Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F98 I0 R1
|
799 |
294.1 |
9752082 |
92.2% |
8991419 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,211,576 |
G→T |
65.3% |
S280R (AGC→AGA) |
arpA ← |
ankyrin repeat protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,211,576 | 0 | G | T | 65.3%
| 186.7
/ 224.7
| 184 | S280R (AGC→AGA) | arpA | ankyrin repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/31); new base T (57/63); total (90/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTGAT > CP009273/4211429‑4211722
|
ttttAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCt < 1:357082/150‑1 (MQ=255)
tttAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAAGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTtctctc > 2:3617081/1‑150 (MQ=255)
tAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCAt > 1:3301283/1‑150 (MQ=255)
aaCATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATa < 1:4734702/150‑1 (MQ=255)
aaCATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATa < 1:2148440/150‑1 (MQ=255)
aCATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATaa > 1:1027369/1‑150 (MQ=255)
cATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAAt > 2:1093400/1‑150 (MQ=255)
tCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTc > 2:4365197/1‑150 (MQ=255)
cAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCt < 1:2740897/150‑1 (MQ=255)
cAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCt < 1:2740438/150‑1 (MQ=255)
aaTAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCtt < 1:3948799/150‑1 (MQ=255)
aaTAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCtt < 1:241429/150‑1 (MQ=255)
aaTAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCtt < 2:4166830/150‑1 (MQ=255)
tAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTAt > 1:2187864/1‑150 (MQ=255)
tAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTAt > 1:4707388/1‑150 (MQ=255)
gCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTAttt < 2:2707598/150‑1 (MQ=255)
tGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTa > 1:4470169/1‑150 (MQ=255)
gTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAAGTCTTATTTTAt > 2:2482321/1‑150 (MQ=255)
tCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTAAATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCg < 1:1496760/150‑1 (MQ=255)
ggAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgttagtt < 2:2442802/150‑1 (MQ=255)
ggAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgttagtt > 1:1384664/1‑150 (MQ=255)
gAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCgttagtta < 2:2523907/150‑1 (MQ=255)
gCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTa < 2:1174104/150‑1 (MQ=255)
tGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAgg > 1:3036820/1‑150 (MQ=255)
gAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGAt < 2:4578918/150‑1 (MQ=255)
gAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGAt < 2:2166291/150‑1 (MQ=255)
tattGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATa > 1:390775/1‑150 (MQ=255)
gCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAAcc < 1:1598223/150‑1 (MQ=255)
gCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAAcc < 1:1212260/150‑1 (MQ=255)
aaCAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGa < 2:3033441/150‑1 (MQ=255)
aaCAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGa < 2:4496554/150‑1 (MQ=255)
aCAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGaa < 1:3147738/150‑1 (MQ=255)
gattgattAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAAcc < 2:4287224/150‑1 (MQ=255)
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attgattAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCa < 1:1715898/150‑1 (MQ=255)
attgattAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCa < 1:269676/150‑1 (MQ=255)
attgattAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCa < 2:3740566/150‑1 (MQ=255)
attAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTa > 2:1532123/1‑150 (MQ=255)
taataaCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAAt < 2:2248880/150‑1 (MQ=255)
taataaCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAAt < 2:1653253/150‑1 (MQ=255)
taataaCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAAt > 1:4378259/1‑150 (MQ=255)
taaCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATggg < 2:3516962/150‑1 (MQ=255)
aCATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTa > 1:3080993/1‑150 (MQ=255)
cATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTAc > 1:2238244/1‑150 (MQ=255)
aTCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATcc > 2:943708/1‑150 (MQ=255)
aTTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTc > 1:585045/1‑150 (MQ=255)
aTTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTc > 1:2764432/1‑150 (MQ=255)
aTTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTc > 1:334101/1‑150 (MQ=255)
tttGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCa > 2:1602213/1‑150 (MQ=255)
ttGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAg < 2:2664433/150‑1 (MQ=255)
gACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGtt > 1:3812306/1‑150 (MQ=255)
aCCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCGTCAGTtg > 2:4037464/1‑150 (MQ=255)
aTTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTgtgt > 2:4301126/1‑150 (MQ=255)
tCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCt < 1:1507820/150‑1 (MQ=255)
cAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCtt > 2:1154932/1‑150 (MQ=255)
ggaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTa < 1:455557/150‑1 (MQ=255)
ggaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTa < 1:1294531/150‑1 (MQ=255)
ggaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTa < 2:4605300/150‑1 (MQ=255)
gaggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTAt > 2:3898482/1‑150 (MQ=255)
aggCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTAtt > 2:2448547/1‑150 (MQ=255)
ataATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAg > 2:4314550/1‑150 (MQ=255)
taATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGc > 2:288472/1‑150 (MQ=255)
tCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCgg < 2:881752/150‑1 (MQ=255)
cTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGa < 1:1275816/150‑1 (MQ=255)
cTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGa < 1:1276265/150‑1 (MQ=255)
cTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGa < 1:1424791/150‑1 (MQ=255)
aCATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGAcc > 2:831009/1‑150 (MQ=255)
aTAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCaaa < 2:1046309/150‑1 (MQ=255)
tAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAg < 1:4287337/150‑1 (MQ=255)
tAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAg > 2:3465662/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCa < 2:3280919/150‑1 (MQ=255)
aaaTCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCa < 2:3261111/150‑1 (MQ=255)
aTCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATg < 2:1730289/150‑1 (MQ=255)
aTCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATg > 2:2707661/1‑150 (MQ=255)
tCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATgg > 2:310241/1‑150 (MQ=255)
tCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATgg > 1:810221/1‑150 (MQ=255)
ccATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGt > 2:3354105/1‑150 (MQ=255)
aTCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTa < 2:1802387/150‑1 (MQ=255)
aTCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTa > 2:1750322/1‑150 (MQ=255)
gagaATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTATGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTATTTATTATTATCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATaca > 1:3291442/1‑150 (MQ=255)
gaATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATccacc > 2:2136694/1‑150 (MQ=255)
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aGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTa > 2:2965924/1‑150 (MQ=255)
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TCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGG > SRR19973081.815279/1‑150 (MQ=60)
TCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGG > SRR19973081.816593/1‑150 (MQ=60)
ATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTA < SRR19973081.4371019/150‑1 (MQ=60)
GAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTATGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTATTTATTATTATCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATACA > SRR19973081.3311496/1‑150 (MQ=60)
AATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCA < SRR19973081.375419/150‑1 (MQ=60)
TAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGT < SRR19973081.4526104/150‑1 (MQ=60)
AGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTA > SRR19973081.4073615/1‑150 (MQ=60)
AGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTA > SRR19973081.1463041/1‑150 (MQ=60)
TGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAAT < SRR19973081.4448831/150‑1 (MQ=60)
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GTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATA < SRR19973081.1062368/150‑1 (MQ=60)
GTTTAATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATA < SRR19973081.3528749/150‑1 (MQ=60)
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TAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGG > SRR19973081.1474659/1‑150 (MQ=60)
ATATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCT < SRR19973081.3678142/150‑1 (MQ=60)
TATTCTCTTTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTG < SRR19973081.1087821/150‑1 (MQ=60)
TTGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACA < SRR19973081.1229017/150‑1 (MQ=60)
TGCTTTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACAC > SRR19973081.3209859/1‑150 (MQ=60)
CTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTG < SRR19973081.48791/150‑1 (MQ=60)
TTCTCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTGAT > SRR19973081.392466/1‑150 (MQ=60)
TCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTGATGCC > SRR19973081.3253164/1‑150 (MQ=60)
TCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTGATGCC > SRR19973081.806131/1‑150 (MQ=60)
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TTTTAACATCAATAGCTGTTCTTTCGGAAGTGCTGGAATTATTGCAACAGATTGATTAATAACATGATCATTTGACCATTTCAGGAGGCTATAATCTACATTCATAAAATCCATCAGAGAATAGTGTTTAATATTCTCTTTGCTTTCGCTCATAATTCTTATTTTATCGTTAGTTACATTAGGATCATAAACCGAAACCACGTAATGGGTACATCCTTCAGTTGTGTTCTTTATTCTTAGCCGGACCGTCAAAGCATGGTTATCCACCAGTAATATGGCTGCCATAACACTGATGCC > CP009273/4211429‑4211725
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
