Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,922,164 |
C→A |
72.2% |
P311P (CCG→CCT) |
ptrB ← |
protease II |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,922,164 | 0 | C | A | 72.2%
| 392.5
/ 299.3
| 328 | P311P (CCG→CCT) | ptrB | protease II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/48); new base A (124/113); total (167/161) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.22e-01 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
ACATAGGCCGGATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAAC > CP009273/1922015‑1922310
|
ggCCGGATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAAt < 2:1831105/150‑1 (MQ=255)
gCCGGATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAAtt < 2:3669740/150‑1 (MQ=255)
ccGGATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTa < 1:4619068/150‑1 (MQ=255)
cGGATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTaa > 1:1098735/1‑150 (MQ=255)
cGGATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTaa > 1:2928454/1‑150 (MQ=255)
ggATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAAc < 1:4811125/150‑1 (MQ=255)
ggATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAAc > 1:4511786/1‑150 (MQ=255)
tcatcaAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGACTTAActct > 2:5247512/1‑150 (MQ=255)
tcatcaAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAActct < 1:492523/150‑1 (MQ=255)
tcaAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGAAGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCATca > 2:1274059/1‑149 (MQ=255)
caAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTccc < 2:2268437/150‑1 (MQ=255)
aaGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCAc > 2:3728935/1‑150 (MQ=255)
cAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGtt > 1:5128488/1‑150 (MQ=255)
aaTACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTg > 2:4257146/1‑150 (MQ=255)
aTACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGc > 2:1951956/1‑150 (MQ=255)
tACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCt > 1:511432/1‑150 (MQ=255)
aCCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCtc > 2:2134167/1‑150 (MQ=255)
aCCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCtc > 2:4766174/1‑150 (MQ=255)
aaTGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCCGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGACTTAACTCTTCCCACTGTTGCtcatc > 2:258047/1‑150 (MQ=255)
aaTGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGAAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGACTTAACTCTTCCCACTGTTGCtcatc > 2:5049621/1‑150 (MQ=255)
gACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACg < 1:4241949/150‑1 (MQ=255)
ttCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCAt < 1:2750498/150‑1 (MQ=255)
gTCTTGCTGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTa < 1:2591387/150‑1 (MQ=255)
gTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTa < 1:2992435/150‑1 (MQ=255)
tCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTAc < 1:4399255/150‑1 (MQ=255)
cTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGATGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACg < 2:2631871/150‑1 (MQ=255)
cTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACg < 1:1303965/150‑1 (MQ=255)
cTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACg > 1:1793122/1‑150 (MQ=255)
cGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGtat < 2:1606809/150‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATaa > 2:2511528/1‑150 (MQ=255)
gTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATaa > 1:726915/1‑150 (MQ=255)
gTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATaa > 1:4964427/1‑150 (MQ=255)
ttAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAg < 1:5225611/150‑1 (MQ=255)
ttAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAg > 1:4644171/1‑150 (MQ=255)
ttAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAg < 1:4696350/150‑1 (MQ=255)
gcgcAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGtt < 2:1375712/150‑1 (MQ=255)
gcgcAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGtt < 2:1718234/150‑1 (MQ=255)
cAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGttttt < 2:3066285/150‑1 (MQ=255)
cAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGttttt < 1:3593038/150‑1 (MQ=255)
aaaCTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTg > 2:4144930/1‑150 (MQ=255)
ggTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTg < 1:3159643/150‑1 (MQ=255)
gTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTgg < 2:3292668/150‑1 (MQ=255)
gTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTgg > 1:1990267/1‑150 (MQ=255)
tAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCg < 2:4396160/150‑1 (MQ=255)
tAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCg < 1:2654932/150‑1 (MQ=255)
tAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCg > 1:1646549/1‑150 (MQ=255)
ccGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTg > 1:2172716/1‑150 (MQ=255)
ccGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTg < 2:1513372/150‑1 (MQ=255)
cgcTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGaa < 1:1401175/150‑1 (MQ=255)
cTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACg < 1:1628595/150‑1 (MQ=255)
cTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACg > 2:4114454/1‑150 (MQ=255)
cTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGCCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACg < 2:2695324/150‑1 (MQ=255)
aCGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAg < 2:1037607/150‑1 (MQ=255)
gCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGAt < 2:4024751/150‑1 (MQ=255)
gCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGAt > 1:631487/1‑150 (MQ=255)
gCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGAt < 1:226896/150‑1 (MQ=255)
tctTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATaa < 2:1442047/150‑1 (MQ=255)
tctTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATaa < 2:391982/150‑1 (MQ=255)
ctTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGAGGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATaaa > 2:2737318/1‑150 (MQ=255)
ttCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGGGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATaaaa > 2:4943032/1‑150 (MQ=255)
cAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAAc < 2:823163/150‑1 (MQ=255)
aaCCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACg > 1:326272/1‑150 (MQ=255)
aaCCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACg < 1:876561/150‑1 (MQ=255)
ccaccaGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGAt < 1:4100661/150‑1 (MQ=255)
ccaccaGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGAt < 2:3191768/150‑1 (MQ=255)
ccagccagTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACTATGCt < 1:3727219/150‑1 (MQ=255)
gccagTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGt < 1:440120/150‑1 (MQ=255)
cGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGAt > 2:5202249/1‑150 (MQ=255)
ggTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATc > 1:1266215/1‑150 (MQ=255)
ggTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATc < 2:1669636/150‑1 (MQ=255)
gTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCa > 1:3118067/1‑150 (MQ=255)
tAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCaa > 2:2826208/1‑150 (MQ=255)
tAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCaa < 2:113129/150‑1 (MQ=255)
tAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCaa > 2:2889208/1‑150 (MQ=255)
aaaCAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAg < 2:1176856/150‑1 (MQ=255)
aaaCAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAg > 2:4445749/1‑150 (MQ=255)
aaaCAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAg > 2:4196124/1‑150 (MQ=255)
aaCAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAgg < 1:2378601/150‑1 (MQ=255)
aGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTg > 2:3539978/1‑150 (MQ=255)
aGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTg < 1:69960/150‑1 (MQ=255)
cGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTa > 2:4895220/1‑150 (MQ=255)
gTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCTGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTAt < 2:236118/150‑1 (MQ=255)
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TTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAG > SRR19973062.4668471/1‑150 (MQ=60)
TTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAG < SRR19973062.4720882/150‑1 (MQ=60)
TTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAG > SRR19973062.1407611/1‑150 (MQ=60)
TTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAG > SRR19973062.1407604/1‑150 (MQ=60)
TTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAG < SRR19973062.5253156/150‑1 (MQ=60)
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CAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTT < SRR19973062.3611264/150‑1 (MQ=60)
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CTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGGACGCAGATAAA > SRR19973062.315403/1‑150 (MQ=60)
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TCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCT > SRR19973062.3049349/1‑150 (MQ=60)
TCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCT > SRR19973062.3049780/1‑150 (MQ=60)
CAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTT < SRR19973062.4279106/150‑1 (MQ=60)
CAGCATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTT < SRR19973062.4279194/150‑1 (MQ=60)
CATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCG > SRR19973062.1023845/1‑150 (MQ=60)
CATGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCG < SRR19973062.859239/150‑1 (MQ=60)
ATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGG > SRR19973062.3216418/1‑150 (MQ=60)
TGATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGC > SRR19973062.512512/1‑150 (MQ=60)
GATGTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCG > SRR19973062.2166428/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCGCGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGG > SRR19973062.1677696/1‑150 (MQ=60)
ggTCGCGTGGAGGAAGTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTGTTGCCGGGGCGGGGGGACCGCAGATAAAAACGATGCGGGTAGTGATCAAGGCTGTCTTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCA > SRR19973062.3905929/3‑150 (MQ=60)
CGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGAGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAA > SRR19973062.454130/1‑150 (MQ=60)
CGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAA > SRR19973062.4958567/1‑150 (MQ=60)
CGTGGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAA > SRR19973062.4958537/1‑150 (MQ=60)
GGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACA < SRR19973062.4453409/150‑1 (MQ=60)
GGAGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACA < SRR19973062.259344/150‑1 (MQ=60)
GGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAA > SRR19973062.1208976/1‑150 (MQ=60)
AGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAA < SRR19973062.2422034/150‑1 (MQ=60)
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ACATAGGCCGGATCATCAAAGGCAATACCAATGACTTCCCGGGTCTTGCGGTTAATTTGGCGCAAACTGGTTAACCCGCGCTGACGCTCTTCAACCACCAGCCAGTCGGTAAACAGCGTAAACCCTTCCAGCATGATGTTTTCGCGTGGCGGAATTAACTCTTCCCACTGTTGCTCATCACGCATACGGGTACGGTATAAGCCAAAGTTTTTGCCGTGGCGGTTGGAACGCAGATAAAAACGATGCTGGTAGTGATCAAGGCTGTATTCGTGATCTTTGCGGCGCGGCAGAAAAACAAA > CP009273/1922015‑1922313
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |