Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,211,576 |
G→T |
100% |
S280R (AGC→AGA) |
arpA ← |
ankyrin repeat protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,211,576 | 0 | G | T | 100.0%
| 892.9
/ NA
| 258 | S280R (AGC→AGA) | arpA | ankyrin repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (144/114); total (144/114) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
AACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTGA > CP009273/4211433‑4211721
|
aaCATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCAt < 1:2382235/149‑1 (MQ=255)
aCATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTATCTTTGCTTTCTCTCATa > 1:2849566/1‑149 (MQ=255)
aTCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAAt > 2:4703254/1‑149 (MQ=255)
tCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAAtt < 2:4785078/149‑1 (MQ=255)
cAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTc < 1:2881195/149‑1 (MQ=255)
aaTAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCt > 1:929577/1‑149 (MQ=255)
aaTAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCt > 1:2234586/1‑149 (MQ=255)
aTAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCtt > 1:4703374/1‑149 (MQ=255)
gCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTAtt < 1:1633078/149‑1 (MQ=255)
gCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTAtt > 1:1783338/1‑149 (MQ=255)
cTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTAttt < 1:1939470/149‑1 (MQ=255)
cTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTAttt < 1:3183011/149‑1 (MQ=255)
tGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTAtttt < 1:2968417/149‑1 (MQ=255)
tCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATc < 2:86777/149‑1 (MQ=255)
ttCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgtt < 1:3980969/149‑1 (MQ=255)
tCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgtta < 1:4236170/149‑1 (MQ=255)
tCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgtta < 2:214374/149‑1 (MQ=255)
ggAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgttagt < 2:1299783/149‑1 (MQ=255)
gAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgttagtt < 1:2923192/149‑1 (MQ=255)
gAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgttagtt < 1:3763805/149‑1 (MQ=255)
gAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgttagtt < 2:3488600/149‑1 (MQ=255)
aGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTAc > 2:3109492/1‑149 (MQ=255)
tGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACAt > 2:3818553/1‑149 (MQ=255)
tGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACAt < 1:591244/149‑1 (MQ=255)
tcTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACAATTTCAGGAGGATATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACAtt < 1:3666453/148‑1 (MQ=255)
gCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCTTTATTTACAtt > 2:4505990/1‑149 (MQ=255)
gCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACAtt < 2:1111823/149‑1 (MQ=255)
gCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACAtt > 2:3880524/1‑149 (MQ=255)
cTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATAATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTa < 2:612749/149‑1 (MQ=255)
tGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAg < 2:2159756/149‑1 (MQ=255)
ggAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAgg < 2:4286655/149‑1 (MQ=255)
ggAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAgg < 2:3925508/149‑1 (MQ=255)
gAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGa < 1:1436478/149‑1 (MQ=255)
attattGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATc > 1:2161536/1‑149 (MQ=255)
tattGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCAt < 1:1961117/149‑1 (MQ=255)
attGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATa < 2:3352018/149‑1 (MQ=255)
ttGCGACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATaa > 1:207865/1‑149 (MQ=255)
ttGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATaa > 2:1748865/1‑149 (MQ=255)
gaaaCAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAAc < 1:4638128/147‑1 (MQ=255)
aaCAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCg > 2:1133250/1‑149 (MQ=255)
aGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGaaa > 1:684133/1‑149 (MQ=255)
aGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGaaa > 2:2575647/1‑149 (MQ=255)
aGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGaaa > 2:4577943/1‑149 (MQ=255)
gattgattAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAAc < 1:4073422/149‑1 (MQ=255)
attgattAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCTTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAAcc > 2:3613601/1‑149 (MQ=255)
attgattAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAAcc > 2:4171214/1‑149 (MQ=255)
ttAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTa > 1:4338264/1‑149 (MQ=255)
aataaCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAAt < 2:2251377/149‑1 (MQ=255)
ataaCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTATCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATg < 2:4550355/149‑1 (MQ=255)
aCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGt < 2:4038181/149‑1 (MQ=255)
aCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAAACACGTAATGGGt > 1:4543802/1‑149 (MQ=255)
cATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTa > 2:4488889/1‑149 (MQ=255)
aTGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTAc > 1:566086/1‑149 (MQ=255)
cATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCt > 1:1109906/1‑149 (MQ=255)
aTTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCtt < 2:3602040/149‑1 (MQ=255)
tttGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTc > 2:3170016/1‑149 (MQ=255)
ttGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCa < 1:3103851/149‑1 (MQ=255)
aCCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGtt < 2:571874/149‑1 (MQ=255)
tttCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTgtgt > 2:1471761/1‑149 (MQ=255)
cAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCt > 2:4099867/1‑149 (MQ=255)
aggaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCtt > 1:838310/1‑149 (MQ=255)
ggaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCttt > 1:2824292/1‑149 (MQ=255)
gaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTa < 2:1474560/149‑1 (MQ=255)
gaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTa < 2:244968/149‑1 (MQ=255)
aggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTAt > 1:1911731/1‑149 (MQ=255)
aggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGGTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTAt > 2:1885161/1‑149 (MQ=255)
ataATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTa > 1:2586916/1‑149 (MQ=255)
ataATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTa > 2:1983088/1‑149 (MQ=255)
taATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAg > 1:1700952/1‑149 (MQ=255)
aaTCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGc > 1:3532619/1‑149 (MQ=255)
tCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCg > 1:1123312/1‑149 (MQ=255)
tACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGa > 1:3031464/1‑149 (MQ=255)
cATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGAcc < 1:4747638/149‑1 (MQ=255)
aTAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCaa > 1:4540780/1‑149 (MQ=255)
aTCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCAt < 2:2700267/149‑1 (MQ=255)
tCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAAAGTGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATg > 1:3869905/1‑149 (MQ=255)
ccATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATgg < 1:3138980/149‑1 (MQ=255)
tCAGAGACTAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTCTCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCACAGCATGGTTa < 2:4202903/149‑1 (MQ=255)
cAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTAt > 1:466931/1‑149 (MQ=255)
cAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTAt > 1:2294588/1‑149 (MQ=255)
agagAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATc > 2:281646/1‑149 (MQ=255)
aTAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATccacca > 2:1565417/1‑149 (MQ=255)
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tAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAg > 1:300950/1‑149 (MQ=255)
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TCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCT > SRR19973071.1113815/1‑150 (MQ=60)
CATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTT < SRR19973071.2096593/150‑1 (MQ=60)
CATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAAACGAAACCACGTAATGGGTACATCCTT > SRR19973071.3256925/1‑150 (MQ=60)
ATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTC > SRR19973071.3990786/1‑150 (MQ=60)
TTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAG < SRR19973071.3114790/150‑1 (MQ=60)
TTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAG < SRR19973071.49206/150‑1 (MQ=60)
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TCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTAT > SRR19973071.2302986/1‑150 (MQ=60)
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CTTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTGAT > CP009273/4211428‑4211722
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
