Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
753,549 |
G→T |
100% |
Q135H (CAG→CAT) |
sdhB → |
succinate dehydrogenase, FeS subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 753,549 | 0 | G | T | 99.5%
| 696.3
/ ‑4.3
| 217 | Q135H (CAG→CAT) | sdhB | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (104/112); total (104/113) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
AGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGAT > CP009273/753404‑753692
|
agaagaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACatat > 1:2372009/1‑148 (MQ=255)
agaagaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACatat > 1:962434/1‑148 (MQ=255)
gaagaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATg < 1:3355169/148‑1 (MQ=255)
ttGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCaga > 1:1013335/1‑148 (MQ=255)
ttGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCaga > 2:794087/1‑148 (MQ=255)
tgtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCagag < 2:2628528/148‑1 (MQ=255)
tgtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCagag > 1:1872501/1‑148 (MQ=255)
gtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGagc < 2:1249178/148‑1 (MQ=255)
gATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGagcag < 2:1872061/148‑1 (MQ=255)
cccGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGaa > 2:3783803/1‑148 (MQ=255)
ccAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAACTTAAGCCTGACCGGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCAGTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCg < 1:879205/148‑1 (MQ=255)
ccAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCg < 1:1295582/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGa < 1:2936116/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGa < 2:2131522/148‑1 (MQ=255)
aGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGTGCAGCGCGAAAAAGTCgtg > 1:2319516/1‑146 (MQ=255)
aGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGAc < 1:2963347/148‑1 (MQ=255)
ggTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACg > 2:1168967/1‑148 (MQ=255)
tttACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACggg < 1:3519951/148‑1 (MQ=255)
tttACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACggg > 1:199014/1‑148 (MQ=255)
aCCGGTGATCCGCTATTTGGTGTTATACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGATAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTg < 1:50768/148‑1 (MQ=255)
ccGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGt < 2:158070/148‑1 (MQ=255)
tGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGa < 1:3737009/148‑1 (MQ=255)
tGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGa > 1:3811608/1‑148 (MQ=255)
gATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGaa < 1:3139002/148‑1 (MQ=255)
cgcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTa < 1:3058582/148‑1 (MQ=255)
cgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTAtt < 1:2527005/148‑1 (MQ=255)
aTTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATtct < 1:206758/148‑1 (MQ=255)
aTTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATtct < 1:2143093/148‑1 (MQ=255)
aTTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATtct > 1:1332229/1‑148 (MQ=255)
tggtggTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTg < 1:2462427/148‑1 (MQ=255)
tggtAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTgcgc < 2:2842454/148‑1 (MQ=255)
ggtAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCa < 2:961969/148‑1 (MQ=255)
gtAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCAt > 2:249874/1‑148 (MQ=255)
tAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCAtg > 1:2883027/1‑148 (MQ=255)
tAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCAtg < 2:2345959/148‑1 (MQ=255)
tAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCAtg < 2:208836/148‑1 (MQ=255)
aGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCAtgt < 2:3515516/148‑1 (MQ=255)
aTGGGACATGTCTTGGCGCAATCTGACAAAATTAAGCCTTAGCTTTTTATTAATGGAAAACATCCGCCAGCTCGCGAGCAATTACATATCCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATgttgtt < 1:330029/148‑1 (MQ=255)
gtgACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCTCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCa < 2:1495595/146‑1 (MQ=255)
gggACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCa < 2:2907039/148‑1 (MQ=255)
ggACTATTCTATGCTCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTTAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCaa < 1:1682152/148‑1 (MQ=255)
ggACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCaa > 1:1303779/1‑148 (MQ=255)
ggACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCaa < 1:643598/148‑1 (MQ=255)
gACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAAc > 2:2417889/1‑148 (MQ=255)
gACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAAc > 1:3621538/1‑148 (MQ=255)
ttCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCtt > 2:3545151/1‑148 (MQ=255)
ttCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCtt > 1:107661/1‑148 (MQ=255)
aTGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTcc > 1:3654687/1‑148 (MQ=255)
aTGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTcc > 1:1585242/1‑148 (MQ=255)
cgcAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTc < 2:856500/148‑1 (MQ=255)
gcAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCt < 1:1182076/148‑1 (MQ=255)
aaTATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCttt < 2:263053/148‑1 (MQ=255)
atGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCtg > 1:250510/1‑148 (MQ=255)
atGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCtg > 1:1456245/1‑148 (MQ=255)
gagaAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCtggt > 1:45945/1‑148 (MQ=255)
agaAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCtggtg > 2:1374971/1‑148 (MQ=255)
gaAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCtggtgg < 1:3780588/148‑1 (MQ=255)
gaAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCtggtgg > 2:3650560/1‑148 (MQ=255)
aaaaTTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATACGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGa > 2:669689/1‑148 (MQ=255)
aaTTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAAt > 1:2158953/1‑148 (MQ=255)
ttAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATcc < 2:3362429/148‑1 (MQ=255)
ttAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATcc < 2:1508514/148‑1 (MQ=255)
aaGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCg < 1:1488943/148‑1 (MQ=255)
ccTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATa > 1:1744859/1‑148 (MQ=255)
cTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATaa > 2:750584/1‑148 (MQ=255)
ttACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAg < 2:1450656/148‑1 (MQ=255)
ttACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAg > 2:1842626/1‑148 (MQ=255)
tACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGt > 1:2843098/1‑148 (MQ=255)
aCCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGtt > 1:2039285/1‑148 (MQ=255)
aCCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGtt > 1:109258/1‑148 (MQ=255)
cTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTa < 1:3013696/148‑1 (MQ=255)
ttGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCg > 2:3676840/1‑148 (MQ=255)
ttGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCg > 2:973700/1‑148 (MQ=255)
tGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCgg > 1:2929621/1‑148 (MQ=255)
tGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCgg > 1:1384984/1‑148 (MQ=255)
tGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCgg > 1:2929642/1‑148 (MQ=255)
gAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGc < 1:2653425/148‑1 (MQ=255)
taatGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCg > 1:1048244/1‑148 (MQ=255)
ggACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAg > 1:38146/1‑148 (MQ=255)
aCAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGc < 2:2158953/148‑1 (MQ=255)
aCAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGc > 1:288961/1‑148 (MQ=255)
aCAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGc < 1:3783803/148‑1 (MQ=255)
aaaTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATCTGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTg < 1:603455/148‑1 (MQ=255)
aaaTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTg > 2:583096/1‑148 (MQ=255)
aaaTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTg < 2:336497/148‑1 (MQ=255)
aaaTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTg > 2:2671880/1‑148 (MQ=255)
actCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGt < 1:196260/146‑1 (MQ=255)
aaTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGt > 1:3608944/1‑148 (MQ=255)
aaTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGt < 1:3545066/148‑1 (MQ=255)
aaTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGt < 2:50123/148‑1 (MQ=255)
tCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTa > 2:3226229/1‑148 (MQ=255)
ccGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAg < 2:2935117/148‑1 (MQ=255)
cAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGc < 1:1288712/148‑1 (MQ=255)
aGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCa < 2:3151951/148‑1 (MQ=255)
cTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCata < 1:2689908/148‑1 (MQ=255)
aGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGttt > 2:683068/1‑148 (MQ=255)
gCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTc < 1:3500488/148‑1 (MQ=255)
tttACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCtg < 1:363690/148‑1 (MQ=255)
tttACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCtg > 2:1081551/1‑148 (MQ=255)
tACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCtgat > 2:750654/1‑148 (MQ=255)
|
AGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGAT > CP009273/753404‑753692
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGATTGATAG > CP009273/753400‑753698
|
GGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAT > SRR19973069.338844/1‑150 (MQ=60)
CAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATAT > SRR19973069.968862/1‑150 (MQ=60)
CAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATAT > SRR19973069.2863546/1‑150 (MQ=60)
CAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATAT > SRR19973069.451024/1‑150 (MQ=60)
CAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATAT > SRR19973069.2388105/1‑150 (MQ=60)
AAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATG > SRR19973069.1477344/1‑150 (MQ=60)
AAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATG > SRR19973069.2144233/1‑150 (MQ=60)
AAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATG > SRR19973069.53166/1‑150 (MQ=60)
AAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATG > SRR19973069.2361914/1‑150 (MQ=60)
AAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATG > SRR19973069.50755/1‑150 (MQ=60)
AGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGC > SRR19973069.1678165/1‑150 (MQ=60)
GAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCC < SRR19973069.3377123/150‑1 (MQ=60)
GATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGA > SRR19973069.1020323/1‑150 (MQ=60)
ATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAG > SRR19973069.1885532/1‑150 (MQ=60)
ATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAG < SRR19973069.1062474/150‑1 (MQ=60)
CGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAC < SRR19973069.3838685/150‑1 (MQ=60)
CCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAACTTAAGCCTGACCGGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCAGTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGAC < SRR19973069.885306/150‑1 (MQ=60)
CCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGTGCAGCGCGAAAAAgtcgtg > SRR19973069.2335298/1‑144 (MQ=60)
CCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGAC < SRR19973069.1304307/150‑1 (MQ=60)
CCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGAC < SRR19973069.1304304/150‑1 (MQ=60)
CAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACG < SRR19973069.2955596/150‑1 (MQ=60)
CAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACG < SRR19973069.2955586/150‑1 (MQ=60)
AGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGG < SRR19973069.2983010/150‑1 (MQ=60)
AGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGG < SRR19973069.2983313/150‑1 (MQ=60)
AGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGG < SRR19973069.3658924/150‑1 (MQ=60)
AGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGG > SRR19973069.3810954/1‑150 (MQ=60)
GGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGG > SRR19973069.200610/1‑150 (MQ=60)
TTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCT < SRR19973069.3542690/150‑1 (MQ=60)
TTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCT > SRR19973069.2086584/1‑150 (MQ=60)
TTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCT < SRR19973069.2453157/150‑1 (MQ=60)
TTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCT < SRR19973069.2453100/150‑1 (MQ=60)
ACCGGTGATCCGCTATTTGGTGTTATACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGATAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTA < SRR19973069.51406/150‑1 (MQ=60)
GGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGA > SRR19973069.139869/1‑150 (MQ=60)
GGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGA > SRR19973069.140027/1‑150 (MQ=60)
GGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGA > SRR19973069.3836279/1‑150 (MQ=60)
TGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAAT < SRR19973069.3761367/150‑1 (MQ=60)
GATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATG > SRR19973069.2954577/1‑150 (MQ=60)
GATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATG > SRR19973069.2954574/1‑150 (MQ=60)
GATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATG < SRR19973069.3159560/150‑1 (MQ=60)
CGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATT < SRR19973069.3078817/150‑1 (MQ=60)
CGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATT < SRR19973069.3078814/150‑1 (MQ=60)
CGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCT < SRR19973069.905023/150‑1 (MQ=60)
CGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCT < SRR19973069.904656/150‑1 (MQ=60)
CGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCT < SRR19973069.2543779/150‑1 (MQ=60)
CGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCT > SRR19973069.1341407/1‑150 (MQ=60)
ATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCT < SRR19973069.2157808/150‑1 (MQ=60)
ATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCT < SRR19973069.208408/150‑1 (MQ=60)
ATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCAGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCT > SRR19973069.124995/1‑150 (MQ=60)
TTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTG < SRR19973069.2676810/150‑1 (MQ=60)
TGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCG < SRR19973069.26740/150‑1 (MQ=60)
TGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCG < SRR19973069.2478960/150‑1 (MQ=60)
GGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATG > SRR19973069.2901982/1‑150 (MQ=60)
GGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATG < SRR19973069.2860005/150‑1 (MQ=60)
CATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTC < SRR19973069.3689705/150‑1 (MQ=60)
atgggacatgtcttgGCGCAATCTGACAAAATTAAGCCTTAGCTTTTTATTAATGGAAAACATCCGCCAGCTCGCGAGCAATTACATATCCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCA < SRR19973069.332283/135‑1 (MQ=60)
TGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAA > SRR19973069.1313825/1‑150 (MQ=60)
TGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAA > SRR19973069.1312625/1‑150 (MQ=60)
GGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAAC > SRR19973069.3645204/1‑150 (MQ=60)
GGACTATTCTATGCTCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTTAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACC < SRR19973069.1693888/150‑1 (MQ=60)
GGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACC < SRR19973069.647817/150‑1 (MQ=60)
GGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACC < SRR19973069.645722/150‑1 (MQ=60)
GGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACC > SRR19973069.3175260/1‑150 (MQ=60)
CAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCT < SRR19973069.976418/150‑1 (MQ=60)
CAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCT < SRR19973069.1050086/150‑1 (MQ=60)
AATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTT > SRR19973069.3376549/1‑150 (MQ=60)
AATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTT > SRR19973069.108729/1‑150 (MQ=60)
ATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTG > SRR19973069.2537560/1‑150 (MQ=60)
TCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTC < SRR19973069.3082398/150‑1 (MQ=60)
CTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCC > SRR19973069.1595983/1‑150 (MQ=60)
CTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCC > SRR19973069.3678623/1‑150 (MQ=60)
CTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCC > SRR19973069.3678617/1‑150 (MQ=60)
CTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCC < SRR19973069.2173255/150‑1 (MQ=60)
GCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTT < SRR19973069.1190241/150‑1 (MQ=60)
GCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTT < SRR19973069.1189148/150‑1 (MQ=60)
ATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTG > SRR19973069.1565256/1‑150 (MQ=60)
ATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTG > SRR19973069.1466405/1‑150 (MQ=60)
ATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTG > SRR19973069.252351/1‑150 (MQ=60)
ATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTG > SRR19973069.251457/1‑150 (MQ=60)
ATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTG < SRR19973069.2022565/150‑1 (MQ=60)
ATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGT > SRR19973069.46532/1‑150 (MQ=60)
GAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAA < SRR19973069.3805146/150‑1 (MQ=60)
GAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAA < SRR19973069.3805132/150‑1 (MQ=60)
AAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAAT > SRR19973069.2173731/1‑150 (MQ=60)
AATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCC < SRR19973069.3545125/150‑1 (MQ=60)
TAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGA > SRR19973069.1774357/1‑150 (MQ=60)
AAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGAT < SRR19973069.1499284/150‑1 (MQ=60)
AGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATA > SRR19973069.1757108/1‑150 (MQ=60)
AGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATA < SRR19973069.3749566/150‑1 (MQ=60)
AGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATA < SRR19973069.1986307/150‑1 (MQ=60)
AGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATA < SRR19973069.1297495/150‑1 (MQ=60)
CTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGT > SRR19973069.2861846/1‑150 (MQ=60)
TTACCTTTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTT < SRR19973069.3168430/150‑1 (MQ=60)
TTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTT > SRR19973069.110336/1‑150 (MQ=60)
TTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTT < SRR19973069.2209341/150‑1 (MQ=60)
TTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTT > SRR19973069.2053447/1‑150 (MQ=60)
TTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTT < SRR19973069.1252550/150‑1 (MQ=60)
CTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGNCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATC < SRR19973069.1948018/150‑1 (MQ=60)
CTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATC < SRR19973069.3033692/150‑1 (MQ=60)
GTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGG > SRR19973069.2849879/1‑150 (MQ=60)
GTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGG > SRR19973069.2949030/1‑150 (MQ=60)
GTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGG > SRR19973069.1394645/1‑150 (MQ=60)
GTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGG > SRR19973069.2949056/1‑150 (MQ=60)
GTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGG > SRR19973069.2949038/1‑150 (MQ=60)
GTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGG > SRR19973069.2949035/1‑150 (MQ=60)
TGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCC > SRR19973069.2907753/1‑150 (MQ=60)
TGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCC < SRR19973069.1094056/150‑1 (MQ=60)
GAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCC < SRR19973069.2671203/150‑1 (MQ=60)
AATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCG > SRR19973069.1055518/1‑150 (MQ=60)
ATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAG > SRR19973069.38656/1‑150 (MQ=60)
TGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGG < SRR19973069.406241/150‑1 (MQ=60)
GGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGC > SRR19973069.290954/1‑150 (MQ=60)
ACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTT < SRR19973069.3808357/150‑1 (MQ=60)
ACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTT > SRR19973069.1782857/1‑150 (MQ=60)
AAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGT > SRR19973069.3632509/1‑150 (MQ=60)
AAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGT > SRR19973069.3632841/1‑150 (MQ=60)
AAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATCTGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTT < SRR19973069.607514/150‑1 (MQ=60)
ACTCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTA < SRR19973069.197845/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTA > SRR19973069.2056107/1‑150 (MQ=60)
AATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTA < SRR19973069.3568177/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTA < SRR19973069.3568091/150‑1 (MQ=60)
AATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTA < SRR19973069.3567850/150‑1 (MQ=60)
ATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAG > SRR19973069.1703846/1‑150 (MQ=60)
CCGCCAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCG < SRR19973069.3765087/150‑1 (MQ=60)
CAGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCAT < SRR19973069.1297327/150‑1 (MQ=60)
AGCTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATA > SRR19973069.841852/1‑150 (MQ=60)
CTCGCGAGCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATC < SRR19973069.2707929/150‑1 (MQ=60)
GCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCT < SRR19973069.3523042/150‑1 (MQ=60)
GCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCT < SRR19973069.3523033/150‑1 (MQ=60)
GCATTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCT < SRR19973069.1383942/150‑1 (MQ=60)
TTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGAT < SRR19973069.3488646/150‑1 (MQ=60)
TTTACATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGAT < SRR19973069.366317/150‑1 (MQ=60)
ATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGATTGATA > SRR19973069.3729757/1‑150 (MQ=60)
ATATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGATTGATA > SRR19973069.3729792/1‑150 (MQ=60)
TATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCTATACGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGATTGATAG < SRR19973069.674324/150‑1 (MQ=60)
TATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGATTGATAG > SRR19973069.2460823/1‑150 (MQ=60)
|
GGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTATGAATGTATTCTCTGCGCATGTTGTTCAACCTCTTGTCCGTCTTTCTGGTGGAATCCCGATAAGTTTATCGGCCCGGCAGGCTTGTTAGCGGCATATCGTTTCCTGATTGATAG > CP009273/753400‑753698
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
