Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP043523 |
1,847,985 |
T→A |
G57G (GGT→GGA) |
FTN78_chr1897 → |
Cold shock protein of CSP family |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP043523 | 1,847,985 | 0 | T | A | 99.8%
| 1412.6
/ NA
| 417 | G57G (GGT→GGA) | FTN78_chr1897 | Cold shock protein of CSP family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (144/271); minor base G (0/1); total (144/273) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 417 total aligned reads displayed.
TTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGTCGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAA > CP043523/1847840‑1848128
|
aCGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTa > 2:694664/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTa < 2:1098743/148‑1 (MQ=255)
cTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGc > 1:2468674/1‑148 (MQ=255)
tGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTTAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCt > 2:4116005/1‑148 (MQ=255)
aCAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTc > 2:3162954/1‑148 (MQ=255)
aCAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTc > 2:3030000/1‑148 (MQ=255)
aCAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTc > 2:1762009/1‑148 (MQ=255)
aaaGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCaa < 2:453346/148‑1 (MQ=255)
aaaGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCaa < 2:4419017/148‑1 (MQ=255)
aGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAAc > 1:2444602/1‑148 (MQ=255)
ggCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACg < 1:3139005/148‑1 (MQ=255)
gCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGt > 2:906156/1‑148 (MQ=255)
gCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGt < 1:2090221/148‑1 (MQ=255)
tATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTAc > 2:3838464/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACAt > 2:2062160/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACAt > 2:2630648/1‑148 (MQ=255)
ggTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATa > 2:1247836/1‑148 (MQ=255)
gTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATaa > 2:557091/1‑148 (MQ=255)
attatGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGAt < 1:3207851/148‑1 (MQ=255)
tatGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATaa > 2:1397924/1‑148 (MQ=255)
atGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATaaa < 2:1000091/148‑1 (MQ=255)
aGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGt < 1:174556/148‑1 (MQ=255)
atgatATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAACTGCTTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTa < 2:1351300/148‑1 (MQ=255)
atatGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAg < 2:1975511/148‑1 (MQ=255)
atGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCa > 1:4587091/1‑148 (MQ=255)
atGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCa < 1:1955297/148‑1 (MQ=255)
atGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCa < 1:1389873/148‑1 (MQ=255)
tGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGATCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCAt < 2:370574/148‑1 (MQ=255)
gCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATg < 1:1334744/148‑1 (MQ=255)
gCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATg > 2:152090/1‑148 (MQ=255)
cAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATgg < 2:3104627/148‑1 (MQ=255)
aGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATgggg < 1:3366032/148‑1 (MQ=255)
aGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATgggg < 1:2518570/148‑1 (MQ=255)
gATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGgt < 2:23462/148‑1 (MQ=255)
gtgtTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTc > 1:4012230/1‑148 (MQ=255)
tgtTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTcc < 2:3998842/148‑1 (MQ=255)
tttGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCtt < 2:4353189/148‑1 (MQ=255)
ttGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCttt < 1:3858417/148‑1 (MQ=255)
tGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTg > 2:4568504/1‑148 (MQ=255)
cttatctcttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCt < 2:2560087/148‑1 (MQ=255)
atctcttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCtttt < 2:3391532/148‑1 (MQ=255)
atctcttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCtttt > 2:3616528/1‑148 (MQ=255)
atctcttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCtttt < 1:2180768/148‑1 (MQ=255)
atctcttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCtttt < 1:1817861/148‑1 (MQ=255)
ctcttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCtttttt < 2:2958845/148‑1 (MQ=255)
cttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTtttat < 2:3292851/148‑1 (MQ=255)
ttatctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTtttatt < 1:693791/148‑1 (MQ=255)
tctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTttatttat < 2:617614/148‑1 (MQ=255)
tctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTttatttat < 1:1288554/148‑1 (MQ=255)
tctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTttatttat < 1:1523553/148‑1 (MQ=255)
tctATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTttatttat > 2:2489109/1‑148 (MQ=255)
ttCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTtattgct > 2:2675168/1‑148 (MQ=255)
ttCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTtattgct < 1:353962/148‑1 (MQ=255)
ttCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTtattgct < 1:356083/148‑1 (MQ=255)
cAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTtattgctat > 2:131828/1‑148 (MQ=255)
aGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTtattgctatt > 2:2723472/1‑148 (MQ=255)
ggAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTtattgctattgc < 1:1203927/148‑1 (MQ=255)
tGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCaaaaa > 1:646006/1‑148 (MQ=255)
gATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAAt < 1:4261134/148‑1 (MQ=255)
gATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAAt < 2:2233311/148‑1 (MQ=255)
aTTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATg < 1:2862424/148‑1 (MQ=255)
ttttAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGa > 2:346873/1‑148 (MQ=255)
tttAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGaa < 1:3452398/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTa < 1:4356094/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTa > 1:3752271/1‑148 (MQ=255)
aaaaaTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTaa < 1:3581280/148‑1 (MQ=255)
aaaaTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTaaa < 1:1638888/148‑1 (MQ=255)
aaaTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTaaaa < 1:2578570/148‑1 (MQ=255)
aaTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAAt < 2:2135910/148‑1 (MQ=255)
aaTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAAt < 1:735756/148‑1 (MQ=255)
aTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATg < 2:3882413/148‑1 (MQ=255)
aTACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATg < 2:3078398/148‑1 (MQ=255)
cGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTta > 2:3761647/1‑148 (MQ=255)
aTGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTtata > 2:2440753/1‑148 (MQ=255)
tGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATAc > 1:3035187/1‑148 (MQ=255)
tGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATAc < 1:535602/148‑1 (MQ=255)
tGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTAAAAAAAAAAAAATGAATTAAAATGTTATAc < 2:794619/148‑1 (MQ=255)
gTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACtgagt > 2:2852330/1‑148 (MQ=255)
tCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACtgagtg > 2:4225942/1‑148 (MQ=255)
aaaaGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGAAAATAAAAAAATGAATTAAAATGTTATACtgagtgag < 2:4679878/148‑1 (MQ=255)
aGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGa < 1:4312846/148‑1 (MQ=255)
aGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGa > 1:2283138/1‑148 (MQ=255)
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ATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTC > SRR13214404.4038023/1‑150 (MQ=60)
TGTGTTTGCTTATCTCTTATCGAGTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCC < SRR13214404.3195356/150‑1 (MQ=60)
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AATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAA > SRR13214404.650629/1‑150 (MQ=60)
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GATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATAC < SRR13214404.1224005/150‑1 (MQ=60)
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AAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGA > SRR13214404.2298281/1‑150 (MQ=60)
AAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGA < SRR13214404.3489051/150‑1 (MQ=60)
AGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAA < SRR13214404.1359748/150‑1 (MQ=60)
AGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAA < SRR13214404.4339903/150‑1 (MQ=60)
AGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAA < SRR13214404.351463/150‑1 (MQ=60)
AGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAA > SRR13214404.2743639/1‑150 (MQ=60)
GGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAG < SRR13214404.1243156/150‑1 (MQ=60)
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GGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAG < SRR13214404.1243012/150‑1 (MQ=60)
GGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAG < SRR13214404.1313517/150‑1 (MQ=60)
TTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGAT < SRR13214404.1147128/150‑1 (MQ=60)
ACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTA < SRR13214404.4252482/150‑1 (MQ=60)
ACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTA < SRR13214404.561065/150‑1 (MQ=60)
ACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTA > SRR13214404.4376988/1‑150 (MQ=60)
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CTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAG > SRR13214404.3073752/1‑150 (MQ=60)
TTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGT > SRR13214404.1559128/1‑150 (MQ=60)
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TTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTT > SRR13214404.654613/1‑150 (MQ=60)
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TTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTcacgctcctgtatctcggtggtcgccgtatcatt < SRR13214404.3500624/150‑35 (MQ=60)
TATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTT < SRR13214404.4601796/150‑1 (MQ=60)
TATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTT < SRR13214404.1358107/150‑1 (MQ=60)
ATCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCATTTGCTTTTTTATTTATTGTTATTGCAAGAATGAATTAAAATATTATACTGAGTGAGGGAAAGAGTAGTTGCTTTC > SRR13214404.110370/1‑150 (MQ=60)
TCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCC < SRR13214404.912547/150‑1 (MQ=60)
TCAAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCC < SRR13214404.912424/150‑1 (MQ=60)
AAAATGACGTCTCGTGGGCGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCA < SRR13214404.2149607/150‑1 (MQ=60)
AAAATGACGTCTCGTGGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCT > SRR13214404.4570011/1‑150 (MQ=60)
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GGACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATC > SRR13214404.3686808/1‑150 (MQ=60)
ACGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCA < SRR13214404.2716997/150‑1 (MQ=60)
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TGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGTCGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGAGTTAAAGCATGGGGTGTCCTTTGCTTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATTAAAATGTTATACTGAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCA > CP043523/1847836‑1848134
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |