Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 535 total aligned reads displayed.
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|
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AAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTC > SRR13214404.2350151/1‑150 (MQ=21)
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AGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGT > SRR13214404.3570686/1‑150 (MQ=21)
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TTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAACAGTCAGATGTTGCAAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGT > SRR13214404.1249862/1‑150 (MQ=0)
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TTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAA < SRR13214404.801838/150‑1 (MQ=1)
TTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAA > SRR13214404.12327/1‑150 (MQ=9)
TAGCTTTAAGCGTTTCACGAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAAT < SRR13214404.3654957/150‑1 (MQ=7)
AGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATA < SRR13214404.3339762/150‑1 (MQ=5)
AGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATA > SRR13214404.3600039/1‑150 (MQ=5)
GCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAA > SRR13214404.3178122/1‑150 (MQ=6)
GCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAA > SRR13214404.3799468/1‑150 (MQ=5)
GCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAA < SRR13214404.1851364/150‑1 (MQ=5)
CTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAA > SRR13214404.881947/1‑150 (MQ=5)
CTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAA < SRR13214404.1673749/150‑1 (MQ=5)
CTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAA > SRR13214404.1691714/1‑150 (MQ=5)
CTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAA < SRR13214404.2230397/150‑1 (MQ=5)
TTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAAC > SRR13214404.4569168/1‑150 (MQ=6)
TTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAAC > SRR13214404.1212588/1‑150 (MQ=6)
TTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACA > SRR13214404.1880098/1‑150 (MQ=5)
TAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAA < SRR13214404.491805/150‑1 (MQ=5)
TAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAA > SRR13214404.2532984/1‑150 (MQ=5)
AGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAA > SRR13214404.2768857/1‑150 (MQ=1)
GCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAA < SRR13214404.788291/150‑1 (MQ=0)
GCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAA < SRR13214404.1299836/150‑1 (MQ=0)
CGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAAC < SRR13214404.4429302/150‑1 (MQ=0)
GTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACT > SRR13214404.3735050/1‑150 (MQ=0)
GTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACT < SRR13214404.2269868/150‑1 (MQ=0)
GTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCAAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACT > SRR13214404.488098/1‑150 (MQ=0)
TTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTT < SRR13214404.2468514/150‑1 (MQ=0)
TTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTT < SRR13214404.2225763/150‑1 (MQ=0)
TCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTT > SRR13214404.2897398/1‑150 (MQ=0)
CACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTG < SRR13214404.3711650/150‑1 (MQ=0)
ACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGG > SRR13214404.1124131/1‑150 (MQ=0)
CTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGA < SRR13214404.242950/150‑1 (MQ=0)
TAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGA < SRR13214404.3954266/150‑1 (MQ=0)
AAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAG > SRR13214404.1759480/1‑150 (MQ=0)
AAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAG > SRR13214404.3648908/1‑150 (MQ=0)
AAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGT > SRR13214404.1832608/1‑150 (MQ=0)
AATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTagatcgg > SRR13214404.1936948/1‑143 (MQ=0)
TGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAtgatacggcgaccaccg < SRR13214404.4582362/150‑18 (MQ=0)
CAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCT > SRR13214404.296974/1‑150 (MQ=0)
CAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCT > SRR13214404.3023463/1‑150 (MQ=0)
AGTTCGCCCTATAGGTAACAAGCCATATCTACGCAATCTGATGTTGCGAGATGGCCGTTCTTTCGGTTTTGAACATCAAGGGGAACATTCGTTTGATAAAGCGTCTCATTGGTTGTCTGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTA < SRR13214404.938607/150‑1 (MQ=0)
AGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTA < SRR13214404.3424813/150‑1 (MQ=0)
AGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTA < SRR13214404.222180/150‑1 (MQ=0)
GTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTAT < SRR13214404.3115289/150‑1 (MQ=0)
GTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTAT > SRR13214404.3753382/1‑150 (MQ=0)
TACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATT > SRR13214404.2435459/1‑150 (MQ=0)
TACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATT > SRR13214404.1768933/1‑150 (MQ=0)
TACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATT > SRR13214404.2856587/1‑150 (MQ=0)
CGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTAT < SRR13214404.4196215/150‑1 (MQ=0)
CGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTAT < SRR13214404.3923400/150‑1 (MQ=0)
CCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAA < SRR13214404.742491/150‑1 (MQ=0)
CCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAA > SRR13214404.4407049/1‑150 (MQ=0)
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CATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTC > SRR13214404.537391/1‑150 (MQ=0)
ATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTAGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCA > SRR13214404.723214/1‑150 (MQ=3)
TAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCAT < SRR13214404.1039933/150‑1 (MQ=6)
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GTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATA > SRR13214404.1811200/1‑150 (MQ=8)
GTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATA > SRR13214404.4392379/1‑150 (MQ=8)
TAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAA < SRR13214404.4680979/150‑1 (MQ=8)
TAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAA < SRR13214404.4712427/150‑1 (MQ=8)
TAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAA > SRR13214404.1159268/1‑150 (MQ=8)
TAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGACTCAATAGTTGTCCGTCAATAAACAAAAACCTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAA > SRR13214404.2799707/1‑150 (MQ=7)
AACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAG < SRR13214404.1053733/150‑1 (MQ=8)
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CGATACCTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGC < SRR13214404.4225367/150‑1 (MQ=6)
CGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGC < SRR13214404.4238202/150‑1 (MQ=8)
AACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTT > SRR13214404.3377843/1‑150 (MQ=6)
ACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTT > SRR13214404.2262338/1‑150 (MQ=6)
CTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTC < SRR13214404.4174835/150‑1 (MQ=6)
TAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGACCCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTGTTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCT > SRR13214404.2138925/1‑150 (MQ=5)
TAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCT > SRR13214404.2128505/1‑150 (MQ=6)
AGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAA > SRR13214404.2667572/1‑150 (MQ=6)
CAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATG > SRR13214404.264540/1‑150 (MQ=6)
TCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTT < SRR13214404.1577401/150‑1 (MQ=6)
ATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTG > SRR13214404.4085686/1‑150 (MQ=6)
TGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGG > SRR13214404.4269235/1‑150 (MQ=6)
GTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGT < SRR13214404.657189/150‑1 (MQ=6)
GTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGT > SRR13214404.4637743/1‑150 (MQ=6)
TGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTT < SRR13214404.4511238/150‑1 (MQ=8)
GAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAG < SRR13214404.4453248/150‑1 (MQ=8)
GATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGAT > SRR13214404.1734076/1‑150 (MQ=8)
GATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGAT > SRR13214404.3819509/1‑150 (MQ=8)
ATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATT > SRR13214404.3761821/1‑150 (MQ=8)
TGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTA < SRR13214404.2158056/150‑1 (MQ=8)
GGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAG > SRR13214404.4067666/1‑150 (MQ=8)
GTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATA > SRR13214404.3810616/1‑150 (MQ=8)
TCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGC < SRR13214404.1757826/150‑1 (MQ=8)
TTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCAC < SRR13214404.3781293/150‑1 (MQ=10)
GGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACT > SRR13214404.1536212/1‑150 (MQ=0)
GGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACT > SRR13214404.2098456/1‑150 (MQ=22)
GGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACT > SRR13214404.682203/1‑150 (MQ=0)
GTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAATCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTT > SRR13214404.3902749/1‑150 (MQ=0)
TTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTAAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTA < SRR13214404.1714879/150‑1 (MQ=0)
TTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTA > SRR13214404.1935990/1‑150 (MQ=0)
TTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTA < SRR13214404.3225538/150‑1 (MQ=22)
TTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTAT > SRR13214404.3204762/1‑150 (MQ=22)
TTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAACGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTAT < SRR13214404.2710278/150‑1 (MQ=21)
TTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATT > SRR13214404.1071237/1‑150 (MQ=0)
TGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTT > SRR13214404.4071067/1‑150 (MQ=0)
TGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTT < SRR13214404.3976056/150‑1 (MQ=0)
TGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTT < SRR13214404.3363350/150‑1 (MQ=0)
GAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATA > SRR13214404.3836642/1‑150 (MQ=0)
AACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTAT > SRR13214404.4598347/1‑150 (MQ=0)
AACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTAT < SRR13214404.2608349/150‑1 (MQ=22)
ACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATT < SRR13214404.3671324/150‑1 (MQ=0)
ACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATT > SRR13214404.3053124/1‑150 (MQ=0)
CCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTT < SRR13214404.31356/150‑1 (MQ=0)
CTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTT > SRR13214404.2979927/1‑150 (MQ=0)
CTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTT > SRR13214404.4557202/1‑150 (MQ=22)
cactGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCC < SRR13214404.1081936/146‑1 (MQ=21)
CAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCC < SRR13214404.4639990/150‑1 (MQ=0)
AAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCA < SRR13214404.2003883/150‑1 (MQ=22)
AAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCA < SRR13214404.3247555/150‑1 (MQ=0)
AGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAA > SRR13214404.2582528/1‑150 (MQ=22)
AGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAA > SRR13214404.1181404/1‑150 (MQ=22)
GGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAAT < SRR13214404.1020322/150‑1 (MQ=0)
GGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAAT < SRR13214404.1432863/150‑1 (MQ=22)
GGGAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATG < SRR13214404.1437394/150‑1 (MQ=0)
GGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGA > SRR13214404.91967/1‑150 (MQ=0)
GAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAA < SRR13214404.2592289/150‑1 (MQ=0)
AACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAA > SRR13214404.3334012/1‑150 (MQ=0)
CACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATC > SRR13214404.775468/1‑150 (MQ=0)
CACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATT < SRR13214404.1359587/150‑1 (MQ=22)
CACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATT < SRR13214404.3726145/150‑1 (MQ=0)
ACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCA < SRR13214404.3498178/150‑1 (MQ=0)
ACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTA < SRR13214404.355564/150‑1 (MQ=0)
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AGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTA > CP043523/248516‑248814
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |