Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,443,093 |
C→A |
32.9% |
L440I (CTC→ATC) |
feaB → |
phenylacetaldehyde dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,443,093 | 0 | C | A | 32.9%
| 405.8
/ 195.2
| 221 | L440I (CTC→ATC) | feaB | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (74/74); new base A (35/38); total (109/112) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
TGGTAAATCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGACTGGCTGGACGGTTG > CP009273/1442944‑1443241
|
tggtAAATCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAAtc > 1:887451/1‑150 (MQ=255)
tggtAAATCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAAtc < 2:78290/150‑1 (MQ=255)
gtAAATCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAAtatc > 2:561321/1‑150 (MQ=255)
gtAAATCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAAtatc > 2:3664224/1‑150 (MQ=255)
tAAATCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAAtctct > 1:3371188/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAAtctctc > 2:539611/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAAtctctc > 2:295891/1‑150 (MQ=255)
aaTCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTcc < 2:515519/150‑1 (MQ=255)
cGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGc > 1:2829254/1‑150 (MQ=255)
gATGCTAACTTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGct < 2:2473839/150‑1 (MQ=255)
gATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCTAAATCTCTCCCAGGct < 1:815072/150‑1 (MQ=255)
gATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGct > 1:2056730/1‑150 (MQ=255)
aTGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGACTATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGctc > 2:748402/1‑150 (MQ=255)
aTGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGctc > 2:3954762/1‑150 (MQ=255)
tGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGctct < 2:2796868/150‑1 (MQ=255)
tAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGa < 1:1322402/150‑1 (MQ=255)
tAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGa < 2:3580842/150‑1 (MQ=255)
gcTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCg > 2:1931395/1‑150 (MQ=255)
ttAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGAt < 2:2512263/150‑1 (MQ=255)
ttAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGAt < 2:2706927/150‑1 (MQ=255)
aaCTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGAGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTGAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCg > 1:3070748/1‑150 (MQ=255)
cGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTa > 2:1415924/1‑150 (MQ=255)
gAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTAcag > 1:1753919/1‑150 (MQ=255)
aaGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTAcagg > 1:2228132/1‑150 (MQ=255)
aaGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTAcagg < 1:1708525/150‑1 (MQ=255)
agagGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTAcaggc < 2:3416231/150‑1 (MQ=255)
agGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTAcaggcag < 2:2134478/150‑1 (MQ=255)
gtgtTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAggg > 2:2663619/1‑150 (MQ=255)
gtTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGAc < 1:704391/150‑1 (MQ=255)
tttGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACg < 1:97791/150‑1 (MQ=255)
tGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGgt > 1:2330811/1‑150 (MQ=255)
tGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGgt < 1:3975216/150‑1 (MQ=255)
tGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGgt > 1:525231/1‑150 (MQ=255)
ggTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGgtg < 1:3410741/150‑1 (MQ=255)
ggTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGgtg < 1:1398010/150‑1 (MQ=255)
gTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGgtgt < 1:3141336/150‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTgg < 1:3719334/150‑1 (MQ=255)
tggtAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTaa < 2:1493336/150‑1 (MQ=255)
ggtAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTaaa > 1:1556952/1‑150 (MQ=255)
ggtAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTaaa > 2:3909723/1‑150 (MQ=255)
gtAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAAc < 2:2436737/150‑1 (MQ=255)
gtAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAAc < 1:2628749/150‑1 (MQ=255)
ccTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCa > 1:4154653/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCAt < 2:1009636/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTCAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATCGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCAt > 2:730326/1‑150 (MQ=255)
tGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATa < 2:2717938/150‑1 (MQ=255)
tGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATa < 2:2463978/150‑1 (MQ=255)
ggTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATAc < 2:2154194/150‑1 (MQ=255)
gCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCtt < 2:3404701/150‑1 (MQ=255)
gCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCtt < 1:2883085/150‑1 (MQ=255)
aGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTTTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAAt > 1:407768/1‑150 (MQ=255)
aGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAAt < 1:2753795/150‑1 (MQ=255)
gCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGAc < 2:3222857/150‑1 (MQ=255)
cGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACg > 1:64902/1‑150 (MQ=255)
gATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCt < 2:3727331/150‑1 (MQ=255)
agaagaGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACtt < 2:106095/150‑1 (MQ=255)
agaagaGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACtt > 1:467320/1‑150 (MQ=255)
agaagaGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACtt > 1:107855/1‑150 (MQ=255)
gaagaGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTa < 2:4056142/150‑1 (MQ=255)
aagaGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTAc > 2:3305948/1‑150 (MQ=255)
gagGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCg < 1:679653/150‑1 (MQ=255)
gagGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCg > 1:1051156/1‑150 (MQ=255)
gCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGttt < 1:3959534/150‑1 (MQ=255)
cGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAAGATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTtg < 2:360692/150‑1 (MQ=255)
gTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTtgg > 2:1669280/1‑150 (MQ=255)
gTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGGGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTtgg > 2:1825589/1‑150 (MQ=255)
cAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTggg < 2:1640545/150‑1 (MQ=255)
aCTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGAt < 1:2825700/150‑1 (MQ=255)
cTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTTGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATAAAGCGATCTCTTACAGGCAGTGACGGAGTGGGTAAACAGCCATACCTTAAATGACGCTAACTTAACGTTTGGAGGGATg > 1:2931046/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATg > 1:2570833/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATg < 1:110230/150‑1 (MQ=255)
ggCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGaa > 1:2725156/1‑150 (MQ=255)
ggCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGaa > 1:3472036/1‑150 (MQ=255)
cAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGc > 2:3026421/1‑150 (MQ=255)
aaaCGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCa > 2:2415787/1‑150 (MQ=255)
aaaCGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGTGATGAAGct > 1:2386099/1‑149 (MQ=255)
aCGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGt < 2:3446771/150‑1 (MQ=255)
gACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCa < 1:727030/150‑1 (MQ=255)
acacGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAg > 2:651159/1‑150 (MQ=255)
acGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGGTGGGTGGGTTGAAGCAGTCAGGa > 2:2334659/1‑150 (MQ=255)
acGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCACTGGAATATAGCGATCGCCTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACATACCGATTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGa > 2:2334851/1‑150 (MQ=255)
cGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGaa > 2:3066008/1‑150 (MQ=255)
ggAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAAc < 2:1182708/150‑1 (MQ=255)
aaCTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGAttt > 1:1216395/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGAttt > 1:1216520/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTgg > 1:2310753/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGcc > 1:2103814/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGcc > 2:2222585/1‑150 (MQ=255)
cAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGccc > 1:428761/1‑150 (MQ=255)
cAGTGTCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGccc > 1:3895658/1‑150 (MQ=255)
gtgtCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCg > 1:1317250/1‑150 (MQ=255)
gtCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGAc > 2:207800/1‑150 (MQ=255)
gtCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGAc > 1:2553446/1‑150 (MQ=255)
gtCTGGACGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGAc > 1:3828798/1‑150 (MQ=255)
ggACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGActggc > 1:3554255/1‑150 (MQ=255)
aCGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGActggctg < 1:1723381/150‑1 (MQ=255)
aCGCAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCATACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACATTAATTGACGCTAACTTACCGTGTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGACCGGGCCGTGATTTTGGCCCCGActggctg > 1:245374/1‑150 (MQ=255)
cAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGACTGGCTGGAc < 1:1987254/150‑1 (MQ=255)
cAAAATATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGACTGGCTGGAc > 2:3393515/1‑150 (MQ=255)
aaaaTATCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCTGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGACTGGCTGGACg > 2:2019700/1‑150 (MQ=255)
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TGGTAAATCCCGATGCTAAATTGCGCTTAACTCGTGAAGAGGTGTTTGGTCCGGTGGTAAACCTGGTGCGAGTAGCGGATGGAGAAGAGGCGTTACAACTGGCAAACGACACGGAATATGGCTTAACTGCCAGTGTCTGGACGCAAAATCTCTCCCAGGCTCTGGAATATAGCGATCGCTTACAGGCAGGGACGGTGTGGGTAAACAGCCATACCTTAATTGACGCTAACTTACCGTTTGGTGGGATGAAGCAGTCAGGAACGGGCCGTGATTTTGGCCCCGACTGGCTGGACGGTTG > CP009273/1442944‑1443241
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
