Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,441,854 |
C→A |
16.5% |
R27S (CGT→AGT) |
feaB → |
phenylacetaldehyde dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,441,854 | 0 | C | A | 16.5%
| 909.7
/ 107.6
| 289 | R27S (CGT→AGT) | feaB | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (146/95); new base A (24/24); total (170/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
AGCGAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTCGCGTCGCTGGGCC > CP009273/1441706‑1442003
|
aGCGAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGgtcg > 1:1684918/1‑150 (MQ=255)
gAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTcc > 2:4337895/1‑150 (MQ=255)
aaGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGcc > 2:4070695/1‑150 (MQ=255)
gTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGcccc < 2:1224764/150‑1 (MQ=255)
gACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGc > 1:837918/1‑150 (MQ=255)
gACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGc > 1:2655406/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGca > 1:3538604/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAAGAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGca > 1:1165949/1‑150 (MQ=255)
tttCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACaa > 2:2225749/1‑150 (MQ=255)
tttCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACaa > 1:3942092/1‑150 (MQ=255)
ttCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACaaa > 1:1001504/1‑150 (MQ=255)
ttCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACaaa > 2:3694325/1‑150 (MQ=255)
cTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGt > 2:2724260/1‑150 (MQ=255)
cTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGt > 1:4099599/1‑150 (MQ=255)
gTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGaa > 1:2548229/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGaaaa > 2:4000797/1‑150 (MQ=255)
tACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTg < 2:733607/150‑1 (MQ=255)
cacTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGc > 1:302779/1‑150 (MQ=255)
aaTCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGACCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTAGGCGATCtt > 2:656031/1‑150 (MQ=255)
aTCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATTGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCttt > 1:1415098/1‑150 (MQ=255)
tCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTg < 2:2552135/150‑1 (MQ=255)
acacTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGAt > 1:2484559/1‑150 (MQ=255)
tGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCgg > 2:4449596/1‑150 (MQ=255)
tGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCgg < 1:3156786/150‑1 (MQ=255)
gTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCa > 1:1735525/1‑150 (MQ=255)
gTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCa > 1:1838225/1‑150 (MQ=255)
gTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCa > 1:4164915/1‑150 (MQ=255)
aataatAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCg > 2:277067/1‑150 (MQ=255)
aataatAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCg > 2:622634/1‑150 (MQ=255)
taataaGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCggg > 2:3128817/1‑150 (MQ=255)
aataaGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGc > 1:3349747/1‑150 (MQ=255)
aaGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAg < 2:883597/150‑1 (MQ=255)
aGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGa < 2:2641280/150‑1 (MQ=255)
aGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGa > 2:380550/1‑150 (MQ=255)
aGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGa > 2:2092374/1‑150 (MQ=255)
aGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGa < 1:4125104/150‑1 (MQ=255)
aGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGa > 1:1220028/1‑150 (MQ=255)
ggAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGaa < 1:2777934/150‑1 (MQ=255)
aaaGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAAtt > 2:1859456/1‑150 (MQ=255)
aGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGc > 1:371349/1‑150 (MQ=255)
tgatgaCAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGt > 1:3502705/1‑150 (MQ=255)
atgaCAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCt < 2:4588989/150‑1 (MQ=255)
atgaCAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCt < 2:925179/150‑1 (MQ=255)
gaCAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTAc > 2:3300906/1‑150 (MQ=255)
aCAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTAct < 1:2246533/150‑1 (MQ=255)
aagagCCGAATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGTCCCCGCACAAAGTGAAAAACTGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTActg < 1:4356868/149‑1 (MQ=255)
agagCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTActgc > 1:2990832/1‑150 (MQ=255)
agagCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTActgc > 1:3249225/1‑150 (MQ=255)
agagCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTActgc > 1:4253815/1‑150 (MQ=255)
gagCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTActgct > 2:2026548/1‑150 (MQ=255)
agCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTActgctg > 2:1082403/1‑150 (MQ=255)
agCCACATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTActgctg < 2:1455678/150‑1 (MQ=255)
ccGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGAt < 2:142118/150‑1 (MQ=255)
ccGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGAt < 1:496669/150‑1 (MQ=255)
cGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATg < 2:1678534/150‑1 (MQ=255)
cATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGcc < 1:1975398/150‑1 (MQ=255)
aTGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCa < 1:319172/150‑1 (MQ=255)
aTGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCa > 1:2026948/1‑150 (MQ=255)
gTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAAc < 2:1257813/150‑1 (MQ=255)
tAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACg > 1:455917/1‑150 (MQ=255)
cAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAg > 2:2871531/1‑150 (MQ=255)
cAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAg < 1:3917551/150‑1 (MQ=255)
aGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGc > 1:3686305/1‑150 (MQ=255)
gTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCg < 1:3666524/150‑1 (MQ=255)
ttAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGAt < 2:4312003/150‑1 (MQ=255)
ttAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGAt > 2:703259/1‑150 (MQ=255)
tAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATg > 2:4169902/1‑150 (MQ=255)
aaGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGt > 2:2597012/1‑150 (MQ=255)
ccAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGa > 1:3458416/1‑150 (MQ=255)
ggTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATaa < 2:2126732/150‑1 (MQ=255)
tCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACg < 2:377066/150‑1 (MQ=255)
tCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACg < 1:1977248/150‑1 (MQ=255)
cAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCa > 2:49824/1‑150 (MQ=255)
aaCAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAg < 1:3426520/150‑1 (MQ=255)
aCAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGt < 1:1637423/150‑1 (MQ=255)
aGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCa > 2:3324284/1‑150 (MQ=255)
gTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCAt > 2:2475401/1‑150 (MQ=255)
gTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCAt > 2:2325140/1‑150 (MQ=255)
ttCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGt > 1:3808540/1‑150 (MQ=255)
ttCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGt < 2:2161960/150‑1 (MQ=255)
tcGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTg > 2:3195329/1‑150 (MQ=255)
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aTCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCt > 1:748867/1‑150 (MQ=255)
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aaCACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCggg < 2:715855/150‑1 (MQ=255)
tttATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGtct < 1:4014389/150‑1 (MQ=255)
tataTTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTcg < 1:4439203/150‑1 (MQ=255)
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tatTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTcgcg > 1:2320697/1‑150 (MQ=255)
atTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTCGCGt < 2:391080/150‑1 (MQ=255)
tGATGGTAGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTCGCGTCg < 2:1096862/150‑1 (MQ=255)
gtcgtcCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTCGCGTCGCTggg > 2:3231618/1‑150 (MQ=255)
cgtcCTGGCCACGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTCGCGTCGCTGGGcc < 1:3122771/150‑1 (MQ=255)
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AGCGAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTCGCGTCGCTGGGCC > CP009273/1441706‑1442003
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
