Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,319,752 |
C→A |
100% |
N55K (AAC→AAA) |
atoB → |
acetyl‑CoA acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,319,752 | 0 | C | A | 99.0%
| 680.1
/ ‑1.9
| 207 | N55K (AAC→AAA) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base A (109/96); total (109/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.23e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
CAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAG > CP009273/2319608‑2319896
|
cAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAgtg > 2:1941967/1‑148 (MQ=255)
aGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAgtgt < 1:3606794/148‑1 (MQ=255)
aGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAgtgt < 1:257662/148‑1 (MQ=255)
tGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACTTTGAAGAAGTTATTATGGGTAAAGTGTTa > 2:3454487/1‑148 (MQ=255)
tGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTa < 2:2745712/148‑1 (MQ=255)
cGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACa < 2:2664103/148‑1 (MQ=255)
ggTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACaa < 1:246505/148‑1 (MQ=255)
tacgtacTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGc < 1:2364995/148‑1 (MQ=255)
tacTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCggg > 1:46894/1‑148 (MQ=255)
acTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGc < 2:2326816/148‑1 (MQ=255)
gCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTgg < 2:1539943/148‑1 (MQ=255)
gCTAGCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACCACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTCCAAGCCGGGCTgg < 2:1540046/148‑1 (MQ=255)
tATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAAACGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTgggg > 2:2866133/1‑148 (MQ=255)
aTCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:3583800/1‑148 (MQ=255)
cGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCaa > 1:2048337/1‑148 (MQ=255)
gTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCaaaa > 2:2472637/1‑148 (MQ=255)
aGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGACATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATc < 1:3635142/148‑1 (MQ=255)
tttAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCgg > 1:3372153/1‑148 (MQ=255)
tttAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCgg > 1:3471777/1‑148 (MQ=255)
cGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGt > 2:291939/1‑148 (MQ=255)
tCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAgg > 2:2101634/1‑148 (MQ=255)
tCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAgg > 2:3777967/1‑148 (MQ=255)
cTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCAc > 2:350919/1‑148 (MQ=255)
cGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTg > 2:3247233/1‑148 (MQ=255)
cTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGtt > 1:1198233/1‑148 (MQ=255)
caccaGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTaaaa < 1:2359467/148‑1 (MQ=255)
ccaGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAg > 1:1889712/1‑148 (MQ=255)
caGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGc > 1:2400008/1‑148 (MQ=255)
caGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGc < 1:655739/148‑1 (MQ=255)
aGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCg < 2:2170102/148‑1 (MQ=255)
gcgcCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCgg > 1:2391588/1‑148 (MQ=255)
cgcCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCggg < 1:2075665/148‑1 (MQ=255)
cgcCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCggg < 1:1659126/148‑1 (MQ=255)
cgcCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCggg < 2:3087287/148‑1 (MQ=255)
gcCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGc < 2:3497303/148‑1 (MQ=255)
tCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGc < 2:2158057/148‑1 (MQ=255)
tCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGc > 2:129821/1‑148 (MQ=255)
ggggCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACgg < 1:2028127/148‑1 (MQ=255)
ggggCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACgg < 2:3388160/148‑1 (MQ=255)
gggCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGgt > 1:2172815/1‑148 (MQ=255)
gggCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGgt > 2:3584281/1‑148 (MQ=255)
cGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGtgtg < 1:3087686/148‑1 (MQ=255)
cAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCgg < 1:305895/148‑1 (MQ=255)
aGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGa < 2:1446432/148‑1 (MQ=255)
aGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGa > 2:3074971/1‑148 (MQ=255)
tAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGAtt < 1:629485/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCAc < 1:383122/148‑1 (MQ=255)
ccgcaATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCaa < 2:1418110/148‑1 (MQ=255)
ccATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATaa < 2:932899/148‑1 (MQ=255)
cATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATaaa > 1:2771830/1‑148 (MQ=255)
ttGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGt < 1:1042035/148‑1 (MQ=255)
ttGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGt < 1:2262351/148‑1 (MQ=255)
ttGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGt > 2:680701/1‑148 (MQ=255)
ttGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGt < 1:1315558/148‑1 (MQ=255)
tGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTa > 2:3528977/1‑148 (MQ=255)
tGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTa > 2:1085849/1‑148 (MQ=255)
tGAACGTGCAAAAATCGATTAAAAACACGTTGATGAATTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCAGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGACACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTa > 2:2893110/1‑148 (MQ=255)
gAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAt < 1:3032578/148‑1 (MQ=255)
aaCGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAtg > 1:2334843/1‑148 (MQ=255)
aaCGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAtg < 2:3301978/148‑1 (MQ=255)
aCGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAtgt > 1:99605/1‑148 (MQ=255)
aCGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAtgt < 1:2542465/148‑1 (MQ=255)
aCGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAtgt > 1:3477342/1‑148 (MQ=255)
cGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATGATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAtgtg > 2:2249422/1‑148 (MQ=255)
tGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGt < 2:509049/148‑1 (MQ=255)
gCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGtt > 2:3680936/1‑148 (MQ=255)
gCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGtt < 2:3103165/148‑1 (MQ=255)
aaTCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGt < 1:1089276/148‑1 (MQ=255)
aaTCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGt < 1:2472637/148‑1 (MQ=255)
aTCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTc > 1:1498714/1‑148 (MQ=255)
aTCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTc < 2:1757281/148‑1 (MQ=255)
aTCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTc > 2:1025983/1‑148 (MQ=255)
aTCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTc < 2:3106504/148‑1 (MQ=255)
tCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCt > 2:2728146/1‑148 (MQ=255)
tCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCt > 2:2837446/1‑148 (MQ=255)
tCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCt > 2:3004165/1‑148 (MQ=255)
tCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCACAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTaaaa < 1:2767937/148‑1 (MQ=255)
cacaACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAg < 2:580039/148‑1 (MQ=255)
acaacaCGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAgt > 1:776558/1‑148 (MQ=255)
acaacaCGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAgt < 1:1614989/148‑1 (MQ=255)
acaacaCGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAgt < 1:2527289/148‑1 (MQ=255)
acaacaCGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAgt > 1:2691702/1‑148 (MQ=255)
caacaCGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAgtg > 1:3690127/1‑148 (MQ=255)
caacaCGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAgtg > 1:3033420/1‑148 (MQ=255)
caacaCGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAgtg > 2:2492118/1‑148 (MQ=255)
gTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGgcgc < 1:3512381/148‑1 (MQ=255)
ttGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGAATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCt > 1:2373369/1‑148 (MQ=255)
tgatgaAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCtt < 2:2065664/148‑1 (MQ=255)
tgatgaAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCtt < 1:1765517/148‑1 (MQ=255)
gatgaAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTg < 2:1584803/148‑1 (MQ=255)
atgaAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTgc > 1:140935/1‑148 (MQ=255)
gaAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTgccg < 2:2219653/148‑1 (MQ=255)
gaAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAACTATGTCGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTAgccg > 2:3651253/1‑148 (MQ=255)
aGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTgccgcc > 2:110680/1‑148 (MQ=255)
aGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTgccgcc > 1:3558873/1‑148 (MQ=255)
aGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTgccgcc > 2:1816616/1‑148 (MQ=255)
gATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAg < 2:2308073/148‑1 (MQ=255)
aTGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCa > 1:3482887/1‑148 (MQ=255)
tGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGTCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCAt < 2:2140189/148‑1 (MQ=255)
tAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTcag > 2:819677/1‑148 (MQ=255)
|
CAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAG > CP009273/2319608‑2319896
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGG > CP009273/2319606‑2319901
|
GTCAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTG > SRR19973069.942862/1‑150 (MQ=60)
GTCAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTG < SRR19973069.2352160/150‑1 (MQ=60)
CAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTT < SRR19973069.3615554/150‑1 (MQ=60)
AGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTA < SRR19973069.259526/150‑1 (MQ=60)
AGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTA < SRR19973069.3630342/150‑1 (MQ=60)
GTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTAC < SRR19973069.3636412/150‑1 (MQ=60)
GGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGC < SRR19973069.248331/150‑1 (MQ=60)
TACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCG > SRR19973069.1769660/1‑150 (MQ=60)
TACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCG < SRR19973069.3103750/150‑1 (MQ=60)
TACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCG < SRR19973069.2381056/150‑1 (MQ=60)
CGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGG > SRR19973069.47414/1‑150 (MQ=60)
CGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGG > SRR19973069.47487/1‑150 (MQ=60)
GTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGC > SRR19973069.1140958/1‑150 (MQ=60)
TGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGG > SRR19973069.2278304/1‑150 (MQ=60)
CTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGC > SRR19973069.3607172/1‑150 (MQ=60)
ATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAA > SRR19973069.2062558/1‑150 (MQ=60)
GGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAAT < SRR19973069.2068482/150‑1 (MQ=60)
AGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGACATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCG < SRR19973069.3658912/150‑1 (MQ=60)
GTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACCGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCCATTAACAACACGGTGATGTAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAACCGGGCGGGGGCAAAATCCGG > SRR19973069.2576989/1‑150 (MQ=60)
GTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGG > SRR19973069.3494228/1‑150 (MQ=60)
GTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGG > SRR19973069.3394199/1‑150 (MQ=60)
CGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTT > SRR19973069.1206471/1‑150 (MQ=60)
CACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAG > SRR19973069.1902823/1‑150 (MQ=60)
CACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAG < SRR19973069.2375496/150‑1 (MQ=60)
ACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGC > SRR19973069.2416258/1‑150 (MQ=60)
CCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCG > SRR19973069.3729914/1‑150 (MQ=60)
CAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGG < SRR19973069.660142/150‑1 (MQ=60)
CAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGG > SRR19973069.2407793/1‑150 (MQ=60)
CAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGG > SRR19973069.2407322/1‑150 (MQ=60)
CGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCT < SRR19973069.1670616/150‑1 (MQ=60)
CGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCT < SRR19973069.2090037/150‑1 (MQ=60)
CTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACG > SRR19973069.2167220/1‑150 (MQ=60)
GGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGT > SRR19973069.2187646/1‑150 (MQ=60)
GGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTG < SRR19973069.2042215/150‑1 (MQ=60)
GGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTG < SRR19973069.2318816/150‑1 (MQ=60)
CGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCG < SRR19973069.3108045/150‑1 (MQ=60)
CAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGAT < SRR19973069.307956/150‑1 (MQ=60)
AGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATT < SRR19973069.3057418/150‑1 (MQ=60)
AGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATT < SRR19973069.248846/150‑1 (MQ=60)
TAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCA < SRR19973069.633768/150‑1 (MQ=60)
TAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCA > SRR19973069.2993580/1‑150 (MQ=60)
TAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCA < SRR19973069.633651/150‑1 (MQ=60)
AATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCAC > SRR19973069.2725606/1‑150 (MQ=60)
TTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGG < SRR19973069.385924/150‑1 (MQ=60)
AAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTC > SRR19973069.10628/1‑150 (MQ=60)
GCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTTCAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAA > SRR19973069.2790229/1‑150 (MQ=60)
GCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAA > SRR19973069.2953456/1‑150 (MQ=60)
GCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAA > SRR19973069.2790297/1‑150 (MQ=60)
GCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAA > SRR19973069.2376233/1‑150 (MQ=60)
CATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGT > SRR19973069.1952903/1‑150 (MQ=60)
TTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAT < SRR19973069.1049275/150‑1 (MQ=60)
TTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAT < SRR19973069.1324573/150‑1 (MQ=60)
TTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTAT < SRR19973069.2277667/150‑1 (MQ=60)
TGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATG > SRR19973069.2557483/1‑150 (MQ=60)
TGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATG > SRR19973069.2350732/1‑150 (MQ=60)
TGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATG > SRR19973069.2351635/1‑150 (MQ=60)
TGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATG < SRR19973069.2382029/150‑1 (MQ=60)
GAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGT > SRR19973069.3500025/1‑150 (MQ=60)
GAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGT > SRR19973069.100608/1‑150 (MQ=60)
GAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGT > SRR19973069.3499816/1‑150 (MQ=60)
GAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGT > SRR19973069.3499780/1‑150 (MQ=60)
GAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGT > SRR19973069.2043884/1‑150 (MQ=60)
GAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGT < SRR19973069.3052684/150‑1 (MQ=60)
ACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGG < SRR19973069.2559287/150‑1 (MQ=60)
GTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTT > SRR19973069.1212575/1‑150 (MQ=60)
AAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGG < SRR19973069.3737260/150‑1 (MQ=60)
AAAATCGATTCACAACACGTTGATGACGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAATCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGGTCGGGT > SRR19973069.741329/1‑150 (MQ=60)
AAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGT > SRR19973069.2434562/1‑150 (MQ=60)
AAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGT < SRR19973069.3276057/150‑1 (MQ=60)
AAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTC > SRR19973069.1509102/1‑150 (MQ=60)
AAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTC > SRR19973069.1510825/1‑150 (MQ=60)
AATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCT < SRR19973069.1096886/150‑1 (MQ=60)
AATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCT < SRR19973069.2489222/150‑1 (MQ=60)
ATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTT > SRR19973069.3600803/1‑150 (MQ=60)
ATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAA > SRR19973069.1472839/1‑150 (MQ=60)
TCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGT > SRR19973069.2709739/1‑150 (MQ=60)
TCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGT > SRR19973069.782064/1‑150 (MQ=60)
TCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCACAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGT < SRR19973069.2786392/150‑1 (MQ=60)
CACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTG > SRR19973069.3053532/1‑150 (MQ=60)
CACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTG > SRR19973069.504216/1‑150 (MQ=60)
CACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTG > SRR19973069.3714260/1‑150 (MQ=60)
ACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGT < SRR19973069.2543631/150‑1 (MQ=60)
ACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGT < SRR19973069.2544065/150‑1 (MQ=60)
ACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGT < SRR19973069.1625874/150‑1 (MQ=60)
AACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGG < SRR19973069.2664929/150‑1 (MQ=60)
ACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGC < SRR19973069.3580517/150‑1 (MQ=60)
CGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCT > SRR19973069.305374/1‑150 (MQ=60)
CGTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGAATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCT > SRR19973069.2389471/1‑150 (MQ=60)
GTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTT < SRR19973069.3535021/150‑1 (MQ=60)
GTTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTT < SRR19973069.2199575/150‑1 (MQ=60)
TTGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTG < SRR19973069.2410137/150‑1 (MQ=60)
TGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGC < SRR19973069.1796514/150‑1 (MQ=60)
TGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGC > SRR19973069.142127/1‑150 (MQ=60)
TGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGC > SRR19973069.142221/1‑150 (MQ=60)
TGATGAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGC < SRR19973069.1777962/150‑1 (MQ=60)
GAAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCC > SRR19973069.3582036/1‑150 (MQ=60)
AAGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCC < SRR19973069.1664705/150‑1 (MQ=60)
AGTGATTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCA > SRR19973069.3713289/1‑150 (MQ=60)
TTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCA > SRR19973069.3505381/1‑150 (MQ=60)
TTATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCA > SRR19973069.3505375/1‑150 (MQ=60)
ATGGGTAAAGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATT > SRR19973069.3441309/1‑150 (MQ=60)
AGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGG < SRR19973069.1300946/150‑1 (MQ=60)
|
GTCAGTGCGGTACGTACTGCTATCGGTAGTTTTAACGGTTCACTCGCTTCCACCAGCGCCATCGACCTGGGGGCGACAGTAATTAAAGCCGCCATTGAACGTGCAAAAATCGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAAAATCCGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGG > CP009273/2319606‑2319901
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
