Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F60 I0 R1
|
465 |
320.4 |
10502068 |
95.5% |
10029474 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
950,103 |
T→C |
30.8% |
intergenic (‑181/+225) |
focA ← / ← ycaO |
formate channel/ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 950,103 | 0 | T | C | 30.8%
| 351.3
/ 240.4
| 247 | intergenic (‑181/+225) | focA/ycaO | formate channel/ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (87/83); new base C (36/40); total (124/123) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
ATACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAA > CP009273/949955‑950251
|
cTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGaa < 1:4435911/149‑1 (MQ=255)
tAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAAt < 2:1019644/149‑1 (MQ=255)
aaCAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAAtt > 1:4030166/1‑149 (MQ=255)
aCAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAAttt < 2:3032720/149‑1 (MQ=255)
aCAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTGGTAttt > 2:5038049/1‑149 (MQ=255)
aaGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAAtttttt > 1:3345922/1‑149 (MQ=255)
gCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTcc < 1:3620282/149‑1 (MQ=255)
ttATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCa < 1:3821716/149‑1 (MQ=255)
ttATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCa > 1:2105363/1‑149 (MQ=255)
ataGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCAtc > 2:287831/1‑149 (MQ=255)
gATGAGAAATTGATAGAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCAtcctc < 2:690040/149‑1 (MQ=255)
aTGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCAtcctcc > 2:1525600/1‑149 (MQ=255)
gagaAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGc > 2:434753/1‑149 (MQ=255)
ttGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAAc < 2:975272/149‑1 (MQ=255)
gATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAg < 2:3547686/149‑1 (MQ=255)
tataGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGtt < 1:2405896/149‑1 (MQ=255)
taGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGttaa > 1:3385964/1‑149 (MQ=255)
aGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGttaat > 2:3489312/1‑149 (MQ=255)
aTCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGttaatta < 2:205360/149‑1 (MQ=255)
tCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGttaattaa > 1:4612817/1‑149 (MQ=255)
atatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTaaaa > 2:4438405/1‑149 (MQ=255)
tatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAg < 1:1356279/149‑1 (MQ=255)
tctcGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAggg > 1:1685139/1‑149 (MQ=255)
cGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGc < 1:454503/149‑1 (MQ=255)
cGCCTGGATTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATACAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGc < 1:4224771/149‑1 (MQ=255)
gCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCa > 1:4627984/1‑149 (MQ=255)
gCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCa > 1:3779202/1‑149 (MQ=255)
ccTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCAt > 1:1734695/1‑149 (MQ=255)
tGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCa < 2:4439373/149‑1 (MQ=255)
ggCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAg > 2:146463/1‑149 (MQ=255)
ggCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAg > 1:190161/1‑149 (MQ=255)
taGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAAt < 1:2577868/149‑1 (MQ=255)
taGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGAATCAGGCGAAt > 2:5157816/1‑149 (MQ=255)
ccGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGt < 1:908360/149‑1 (MQ=255)
cGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTa > 2:474835/1‑149 (MQ=255)
tAACTCGCATTGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAAc < 1:3894006/149‑1 (MQ=255)
aCTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACaa < 1:3031167/149‑1 (MQ=255)
aCTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACaa < 1:3746128/149‑1 (MQ=255)
cTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAat < 1:2216443/149‑1 (MQ=255)
tCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAata < 1:1326270/149‑1 (MQ=255)
cGCAAGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAAAATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAatat < 2:1312098/149‑1 (MQ=255)
gCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatc < 1:4380341/149‑1 (MQ=255)
gCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatc > 1:2633358/1‑149 (MQ=255)
cATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatcg > 2:1189328/1‑149 (MQ=255)
tGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatcgat < 2:1257948/149‑1 (MQ=255)
ggTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatcgatc < 2:2289179/149‑1 (MQ=255)
gCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtatttatt > 1:505534/1‑149 (MQ=255)
aaaTACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTaa > 1:508262/1‑149 (MQ=255)
tACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATa > 2:4877395/1‑149 (MQ=255)
tACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATa > 2:5241162/1‑149 (MQ=255)
aGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAt > 2:3247/1‑149 (MQ=255)
gTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAtt > 1:2733052/1‑149 (MQ=255)
tAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTa < 1:1024724/149‑1 (MQ=255)
tGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATAtt < 1:2878429/149‑1 (MQ=255)
ttATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTaa > 1:1802163/1‑149 (MQ=255)
tCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCt < 1:717346/149‑1 (MQ=255)
tCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCt < 2:902160/149‑1 (MQ=255)
tCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCt > 2:2743122/1‑149 (MQ=255)
tCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCt < 2:1072963/149‑1 (MQ=255)
cAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTta > 2:4086363/1‑149 (MQ=255)
aaataaaaataaATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTtat > 2:4272643/1‑149 (MQ=255)
aaataaaaataaATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTtat < 2:3598921/149‑1 (MQ=255)
aaataaaaataaATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTtat < 2:756810/149‑1 (MQ=255)
aataaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTtata > 2:604355/1‑149 (MQ=255)
taaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAt > 2:344248/1‑149 (MQ=255)
aaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAtt < 1:1077414/149‑1 (MQ=255)
aaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAtt < 1:2981738/149‑1 (MQ=255)
aaataaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTAc > 1:126267/1‑149 (MQ=255)
aaataaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTAc < 2:4017936/149‑1 (MQ=255)
ataaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACaa > 2:3698721/1‑149 (MQ=255)
taaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAat < 1:19705/149‑1 (MQ=255)
taaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAat > 2:2896477/1‑149 (MQ=255)
taaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATACTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGCGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATAAAGATCGTATTTATTAAAAACAAATTAACGCTATTTAACCATATAAtttaaat > 1:4408813/1‑144 (MQ=255)
atTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAattat < 1:2839982/149‑1 (MQ=255)
ttttAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAattatt < 1:486467/149‑1 (MQ=255)
ttttAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAattatt < 1:3314359/149‑1 (MQ=255)
tttAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttattt < 2:4789247/149‑1 (MQ=255)
aaaaaTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttattttat < 2:4271980/149‑1 (MQ=255)
aaaTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTttatta > 1:4313558/1‑149 (MQ=255)
aaaTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTttatta < 1:5162244/149‑1 (MQ=255)
aaTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTaa > 2:1927937/1‑149 (MQ=255)
aTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAAt > 1:370502/1‑149 (MQ=255)
aTTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAAt > 2:3886474/1‑149 (MQ=255)
aTTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAAt > 2:2971797/1‑149 (MQ=255)
ttAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATg < 2:2148267/149‑1 (MQ=255)
tAACAACTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGc < 1:1247876/149‑1 (MQ=255)
tAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGc > 1:551708/1‑149 (MQ=255)
tAACAAATGAGTTGAATATTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGc < 1:3145794/149‑1 (MQ=255)
aCAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCaa > 2:3423458/1‑149 (MQ=255)
aCAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCaa > 2:2379277/1‑149 (MQ=255)
cAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCaaa > 2:1429875/1‑149 (MQ=255)
aaaTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat < 1:4119488/149‑1 (MQ=255)
aaaTGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat > 1:81832/1‑149 (MQ=255)
actGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAata < 1:3351236/147‑1 (MQ=255)
aTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATTCAAatat > 2:2930978/1‑149 (MQ=255)
aTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAACGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAatat < 2:3006551/149‑1 (MQ=255)
gAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAatatat < 2:249973/149‑1 (MQ=255)
aGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATg > 1:3470194/1‑149 (MQ=255)
tGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTaa < 2:4627984/149‑1 (MQ=255)
tGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTaa < 2:4627826/149‑1 (MQ=255)
|
ATACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAA > CP009273/949955‑950251
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
