Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
709,827 |
G→T |
43.7% |
D272Y (GAT→TAT) |
pgm → |
phosphoglucomutase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 709,827 | 0 | G | T | 43.7%
| 280.9
/ inf
| 292 | D272Y (GAT→TAT) | pgm | phosphoglucomutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (77/87); new base T (66/61); total (144/148) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
CGCGATTCAGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAA > CP009273/709679‑709972
|
gATTCAGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATaa < 2:3644706/150‑1 (MQ=255)
ttCAGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAg < 2:2264637/150‑1 (MQ=255)
tCAGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGa > 1:1829615/1‑150 (MQ=255)
cAGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGAc < 1:3988054/150‑1 (MQ=255)
cAGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGAc < 1:3837632/150‑1 (MQ=255)
aGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACg > 1:127933/1‑150 (MQ=255)
gAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACgg > 2:242621/1‑150 (MQ=255)
aaaGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGgc < 2:1570690/150‑1 (MQ=255)
gCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGcgcg < 1:2777912/150‑1 (MQ=255)
gCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGcgcg < 1:3048282/150‑1 (MQ=255)
gggCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGAt > 1:4553345/1‑150 (MQ=255)
gggCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGAt < 1:3090641/150‑1 (MQ=255)
gggCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGAt < 2:4013703/150‑1 (MQ=255)
cTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGt > 2:2993695/1‑150 (MQ=255)
gACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTAt > 2:3752296/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATgg < 2:3546520/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGAc < 1:3155718/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGc > 2:2675472/1‑150 (MQ=255)
tGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGctcctc < 1:1546599/150‑1 (MQ=255)
tGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGctcctc < 2:3809082/150‑1 (MQ=255)
aTCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCg < 2:1844956/150‑1 (MQ=255)
aTCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCg > 2:1667165/1‑150 (MQ=255)
aTCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCg < 2:515229/150‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGa > 2:1358045/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGCTCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAgt < 2:2066165/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAgtg < 2:2744014/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAgtg < 2:4166690/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAgtg < 1:3299455/150‑1 (MQ=255)
gggCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGc < 2:2448023/150‑1 (MQ=255)
gggCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGc < 2:1986265/150‑1 (MQ=255)
ggTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATg > 2:954859/1‑150 (MQ=255)
ggTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTAACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATg > 1:3197500/1‑150 (MQ=255)
gTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATgg < 1:74429/150‑1 (MQ=255)
tCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTAGCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAATGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGCTGGCg > 2:3292088/1‑150 (MQ=255)
ccGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCgg > 2:3095498/1‑150 (MQ=255)
ggTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGc > 1:3514544/1‑150 (MQ=255)
cGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCctgct < 1:2485691/150‑1 (MQ=255)
gAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCctgctg > 1:362060/1‑150 (MQ=255)
gAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCctgctg < 2:1919908/150‑1 (MQ=255)
gAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCctgctg < 2:3046736/150‑1 (MQ=255)
aaTACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTgg > 1:4181228/1‑150 (MQ=255)
tACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCa < 1:703959/150‑1 (MQ=255)
tGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTg > 1:624131/1‑150 (MQ=255)
ggAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGc > 1:579920/1‑150 (MQ=255)
cGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGAt < 2:732258/150‑1 (MQ=255)
gTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATa > 2:297990/1‑150 (MQ=255)
gTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATa > 1:4198916/1‑150 (MQ=255)
tATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATaa < 1:2653354/150‑1 (MQ=255)
aTTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAg < 1:1037956/150‑1 (MQ=255)
aTTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAg > 1:239279/1‑150 (MQ=255)
ggCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTc < 2:4364503/150‑1 (MQ=255)
cGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGa < 2:3232091/150‑1 (MQ=255)
aTTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAATCCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTgg > 2:2537913/1‑150 (MQ=255)
tACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCg > 1:3360745/1‑150 (MQ=255)
caacctcaacctGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGtt < 1:2961683/150‑1 (MQ=255)
caacctcaacctGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGtt < 2:1701348/150‑1 (MQ=255)
aacctcaacctGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTAATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGttt > 1:2498094/1‑150 (MQ=255)
cctcaacctGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGc > 1:562591/1‑150 (MQ=255)
ctcaacctGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCt < 1:349550/150‑1 (MQ=255)
aacctGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAAc < 1:496871/150‑1 (MQ=255)
acctGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACg > 2:983108/1‑150 (MQ=255)
tGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGAcc < 2:4623089/150‑1 (MQ=255)
tATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGa < 2:1529758/150‑1 (MQ=255)
tATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGa < 2:2605843/150‑1 (MQ=255)
tATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGa > 1:2028396/1‑150 (MQ=255)
aTCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGAt < 2:176438/150‑1 (MQ=255)
aTCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGAt > 1:2874524/1‑150 (MQ=255)
tCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGAtt < 1:3981525/150‑1 (MQ=255)
cGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTa > 1:4429296/1‑150 (MQ=255)
gTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTAt > 2:4572855/1‑150 (MQ=255)
ttAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATg < 1:854490/150‑1 (MQ=255)
tAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGa > 2:1734801/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTc > 2:609890/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTc > 2:1343529/1‑150 (MQ=255)
cAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCAc > 2:3759993/1‑150 (MQ=255)
cAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCAc < 2:1155301/150‑1 (MQ=255)
cAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCAc < 1:925221/150‑1 (MQ=255)
cGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTAt < 1:3860738/150‑1 (MQ=255)
cGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTAt < 2:3457465/150‑1 (MQ=255)
gATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATc < 1:1117472/150‑1 (MQ=255)
aTCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCg > 1:1610083/1‑150 (MQ=255)
aTCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCg > 2:3147147/1‑150 (MQ=255)
cAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTc > 2:796769/1‑150 (MQ=255)
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GGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGC > SRR19973073.581162/1‑150 (MQ=60)
GGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGC > SRR19973073.133760/1‑150 (MQ=60)
AGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTG > SRR19973073.1287730/1‑150 (MQ=60)
CGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGAT < SRR19973073.810355/150‑1 (MQ=60)
GTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATA > SRR19973073.4207253/1‑150 (MQ=60)
TATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAA < SRR19973073.2658794/150‑1 (MQ=60)
ATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAG < SRR19973073.3364425/150‑1 (MQ=60)
ATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAG < SRR19973073.1040123/150‑1 (MQ=60)
ATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAG > SRR19973073.240382/1‑150 (MQ=60)
ATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAG > SRR19973073.239826/1‑150 (MQ=60)
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TACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCG < SRR19973073.2391017/150‑1 (MQ=60)
TACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCG > SRR19973073.3367523/1‑150 (MQ=60)
CAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGCTCTGGCGTT < SRR19973073.545116/150‑1 (MQ=60)
CAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTT < SRR19973073.2967716/150‑1 (MQ=60)
CAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTT > SRR19973073.2732725/1‑150 (MQ=60)
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CGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCA > SRR19973073.4344595/1‑150 (MQ=60)
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CCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAA > SRR19973073.3441309/1‑150 (MQ=60)
TTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCC > SRR19973073.2870101/1‑150 (MQ=60)
TTATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCC > SRR19973073.2232768/1‑150 (MQ=60)
TTATAAAGACGGCGCGATCCATATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCC < SRR19973073.3825066/150‑1 (MQ=60)
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CCGCGATTCAGAAAGCGGGCCTGACGCTGGGCGTTGATCCGCTGGGCGGTTCCGGTATCGAATACTGGAAGCGTATTGGCGAGTATTACAACCTCAACCTGACTATCGTTAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCC > CP009273/709678‑709975
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |