Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
832,445 |
G→T |
94.8% |
P213P (CCG→CCT) |
ybiC → |
putative dehydrogenase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 832,445 | 0 | G | T | 94.8%
| 844.7
/ 35.4
| 267 | P213P (CCG→CCT) | ybiC | putative dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/10); new base T (118/135); total (122/145) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.71e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACA > CP009273/832298‑832591
|
gTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctac < 1:2479440/150‑1 (MQ=255)
gTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctac > 2:3601391/1‑150 (MQ=255)
ttCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctacg > 1:2750792/1‑150 (MQ=255)
tCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctacga > 1:166397/1‑150 (MQ=255)
tCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctacga > 1:1775189/1‑150 (MQ=255)
tCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCctacga > 1:2674301/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGAcc < 2:4206815/150‑1 (MQ=255)
tgtgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGAcc > 1:462100/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGAcc > 2:2999063/1‑150 (MQ=255)
gtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAAt < 1:2176719/150‑1 (MQ=255)
ttttCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcgg > 2:4477370/1‑150 (MQ=255)
tttCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcggc > 1:1096462/1‑150 (MQ=255)
ttCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcggcg < 1:3590811/150‑1 (MQ=255)
ttCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcggcg > 2:1519005/1‑150 (MQ=255)
ttCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCcggcg > 2:1606757/1‑150 (MQ=255)
cccTCGTAAAGATAATTGCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGt < 1:449529/150‑1 (MQ=255)
ccTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTa > 2:2626519/1‑150 (MQ=255)
ctagTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTaa > 2:1839015/4‑150 (MQ=255)
agTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATg < 2:3177045/149‑1 (MQ=255)
gTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGc > 1:1467928/1‑150 (MQ=255)
tAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCa < 2:3344264/150‑1 (MQ=255)
aaGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAgg < 2:1697107/150‑1 (MQ=255)
aGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGa < 2:1115137/150‑1 (MQ=255)
gATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAg < 2:591553/150‑1 (MQ=255)
gATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAg < 2:2932203/150‑1 (MQ=255)
aTAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGt < 2:3093594/150‑1 (MQ=255)
aTAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGt > 1:581401/1‑150 (MQ=255)
aTAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGt < 2:505038/150‑1 (MQ=255)
tAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTc > 2:1919827/1‑150 (MQ=255)
tAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTc > 1:4034252/1‑150 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCg < 1:2443485/150‑1 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCg > 1:1374404/1‑150 (MQ=255)
tttCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGcc > 1:3141787/1‑150 (MQ=255)
ttCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCg < 1:78337/150‑1 (MQ=255)
cccGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGtt < 1:129300/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCTGTAATGCAGGAGTCGCCGTTg < 1:2062592/150‑1 (MQ=255)
gCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTggg > 2:2128374/1‑150 (MQ=255)
tGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGtt < 2:4075737/150‑1 (MQ=255)
gTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTc < 1:141828/150‑1 (MQ=255)
tGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGc < 1:4613810/150‑1 (MQ=255)
gCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCt < 2:2677808/150‑1 (MQ=255)
ttGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGt > 1:4288758/1‑150 (MQ=255)
tGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGtt > 1:3541778/1‑150 (MQ=255)
gATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTg < 2:3190745/150‑1 (MQ=255)
tACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGAcc > 2:3956174/1‑150 (MQ=255)
tACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGGTCGCTGTTGAcc > 2:210975/1‑150 (MQ=255)
cGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCtt < 1:3759849/150‑1 (MQ=255)
cGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCtt > 1:2913199/1‑150 (MQ=255)
cccgcgcCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCg > 2:2240459/4‑150 (MQ=255)
caGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGa > 1:1042103/1‑150 (MQ=255)
cgcCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACa < 2:4431484/150‑1 (MQ=255)
gcCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACAt < 1:2690524/150‑1 (MQ=255)
ccATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATa > 1:3438640/1‑150 (MQ=255)
ccATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATa < 1:4179879/150‑1 (MQ=255)
cATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCt < 2:3250020/150‑1 (MQ=255)
tttGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTAc < 2:3338075/150‑1 (MQ=255)
ttGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACg < 1:3017493/150‑1 (MQ=255)
aaaaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCAGTGCCGCCAGGTTGCCTGAGTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGGAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACCTAAAGGCTACGCCCtt > 1:540350/1‑150 (MQ=255)
aaaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTg < 1:3686849/150‑1 (MQ=255)
aaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGc > 1:1559376/1‑150 (MQ=255)
cgcgTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCg > 1:3363133/1‑150 (MQ=255)
cgcgTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCg < 1:1922416/150‑1 (MQ=255)
cgTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAt < 1:4402094/150‑1 (MQ=255)
cgTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGAAGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAt > 1:850469/1‑150 (MQ=255)
cTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGa > 2:3771550/1‑150 (MQ=255)
tGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGaa > 2:1967394/1‑150 (MQ=255)
ggCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGaaa > 1:4120403/1‑150 (MQ=255)
ggCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGaaa < 2:2817716/150‑1 (MQ=255)
gCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAt < 1:4027879/150‑1 (MQ=255)
gCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAt < 1:2870680/150‑1 (MQ=255)
gCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAt > 2:1286007/1‑150 (MQ=255)
cATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAtt > 2:1221421/1‑150 (MQ=255)
cATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAtt > 2:2713578/1‑150 (MQ=255)
cATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCCCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAAtt < 1:4158909/150‑1 (MQ=255)
aTAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTc > 1:3470923/1‑150 (MQ=255)
aaaGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCtt < 2:2389092/150‑1 (MQ=255)
aaaGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCtt > 1:3286265/1‑150 (MQ=255)
aGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTgg > 1:1246426/1‑150 (MQ=255)
gCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCATGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATTTGTGAAATTCTTGGCg < 2:3972388/150‑1 (MQ=255)
gCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCg < 2:3481153/150‑1 (MQ=255)
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CTACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTATGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAA > SRR19973073.2221397/1‑150 (MQ=60)
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TACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAAC < SRR19973073.1022472/150‑1 (MQ=60)
TACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAAC < SRR19973073.1022064/150‑1 (MQ=60)
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CCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAAC > CP009273/832296‑832594
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |