Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F159 I0 R1
|
879 |
305.9 |
9588012 |
96.6% |
9262019 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
832,445 |
G→T |
92.1% |
P213P (CCG→CCT) |
ybiC → |
putative dehydrogenase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 832,445 | 0 | G | T | 92.1%
| 1077.8
/ 77.7
| 354 | P213P (CCG→CCT) | ybiC | putative dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/16); new base T (141/185); total (153/201) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
CCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAAC > CP009273/832296‑832594
|
gTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATATGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCAAAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTAGCCTGATTGACGTTAACGGCGAGCctac > 1:1000071/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGAcc > 1:1274224/1‑150 (MQ=255)
tgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCaa > 1:928203/1‑150 (MQ=255)
gtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAAt > 1:379592/1‑150 (MQ=255)
ggTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATcc < 1:166479/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATcc < 1:3187925/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATcc < 1:509621/150‑1 (MQ=255)
ttCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCcggcg > 1:1921010/1‑150 (MQ=255)
tCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcggcgg > 1:2931762/1‑150 (MQ=255)
tCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAAt < 2:2206755/150‑1 (MQ=255)
tCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAAt < 1:3666727/150‑1 (MQ=255)
tCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAAt < 1:1838267/150‑1 (MQ=255)
cGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATg < 2:2730222/150‑1 (MQ=255)
gTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGc < 1:3912914/150‑1 (MQ=255)
aGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGa > 1:75561/1‑150 (MQ=255)
aGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGa < 2:2581382/150‑1 (MQ=255)
gATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAg > 2:482221/1‑150 (MQ=255)
gATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAg < 1:2377351/150‑1 (MQ=255)
aTAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGt < 1:296754/150‑1 (MQ=255)
tttCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCTTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGcc > 1:107040/1‑150 (MQ=255)
tttCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGcc > 1:131411/1‑150 (MQ=255)
ttCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCg > 2:811325/1‑150 (MQ=255)
ttCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCg > 1:2098940/1‑150 (MQ=255)
cccGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGtt < 1:2182659/150‑1 (MQ=255)
cccGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGtt < 1:810880/150‑1 (MQ=255)
gCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTggg < 1:18941/150‑1 (MQ=255)
gCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCt > 1:3493568/1‑150 (MQ=255)
tGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGtt < 1:4131015/150‑1 (MQ=255)
gATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTg < 2:3617521/150‑1 (MQ=255)
gATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTg < 2:3935148/150‑1 (MQ=255)
tACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGAcc < 2:4084257/150‑1 (MQ=255)
aCGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCt < 2:3535302/150‑1 (MQ=255)
gCCCCCAGCGCCATTGCATTTGGCACCACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTGAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCttt < 2:3190775/150‑1 (MQ=255)
gCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCttt > 1:3883170/1‑150 (MQ=255)
gCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCttt < 2:1749957/150‑1 (MQ=255)
gCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCttt > 2:2173311/1‑150 (MQ=255)
gCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCttt > 2:3035746/1‑150 (MQ=255)
ccaccaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTg < 2:1126331/150‑1 (MQ=255)
caccaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGc < 2:2860745/150‑1 (MQ=255)
accaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGcc > 1:552958/1‑150 (MQ=255)
accaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGcc > 1:3291641/1‑150 (MQ=255)
caGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGa < 1:3110374/150‑1 (MQ=255)
gcCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACAt < 2:1153201/150‑1 (MQ=255)
cATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATaa > 1:2849188/1‑150 (MQ=255)
gggCATGTGGCAAACCCCGCGTCGCCTGGCCTAAACGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAg < 2:4628988/148‑1 (MQ=255)
gCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGc > 2:163793/1‑150 (MQ=255)
cATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCt < 1:257372/150‑1 (MQ=255)
aTTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTa < 1:4523552/150‑1 (MQ=255)
aTTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTa < 2:1874919/150‑1 (MQ=255)
tttGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTAc < 2:3317740/150‑1 (MQ=255)
gCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGccc < 2:628902/150‑1 (MQ=255)
gCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGccc > 1:1769287/1‑150 (MQ=255)
cAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCt < 2:4389076/150‑1 (MQ=255)
aaaaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCtt > 2:2098959/1‑150 (MQ=255)
aaaaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCtt < 2:1461567/150‑1 (MQ=255)
aaaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTg > 2:4007491/1‑150 (MQ=255)
aaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGc < 2:2442988/150‑1 (MQ=255)
aCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCa < 2:2983449/150‑1 (MQ=255)
aCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCa < 1:2330179/150‑1 (MQ=255)
aCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCa > 2:1365232/1‑150 (MQ=255)
aCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCa < 2:2282332/150‑1 (MQ=255)
cgcgTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCg > 1:4717103/1‑150 (MQ=255)
cgTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAt > 1:4552856/1‑150 (MQ=255)
gTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAtg > 1:3552112/1‑150 (MQ=255)
cGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAggtg > 2:892205/1‑150 (MQ=255)
ccTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAtgtgtg > 1:4412014/1‑150 (MQ=255)
ccTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAtgtgtg > 2:1988300/1‑150 (MQ=255)
cTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGa > 1:3921079/1‑150 (MQ=255)
gCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAt < 1:1133839/150‑1 (MQ=255)
cATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGCTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAtt < 2:665262/150‑1 (MQ=255)
tAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCt < 2:155274/150‑1 (MQ=255)
tAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCt > 2:170418/1‑150 (MQ=255)
aaaGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCtt > 2:751868/1‑150 (MQ=255)
aaGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTg > 1:2039778/1‑150 (MQ=255)
aGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTgg > 1:1352508/1‑150 (MQ=255)
ccccGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGgc < 1:2759233/150‑1 (MQ=255)
cGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCt > 2:4230268/1‑150 (MQ=255)
gccgccAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTc < 1:1506215/150‑1 (MQ=255)
gccAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCcgg < 2:906890/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCcggcg < 1:2250495/150‑1 (MQ=255)
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CCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACACTCGTCGCCTGGCAAAAAGGCGTCCCCGTGCCTCAAGGTTGCCTGAATGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGTAGGTAATGCAGGAGTCtactttg > SRR19973078.3066600/1‑143 (MQ=60)
GCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGG < SRR19973078.19187/150‑1 (MQ=60)
CTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGT > SRR19973078.4605034/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTC < SRR19973078.1048165/150‑1 (MQ=60)
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CCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAAC > CP009273/832296‑832594
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |