Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,024,003 |
C→A |
15.7% |
D59Y (GAT→TAT) |
hspQ ← |
heat shock protein involved in degradation of mutant DnaA; hemimethylated oriC DNA‑binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,024,003 | 0 | C | A | 15.7%
| 801.3
/ 88.1
| 278 | D59Y (GAT→TAT) | hspQ | heat shock protein involved in degradation of mutant DnaA; hemimethylated oriC DNA‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (137/97); new base A (23/21); total (160/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
CAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCGGACCTGCTG > CP009273/1023854‑1024150
|
cAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATc < 2:738116/150‑1 (MQ=255)
aGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCg > 2:3076877/1‑150 (MQ=255)
aGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCg > 2:1764204/1‑150 (MQ=255)
gggATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGTACCGGTAGGCCGTTATCGt > 1:4484469/1‑150 (MQ=255)
ggATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGtc < 2:1139869/150‑1 (MQ=255)
gATTAGTTACTCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCAACCATGGATGGCTGTTCAGGATGTACATCCTGCAAATCGCTACTTAGCTGGGCTACAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGATATCGtcc > 2:713744/1‑150 (MQ=255)
gATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGtcc > 1:4261763/1‑150 (MQ=255)
tAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGtcctcc < 1:921255/150‑1 (MQ=255)
aGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCa < 2:332993/150‑1 (MQ=255)
aCGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGAAGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCAc > 1:392198/1‑150 (MQ=255)
aCGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTg < 2:1366266/150‑1 (MQ=255)
aCGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTg < 1:3879262/150‑1 (MQ=255)
aCGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTg < 1:3591526/150‑1 (MQ=255)
ggggCCAGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCAACCATGGATGGCTGTACAGGATGTTCAACCTGCAATACGCTAATTAGCTGGGCTACAGCCAGGTAGGTATGAAACGGAAGGCCGTTATCGACCACCAACACTAAGTGATaa > 1:2963999/1‑149 (MQ=255)
gggCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGCTGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAAGTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATAcc > 2:3250712/1‑150 (MQ=255)
gggCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATAcc < 1:3053999/150‑1 (MQ=255)
gggCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATAcc > 1:3884124/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATTGCTGTTCATGATGTTCATACTTCAATTCGCTACTTATCTGGGCTTAAGCCAGGTAGGTATGAAACGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTAAGTGATAacac > 1:1409250/1‑150 (MQ=255)
tGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGa > 2:2979142/1‑150 (MQ=255)
tGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATACATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGa > 2:1903105/1‑150 (MQ=255)
tGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCAAACCAGGATGGCTGTTCAGGATGTTAATCCTGCAATTAGCTACATAGCTGGGCTTAAGCCACGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCAACACAACCTTATACCACGGa > 1:4946741/1‑150 (MQ=255)
tGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCACATCCAAGGATGGCTGTTAAGGATGTTCATACTGAAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCAACACAACGTTATACCACGGa > 1:4052670/1‑150 (MQ=255)
ggAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAg > 2:5111609/1‑150 (MQ=255)
ggAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAg < 2:440138/150‑1 (MQ=255)
aGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAgcg > 1:3105680/1‑150 (MQ=255)
gttgttTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAgcgg > 1:1043515/1‑150 (MQ=255)
ttttctgATGGTCTGCGCCAGATCATAAATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATACTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGGAGTCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGcgcg < 2:5238295/144‑1 (MQ=255)
tttGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGcgcg > 2:167947/1‑150 (MQ=255)
gCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAg > 2:3519857/1‑150 (MQ=255)
gCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAg < 2:4525384/150‑1 (MQ=255)
ggATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCt > 2:1865118/1‑150 (MQ=255)
ggATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCt > 1:4874236/1‑150 (MQ=255)
gATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTc > 2:3894819/1‑150 (MQ=255)
ggTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTc > 2:2308347/1‑150 (MQ=255)
gTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACTGAGCGGCGCGAAGCTCGTCa > 1:2727184/1‑150 (MQ=255)
tGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTc > 1:1898625/1‑150 (MQ=255)
cgcCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCAc < 2:4356829/150‑1 (MQ=255)
cAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGc > 2:3609158/1‑150 (MQ=255)
aGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGcc > 1:3655344/1‑150 (MQ=255)
gCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAGCCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCa < 1:3503453/150‑1 (MQ=255)
tCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGc > 1:2503408/1‑150 (MQ=255)
cATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCt < 1:4709833/150‑1 (MQ=255)
aTCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCtc > 1:112318/1‑150 (MQ=255)
tggatggCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAg < 1:225398/150‑1 (MQ=255)
atggCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCg > 1:1185673/1‑150 (MQ=255)
tggCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGa > 1:4313078/1‑150 (MQ=255)
gTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGtt < 2:2145834/150‑1 (MQ=255)
ttCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTc < 1:2023157/150‑1 (MQ=255)
tCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCa > 1:3072275/1‑150 (MQ=255)
ggATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCagag < 2:2241720/150‑1 (MQ=255)
ggATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCagag > 2:4725745/1‑150 (MQ=255)
ggATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCagag < 1:846056/150‑1 (MQ=255)
ggATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCagag < 1:813217/150‑1 (MQ=255)
gATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCagaga > 1:3176925/1‑150 (MQ=255)
gTTCATCCTGCTATTCGCTACTGAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAATCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCg < 2:4933565/150‑1 (MQ=255)
gTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGGATGAACCGGGAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCg < 2:4834702/150‑1 (MQ=255)
tCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGaa < 2:1277880/150‑1 (MQ=255)
tCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATaa < 2:3596197/150‑1 (MQ=255)
ccTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATaaa < 1:1432773/150‑1 (MQ=255)
gCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCg > 1:2534686/1‑150 (MQ=255)
cAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCgg > 2:632307/1‑150 (MQ=255)
aTTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGt < 1:4069977/150‑1 (MQ=255)
gtCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTc < 2:4161084/149‑1 (MQ=255)
cTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGata > 2:3430978/1‑150 (MQ=255)
cTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGata > 1:523143/1‑150 (MQ=255)
tACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGatat < 2:1028711/150‑1 (MQ=255)
aCTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATc < 1:1082490/150‑1 (MQ=255)
aCTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATc > 1:210524/1‑150 (MQ=255)
aCTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATc > 1:2896462/1‑150 (MQ=255)
cTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATcc > 1:669104/1‑150 (MQ=255)
ttAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCa > 2:1527812/1‑150 (MQ=255)
tAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCAc < 2:1940922/150‑1 (MQ=255)
aGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACg < 1:1874327/150‑1 (MQ=255)
ttCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTcc < 2:4807057/150‑1 (MQ=255)
tCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCg < 2:2457397/150‑1 (MQ=255)
ccAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGAt > 2:4188195/1‑150 (MQ=255)
ccAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGAt < 2:3803921/150‑1 (MQ=255)
cAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGATGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATa > 1:1663465/1‑150 (MQ=255)
cAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATa > 1:188424/1‑150 (MQ=255)
cAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATa > 1:3323758/1‑150 (MQ=255)
cAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATa > 2:4108864/1‑150 (MQ=255)
aggtaggtATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATaa < 1:1472787/150‑1 (MQ=255)
ggtaggtaTGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAAc < 1:4633880/150‑1 (MQ=255)
ggtaggtaTGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAAc < 2:1669677/150‑1 (MQ=255)
ggtaTGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATCTCCACGACCACTCCGAGATAACCTaa > 2:2580631/1‑150 (MQ=255)
ggtaTGAACCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTaa > 1:300274/1‑150 (MQ=255)
taTGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACa > 1:559794/1‑150 (MQ=255)
aTGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAg < 1:1764204/150‑1 (MQ=255)
gAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAggg < 2:5317139/150‑1 (MQ=255)
aaCCGGTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGa > 1:3862840/1‑150 (MQ=255)
cGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATg > 2:2106131/1‑150 (MQ=255)
cGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATg > 2:2813999/1‑150 (MQ=255)
gTAGGCCGTTATAGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGc < 2:4871739/150‑1 (MQ=255)
tAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCg > 2:2730221/1‑150 (MQ=255)
aGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCgg > 2:405416/1‑150 (MQ=255)
ggCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCGGa < 2:1043515/150‑1 (MQ=255)
cGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCGGACct < 2:5027202/150‑1 (MQ=255)
gTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCGGACctg > 2:852992/1‑150 (MQ=255)
ttATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCGGACctgc > 1:3454200/1‑150 (MQ=255)
tataGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCGGACctgct > 1:3390111/1‑150 (MQ=255)
|
CAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTTATCGTCCTCCATCACTACGTGATACCACGGAGCGGCGCGAAGCTCGTCATTCACCGCCAGCTCATCAGGCGACGGTTCAGAGAGCGAATAAACCGGGTCGATATCCACGACCACTCCGAGATAACCTAACAGGGAATGGCGGACCTGCTG > CP009273/1023854‑1024150
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
