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTT > SRR19973071.4302447/1‑150 (MQ=60)
TATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTA > SRR19973071.55685/1‑150 (MQ=60)
ATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAG < SRR19973071.2717523/150‑1 (MQ=60)
ATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAG < SRR19973071.2717607/150‑1 (MQ=60)
CGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTT > SRR19973071.4680405/1‑150 (MQ=60)
CGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTT > SRR19973071.3351677/1‑150 (MQ=60)
CGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTT < SRR19973071.4489973/150‑1 (MQ=60)
CGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTT > SRR19973071.558336/1‑150 (MQ=60)
GTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTT > SRR19973071.4789455/1‑150 (MQ=60)
GTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTT < SRR19973071.4263931/150‑1 (MQ=60)
TGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTG < SRR19973071.773287/150‑1 (MQ=60)
TTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTG > SRR19973071.1627942/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTG > SRR19973071.1628283/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTG > SRR19973071.1628302/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTG > SRR19973071.2040301/1‑150 (MQ=60)
TTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGG > SRR19973071.1259121/1‑150 (MQ=60)
AAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAA > SRR19973071.1018898/1‑150 (MQ=60)
AAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAA > SRR19973071.235216/1‑150 (MQ=60)
ATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAAAGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACC > SRR19973071.4086550/1‑150 (MQ=60)
TTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGC > SRR19973071.2472106/1‑150 (MQ=60)
TTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGC > SRR19973071.70013/1‑150 (MQ=60)
TATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCA > SRR19973071.797401/1‑150 (MQ=60)
ATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAG > SRR19973071.4162101/1‑150 (MQ=60)
ATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAG > SRR19973071.4162044/1‑150 (MQ=60)
ATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAG > SRR19973071.4429125/1‑150 (MQ=60)
TTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGG > SRR19973071.163425/1‑150 (MQ=60)
GATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGAC > SRR19973071.2317528/1‑150 (MQ=60)
GATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGAC > SRR19973071.1438120/1‑150 (MQ=60)
TGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTA < SRR19973071.3564443/150‑1 (MQ=60)
GTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGC > SRR19973071.1062006/1‑150 (MQ=60)
TGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCC > SRR19973071.4174520/1‑150 (MQ=60)
TGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCC < SRR19973071.2858263/150‑1 (MQ=60)
GAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCT < SRR19973071.2902202/150‑1 (MQ=60)
GAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCT > SRR19973071.101552/1‑150 (MQ=60)
AATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGACAGTATATTAAACTGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGACTG > SRR19973071.2564501/1‑150 (MQ=60)
ATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGG > SRR19973071.208589/1‑150 (MQ=60)
TTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGA < SRR19973071.4061152/150‑1 (MQ=60)
TAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAG < SRR19973071.822910/150‑1 (MQ=60)
TAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAG < SRR19973071.647328/150‑1 (MQ=60)
TAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAG < SRR19973071.3221651/150‑1 (MQ=60)
ATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCT > SRR19973071.2765879/1‑150 (MQ=60)
TATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTA > SRR19973071.972235/1‑150 (MQ=60)
TATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTA > SRR19973071.85337/1‑150 (MQ=60)
TATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTA > SRR19973071.3954004/1‑150 (MQ=60)
TTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAG < SRR19973071.532902/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAG < SRR19973071.3224183/150‑1 (MQ=60)
TTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATA < SRR19973071.1024989/150‑1 (MQ=60)
CTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATC > SRR19973071.2615436/1‑150 (MQ=60)
TAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCG < SRR19973071.1929431/150‑1 (MQ=60)
AAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATCAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGA < SRR19973071.2779226/150‑1 (MQ=60)
GGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAA > SRR19973071.668425/1‑150 (MQ=60)
GATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAAT < SRR19973071.3265911/150‑1 (MQ=60)
ATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCTATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATT < SRR19973071.2477153/150‑1 (MQ=60)
ATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTCAGTATATCGAAATT > SRR19973071.1720992/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGG > SRR19973071.3240457/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTATGTATATCGAAATTACGGC > SRR19973071.4473194/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGC > SRR19973071.3408197/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGC > SRR19973071.3996745/1‑150 (MQ=60)
AAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATCTCGAAATTACGGCA > SRR19973071.428917/1‑150 (MQ=60)
AAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCA > SRR19973071.2830526/1‑150 (MQ=60)
AGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACC > SRR19973071.4142554/1‑150 (MQ=60)
GAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCA > SRR19973071.1575141/1‑150 (MQ=60)
GAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCA > SRR19973071.1575150/1‑150 (MQ=60)
GAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCA > SRR19973071.3926125/1‑150 (MQ=60)
GAATGGAATCATAATCGCAAAACAGCAATAAATTATATTTTCAGCAAGATTCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTATGTTTGGTGTCAAAAGCAGTACTAGCATGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTAatgcaaaca > SRR19973071.450780/1‑141 (MQ=60)
AATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAA > SRR19973071.4289286/1‑150 (MQ=60)
TGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAAT < SRR19973071.1305865/150‑1 (MQ=60)
GGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATA > SRR19973071.3062426/1‑150 (MQ=60)
GGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATA > SRR19973071.3062418/1‑150 (MQ=60)
GGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATA > SRR19973071.3062275/1‑150 (MQ=60)
GGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATA > SRR19973071.642228/1‑150 (MQ=60)
ATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGA > SRR19973071.1551996/1‑150 (MQ=60)
ATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGA > SRR19973071.4692488/1‑150 (MQ=60)
TCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGAT > SRR19973071.2105500/1‑150 (MQ=60)
ATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTC < SRR19973071.2658285/150‑1 (MQ=60)
ACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCAC > SRR19973071.3090144/1‑150 (MQ=60)
ACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCAC > SRR19973071.3432591/1‑150 (MQ=60)
CTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACC > SRR19973071.2433761/1‑150 (MQ=60)
CTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACC > SRR19973071.2434108/1‑150 (MQ=60)
CAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCA > SRR19973071.1736610/1‑150 (MQ=60)
CAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCA > SRR19973071.1736287/1‑150 (MQ=60)
AAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCTCGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAA > SRR19973071.2688258/1‑150 (MQ=60)
AAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAAT > SRR19973071.453875/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATG > SRR19973071.4568071/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATG > SRR19973071.4568091/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATG > SRR19973071.4568017/1‑150 (MQ=60)
ACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGT > SRR19973071.108846/1‑150 (MQ=60)
CAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTA < SRR19973071.2767104/150‑1 (MQ=60)
AGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTAT < SRR19973071.321432/150‑1 (MQ=60)
AGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTAT < SRR19973071.1428814/150‑1 (MQ=60)
AGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTAT < SRR19973071.321534/150‑1 (MQ=60)
AGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTAT > SRR19973071.334831/1‑150 (MQ=60)
AATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTC < SRR19973071.2877106/150‑1 (MQ=60)
AATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTC > SRR19973071.2136476/1‑150 (MQ=60)
AATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTC > SRR19973071.1352581/1‑150 (MQ=60)
AAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCC > SRR19973071.611334/1‑150 (MQ=60)
AATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCA > SRR19973071.3837807/1‑150 (MQ=60)
AATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCA > SRR19973071.3836630/1‑150 (MQ=60)
AGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGG > SRR19973071.1888981/1‑150 (MQ=60)
GATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGG > SRR19973071.4032846/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGT > SRR19973071.3554618/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGT < SRR19973071.1594111/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTT < SRR19973071.2978026/150‑1 (MQ=60)
TTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTA < SRR19973071.1210457/150‑1 (MQ=60)
TCAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATT < SRR19973071.3372022/150‑1 (MQ=60)
CAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTA < SRR19973071.2312467/150‑1 (MQ=60)
CAGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTA > SRR19973071.909123/1‑150 (MQ=60)
AGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTAT > SRR19973071.2413677/1‑150 (MQ=60)
AGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTAT > SRR19973071.2238815/1‑150 (MQ=60)
AGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTAT > SRR19973071.2238599/1‑150 (MQ=60)
AGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTAT > SRR19973071.2238587/1‑150 (MQ=60)
AGCACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTAT > SRR19973071.3247012/1‑150 (MQ=60)
ACGAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTAC < SRR19973071.3844667/150‑1 (MQ=60)
GAGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTT < SRR19973071.2418853/150‑1 (MQ=60)
AGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTT < SRR19973071.1013109/150‑1 (MQ=60)
AGGCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTT < SRR19973071.1013191/150‑1 (MQ=60)
GCCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGT < SRR19973071.3809698/150‑1 (MQ=60)
CCAGTATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGTA > SRR19973071.1043510/1‑150 (MQ=60)
TATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGTATGTA < SRR19973071.903992/150‑1 (MQ=60)
TATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGTATGTA < SRR19973071.904091/150‑1 (MQ=60)
|
GTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGGTGGCAACCGCAGGACTAGCCTGGGGAGCTAAGTATATCGAAATTACGGCAACCAAATATGATTCACCACCAATGTATGTCGCCATAGGGTTATTATTACTTTGTATGTA > CP009273/816153‑816451
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |