Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,580,852 |
C→A |
100% |
intergenic (‑109/+225) |
ydeP ← / ← ydeQ |
putative oxidoreductase/putative fimbrial‑like adhesin protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,580,852 | 0 | C | A | 98.3%
| 1138.3
/ 7.0
| 354 | intergenic (‑109/+225) | ydeP/ydeQ | putative oxidoreductase/putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/3); new base A (169/179); total (172/182) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
ACCTGCAGCACCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTCTCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATAAAAAATAAGACTCTGGCTTCAATTGTGCGCGGATTTTCTTACAGGTG > CP009273/1580705‑1580998
|
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tGCAGCACCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCttt < 2:4115493/150‑1 (MQ=255)
gcagcaCCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTc < 1:4113089/150‑1 (MQ=255)
cagcaCCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCt < 2:34407/150‑1 (MQ=255)
agcaCCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTa < 1:656799/150‑1 (MQ=255)
gcaCCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTAt < 2:2316580/150‑1 (MQ=255)
caCCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTAtt < 2:546771/150‑1 (MQ=255)
aCCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTAttt < 1:2415524/150‑1 (MQ=255)
ggTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAAt > 1:991422/1‑150 (MQ=255)
gTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATc > 1:3617308/1‑150 (MQ=255)
tAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACATTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCt < 2:159353/150‑1 (MQ=255)
tAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCt > 1:216543/1‑150 (MQ=255)
gATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCtatt > 1:2884597/1‑150 (MQ=255)
gATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCtatt > 1:1409782/1‑150 (MQ=255)
ttCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCtattat < 1:4651845/150‑1 (MQ=255)
ttCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCtattat < 2:4075246/150‑1 (MQ=255)
cAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCg > 2:513959/1‑150 (MQ=255)
cAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCg > 1:870507/1‑150 (MQ=255)
cAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCg > 2:3533016/1‑150 (MQ=255)
aaTTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATATCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATTGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATATATTATCGt > 1:3731206/1‑150 (MQ=255)
aTTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTCTCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGtt < 1:4444082/150‑1 (MQ=255)
aTTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGtt > 1:3021580/1‑150 (MQ=255)
aTTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGtt < 1:3124217/150‑1 (MQ=255)
tttttCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTaaa < 1:3556415/150‑1 (MQ=255)
tttCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACa < 1:3815306/150‑1 (MQ=255)
ttcttcATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACaa > 2:2638654/1‑150 (MQ=255)
cttcATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATa > 1:4755765/1‑150 (MQ=255)
tcATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGa < 1:523227/150‑1 (MQ=255)
tACTTATCCTGTGTTGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGATTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTaaa < 2:1701128/150‑1 (MQ=255)
aCTTATCCTGTGTGGATATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAAt < 2:2564482/150‑1 (MQ=255)
aCTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAAt < 2:1945527/150‑1 (MQ=255)
aCTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAAt < 1:2344998/150‑1 (MQ=255)
ttATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATAc < 1:1995809/150‑1 (MQ=255)
ttATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATAc < 2:2038601/150‑1 (MQ=255)
tATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACg > 2:2266948/1‑150 (MQ=255)
tATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACg < 1:1774522/150‑1 (MQ=255)
gtgtgGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGt > 2:145878/1‑150 (MQ=255)
tgtgGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGtt < 1:934674/150‑1 (MQ=255)
tgtgGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGtt < 1:1222416/150‑1 (MQ=255)
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gtgGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTa > 1:4826706/1‑150 (MQ=255)
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aaaTGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGATAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGca > 2:1417105/1‑150 (MQ=255)
aaTGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGcat > 2:2776297/1‑150 (MQ=255)
aTGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGcatc > 1:3224640/1‑150 (MQ=255)
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tGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGcatca < 1:3333318/150‑1 (MQ=255)
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attattAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCAtct > 1:2234728/1‑150 (MQ=255)
taGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCAt > 1:2310126/1‑150 (MQ=255)
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gATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAgt < 1:5315504/150‑1 (MQ=255)
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ttGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGtt > 2:390313/1‑150 (MQ=255)
aTAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAAt < 1:4026124/150‑1 (MQ=255)
tAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAAtt < 2:1287501/150‑1 (MQ=255)
aGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTATACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTa > 2:4704811/1‑150 (MQ=255)
aGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTa < 1:2905283/150‑1 (MQ=255)
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gatgatGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACa > 2:1027945/1‑150 (MQ=255)
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gCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATAtttt < 2:3269812/150‑1 (MQ=255)
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catacaAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAAtata > 2:177561/1‑150 (MQ=255)
atacaAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATaa < 1:4349184/150‑1 (MQ=255)
tacaAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATaaa < 1:3920749/150‑1 (MQ=255)
caAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATaaaaa < 2:3079604/150‑1 (MQ=255)
aaaGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATaaaaaa > 2:4200996/1‑150 (MQ=255)
agtgATTATCGCCAACATGTATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATAAAAAATa < 2:953780/147‑1 (MQ=255)
aGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATAAAAAATa > 1:1572140/1‑150 (MQ=255)
gggATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATATTTTTCAATATAAAAAATaa < 1:2554109/150‑1 (MQ=255)
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ATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTAATATCTTTCTATTTTAAAACTATTAACGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGATAAGAATCATATCTCAGTGTGTTTAAATTATCATA‑TTTTTAATTATAA > SRR19973062.4789021/1‑150 (MQ=60)
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TACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATA‑TTTTTCAATATAAA < SRR19973062.4473415/150‑1 (MQ=60)
AAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATA‑TTTTTCAATATAAAAAAT < SRR19973062.2845609/150‑1 (MQ=60)
AAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATA‑TTTTTCAATATAAAAAAT > SRR19973062.544484/1‑150 (MQ=60)
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GGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATA‑TTTTTCAATATAAAAAATAAG < SRR19973062.4512789/150‑1 (MQ=60)
ATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATA‑TTTTTCAATATAAAAAATAAGAC > SRR19973062.2312743/1‑150 (MQ=60)
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TAAGAGTAGGGGACTACTATCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATA‑TTTTTCAATATAAAAAATAAGACTCTGGCTTCAATTGTGCGCGG > SRR19973062.3707273/1‑150 (MQ=60)
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CCACCTGCAGCACCCTGGTAGGATTCAATTTTTTTCTTCATCTACTTATCCTGTGTGGAAATGAATTATTAGGATTTGTAATAGCGATGATGCACAGTACATACAAAGGGATTATCGCCAACATGGATATATAAGAGTAGGGGACTACTCTCTTTCTATTTTTAATCTATTATCGTTAAACAATAGATTAAATACGATAAGTTAAGCATCATCTCTCATAGTGTTTAAATTAACATA‑TTTTTCAATATAAAAAATAAGACTCTGGCTTCAATTGTGCGCGGATTTTCTTACAGGTGTAG > CP009273/1580703‑1581001
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |